MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018191	CTG	2	6	160579	160584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3002	NC_018191	CGA	2	6	160623	160628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3003	NC_018191	CGG	2	6	160643	160648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356271
3004	NC_018191	TCC	2	6	160739	160744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356271
3005	NC_018191	GCC	2	6	160833	160838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356271
3006	NC_018191	CGAC	2	8	160853	160860	25 %	0 %	25 %	50 %	398356271
3007	NC_018191	CTCCG	2	10	160864	160873	0 %	20 %	20 %	60 %	398356271
3008	NC_018191	CGC	2	6	160890	160895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356271
3009	NC_018191	CGT	2	6	160901	160906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3010	NC_018191	GGA	2	6	160972	160977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356271
3011	NC_018191	GAT	2	6	160996	161001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356271
3012	NC_018191	CGC	2	6	161028	161033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356271
3013	NC_018191	CG	3	6	161102	161107	0 %	0 %	50 %	50 %	398356271
3014	NC_018191	GACGAG	2	12	161140	161151	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398356271
3015	NC_018191	GAA	2	6	161158	161163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356271
3016	NC_018191	GCG	2	6	161168	161173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356271
3017	NC_018191	TGC	2	6	161174	161179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3018	NC_018191	CGG	2	6	161198	161203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356271
3019	NC_018191	TGC	2	6	161204	161209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3020	NC_018191	TCGG	2	8	161270	161277	0 %	25 %	50 %	25 %	398356271
3021	NC_018191	CTG	2	6	161278	161283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3022	NC_018191	CAG	2	6	161318	161323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3023	NC_018191	ATCGCG	2	12	161381	161392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3024	NC_018191	GCT	2	6	161400	161405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3025	NC_018191	GCTGGC	2	12	161463	161474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	398356271
3026	NC_018191	GAT	2	6	161481	161486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356271
3027	NC_018191	TCG	2	6	161515	161520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356271
3028	NC_018191	GTG	2	6	161575	161580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356271
3029	NC_018191	CGC	2	6	161600	161605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356271
3030	NC_018191	GGC	2	6	161607	161612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356271
3031	NC_018191	GCG	2	6	161613	161618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356271
3032	NC_018191	AGG	2	6	161653	161658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356271
3033	NC_018191	AAG	2	6	161840	161845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356272
3034	NC_018191	TCC	2	6	161854	161859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356272
3035	NC_018191	CGC	2	6	161912	161917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356272
3036	NC_018191	CGG	2	6	161948	161953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356272
3037	NC_018191	GAA	2	6	161988	161993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356272
3038	NC_018191	CG	3	6	162006	162011	0 %	0 %	50 %	50 %	398356272
3039	NC_018191	TGTGGA	2	12	162146	162157	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	398356272
3040	NC_018191	CGA	2	6	162225	162230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356272
3041	NC_018191	TGC	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356272
3042	NC_018191	CG	3	6	162252	162257	0 %	0 %	50 %	50 %	398356272
3043	NC_018191	GCTC	2	8	162383	162390	0 %	25 %	25 %	50 %	398356272
3044	NC_018191	GCC	2	6	162416	162421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356272
3045	NC_018191	GCG	2	6	162425	162430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356272
3046	NC_018191	GC	4	8	162506	162513	0 %	0 %	50 %	50 %	398356272
3047	NC_018191	CGG	2	6	162569	162574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3048	NC_018191	AGA	2	6	162643	162648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356273
3049	NC_018191	GCCA	2	8	162711	162718	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3050	NC_018191	TCG	2	6	162735	162740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3051	NC_018191	AGG	2	6	162764	162769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356273
3052	NC_018191	GCC	2	6	162824	162829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3053	NC_018191	GC	3	6	162851	162856	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3054	NC_018191	GCG	2	6	162864	162869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3055	NC_018191	TCG	2	6	162915	162920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3056	NC_018191	CCAG	2	8	162925	162932	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3057	NC_018191	CGC	2	6	162980	162985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3058	NC_018191	CAT	2	6	163031	163036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3059	NC_018191	CCG	2	6	163060	163065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3060	NC_018191	GCC	3	9	163070	163078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3061	NC_018191	GCG	2	6	163112	163117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3062	NC_018191	GC	3	6	163173	163178	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3063	NC_018191	CAG	2	6	163292	163297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3064	NC_018191	CGA	2	6	163324	163329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3065	NC_018191	TCG	2	6	163332	163337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3066	NC_018191	GCC	2	6	163353	163358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3067	NC_018191	TCA	2	6	163389	163394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3068	NC_018191	GA	3	6	163410	163415	50 %	0 %	50 %	0 %	398356273
3069	NC_018191	CGCGT	2	10	163450	163459	0 %	20 %	40 %	40 %	398356273
3070	NC_018191	GTG	2	6	163467	163472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356273
3071	NC_018191	CTT	2	6	163508	163513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3072	NC_018191	GTCCTC	2	12	163529	163540	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	398356273
3073	NC_018191	CG	3	6	163604	163609	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3074	NC_018191	CGA	2	6	163660	163665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3075	NC_018191	CTC	2	6	163679	163684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3076	NC_018191	TTC	2	6	163694	163699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3077	NC_018191	CGC	2	6	163708	163713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356273
