MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018191	AGTGC	2	10	185582	185591	20 %	20 %	40 %	20 %	398356289
3502	NC_018191	ATC	2	6	185772	185777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356290
3503	NC_018191	GGCC	2	8	185778	185785	0 %	0 %	50 %	50 %	398356290
3504	NC_018191	T	6	6	185788	185793	0 %	100 %	0 %	0 %	398356290
3505	NC_018191	CCGG	2	8	185799	185806	0 %	0 %	50 %	50 %	398356290
3506	NC_018191	AGA	2	6	186171	186176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356291
3507	NC_018191	CTT	2	6	186187	186192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356291
3508	NC_018191	CTT	3	9	186217	186225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356291
3509	NC_018191	GAATT	2	10	186284	186293	40 %	40 %	20 %	0 %	398356291
3510	NC_018191	TA	3	6	186315	186320	50 %	50 %	0 %	0 %	398356291
3511	NC_018191	GC	3	6	186453	186458	0 %	0 %	50 %	50 %	398356291
3512	NC_018191	GATCTT	2	12	186472	186483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	398356291
3513	NC_018191	CGA	2	6	186501	186506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356291
3514	NC_018191	CCA	2	6	186519	186524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356291
3515	NC_018191	TGG	2	6	186689	186694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356292
3516	NC_018191	GC	4	8	186730	186737	0 %	0 %	50 %	50 %	398356292
3517	NC_018191	CGT	2	6	186744	186749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356292
3518	NC_018191	GGA	2	6	186761	186766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356292
3519	NC_018191	AGCTTC	2	12	186817	186828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356292
3520	NC_018191	TCGC	2	8	186829	186836	0 %	25 %	25 %	50 %	398356292
3521	NC_018191	GGC	2	6	186869	186874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356292
3522	NC_018191	AGA	2	6	186882	186887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356292
3523	NC_018191	GAG	2	6	187012	187017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356292
3524	NC_018191	GCG	2	6	187118	187123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356293
3525	NC_018191	GCG	2	6	187187	187192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356293
3526	NC_018191	AGC	2	6	187210	187215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356293
3527	NC_018191	ACC	2	6	187219	187224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356293
3528	NC_018191	TGC	2	6	187268	187273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356293
3529	NC_018191	CGG	2	6	187598	187603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356293
3530	NC_018191	CTT	2	6	187626	187631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356293
3531	NC_018191	CGA	2	6	187646	187651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356293
3532	NC_018191	GGCC	2	8	187653	187660	0 %	0 %	50 %	50 %	398356293
3533	NC_018191	TTC	2	6	187663	187668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356293
3534	NC_018191	TTG	2	6	187696	187701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356293
3535	NC_018191	TGT	2	6	187730	187735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356293
3536	NC_018191	CGAG	2	8	187859	187866	25 %	0 %	50 %	25 %	398356293
3537	NC_018191	ATC	2	6	187876	187881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356293
3538	NC_018191	CG	3	6	187902	187907	0 %	0 %	50 %	50 %	398356293
3539	NC_018191	GGC	2	6	188034	188039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356293
3540	NC_018191	CCA	2	6	188042	188047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356293
3541	NC_018191	GGC	2	6	188055	188060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356293
3542	NC_018191	CGAC	2	8	188114	188121	25 %	0 %	25 %	50 %	398356293
3543	NC_018191	CGCT	2	8	188164	188171	0 %	25 %	25 %	50 %	398356293
3544	NC_018191	TCG	2	6	188176	188181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356293
3545	NC_018191	GC	3	6	188237	188242	0 %	0 %	50 %	50 %	398356294
3546	NC_018191	GCG	3	9	188292	188300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356294
3547	NC_018191	CGC	2	6	188304	188309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356294
3548	NC_018191	GC	3	6	188356	188361	0 %	0 %	50 %	50 %	398356294
3549	NC_018191	A	6	6	188461	188466	100 %	0 %	0 %	0 %	398356295
3550	NC_018191	TTC	2	6	188505	188510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356295
3551	NC_018191	CG	3	6	188534	188539	0 %	0 %	50 %	50 %	398356295
3552	NC_018191	GTC	2	6	188641	188646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356296
3553	NC_018191	CGA	2	6	188667	188672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356296
3554	NC_018191	GC	3	6	188786	188791	0 %	0 %	50 %	50 %	398356296
3555	NC_018191	GGC	2	6	188806	188811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356296
3556	NC_018191	CGG	2	6	188853	188858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356296
3557	NC_018191	CAC	2	6	188871	188876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356296
3558	NC_018191	GGT	2	6	188883	188888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356296
3559	NC_018191	TCTTT	2	10	188910	188919	0 %	80 %	0 %	20 %	398356296
3560	NC_018191	TCG	2	6	188963	188968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356296
3561	NC_018191	GAG	2	6	189004	189009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356296
3562	NC_018191	GGC	2	6	189022	189027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356296
3563	NC_018191	CGT	2	6	189036	189041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356296
3564	NC_018191	GGC	2	6	189090	189095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356296
3565	NC_018191	CCG	2	6	189126	189131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356296
3566	NC_018191	GGC	2	6	189134	189139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356296
