MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018191	GTC	2	6	81940	81945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356193
1502	NC_018191	ACGC	2	8	81983	81990	25 %	0 %	25 %	50 %	398356193
1503	NC_018191	ATG	2	6	82040	82045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356193
1504	NC_018191	ATA	2	6	82467	82472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356194
1505	NC_018191	CTCC	2	8	82484	82491	0 %	25 %	0 %	75 %	398356194
1506	NC_018191	CTGACC	2	12	82495	82506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	398356194
1507	NC_018191	AGG	2	6	82525	82530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356194
1508	NC_018191	TCG	2	6	82555	82560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356194
1509	NC_018191	AAC	2	6	82580	82585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356194
1510	NC_018191	GCTT	2	8	82719	82726	0 %	50 %	25 %	25 %	398356195
1511	NC_018191	CGA	2	6	82746	82751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1512	NC_018191	GCGT	2	8	82805	82812	0 %	25 %	50 %	25 %	398356195
1513	NC_018191	GCA	2	6	82833	82838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1514	NC_018191	AGG	2	6	82914	82919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356195
1515	NC_018191	CGT	2	6	82938	82943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1516	NC_018191	AGC	2	6	83028	83033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1517	NC_018191	TGA	2	6	83048	83053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356195
1518	NC_018191	GGC	3	9	83191	83199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356195
1519	NC_018191	AGG	2	6	83222	83227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356195
1520	NC_018191	CT	3	6	83239	83244	0 %	50 %	0 %	50 %	398356195
1521	NC_018191	CGT	2	6	83292	83297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1522	NC_018191	CGA	2	6	83349	83354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1523	NC_018191	CGG	2	6	83367	83372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356195
1524	NC_018191	AGC	2	6	83385	83390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1525	NC_018191	GCG	2	6	83408	83413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356195
1526	NC_018191	AAC	2	6	83537	83542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356195
1527	NC_018191	GGT	2	6	83562	83567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356195
1528	NC_018191	TTG	2	6	83582	83587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356195
1529	NC_018191	TCG	2	6	83598	83603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1530	NC_018191	CGG	2	6	83613	83618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356195
1531	NC_018191	CGA	2	6	83640	83645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356195
1532	NC_018191	TGAC	2	8	83646	83653	25 %	25 %	25 %	25 %	398356195
1533	NC_018191	GCC	2	6	83658	83663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356196
1534	NC_018191	TTC	2	6	83702	83707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356196
1535	NC_018191	CCGGA	2	10	83713	83722	20 %	0 %	40 %	40 %	398356196
1536	NC_018191	GCA	2	6	83757	83762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1537	NC_018191	GCAA	2	8	83786	83793	50 %	0 %	25 %	25 %	398356196
1538	NC_018191	GTC	2	6	83797	83802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1539	NC_018191	TCG	2	6	83900	83905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1540	NC_018191	GAT	2	6	83914	83919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356196
1541	NC_018191	CGA	2	6	84009	84014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1542	NC_018191	GACG	2	8	84063	84070	25 %	0 %	50 %	25 %	398356196
1543	NC_018191	GGC	2	6	84088	84093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356196
1544	NC_018191	CAG	2	6	84124	84129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1545	NC_018191	TA	3	6	84166	84171	50 %	50 %	0 %	0 %	398356196
1546	NC_018191	GTC	2	6	84289	84294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1547	NC_018191	GCC	2	6	84303	84308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356196
1548	NC_018191	GC	3	6	84357	84362	0 %	0 %	50 %	50 %	398356196
1549	NC_018191	CGG	2	6	84416	84421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356196
1550	NC_018191	CTC	3	9	84433	84441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356196
1551	NC_018191	AGA	2	6	84444	84449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356196
1552	NC_018191	CTT	2	6	84499	84504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356196
1553	NC_018191	TCG	2	6	84521	84526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356196
1554	NC_018191	TGT	2	6	84567	84572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356196
1555	NC_018191	CGG	2	6	84574	84579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356196
1556	NC_018191	AGG	2	6	84588	84593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356196
1557	NC_018191	GCG	2	6	84688	84693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356196
1558	NC_018191	CAT	2	6	84703	84708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356196
1559	NC_018191	GCA	2	6	84743	84748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356197
1560	NC_018191	CGC	2	6	84761	84766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356197
1561	NC_018191	AGC	2	6	84769	84774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356197
1562	NC_018191	GGC	2	6	84785	84790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356197
1563	NC_018191	GCC	2	6	84801	84806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356197
1564	NC_018191	TGAT	2	8	84910	84917	25 %	50 %	25 %	0 %	398356197
1565	NC_018191	CG	3	6	84995	85000	0 %	0 %	50 %	50 %	398356197
1566	NC_018191	AAGG	2	8	85008	85015	50 %	0 %	50 %	0 %	398356197
