MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 2851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018191	GAT	2	6	139	144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356093
2	NC_018191	TCA	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356093
3	NC_018191	AGC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356093
4	NC_018191	AAG	2	6	230	235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356093
5	NC_018191	TCA	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356093
6	NC_018191	ATG	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356093
7	NC_018191	TGC	2	6	337	342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
8	NC_018191	CGG	2	6	385	390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356094
9	NC_018191	TCT	2	6	433	438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356094
10	NC_018191	CCA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356094
11	NC_018191	TGC	2	6	478	483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
12	NC_018191	TGC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
13	NC_018191	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356094
14	NC_018191	TCC	2	6	607	612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356094
15	NC_018191	GCC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356094
16	NC_018191	AGC	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356094
17	NC_018191	TCT	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356094
18	NC_018191	GAT	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356094
19	NC_018191	TCG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356094
20	NC_018191	ATG	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356094
21	NC_018191	CAT	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
22	NC_018191	GCA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
23	NC_018191	TGT	2	6	1007	1012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
24	NC_018191	CGT	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356095
25	NC_018191	ATC	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
26	NC_018191	GGC	2	6	1106	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
27	NC_018191	CAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356095
28	NC_018191	CGG	2	6	1186	1191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
29	NC_018191	TTG	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
30	NC_018191	GAC	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
31	NC_018191	TGG	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356095
32	NC_018191	GAA	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356095
33	NC_018191	GCC	2	6	1598	1603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
34	NC_018191	GCC	2	6	1663	1668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
35	NC_018191	TAG	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356095
36	NC_018191	GGC	2	6	1698	1703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
37	NC_018191	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356095
38	NC_018191	ATC	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
39	NC_018191	CAG	2	6	1988	1993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
40	NC_018191	TCT	2	6	2050	2055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356095
41	NC_018191	GCA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
42	NC_018191	TTG	2	6	2185	2190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356095
43	NC_018191	GAC	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
44	NC_018191	GCC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356095
45	NC_018191	AAG	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356095
46	NC_018191	GCA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356095
47	NC_018191	ATC	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356095
48	NC_018191	GTC	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356095
49	NC_018191	CAG	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356096
50	NC_018191	CAC	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356096
51	NC_018191	CTT	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356096
52	NC_018191	CGT	2	6	2791	2796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356096
53	NC_018191	GCC	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356096
54	NC_018191	CGC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356096
55	NC_018191	ATC	2	6	2967	2972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356096
56	NC_018191	CTT	2	6	3076	3081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356097
57	NC_018191	GTG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356097
58	NC_018191	GTC	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356097
59	NC_018191	CGC	2	6	3130	3135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356097
60	NC_018191	GAC	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356097
61	NC_018191	AAC	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356097
62	NC_018191	CGC	3	9	3271	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356097
63	NC_018191	TGC	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356097
64	NC_018191	GAA	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356098
65	NC_018191	AAG	2	6	3593	3598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356098
66	NC_018191	CTT	2	6	3601	3606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356098
67	NC_018191	TGC	2	6	4268	4273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
68	NC_018191	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356099
69	NC_018191	GCC	2	6	4300	4305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356099
70	NC_018191	CTC	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356099
71	NC_018191	GAA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356099
72	NC_018191	CTG	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
73	NC_018191	AAG	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356099
74	NC_018191	TGG	2	6	4493	4498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356099
75	NC_018191	TTC	2	6	4655	4660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356099
76	NC_018191	GCC	2	6	4699	4704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356099
77	NC_018191	GAG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356099
78	NC_018191	TCG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
79	NC_018191	CGG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356099
80	NC_018191	GTC	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
81	NC_018191	TCG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356099
82	NC_018191	GAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356099
83	NC_018191	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356100
84	NC_018191	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356100
85	NC_018191	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356100
86	NC_018191	ACC	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356100
87	NC_018191	GCT	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356101
88	NC_018191	CCT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356101
89	NC_018191	TCG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356101
90	NC_018191	CGA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
91	NC_018191	CGA	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
92	NC_018191	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356101
93	NC_018191	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356101
94	NC_018191	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356101
95	NC_018191	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356101
96	NC_018191	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356101
97	NC_018191	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356102
98	NC_018191	CGA	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
99	NC_018191	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356102
100	NC_018191	GCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356102
101	NC_018191	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
102	NC_018191	CGC	2	6	6946	6951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356102
103	NC_018191	CAT	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356102
104	NC_018191	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356102
105	NC_018191	ACG	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356102
106	NC_018191	GAA	2	6	7396	7401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356102
