MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018191	CGG	2	6	134504	134509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356239
2502	NC_018191	CAT	2	6	134544	134549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2503	NC_018191	GCC	2	6	134562	134567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356239
2504	NC_018191	GC	3	6	134575	134580	0 %	0 %	50 %	50 %	398356239
2505	NC_018191	CCT	2	6	134609	134614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356239
2506	NC_018191	CAT	2	6	134679	134684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2507	NC_018191	GCC	2	6	134727	134732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356239
2508	NC_018191	CAT	2	6	134733	134738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2509	NC_018191	CCG	2	6	134755	134760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356239
2510	NC_018191	CAT	2	6	134763	134768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2511	NC_018191	CAT	2	6	134772	134777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2512	NC_018191	CAT	2	6	134784	134789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2513	NC_018191	CAT	2	6	134799	134804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2514	NC_018191	GCG	2	6	134833	134838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356239
2515	NC_018191	CCG	2	6	134843	134848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356239
2516	NC_018191	CTT	2	6	134858	134863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356239
2517	NC_018191	AAGCAT	2	12	134925	134936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	398356239
2518	NC_018191	CAG	2	6	134946	134951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356239
2519	NC_018191	GCG	2	6	135079	135084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356240
2520	NC_018191	CAT	2	6	135146	135151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356240
2521	NC_018191	GCTT	2	8	135161	135168	0 %	50 %	25 %	25 %	398356240
2522	NC_018191	CGA	2	6	135170	135175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2523	NC_018191	CGC	2	6	135195	135200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2524	NC_018191	GCGA	2	8	135202	135209	25 %	0 %	50 %	25 %	398356240
2525	NC_018191	ACC	2	6	135223	135228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356240
2526	NC_018191	TCC	2	6	135298	135303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356240
2527	NC_018191	CATGGA	2	12	135311	135322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	398356240
2528	NC_018191	GCG	2	6	135339	135344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356240
2529	NC_018191	GTCG	2	8	135402	135409	0 %	25 %	50 %	25 %	398356240
2530	NC_018191	GCTG	2	8	135452	135459	0 %	25 %	50 %	25 %	398356240
2531	NC_018191	CGA	2	6	135482	135487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2532	NC_018191	GAC	2	6	135492	135497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2533	NC_018191	ATC	2	6	135532	135537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356240
2534	NC_018191	ACC	2	6	135583	135588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356240
2535	NC_018191	TCCA	2	8	135670	135677	25 %	25 %	0 %	50 %	398356240
2536	NC_018191	CGA	2	6	135701	135706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2537	NC_018191	CTC	2	6	135727	135732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356240
2538	NC_018191	ACC	2	6	135745	135750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356240
2539	NC_018191	GA	3	6	135751	135756	50 %	0 %	50 %	0 %	398356240
2540	NC_018191	CGG	2	6	135771	135776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356240
2541	NC_018191	AGAT	2	8	135778	135785	50 %	25 %	25 %	0 %	398356240
2542	NC_018191	GAT	2	6	135789	135794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356240
2543	NC_018191	CTT	2	6	135801	135806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356240
2544	NC_018191	GCC	2	6	135863	135868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2545	NC_018191	CAG	2	6	135882	135887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2546	NC_018191	CGA	2	6	135971	135976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2547	NC_018191	GAA	2	6	136002	136007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356240
2548	NC_018191	CAG	2	6	136023	136028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2549	NC_018191	CCAG	2	8	136037	136044	25 %	0 %	25 %	50 %	398356240
2550	NC_018191	GACG	2	8	136152	136159	25 %	0 %	50 %	25 %	398356240
2551	NC_018191	TCG	2	6	136180	136185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2552	NC_018191	GAG	2	6	136338	136343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356240
2553	NC_018191	GCC	2	6	136347	136352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2554	NC_018191	GCG	2	6	136377	136382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356240
2555	NC_018191	TTG	2	6	136552	136557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356240
2556	NC_018191	CG	3	6	136568	136573	0 %	0 %	50 %	50 %	398356240
2557	NC_018191	GAT	2	6	136602	136607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356240
2558	NC_018191	CAGG	2	8	136615	136622	25 %	0 %	50 %	25 %	398356240
2559	NC_018191	GCC	2	6	136696	136701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2560	NC_018191	CGA	2	6	136736	136741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2561	NC_018191	GTAGCC	2	12	136752	136763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2562	NC_018191	TCG	2	6	136901	136906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2563	NC_018191	CGA	2	6	136937	136942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356240
