MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 3985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018191	CAA	2	6	25421	25426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356128
502	NC_018191	CGA	2	6	25432	25437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356128
503	NC_018191	CGGC	2	8	25475	25482	0 %	0 %	50 %	50 %	398356128
504	NC_018191	TTCG	2	8	25490	25497	0 %	50 %	25 %	25 %	398356128
505	NC_018191	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	398356129
506	NC_018191	GGC	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356130
507	NC_018191	GAG	2	6	25790	25795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356130
508	NC_018191	GCC	2	6	25800	25805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356130
509	NC_018191	TG	3	6	25832	25837	0 %	50 %	50 %	0 %	398356130
510	NC_018191	TGC	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356130
511	NC_018191	CAG	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356130
512	NC_018191	CG	3	6	26001	26006	0 %	0 %	50 %	50 %	398356130
513	NC_018191	TCG	3	9	26070	26078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356130
514	NC_018191	ATC	2	6	26135	26140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356130
515	NC_018191	TGG	2	6	26163	26168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356130
516	NC_018191	TCG	2	6	27961	27966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356131
517	NC_018191	CCA	2	6	27991	27996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356131
518	NC_018191	ACG	2	6	28150	28155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356131
519	NC_018191	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	398356131
520	NC_018191	TCT	2	6	28356	28361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356132
521	NC_018191	ATA	2	6	28504	28509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356132
522	NC_018191	TCC	2	6	28523	28528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
523	NC_018191	TCC	2	6	28532	28537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356132
524	NC_018191	TTC	2	6	28589	28594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356132
525	NC_018191	CGA	2	6	28644	28649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356132
526	NC_018191	CGGC	2	8	28740	28747	0 %	0 %	50 %	50 %	398356132
527	NC_018191	GCG	2	6	28777	28782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356132
528	NC_018191	CT	3	6	28810	28815	0 %	50 %	0 %	50 %	398356132
529	NC_018191	GCC	2	6	29086	29091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356133
530	NC_018191	CG	3	6	29104	29109	0 %	0 %	50 %	50 %	398356133
531	NC_018191	GAG	2	6	29165	29170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356133
532	NC_018191	GCC	2	6	29544	29549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356134
533	NC_018191	CGC	2	6	29598	29603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356134
534	NC_018191	CCG	2	6	29860	29865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356134
535	NC_018191	GAAA	2	8	29929	29936	75 %	0 %	25 %	0 %	398356134
536	NC_018191	CGT	2	6	30001	30006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356134
537	NC_018191	CT	4	8	30071	30078	0 %	50 %	0 %	50 %	398356134
538	NC_018191	GAA	2	6	30103	30108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356134
539	NC_018191	GAG	3	9	30116	30124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356134
540	NC_018191	GGC	2	6	30215	30220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356134
541	NC_018191	CG	3	6	30231	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
542	NC_018191	GAC	2	6	30245	30250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
543	NC_018191	CGCCAA	2	12	30252	30263	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	398356134
544	NC_018191	GA	3	6	30290	30295	50 %	0 %	50 %	0 %	398356134
545	NC_018191	CCA	3	9	30326	30334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356134
546	NC_018191	AACGG	2	10	30420	30429	40 %	0 %	40 %	20 %	398356134
547	NC_018191	GGC	2	6	30522	30527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356134
548	NC_018191	CGGC	2	8	30544	30551	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
549	NC_018191	GGTC	2	8	30613	30620	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
550	NC_018191	ACG	3	9	30636	30644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
551	NC_018191	CGA	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
552	NC_018191	CCCCT	2	10	30691	30700	0 %	20 %	0 %	80 %	398356134
553	NC_018191	CTGC	2	8	30724	30731	0 %	25 %	25 %	50 %	398356134
554	NC_018191	AAT	2	6	30767	30772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356134
555	NC_018191	CG	3	6	30821	30826	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
556	NC_018191	CCAG	2	8	30838	30845	25 %	0 %	25 %	50 %	398356134
557	NC_018191	GC	3	6	30859	30864	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
558	NC_018191	GCCG	2	8	30890	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
559	NC_018191	GTCG	2	8	30934	30941	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
560	NC_018191	CGT	2	6	30958	30963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356134
561	NC_018191	CGA	2	6	30964	30969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
562	NC_018191	TGGC	2	8	30992	30999	0 %	25 %	50 %	25 %	398356134
563	NC_018191	CGA	2	6	31006	31011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
564	NC_018191	G	6	6	31033	31038	0 %	0 %	100 %	0 %	398356134
565	NC_018191	GGC	2	6	31068	31073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356134
566	NC_018191	CGA	2	6	31171	31176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356134
