MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018294	CGG	2	6	29242	29247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
502	NC_018294	TCGA	2	8	29277	29284	25 %	25 %	25 %	25 %	399995051
503	NC_018294	GATG	2	8	29285	29292	25 %	25 %	50 %	0 %	399995051
504	NC_018294	CCG	2	6	29368	29373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
505	NC_018294	ACA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995051
506	NC_018294	CTC	2	6	29393	29398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995051
507	NC_018294	GCC	2	6	29418	29423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
508	NC_018294	GCC	3	9	29475	29483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995051
509	NC_018294	GTATCC	2	12	29558	29569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995051
510	NC_018294	GCG	2	6	29622	29627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
511	NC_018294	GCA	2	6	29689	29694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995051
512	NC_018294	GCG	2	6	29739	29744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995051
513	NC_018294	CG	3	6	29815	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	399995051
514	NC_018294	TGA	2	6	29857	29862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995051
515	NC_018294	GTG	2	6	29866	29871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995051
516	NC_018294	ATTC	2	8	30113	30120	25 %	50 %	0 %	25 %	399995051
517	NC_018294	GGTC	2	8	30318	30325	0 %	25 %	50 %	25 %	399995052
518	NC_018294	CGC	2	6	30354	30359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995052
519	NC_018294	CGGG	2	8	30382	30389	0 %	0 %	75 %	25 %	399995052
520	NC_018294	GCA	2	6	30457	30462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
521	NC_018294	CCGA	2	8	30494	30501	25 %	0 %	25 %	50 %	399995052
522	NC_018294	CAA	2	6	30537	30542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995052
523	NC_018294	CGA	2	6	30546	30551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
524	NC_018294	AGC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
525	NC_018294	GATGCA	2	12	30589	30600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995052
526	NC_018294	GCT	2	6	30675	30680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
527	NC_018294	CAGCA	2	10	30721	30730	40 %	0 %	20 %	40 %	399995052
528	NC_018294	ACC	2	6	30751	30756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995052
529	NC_018294	CGG	2	6	30836	30841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995052
530	NC_018294	TCG	2	6	30898	30903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
531	NC_018294	GCT	2	6	30987	30992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
532	NC_018294	GGC	2	6	31041	31046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995052
533	NC_018294	GGT	2	6	31059	31064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995052
534	NC_018294	AGC	2	6	31127	31132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
535	NC_018294	CAT	2	6	31236	31241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995052
536	NC_018294	TCG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
537	NC_018294	CCGG	2	8	31322	31329	0 %	0 %	50 %	50 %	399995052
538	NC_018294	GAC	2	6	31438	31443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
539	NC_018294	GGC	2	6	31471	31476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995052
540	NC_018294	GAC	2	6	31537	31542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995052
541	NC_018294	TGC	2	6	31548	31553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995052
542	NC_018294	CT	3	6	31929	31934	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
543	NC_018294	CTGT	2	8	31958	31965	0 %	50 %	25 %	25 %	399995053
544	NC_018294	GGC	2	6	31973	31978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995053
545	NC_018294	ACGG	2	8	31997	32004	25 %	0 %	50 %	25 %	399995053
546	NC_018294	T	6	6	32076	32081	0 %	100 %	0 %	0 %	399995053
547	NC_018294	TTCC	2	8	32141	32148	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
548	NC_018294	TTC	2	6	32157	32162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995053
549	NC_018294	TGG	2	6	32169	32174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995053
550	NC_018294	GAT	2	6	32262	32267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995053
551	NC_018294	GT	3	6	32286	32291	0 %	50 %	50 %	0 %	399995053
552	NC_018294	CGA	2	6	32315	32320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995053
553	NC_018294	CTAT	2	8	32386	32393	25 %	50 %	0 %	25 %	399995053
554	NC_018294	TGC	2	6	32525	32530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995053
555	NC_018294	GC	3	6	32581	32586	0 %	0 %	50 %	50 %	399995053
556	NC_018294	TCT	2	6	32621	32626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995053
557	NC_018294	TCG	2	6	32710	32715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995053
558	NC_018294	TCT	2	6	32723	32728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995053
559	NC_018294	TCC	2	6	32756	32761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995053
560	NC_018294	ACGC	2	8	32782	32789	25 %	0 %	25 %	50 %	399995053
561	NC_018294	CAA	2	6	32860	32865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995053
562	NC_018294	TGAA	2	8	32877	32884	50 %	25 %	25 %	0 %	399995053
563	NC_018294	CTG	2	6	33190	33195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995054