1567	NC_018191	ATC	2	6	85098	85103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356197
1568	NC_018191	CGC	2	6	85128	85133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356197
1569	NC_018191	GC	3	6	85142	85147	0 %	0 %	50 %	50 %	398356197
1570	NC_018191	GCGTC	2	10	85168	85177	0 %	20 %	40 %	40 %	398356197
1571	NC_018191	CTC	2	6	85182	85187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356197
1572	NC_018191	CCG	2	6	85214	85219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356197
1573	NC_018191	CGC	2	6	85292	85297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356197
1574	NC_018191	GGC	2	6	85328	85333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356197
1575	NC_018191	CGG	2	6	85418	85423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356197
1576	NC_018191	CG	3	6	85450	85455	0 %	0 %	50 %	50 %	398356197
1577	NC_018191	GC	3	6	85464	85469	0 %	0 %	50 %	50 %	398356197
1578	NC_018191	GA	3	6	85751	85756	50 %	0 %	50 %	0 %	398356198
1579	NC_018191	GAA	2	6	85909	85914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356198
1580	NC_018191	GC	4	8	85922	85929	0 %	0 %	50 %	50 %	398356198
1581	NC_018191	TGC	2	6	85931	85936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1582	NC_018191	GGC	2	6	85941	85946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356198
1583	NC_018191	TCG	2	6	85964	85969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1584	NC_018191	GAC	2	6	85977	85982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1585	NC_018191	AAG	2	6	86107	86112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356198
1586	NC_018191	CGA	2	6	86156	86161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1587	NC_018191	ACG	2	6	86174	86179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1588	NC_018191	CGA	2	6	86223	86228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1589	NC_018191	TCA	2	6	86234	86239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356198
1590	NC_018191	TCC	2	6	86372	86377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356198
1591	NC_018191	GCT	2	6	86451	86456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1592	NC_018191	CAT	2	6	86457	86462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356198
1593	NC_018191	GAG	2	6	86620	86625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356198
1594	NC_018191	AAC	2	6	86657	86662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356198
1595	NC_018191	GTC	2	6	86680	86685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1596	NC_018191	ACC	2	6	86701	86706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356198
1597	NC_018191	ATC	2	6	86707	86712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356198
1598	NC_018191	AAG	2	6	86728	86733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356198
1599	NC_018191	ACC	2	6	86776	86781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356198
1600	NC_018191	AGC	2	6	86782	86787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1601	NC_018191	CGG	2	6	86832	86837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356198
1602	NC_018191	GGTG	2	8	86853	86860	0 %	25 %	75 %	0 %	398356198
1603	NC_018191	AAG	2	6	86887	86892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356198
1604	NC_018191	TGA	2	6	86901	86906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356198
1605	NC_018191	GGC	2	6	86925	86930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356198
1606	NC_018191	AGG	3	9	86996	87004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356198
1607	NC_018191	CGA	2	6	87018	87023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1608	NC_018191	CGGCA	2	10	87065	87074	20 %	0 %	40 %	40 %	398356198
1609	NC_018191	CGG	2	6	87099	87104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356198
1610	NC_018191	CGT	2	6	87105	87110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1611	NC_018191	ACG	2	6	87149	87154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356198
1612	NC_018191	CGGC	2	8	87185	87192	0 %	0 %	50 %	50 %	398356198
1613	NC_018191	ATC	2	6	87193	87198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356198
1614	NC_018191	CCA	2	6	87203	87208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356198
1615	NC_018191	TGT	2	6	87257	87262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356198
1616	NC_018191	GA	3	6	87400	87405	50 %	0 %	50 %	0 %	398356199
1617	NC_018191	GAA	2	6	87414	87419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356199
1618	NC_018191	CG	3	6	87495	87500	0 %	0 %	50 %	50 %	398356199
1619	NC_018191	CGA	3	9	87566	87574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356199
1620	NC_018191	AGC	2	6	87631	87636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356199
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1622	NC_018191	CGC	2	6	87668	87673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356199
1623	NC_018191	AAC	2	6	87676	87681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356199
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1992	NC_018191	GAA	2	6	108930	108935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
1993	NC_018191	GAA	2	6	108946	108951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356216
1994	NC_018191	CG	4	8	109011	109018	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
1995	NC_018191	CCG	2	6	109047	109052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356216
1996	NC_018191	ACG	3	9	109094	109102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356216
1997	NC_018191	ATG	2	6	109259	109264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356216
1998	NC_018191	CGG	2	6	109269	109274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356216
1999	NC_018191	GC	3	6	109403	109408	0 %	0 %	50 %	50 %	398356216
2000	NC_018191	CACC	2	8	109488	109495	25 %	0 %	0 %	75 %	398356216

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