MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018191	CGT	2	6	55665	55670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356166
1002	NC_018191	CAC	2	6	55831	55836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356166
1003	NC_018191	TGG	2	6	55887	55892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356166
1004	NC_018191	GAT	2	6	55899	55904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356166
1005	NC_018191	TGCC	2	8	55929	55936	0 %	25 %	25 %	50 %	398356166
1006	NC_018191	CG	3	6	55971	55976	0 %	0 %	50 %	50 %	398356166
1007	NC_018191	TCG	2	6	56025	56030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356166
1008	NC_018191	TCC	2	6	56102	56107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356166
1009	NC_018191	G	6	6	56181	56186	0 %	0 %	100 %	0 %	398356167
1010	NC_018191	CCCTC	2	10	56221	56230	0 %	20 %	0 %	80 %	398356167
1011	NC_018191	GCCC	2	8	56319	56326	0 %	0 %	25 %	75 %	398356167
1012	NC_018191	CCG	2	6	56370	56375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356167
1013	NC_018191	TCGC	2	8	56380	56387	0 %	25 %	25 %	50 %	398356167
1014	NC_018191	GCC	2	6	56422	56427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356167
1015	NC_018191	CCG	2	6	56458	56463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356167
1016	NC_018191	GGCG	2	8	56468	56475	0 %	0 %	75 %	25 %	398356167
1017	NC_018191	TCAG	2	8	56520	56527	25 %	25 %	25 %	25 %	398356167
1018	NC_018191	TGACCG	2	12	56551	56562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356167
1019	NC_018191	CGG	2	6	56575	56580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356167
1020	NC_018191	GCG	2	6	56606	56611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356167
1021	NC_018191	TCG	2	6	56650	56655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356167
1022	NC_018191	TGCC	2	8	56708	56715	0 %	25 %	25 %	50 %	398356167
1023	NC_018191	GAA	2	6	56747	56752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356167
1024	NC_018191	AGCA	2	8	56771	56778	50 %	0 %	25 %	25 %	398356167
1025	NC_018191	GAGG	2	8	56795	56802	25 %	0 %	75 %	0 %	398356167
1026	NC_018191	CAG	2	6	56813	56818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356167
1027	NC_018191	CG	3	6	56853	56858	0 %	0 %	50 %	50 %	398356167
1028	NC_018191	GAC	2	6	56894	56899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356167
1029	NC_018191	TGC	2	6	56950	56955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356167
1030	NC_018191	GCG	2	6	56982	56987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356167
1031	NC_018191	TCGCC	2	10	57004	57013	0 %	20 %	20 %	60 %	398356167
1032	NC_018191	CAG	2	6	57092	57097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356168
1033	NC_018191	GCA	2	6	57176	57181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356168
1034	NC_018191	GCTCG	2	10	57206	57215	0 %	20 %	40 %	40 %	398356168
1035	NC_018191	CGC	2	6	57327	57332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356168
1036	NC_018191	GAA	2	6	57460	57465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356168
1037	NC_018191	CTT	2	6	57500	57505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356168
1038	NC_018191	ATG	2	6	57614	57619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356169
1039	NC_018191	CAG	2	6	57623	57628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356169
1040	NC_018191	CGG	2	6	57684	57689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356169
1041	NC_018191	GAT	2	6	57841	57846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356170
1042	NC_018191	TTC	2	6	57879	57884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356170
1043	NC_018191	AGC	2	6	57903	57908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356170
1044	NC_018191	GC	4	8	57964	57971	0 %	0 %	50 %	50 %	398356170
1045	NC_018191	CCG	2	6	58118	58123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356171
1046	NC_018191	GGC	2	6	58173	58178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356171
1047	NC_018191	CGGC	2	8	58241	58248	0 %	0 %	50 %	50 %	398356171
1048	NC_018191	GCC	2	6	58383	58388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356172
1049	NC_018191	GGC	2	6	58402	58407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356172
1050	NC_018191	TCA	2	6	58447	58452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356172
1051	NC_018191	CGG	2	6	58461	58466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356172
1052	NC_018191	AG	3	6	58995	59000	50 %	0 %	50 %	0 %	398356173
1053	NC_018191	GGCGC	2	10	59001	59010	0 %	0 %	60 %	40 %	398356173
1054	NC_018191	ACC	3	9	59014	59022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356173
1055	NC_018191	TCT	2	6	59027	59032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356173
1056	NC_018191	CGG	2	6	59037	59042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356173
1057	NC_018191	TCG	2	6	59057	59062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356173
1058	NC_018191	ATACAG	2	12	59063	59074	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	398356173
1059	NC_018191	AGA	2	6	59076	59081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356173
1060	NC_018191	G	6	6	59085	59090	0 %	0 %	100 %	0 %	398356173
1061	NC_018191	CGA	2	6	59097	59102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356173
1062	NC_018191	C	6	6	59126	59131	0 %	0 %	0 %	100 %	398356173