107	NC_018191	CGC	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356102
108	NC_018191	CCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356102
109	NC_018191	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
110	NC_018191	GCC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
111	NC_018191	GAC	2	6	7749	7754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356103
112	NC_018191	CGC	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
113	NC_018191	GAT	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356103
114	NC_018191	GCC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
115	NC_018191	CGG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
116	NC_018191	GTC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356103
117	NC_018191	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356103
118	NC_018191	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
119	NC_018191	GGC	2	6	8292	8297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
120	NC_018191	GGC	2	6	8304	8309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
121	NC_018191	CGG	2	6	8336	8341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356103
122	NC_018191	ATC	2	6	8350	8355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356103
123	NC_018191	TCT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356103
124	NC_018191	TCA	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356103
125	NC_018191	GTC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356103
126	NC_018191	ACC	2	6	8484	8489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356104
127	NC_018191	CGC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356104
128	NC_018191	TGG	2	6	8565	8570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356104
129	NC_018191	CCT	2	6	8699	8704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356104
130	NC_018191	GTC	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356104
131	NC_018191	TTC	2	6	8737	8742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356104
132	NC_018191	TGG	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356104
133	NC_018191	GGA	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356104
134	NC_018191	GCG	2	6	9178	9183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356104
135	NC_018191	GAG	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356105
136	NC_018191	TCA	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356105
137	NC_018191	CGT	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356105
138	NC_018191	CTT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356105
139	NC_018191	GAT	2	6	9673	9678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356105
140	NC_018191	CCT	2	6	9762	9767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356105
141	NC_018191	GCC	2	6	9797	9802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356105
142	NC_018191	CTT	2	6	9850	9855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356105
143	NC_018191	GAA	2	6	10085	10090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356107
144	NC_018191	GGT	2	6	10111	10116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356107
145	NC_018191	CCT	2	6	10150	10155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356107
146	NC_018191	CCG	2	6	10181	10186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356108
147	NC_018191	GGC	2	6	10226	10231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356108
148	NC_018191	CTT	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356108
149	NC_018191	ACA	2	6	10439	10444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356108
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152	NC_018191	TCG	2	6	10761	10766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356108
153	NC_018191	ATG	2	6	10842	10847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356108
154	NC_018191	GCC	2	6	10898	10903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356108
155	NC_018191	GGC	2	6	10967	10972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356108
156	NC_018191	GGC	2	6	10979	10984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356108
157	NC_018191	ATC	2	6	10985	10990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356108
158	NC_018191	CTC	2	6	11039	11044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356108
159	NC_018191	CGA	2	6	11080	11085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356108
160	NC_018191	CGC	2	6	11113	11118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356108
161	NC_018191	CGA	2	6	11119	11124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356108
162	NC_018191	ACG	2	6	11148	11153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356108
163	NC_018191	GCA	2	6	11170	11175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356108
164	NC_018191	ACC	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356108
165	NC_018191	GCC	2	6	11299	11304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356108
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169	NC_018191	GGT	2	6	11455	11460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356108
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234	NC_018191	CAT	2	6	16972	16977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356118
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242	NC_018191	CGA	2	6	17428	17433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356118
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250	NC_018191	TCT	2	6	17945	17950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356119
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252	NC_018191	TGG	2	6	18035	18040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356119
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254	NC_018191	CGC	2	6	18222	18227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356119
255	NC_018191	GCG	3	9	18283	18291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356119
256	NC_018191	CGC	2	6	18292	18297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356119
257	NC_018191	GAA	2	6	18420	18425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356119
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259	NC_018191	GAC	2	6	18484	18489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356119
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262	NC_018191	CGC	2	6	18624	18629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356120
263	NC_018191	GGC	2	6	18723	18728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356120
264	NC_018191	CCG	2	6	18754	18759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356120
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279	NC_018191	GCG	2	6	19498	19503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356120
280	NC_018191	CGC	2	6	19568	19573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356120
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283	NC_018191	TCG	2	6	19707	19712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356121
284	NC_018191	CAT	2	6	19756	19761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356121
285	NC_018191	AGC	2	6	19767	19772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356121
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287	NC_018191	GAC	2	6	19864	19869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356121
288	NC_018191	GCC	3	9	19976	19984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356121
289	NC_018191	CAT	2	6	20026	20031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356121
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292	NC_018191	TGA	2	6	20259	20264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356121
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297	NC_018191	CTC	2	6	21333	21338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356123
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300	NC_018191	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356124
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372	NC_018191	ATA	2	6	28504	28509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356132
373	NC_018191	TCC	2	6	28523	28528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
374	NC_018191	TCC	2	6	28532	28537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
375	NC_018191	TTC	2	6	28589	28594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356132
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