564	NC_018294	CGT	2	6	33229	33234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995054
565	NC_018294	TCA	2	6	33238	33243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995054
566	NC_018294	T	6	6	33301	33306	0 %	100 %	0 %	0 %	399995054
567	NC_018294	TGC	2	6	33341	33346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995054
568	NC_018294	GGCT	2	8	33542	33549	0 %	25 %	50 %	25 %	399995054
569	NC_018294	AG	3	6	33643	33648	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
570	NC_018294	GCAT	2	8	33656	33663	25 %	25 %	25 %	25 %	399995054
571	NC_018294	GCG	2	6	33742	33747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995054
572	NC_018294	GAT	2	6	33843	33848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995054
573	NC_018294	CAG	2	6	33853	33858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995054
574	NC_018294	ACA	2	6	33895	33900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995054
575	NC_018294	TCG	2	6	33914	33919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995054
576	NC_018294	TGGG	2	8	33955	33962	0 %	25 %	75 %	0 %	399995054
577	NC_018294	GAA	2	6	33973	33978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995054
578	NC_018294	CGC	2	6	33990	33995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995054
579	NC_018294	CGT	2	6	34008	34013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995054
580	NC_018294	CCA	2	6	34070	34075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995054
581	NC_018294	GA	3	6	34116	34121	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
582	NC_018294	CTTG	2	8	34123	34130	0 %	50 %	25 %	25 %	399995054
583	NC_018294	TC	3	6	34149	34154	0 %	50 %	0 %	50 %	399995054
584	NC_018294	GGC	2	6	34382	34387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995055
585	NC_018294	GGTG	2	8	34394	34401	0 %	25 %	75 %	0 %	399995055
586	NC_018294	CCT	2	6	34477	34482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995055
587	NC_018294	CTT	2	6	34503	34508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995055
588	NC_018294	AT	3	6	34527	34532	50 %	50 %	0 %	0 %	399995055
589	NC_018294	GCG	2	6	34542	34547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995055
590	NC_018294	CGT	2	6	34736	34741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995055
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592	NC_018294	G	7	7	34914	34920	0 %	0 %	100 %	0 %	399995055
593	NC_018294	GTT	2	6	34959	34964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995055
594	NC_018294	CGGA	2	8	35002	35009	25 %	0 %	50 %	25 %	399995055
595	NC_018294	CTCG	2	8	35069	35076	0 %	25 %	25 %	50 %	399995055
596	NC_018294	TTC	2	6	35246	35251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995056
597	NC_018294	GTC	2	6	35252	35257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995056
598	NC_018294	GCG	2	6	35297	35302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995056
599	NC_018294	CTC	2	6	35327	35332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995056
600	NC_018294	CGT	2	6	35338	35343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995056
601	NC_018294	TGA	2	6	35386	35391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995056
602	NC_018294	GCC	2	6	35510	35515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995057
603	NC_018294	TCG	2	6	35561	35566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995057
604	NC_018294	GAT	2	6	35653	35658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995057
605	NC_018294	TTCCAA	2	12	35721	35732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995057
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607	NC_018294	ATT	2	6	35758	35763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995057
608	NC_018294	TCC	2	6	35783	35788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995057
609	NC_018294	ATG	2	6	35802	35807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995057
610	NC_018294	CG	3	6	35927	35932	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
611	NC_018294	GC	3	6	35985	35990	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
612	NC_018294	GTCGC	2	10	36052	36061	0 %	20 %	40 %	40 %	399995057
613	NC_018294	CAG	2	6	36071	36076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995057
614	NC_018294	CTTC	2	8	36195	36202	0 %	50 %	0 %	50 %	399995057
615	NC_018294	TTC	2	6	36290	36295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995057
616	NC_018294	GTC	2	6	36352	36357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995057
617	NC_018294	GAA	2	6	36363	36368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995057
618	NC_018294	CGC	2	6	36385	36390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995057
619	NC_018294	GTC	2	6	36517	36522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995057
620	NC_018294	TGC	2	6	36567	36572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995057
621	NC_018294	GGC	2	6	36582	36587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995057
622	NC_018294	TCT	2	6	36609	36614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995057
623	NC_018294	GCA	2	6	36616	36621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995057
624	NC_018294	CTT	2	6	36631	36636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995057
625	NC_018294	CACC	2	8	36702	36709	25 %	0 %	0 %	75 %	399995057
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