3567	NC_018191	TGC	2	6	189203	189208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356296
3568	NC_018191	GTCG	2	8	189235	189242	0 %	25 %	50 %	25 %	398356296
3569	NC_018191	GC	3	6	189244	189249	0 %	0 %	50 %	50 %	398356296
3570	NC_018191	TGGC	2	8	189250	189257	0 %	25 %	50 %	25 %	398356296
3571	NC_018191	GAGG	2	8	189283	189290	25 %	0 %	75 %	0 %	398356296
3572	NC_018191	TCA	2	6	189296	189301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356296
3573	NC_018191	TCTT	2	8	189333	189340	0 %	75 %	0 %	25 %	398356296
3574	NC_018191	CCGA	2	8	189350	189357	25 %	0 %	25 %	50 %	398356296
3575	NC_018191	CGC	2	6	189396	189401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3576	NC_018191	TGG	2	6	189402	189407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356297
3577	NC_018191	CGC	2	6	189439	189444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3578	NC_018191	GCCG	2	8	189487	189494	0 %	0 %	50 %	50 %	398356297
3579	NC_018191	TGA	2	6	189525	189530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356297
3580	NC_018191	CGG	2	6	189543	189548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3581	NC_018191	CGT	2	6	189604	189609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356297
3582	NC_018191	TCC	2	6	189619	189624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356297
3583	NC_018191	ATC	2	6	189632	189637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356297
3584	NC_018191	ATC	2	6	189657	189662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356297
3585	NC_018191	GCG	2	6	189734	189739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3586	NC_018191	GCG	2	6	189758	189763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3587	NC_018191	CAC	2	6	189778	189783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356297
3588	NC_018191	CTC	2	6	189847	189852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356297
3589	NC_018191	CGG	2	6	189864	189869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3590	NC_018191	CGC	2	6	189919	189924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3591	NC_018191	GCCGA	2	10	190001	190010	20 %	0 %	40 %	40 %	398356297
3592	NC_018191	CGATC	2	10	190012	190021	20 %	20 %	20 %	40 %	398356297
3593	NC_018191	TCG	2	6	190035	190040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356297
3594	NC_018191	GCCGA	2	10	190058	190067	20 %	0 %	40 %	40 %	398356297
3595	NC_018191	GCC	2	6	190101	190106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3596	NC_018191	GCG	2	6	190153	190158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3597	NC_018191	ACA	2	6	190185	190190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356297
3598	NC_018191	CGT	2	6	190353	190358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356297
3599	NC_018191	GAA	2	6	190367	190372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356297
3600	NC_018191	CGC	2	6	190389	190394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3601	NC_018191	CGG	2	6	190417	190422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3602	NC_018191	CGG	3	9	190494	190502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3603	NC_018191	GCC	2	6	190537	190542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356297
3604	NC_018191	GCG	3	9	190627	190635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356297
3605	NC_018191	GC	3	6	190642	190647	0 %	0 %	50 %	50 %	398356297
3606	NC_018191	GTG	2	6	190675	190680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356297
3607	NC_018191	ACT	2	6	190713	190718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356297
3608	NC_018191	TCG	2	6	190719	190724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356297
3609	NC_018191	GAT	2	6	190730	190735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356297
3610	NC_018191	CAC	2	6	190851	190856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356298
3611	NC_018191	TCC	2	6	190868	190873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356298
3612	NC_018191	GCG	2	6	190874	190879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356298
3613	NC_018191	CGG	2	6	190886	190891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356298
3614	NC_018191	GGCA	2	8	190959	190966	25 %	0 %	50 %	25 %	398356298
3615	NC_018191	CG	4	8	190988	190995	0 %	0 %	50 %	50 %	398356298
3616	NC_018191	CCGA	2	8	191062	191069	25 %	0 %	25 %	50 %	398356298
3617	NC_018191	GTGC	2	8	191136	191143	0 %	25 %	50 %	25 %	398356298
3618	NC_018191	GAC	2	6	191152	191157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356298
3619	NC_018191	GAC	2	6	191209	191214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356298
3620	NC_018191	CTGC	2	8	191277	191284	0 %	25 %	25 %	50 %	398356298
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3622	NC_018191	ATG	2	6	191366	191371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356298
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3763	NC_018191	CGAT	2	8	199001	199008	25 %	25 %	25 %	25 %	398356303
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3855	NC_018191	TCT	2	6	204313	204318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356310
3856	NC_018191	CTCAC	2	10	204619	204628	20 %	20 %	0 %	60 %	398356311
3857	NC_018191	GCC	2	6	204652	204657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356311
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3859	NC_018191	GCCC	2	8	204712	204719	0 %	0 %	25 %	75 %	398356311
3860	NC_018191	CAT	2	6	204820	204825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356312
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3984	NC_018191	TCG	2	6	209639	209644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313
3985	NC_018191	TCG	2	6	209669	209674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356313

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