MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018294	TCGC	2	8	93205	93212	0 %	25 %	25 %	50 %	399995115
1502	NC_018294	CAA	2	6	93252	93257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995115
1503	NC_018294	TCATG	2	10	93258	93267	20 %	40 %	20 %	20 %	399995115
1504	NC_018294	GCC	3	9	93284	93292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995115
1505	NC_018294	CG	3	6	93313	93318	0 %	0 %	50 %	50 %	399995115
1506	NC_018294	GAG	2	6	93340	93345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995115
1507	NC_018294	CTT	2	6	93408	93413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995115
1508	NC_018294	CAG	2	6	93442	93447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995115
1509	NC_018294	CG	3	6	93465	93470	0 %	0 %	50 %	50 %	399995115
1510	NC_018294	CCG	2	6	93573	93578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995115
1511	NC_018294	TCG	2	6	93650	93655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995115
1512	NC_018294	GC	3	6	93741	93746	0 %	0 %	50 %	50 %	399995115
1513	NC_018294	CGG	2	6	93777	93782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995115
1514	NC_018294	CGC	2	6	93849	93854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995115
1515	NC_018294	GAG	2	6	93899	93904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995115
1516	NC_018294	CCA	2	6	93928	93933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995116
1517	NC_018294	TGC	2	6	93940	93945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1518	NC_018294	GCTC	2	8	94031	94038	0 %	25 %	25 %	50 %	399995116
1519	NC_018294	TGC	2	6	94039	94044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1520	NC_018294	CGC	2	6	94065	94070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995116
1521	NC_018294	CGC	2	6	94097	94102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995116
1522	NC_018294	ATG	2	6	94114	94119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995116
1523	NC_018294	CGC	2	6	94145	94150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995116
1524	NC_018294	CCG	2	6	94234	94239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995116
1525	NC_018294	GCTG	2	8	94252	94259	0 %	25 %	50 %	25 %	399995116
1526	NC_018294	GC	3	6	94264	94269	0 %	0 %	50 %	50 %	399995116
1527	NC_018294	ATC	2	6	94309	94314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995116
1528	NC_018294	GC	3	6	94347	94352	0 %	0 %	50 %	50 %	399995116
1529	NC_018294	CGA	2	6	94412	94417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1530	NC_018294	ACG	2	6	94438	94443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1531	NC_018294	AGC	2	6	94444	94449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1532	NC_018294	TCG	2	6	94468	94473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1533	NC_018294	CCA	2	6	94495	94500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995116
1534	NC_018294	CCAG	2	8	94507	94514	25 %	0 %	25 %	50 %	399995116
1535	NC_018294	AGC	2	6	94630	94635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995116
1536	NC_018294	CCG	2	6	94648	94653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995116
1537	NC_018294	CAT	2	6	94815	94820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995117
1538	NC_018294	TGC	2	6	94828	94833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995117
1539	NC_018294	GCC	2	6	94926	94931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995117
1540	NC_018294	ACT	2	6	94938	94943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995117
1541	NC_018294	CAAT	2	8	94968	94975	50 %	25 %	0 %	25 %	399995117
1542	NC_018294	AAGC	2	8	95049	95056	50 %	0 %	25 %	25 %	399995117
1543	NC_018294	GGC	2	6	95276	95281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995118
1544	NC_018294	CAA	2	6	95302	95307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995118
1545	NC_018294	CTG	3	9	95454	95462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995118
1546	NC_018294	CATC	2	8	95507	95514	25 %	25 %	0 %	50 %	399995118
1547	NC_018294	GAT	2	6	95547	95552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995118
1548	NC_018294	GCTCAA	2	12	95560	95571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995118
1549	NC_018294	GAT	2	6	95573	95578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995118
1550	NC_018294	GCA	2	6	95593	95598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995118
1551	NC_018294	CGAA	2	8	95605	95612	50 %	0 %	25 %	25 %	399995118
1552	NC_018294	TTC	2	6	95690	95695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995118
1553	NC_018294	GTC	2	6	95729	95734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995118
1554	NC_018294	CAA	2	6	95821	95826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995119
1555	NC_018294	CGT	2	6	95845	95850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995119
1556	NC_018294	TCG	2	6	95925	95930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995119
1557	NC_018294	ACC	2	6	96078	96083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995119
1558	NC_018294	CGA	3	9	96209	96217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995119
1559	NC_018294	TCT	2	6	96239	96244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995119
1560	NC_018294	CCG	2	6	96268	96273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995119
1561	NC_018294	CAG	2	6	96311	96316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995119
1562	NC_018294	CG	3	6	96344	96349	0 %	0 %	50 %	50 %	399995119
1563	NC_018294	GAT	2	6	96362	96367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995119
1564	NC_018294	TCGC	2	8	96392	96399	0 %	25 %	25 %	50 %	399995119
