MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018187	ATC	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356073
2	NC_018187	GCT	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356073
3	NC_018187	ATC	2	6	539	544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356073
4	NC_018187	ACG	2	6	873	878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356073
5	NC_018187	GTC	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356073
6	NC_018187	TCA	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356073
7	NC_018187	CCG	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356074
8	NC_018187	GAA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356074
9	NC_018187	TGA	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356074
10	NC_018187	TCT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356074
11	NC_018187	CCG	2	6	1572	1577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356075
12	NC_018187	CGT	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356075
13	NC_018187	CGA	2	6	1739	1744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356075
14	NC_018187	TCG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356075
15	NC_018187	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356075
16	NC_018187	GAG	3	9	1995	2003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356075
17	NC_018187	ATC	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356075
18	NC_018187	TGT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398356075
19	NC_018187	TCT	2	6	2162	2167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356075
20	NC_018187	CGA	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356075
21	NC_018187	AGG	2	6	2239	2244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356075
22	NC_018187	TCC	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356075
23	NC_018187	CAT	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356075
24	NC_018187	TCT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356075
25	NC_018187	AGG	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356075
26	NC_018187	GAC	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356075
27	NC_018187	CGC	2	6	2630	2635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356075
28	NC_018187	AGA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356075
29	NC_018187	CAA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398356075
30	NC_018187	CTC	2	6	3142	3147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356075
31	NC_018187	CAT	2	6	3254	3259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356075
32	NC_018187	CCG	2	6	3276	3281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356075
33	NC_018187	TGA	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356075
34	NC_018187	TGA	2	6	3524	3529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356076
35	NC_018187	GGC	2	6	3594	3599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356076
36	NC_018187	GAT	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356076
37	NC_018187	GCG	3	9	3670	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356076
38	NC_018187	CGT	2	6	3857	3862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356076
39	NC_018187	CGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356076
40	NC_018187	CGC	2	6	4037	4042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356077
41	NC_018187	GAT	2	6	4096	4101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356077
42	NC_018187	TCT	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356078
43	NC_018187	GAA	2	6	4411	4416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356078
44	NC_018187	CCG	2	6	4632	4637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356078
45	NC_018187	GAC	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356078
46	NC_018187	GAT	2	6	4709	4714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356078
47	NC_018187	CCT	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356078
48	NC_018187	CGG	3	9	4888	4896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356078
49	NC_018187	CGT	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356078
50	NC_018187	GCC	2	6	5068	5073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356078
51	NC_018187	GCC	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356078
52	NC_018187	CAG	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356078
53	NC_018187	CCA	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398356079
54	NC_018187	TCT	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356079
55	NC_018187	AGT	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356079

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.