MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_018191	CG	4	8	109626	109633	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2003	NC_018191	GCT	2	6	109639	109644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356216
2004	NC_018191	ATCAG	2	10	109676	109685	40 %	20 %	20 %	20 %	398356216
2005	NC_018191	GGC	2	6	109693	109698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356216
2006	NC_018191	CTC	2	6	109713	109718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356216
2007	NC_018191	TCA	2	6	109933	109938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
2008	NC_018191	ATC	2	6	110006	110011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
2009	NC_018191	GGC	2	6	110023	110028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2010	NC_018191	ACG	2	6	110067	110072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2011	NC_018191	GCT	2	6	110088	110093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2012	NC_018191	TTG	2	6	110136	110141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356217
2013	NC_018191	CG	3	6	110196	110201	0 %	0 %	50 %	50 %	398356217
2014	NC_018191	GGT	2	6	110206	110211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356217
2015	NC_018191	CGG	2	6	110217	110222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2016	NC_018191	TGC	2	6	110263	110268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2017	NC_018191	CAT	2	6	110287	110292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356217
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2020	NC_018191	CTG	2	6	110507	110512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
2021	NC_018191	CGG	2	6	110583	110588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2022	NC_018191	GCC	2	6	110594	110599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356217
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2025	NC_018191	CGACG	2	10	110761	110770	20 %	0 %	40 %	40 %	398356217
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2032	NC_018191	GCG	2	6	110996	111001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356217
2033	NC_018191	TCG	2	6	111009	111014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356217
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2042	NC_018191	GGA	2	6	111457	111462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356217
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2055	NC_018191	GAT	2	6	111934	111939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356217
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2057	NC_018191	CG	3	6	112045	112050	0 %	0 %	50 %	50 %	398356217
2058	NC_018191	CGCT	2	8	112113	112120	0 %	25 %	25 %	50 %	398356217
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2071	NC_018191	GAC	3	9	112977	112985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356218
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2093	NC_018191	CGA	3	9	114090	114098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356220
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2107	NC_018191	ACG	2	6	114773	114778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356221
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2110	NC_018191	GCAT	2	8	114845	114852	25 %	25 %	25 %	25 %	398356221
2111	NC_018191	CT	4	8	114856	114863	0 %	50 %	0 %	50 %	398356221
2112	NC_018191	CA	3	6	114956	114961	50 %	0 %	0 %	50 %	398356221
2113	NC_018191	GC	3	6	114971	114976	0 %	0 %	50 %	50 %	398356221
2114	NC_018191	TCT	2	6	114987	114992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356221
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2118	NC_018191	AGGA	2	8	115283	115290	50 %	0 %	50 %	0 %	398356222
2119	NC_018191	AC	3	6	115435	115440	50 %	0 %	0 %	50 %	398356222
2120	NC_018191	CG	3	6	115475	115480	0 %	0 %	50 %	50 %	398356222
2121	NC_018191	AAG	2	6	115517	115522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356222
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2123	NC_018191	GGCAT	2	10	115758	115767	20 %	20 %	40 %	20 %	398356222
2124	NC_018191	AG	3	6	115769	115774	50 %	0 %	50 %	0 %	398356222
2125	NC_018191	GAGC	2	8	115886	115893	25 %	0 %	50 %	25 %	398356222
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2244	NC_018191	CCG	3	9	121633	121641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356226
2245	NC_018191	TAT	2	6	121712	121717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398356226
2246	NC_018191	TCA	2	6	121730	121735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356226
2247	NC_018191	AAG	2	6	121782	121787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356226
2248	NC_018191	TCG	2	6	121825	121830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356226
2249	NC_018191	TCA	2	6	121850	121855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356226
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2251	NC_018191	CGG	2	6	121868	121873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356226
2252	NC_018191	GAT	2	6	121893	121898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356226
2253	NC_018191	CG	3	6	121922	121927	0 %	0 %	50 %	50 %	398356226
2254	NC_018191	GAC	2	6	121941	121946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356226
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2263	NC_018191	AAATG	2	10	122139	122148	60 %	20 %	20 %	0 %	398356226
2264	NC_018191	CGC	2	6	122250	122255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356226
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2266	NC_018191	GCC	3	9	122356	122364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356226
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2270	NC_018191	TGCC	2	8	122594	122601	0 %	25 %	25 %	50 %	398356226
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2273	NC_018191	CTG	2	6	122978	122983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356227
2274	NC_018191	TTG	2	6	123033	123038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356227
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2277	NC_018191	CG	3	6	123409	123414	0 %	0 %	50 %	50 %	398356227
2278	NC_018191	CTC	2	6	123559	123564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356227
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2282	NC_018191	CCGC	2	8	123645	123652	0 %	0 %	25 %	75 %	398356228
2283	NC_018191	CCT	2	6	123941	123946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356228
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2350	NC_018191	GAT	2	6	127017	127022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356229
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2352	NC_018191	GTC	2	6	127083	127088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356229
2353	NC_018191	CGG	2	6	127097	127102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356229
2354	NC_018191	GGA	2	6	127124	127129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356229
2355	NC_018191	AAG	2	6	127134	127139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356229
2356	NC_018191	CGT	2	6	127228	127233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356229
2357	NC_018191	GA	4	8	127246	127253	50 %	0 %	50 %	0 %	398356229
2358	NC_018191	GCA	2	6	127307	127312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356230
2359	NC_018191	CCT	2	6	127313	127318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356230
2360	NC_018191	TGC	2	6	127346	127351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356230
2361	NC_018191	GCT	2	6	127406	127411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356230
2362	NC_018191	AGG	2	6	127420	127425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356230
2363	NC_018191	GCCC	2	8	127529	127536	0 %	0 %	25 %	75 %	398356230
2364	NC_018191	AAG	2	6	127590	127595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356230
2365	NC_018191	GGC	2	6	127596	127601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356230
2366	NC_018191	GCT	2	6	127613	127618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356230
2367	NC_018191	CCGC	2	8	127630	127637	0 %	0 %	25 %	75 %	398356230
2368	NC_018191	CTT	2	6	127665	127670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356230
2369	NC_018191	GGT	2	6	127675	127680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356230
2370	NC_018191	GTA	2	6	127714	127719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356230
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2374	NC_018191	CGA	2	6	128204	128209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356231
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2376	NC_018191	GCT	2	6	128234	128239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356231
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2402	NC_018191	CTG	2	6	129982	129987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356235
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2484	NC_018191	TCG	2	6	133697	133702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356237
2485	NC_018191	GCT	2	6	133752	133757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356237
2486	NC_018191	C	6	6	133763	133768	0 %	0 %	0 %	100 %	398356237
2487	NC_018191	CAGG	2	8	133933	133940	25 %	0 %	50 %	25 %	398356237
2488	NC_018191	CG	4	8	133955	133962	0 %	0 %	50 %	50 %	398356237
2489	NC_018191	TG	3	6	134079	134084	0 %	50 %	50 %	0 %	398356238
2490	NC_018191	GCC	2	6	134092	134097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356238
2491	NC_018191	ATG	2	6	134104	134109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356238
2492	NC_018191	GCA	2	6	134118	134123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356238
2493	NC_018191	GAA	2	6	134151	134156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356238
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2495	NC_018191	CCG	2	6	134198	134203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356238
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2497	NC_018191	CAT	2	6	134340	134345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2498	NC_018191	CAT	2	6	134349	134354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356239
2499	NC_018191	AG	3	6	134411	134416	50 %	0 %	50 %	0 %	398356239
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