567	NC_018191	TTG	2	6	31272	31277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356134
568	NC_018191	GC	3	6	31354	31359	0 %	0 %	50 %	50 %	398356134
569	NC_018191	CCA	2	6	31438	31443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356134
570	NC_018191	GGC	2	6	31460	31465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356134
571	NC_018191	GGCA	2	8	31472	31479	25 %	0 %	50 %	25 %	398356134
572	NC_018191	GCC	2	6	31488	31493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356134
573	NC_018191	GGA	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356134
574	NC_018191	TGG	2	6	31678	31683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356134
575	NC_018191	TGA	2	6	31693	31698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356134
576	NC_018191	CTC	2	6	31775	31780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356134
577	NC_018191	GGACAA	2	12	31817	31828	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	398356134
578	NC_018191	ATC	2	6	31909	31914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356135
579	NC_018191	GCT	2	6	31947	31952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
580	NC_018191	TCCGT	2	10	31997	32006	0 %	40 %	20 %	40 %	398356135
581	NC_018191	GGCG	2	8	32020	32027	0 %	0 %	75 %	25 %	398356135
582	NC_018191	CCA	2	6	32032	32037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356135
583	NC_018191	GAT	2	6	32066	32071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356135
584	NC_018191	GGA	2	6	32168	32173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356135
585	NC_018191	GCAC	2	8	32181	32188	25 %	0 %	25 %	50 %	398356135
586	NC_018191	TGC	2	6	32248	32253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
587	NC_018191	GGC	2	6	32294	32299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356135
588	NC_018191	GCT	2	6	32337	32342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
589	NC_018191	CCG	2	6	32383	32388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356135
590	NC_018191	CCG	2	6	32410	32415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356135
591	NC_018191	ACG	2	6	32578	32583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356135
592	NC_018191	GTT	2	6	32661	32666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356135
593	NC_018191	GAGAA	2	10	32790	32799	60 %	0 %	40 %	0 %	398356135
594	NC_018191	GGC	2	6	32802	32807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356135
595	NC_018191	GGC	2	6	32888	32893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356135
596	NC_018191	CG	3	6	32959	32964	0 %	0 %	50 %	50 %	398356135
597	NC_018191	GGCCGC	2	12	32996	33007	0 %	0 %	50 %	50 %	398356135
598	NC_018191	GGC	2	6	33092	33097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356135
599	NC_018191	ATG	2	6	33133	33138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356135
600	NC_018191	GCT	2	6	33146	33151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
601	NC_018191	CGACT	2	10	33216	33225	20 %	20 %	20 %	40 %	398356135
602	NC_018191	GCT	2	6	33341	33346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
603	NC_018191	CAT	2	6	33383	33388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356135
604	NC_018191	GCC	2	6	33393	33398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356135
605	NC_018191	GCT	2	6	33409	33414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
606	NC_018191	TGA	2	6	33452	33457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356135
607	NC_018191	CAAGC	2	10	33471	33480	40 %	0 %	20 %	40 %	398356135
608	NC_018191	GCG	2	6	33563	33568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356135
609	NC_018191	GAC	2	6	33585	33590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356135
610	NC_018191	AAG	2	6	33621	33626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356135
611	NC_018191	CTG	2	6	33627	33632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356135
612	NC_018191	GAT	2	6	33974	33979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356136
613	NC_018191	TCG	2	6	34039	34044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356136
614	NC_018191	GCC	2	6	34213	34218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356136
615	NC_018191	TAT	2	6	34328	34333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398356136
616	NC_018191	AGC	2	6	34336	34341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356136
617	NC_018191	CGC	2	6	34370	34375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356136
618	NC_018191	GAT	2	6	34412	34417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356136
619	NC_018191	GTG	2	6	34464	34469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356136
620	NC_018191	TTG	2	6	34525	34530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356136
621	NC_018191	TC	3	6	34545	34550	0 %	50 %	0 %	50 %	398356136
622	NC_018191	GCA	2	6	34551	34556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356136
623	NC_018191	TCGA	2	8	34569	34576	25 %	25 %	25 %	25 %	398356136
624	NC_018191	CAA	2	6	34668	34673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356137
625	NC_018191	ACA	2	6	34680	34685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356137
626	NC_018191	TG	3	6	34696	34701	0 %	50 %	50 %	0 %	398356137
627	NC_018191	CAA	2	6	34729	34734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356137
628	NC_018191	CCG	2	6	34790	34795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356137
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1000	NC_018191	CCT	2	6	55647	55652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356166

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