1063	NC_018191	CCA	2	6	59137	59142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356173
1064	NC_018191	CATG	2	8	59168	59175	25 %	25 %	25 %	25 %	398356173
1065	NC_018191	CCA	2	6	59232	59237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356173
1066	NC_018191	CTC	2	6	59240	59245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356173
1067	NC_018191	CA	3	6	59278	59283	50 %	0 %	0 %	50 %	398356173
1068	NC_018191	GC	3	6	59297	59302	0 %	0 %	50 %	50 %	398356173
1069	NC_018191	TCT	2	6	59313	59318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356173
1070	NC_018191	GTA	2	6	59362	59367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356173
1071	NC_018191	GAC	2	6	59374	59379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356173
1072	NC_018191	AAG	2	6	59431	59436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356173
1073	NC_018191	CTC	2	6	59446	59451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356173
1074	NC_018191	TGA	2	6	59466	59471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356173
1075	NC_018191	AGC	2	6	59611	59616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356174
1076	NC_018191	ACG	2	6	59652	59657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356174
1077	NC_018191	CG	3	6	59736	59741	0 %	0 %	50 %	50 %	398356174
1078	NC_018191	CGG	2	6	59768	59773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356174
1079	NC_018191	CCG	2	6	59833	59838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356174
1080	NC_018191	AGCG	2	8	59839	59846	25 %	0 %	50 %	25 %	398356174
1081	NC_018191	TGC	2	6	59858	59863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356174
1082	NC_018191	GAT	2	6	59898	59903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356174
1083	NC_018191	CCG	2	6	59920	59925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356174
1084	NC_018191	CGG	2	6	59998	60003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356174
1085	NC_018191	GGCCA	2	10	60075	60084	20 %	0 %	40 %	40 %	398356174
1086	NC_018191	GCA	2	6	60161	60166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356174
1087	NC_018191	GC	3	6	60269	60274	0 %	0 %	50 %	50 %	398356174
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1089	NC_018191	T	6	6	60541	60546	0 %	100 %	0 %	0 %	398356175
1090	NC_018191	GGC	2	6	60814	60819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356175
1091	NC_018191	GCC	2	6	60841	60846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1092	NC_018191	TG	3	6	60853	60858	0 %	50 %	50 %	0 %	398356175
1093	NC_018191	GCC	2	6	60881	60886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1094	NC_018191	CGGAT	2	10	60941	60950	20 %	20 %	40 %	20 %	398356175
1095	NC_018191	GCC	2	6	60971	60976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1096	NC_018191	GCGT	2	8	61025	61032	0 %	25 %	50 %	25 %	398356175
1097	NC_018191	CGG	2	6	61060	61065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356175
1098	NC_018191	CTCG	2	8	61185	61192	0 %	25 %	25 %	50 %	398356175
1099	NC_018191	TCGC	2	8	61202	61209	0 %	25 %	25 %	50 %	398356175
1100	NC_018191	GC	4	8	61256	61263	0 %	0 %	50 %	50 %	398356175
1101	NC_018191	CAT	2	6	61281	61286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356175
1102	NC_018191	GTC	2	6	61381	61386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1103	NC_018191	CGC	2	6	61548	61553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1104	NC_018191	AGCG	2	8	61583	61590	25 %	0 %	50 %	25 %	398356175
1105	NC_018191	GCGT	2	8	61612	61619	0 %	25 %	50 %	25 %	398356175
1106	NC_018191	CGCA	2	8	61651	61658	25 %	0 %	25 %	50 %	398356175
1107	NC_018191	AGC	2	6	61710	61715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1108	NC_018191	CAG	2	6	61735	61740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1109	NC_018191	GTC	2	6	61741	61746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1110	NC_018191	AGC	2	6	61749	61754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1111	NC_018191	CCA	2	6	61786	61791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356175
1112	NC_018191	GCA	3	9	61823	61831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1113	NC_018191	AAC	2	6	61871	61876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356175
1114	NC_018191	GCC	3	9	61912	61920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1115	NC_018191	GC	4	8	61937	61944	0 %	0 %	50 %	50 %	398356175
1116	NC_018191	GCC	2	6	62037	62042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
1117	NC_018191	CG	3	6	62080	62085	0 %	0 %	50 %	50 %	398356175
1118	NC_018191	ACG	2	6	62101	62106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1119	NC_018191	CGCC	2	8	62220	62227	0 %	0 %	25 %	75 %	398356175
1120	NC_018191	CCCG	2	8	62232	62239	0 %	0 %	25 %	75 %	398356175
1121	NC_018191	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	398356175
1122	NC_018191	AGC	2	6	62393	62398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1123	NC_018191	ACG	2	6	62426	62431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
1124	NC_018191	AGC	2	6	62462	62467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356175
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1126	NC_018191	CCG	2	6	62494	62499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356175
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