2564	NC_018191	GCAG	2	8	136944	136951	25 %	0 %	50 %	25 %	398356240
2565	NC_018191	TCAGG	2	10	136955	136964	20 %	20 %	40 %	20 %	398356240
2566	NC_018191	GCAT	2	8	136987	136994	25 %	25 %	25 %	25 %	398356240
2567	NC_018191	CGC	2	6	137012	137017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2568	NC_018191	GCC	2	6	137044	137049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356240
2569	NC_018191	TCC	2	6	137113	137118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356240
2570	NC_018191	AGGGC	2	10	137173	137182	20 %	0 %	60 %	20 %	398356240
2571	NC_018191	CCCGG	2	10	137191	137200	0 %	0 %	40 %	60 %	398356240
2572	NC_018191	AGAT	2	8	137353	137360	50 %	25 %	25 %	0 %	398356240
2573	NC_018191	CCGA	2	8	137365	137372	25 %	0 %	25 %	50 %	398356240
2574	NC_018191	GCG	2	6	137383	137388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356240
2575	NC_018191	GAT	2	6	137486	137491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356241
2576	NC_018191	ATC	2	6	137523	137528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356241
2577	NC_018191	GGC	2	6	137535	137540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356241
2578	NC_018191	CGGA	2	8	137570	137577	25 %	0 %	50 %	25 %	398356241
2579	NC_018191	TGG	2	6	137611	137616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356241
2580	NC_018191	ATA	2	6	137672	137677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356242
2581	NC_018191	C	6	6	137696	137701	0 %	0 %	0 %	100 %	398356242
2582	NC_018191	GCC	2	6	137732	137737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356242
2583	NC_018191	CGCTT	2	10	137746	137755	0 %	40 %	20 %	40 %	398356242
2584	NC_018191	CGC	2	6	137855	137860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356242
2585	NC_018191	CGG	2	6	137895	137900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356242
2586	NC_018191	GAA	2	6	137913	137918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356242
2587	NC_018191	ATG	2	6	137933	137938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356242
2588	NC_018191	TCA	2	6	138026	138031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356242
2589	NC_018191	GAC	2	6	138037	138042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2590	NC_018191	TCA	2	6	138051	138056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356242
2591	NC_018191	TGC	2	6	138130	138135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2592	NC_018191	CGC	2	6	138152	138157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356242
2593	NC_018191	CCAA	2	8	138182	138189	50 %	0 %	0 %	50 %	398356242
2594	NC_018191	GTC	3	9	138196	138204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2595	NC_018191	GCA	2	6	138248	138253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356242
2596	NC_018191	CTT	2	6	138289	138294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356242
2597	NC_018191	ATG	2	6	138299	138304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356242
2598	NC_018191	GCATC	2	10	138315	138324	20 %	20 %	20 %	40 %	398356242
2599	NC_018191	GCA	2	6	138343	138348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356243
2600	NC_018191	GGC	2	6	138393	138398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356243
2601	NC_018191	CCT	2	6	138443	138448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356243
2602	NC_018191	GA	3	6	138519	138524	50 %	0 %	50 %	0 %	398356244
2603	NC_018191	CCGT	2	8	138552	138559	0 %	25 %	25 %	50 %	398356244
2604	NC_018191	CGC	2	6	138620	138625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356244
2605	NC_018191	GAG	2	6	138641	138646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356244
2606	NC_018191	GTT	2	6	138693	138698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356245
2607	NC_018191	GC	3	6	138702	138707	0 %	0 %	50 %	50 %	398356245
2608	NC_018191	TCGG	2	8	138713	138720	0 %	25 %	50 %	25 %	398356245
2609	NC_018191	GGC	2	6	138724	138729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356245
2610	NC_018191	CTG	2	6	138735	138740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356245
2611	NC_018191	CTC	2	6	138744	138749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356245
2612	NC_018191	CTC	2	6	138955	138960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356246
2613	NC_018191	ACG	2	6	138995	139000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356246
2614	NC_018191	CGT	2	6	139057	139062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356246
2615	NC_018191	CGA	2	6	139101	139106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356246
2616	NC_018191	GGCC	2	8	139139	139146	0 %	0 %	50 %	50 %	398356246
2617	NC_018191	GAG	2	6	139172	139177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356246
2618	NC_018191	TGC	2	6	139186	139191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356246
2619	NC_018191	CGTC	2	8	139194	139201	0 %	25 %	25 %	50 %	398356246
2620	NC_018191	TCA	3	9	139242	139250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356246
2621	NC_018191	ATCA	2	8	139280	139287	50 %	25 %	0 %	25 %	398356246
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2739	NC_018191	CG	3	6	145641	145646	0 %	0 %	50 %	50 %	398356253
2740	NC_018191	GCG	2	6	145671	145676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356253
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