3078	NC_018191	TCG	3	9	163722	163730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3079	NC_018191	CGG	3	9	163750	163758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3080	NC_018191	CTT	2	6	163780	163785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3081	NC_018191	CGT	2	6	163834	163839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3082	NC_018191	CGA	2	6	163885	163890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3083	NC_018191	ACATG	2	10	163978	163987	40 %	20 %	20 %	20 %	398356273
3084	NC_018191	TCGACG	2	12	164001	164012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3085	NC_018191	CTC	2	6	164048	164053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3086	NC_018191	TCT	2	6	164062	164067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356273
3087	NC_018191	CGG	2	6	164101	164106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3088	NC_018191	CGA	2	6	164143	164148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3089	NC_018191	CAG	2	6	164171	164176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3090	NC_018191	GCCG	2	8	164209	164216	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3091	NC_018191	TGG	2	6	164217	164222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356273
3092	NC_018191	AGGC	2	8	164241	164248	25 %	0 %	50 %	25 %	398356273
3093	NC_018191	CGG	2	6	164251	164256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3094	NC_018191	TCC	2	6	164316	164321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356273
3095	NC_018191	CAT	2	6	164539	164544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3096	NC_018191	GTCGAG	2	12	164546	164557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	398356273
3097	NC_018191	GC	3	6	164590	164595	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3098	NC_018191	TCG	2	6	164646	164651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3099	NC_018191	GA	3	6	164706	164711	50 %	0 %	50 %	0 %	398356273
3100	NC_018191	CGG	2	6	164721	164726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356273
3101	NC_018191	CTG	2	6	164728	164733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3102	NC_018191	CCGC	2	8	164737	164744	0 %	0 %	25 %	75 %	398356273
3103	NC_018191	CGCT	2	8	164784	164791	0 %	25 %	25 %	50 %	398356273
3104	NC_018191	TCG	2	6	164811	164816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3105	NC_018191	CGT	2	6	164833	164838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3106	NC_018191	ATG	2	6	164892	164897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356273
3107	NC_018191	TCA	2	6	164922	164927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356273
3108	NC_018191	CCGA	2	8	164928	164935	25 %	0 %	25 %	50 %	398356273
3109	NC_018191	GAG	2	6	164958	164963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356273
3110	NC_018191	GC	3	6	165024	165029	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3111	NC_018191	GC	3	6	165053	165058	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3112	NC_018191	CGA	2	6	165059	165064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3113	NC_018191	CGA	2	6	165124	165129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3114	NC_018191	TCG	2	6	165135	165140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3115	NC_018191	GC	3	6	165206	165211	0 %	0 %	50 %	50 %	398356273
3116	NC_018191	CGA	2	6	165218	165223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3117	NC_018191	CGGTT	2	10	165272	165281	0 %	40 %	40 %	20 %	398356273
3118	NC_018191	TGC	2	6	165303	165308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3119	NC_018191	GTC	2	6	165314	165319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3120	NC_018191	CCA	2	6	165347	165352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356273
3121	NC_018191	TCG	2	6	165493	165498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
3122	NC_018191	TCG	2	6	165507	165512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
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3125	NC_018191	GTC	2	6	165662	165667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356273
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3152	NC_018191	AGC	2	6	166927	166932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356275
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3230	NC_018191	ACG	2	6	170973	170978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356279
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3236	NC_018191	ACG	3	9	171236	171244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356279
3237	NC_018191	CGAG	2	8	171426	171433	25 %	0 %	50 %	25 %	398356279
3238	NC_018191	GGC	3	9	171440	171448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356279
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3240	NC_018191	GAC	2	6	171499	171504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356279
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3349	NC_018191	ACTCGA	2	12	177664	177675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	398356282
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3362	NC_018191	CAT	2	6	178324	178329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356282
3363	NC_018191	GGT	2	6	178582	178587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356282
3364	NC_018191	TGC	2	6	178625	178630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356282
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3473	NC_018191	CAT	2	6	184526	184531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356289
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3478	NC_018191	GC	3	6	184641	184646	0 %	0 %	50 %	50 %	398356289
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3481	NC_018191	CG	3	6	184899	184904	0 %	0 %	50 %	50 %	398356289
3482	NC_018191	GAT	2	6	184916	184921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356289
3483	NC_018191	AGCC	2	8	184925	184932	25 %	0 %	25 %	50 %	398356289
3484	NC_018191	GC	3	6	184942	184947	0 %	0 %	50 %	50 %	398356289
3485	NC_018191	TCGTCA	2	12	184987	184998	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398356289
3486	NC_018191	TCC	2	6	185087	185092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356289
3487	NC_018191	CGG	2	6	185113	185118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356289
3488	NC_018191	AAGG	2	8	185166	185173	50 %	0 %	50 %	0 %	398356289
3489	NC_018191	GAT	2	6	185214	185219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356289
3490	NC_018191	GAC	2	6	185286	185291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356289
3491	NC_018191	CCG	2	6	185354	185359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356289
3492	NC_018191	CGC	3	9	185370	185378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356289
3493	NC_018191	GAC	2	6	185379	185384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356289
3494	NC_018191	CGA	2	6	185392	185397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356289
3495	NC_018191	GGAC	2	8	185399	185406	25 %	0 %	50 %	25 %	398356289
3496	NC_018191	GTC	2	6	185425	185430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356289
3497	NC_018191	CAAC	2	8	185459	185466	50 %	0 %	0 %	50 %	398356289
3498	NC_018191	CGC	2	6	185470	185475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356289
3499	NC_018191	CAA	2	6	185481	185486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356289
3500	NC_018191	AAGGA	2	10	185533	185542	60 %	0 %	40 %	0 %	398356289

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