1565	NC_018294	CAT	2	6	96450	96455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995119
1566	NC_018294	CGT	2	6	96471	96476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995119
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1568	NC_018294	CCG	2	6	96537	96542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995119
1569	NC_018294	CAGG	2	8	96548	96555	25 %	0 %	50 %	25 %	399995119
1570	NC_018294	TCG	2	6	96806	96811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995120
1571	NC_018294	CTT	2	6	96829	96834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995120
1572	NC_018294	CAG	2	6	96898	96903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995120
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1575	NC_018294	CCG	2	6	96950	96955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995120
1576	NC_018294	GTA	2	6	96964	96969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995120
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1583	NC_018294	CGGC	2	8	98097	98104	0 %	0 %	50 %	50 %	399995121
1584	NC_018294	CAG	2	6	98226	98231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995122
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1587	NC_018294	ACGA	2	8	98282	98289	50 %	0 %	25 %	25 %	399995122
1588	NC_018294	T	6	6	98363	98368	0 %	100 %	0 %	0 %	399995122
1589	NC_018294	CAC	2	6	98653	98658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995123
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1591	NC_018294	CTC	2	6	98740	98745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995123
1592	NC_018294	CGG	2	6	98760	98765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995123
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1595	NC_018294	CTC	2	6	98836	98841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995123
1596	NC_018294	CG	3	6	98921	98926	0 %	0 %	50 %	50 %	399995123
1597	NC_018294	TCA	2	6	99003	99008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995123
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1599	NC_018294	CCG	2	6	99294	99299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
1600	NC_018294	TCG	2	6	99345	99350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995125
1601	NC_018294	CAG	2	6	99352	99357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995125
1602	NC_018294	GCC	2	6	99364	99369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
1603	NC_018294	GGT	4	12	99393	99404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995125
1604	NC_018294	GCG	2	6	99438	99443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995125
1605	NC_018294	CAG	2	6	99487	99492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995125
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1607	NC_018294	AGC	2	6	99584	99589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995125
1608	NC_018294	GCC	2	6	99611	99616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
1609	NC_018294	TGG	2	6	99624	99629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995125
1610	NC_018294	CGC	2	6	99648	99653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
1611	NC_018294	GCCG	2	8	99762	99769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995125
1612	NC_018294	CCGG	2	8	99799	99806	0 %	0 %	50 %	50 %	399995125
1613	NC_018294	TCA	2	6	99822	99827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995125
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1616	NC_018294	TGT	2	6	99918	99923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995125
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1618	NC_018294	GCC	2	6	99959	99964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
1619	NC_018294	TCG	2	6	99978	99983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995125
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1621	NC_018294	GAT	2	6	100132	100137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995125
1622	NC_018294	GCCG	2	8	100147	100154	0 %	0 %	50 %	50 %	399995125
1623	NC_018294	TGCG	2	8	100157	100164	0 %	25 %	50 %	25 %	399995125
1624	NC_018294	CGA	2	6	100233	100238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995125
1625	NC_018294	GGCG	2	8	100240	100247	0 %	0 %	75 %	25 %	399995125
1626	NC_018294	CGGG	2	8	100272	100279	0 %	0 %	75 %	25 %	399995125
1627	NC_018294	GTC	2	6	100321	100326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995125
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1987	NC_018294	AGC	2	6	120417	120422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995145
1988	NC_018294	GCC	2	6	120426	120431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1989	NC_018294	CCG	2	6	120472	120477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1990	NC_018294	GCC	2	6	120548	120553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1991	NC_018294	GC	4	8	120562	120569	0 %	0 %	50 %	50 %	399995145
1992	NC_018294	CGC	2	6	120587	120592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1993	NC_018294	GCCA	2	8	120677	120684	25 %	0 %	25 %	50 %	399995145
1994	NC_018294	GCC	2	6	120685	120690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1995	NC_018294	ATT	2	6	120701	120706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995145
1996	NC_018294	ACG	2	6	120756	120761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995145
1997	NC_018294	TTTG	2	8	120766	120773	0 %	75 %	25 %	0 %	399995145
1998	NC_018294	CGC	2	6	120842	120847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995145
1999	NC_018294	CGG	2	6	120856	120861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995145
2000	NC_018294	GCG	2	6	120870	120875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995145

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