MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018184	AGGT	2	8	352	359	25 %	25 %	50 %	0 %	398356041
2	NC_018184	TCGA	2	8	767	774	25 %	25 %	25 %	25 %	398356041
3	NC_018184	GGCA	2	8	796	803	25 %	0 %	50 %	25 %	398356041
4	NC_018184	GATG	2	8	926	933	25 %	25 %	50 %	0 %	398356041
5	NC_018184	TCCG	2	8	2041	2048	0 %	25 %	25 %	50 %	398356041
6	NC_018184	GATC	2	8	2150	2157	25 %	25 %	25 %	25 %	398356041
7	NC_018184	ATGC	2	8	2476	2483	25 %	25 %	25 %	25 %	398356041
8	NC_018184	TACC	2	8	2690	2697	25 %	25 %	0 %	50 %	398356041
9	NC_018184	CCGT	2	8	4162	4169	0 %	25 %	25 %	50 %	398356042
10	NC_018184	GATA	2	8	4977	4984	50 %	25 %	25 %	0 %	398356044
11	NC_018184	ATTT	2	8	5653	5660	25 %	75 %	0 %	0 %	398356044
12	NC_018184	GGCA	2	8	5865	5872	25 %	0 %	50 %	25 %	398356044
13	NC_018184	GTCA	2	8	6099	6106	25 %	25 %	25 %	25 %	398356045
14	NC_018184	CGCT	2	8	6784	6791	0 %	25 %	25 %	50 %	398356045
15	NC_018184	TGGA	2	8	8081	8088	25 %	25 %	50 %	0 %	398356046
16	NC_018184	CGTC	2	8	8302	8309	0 %	25 %	25 %	50 %	398356046
17	NC_018184	ATGT	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	398356047
18	NC_018184	TCCC	2	8	8853	8860	0 %	25 %	0 %	75 %	398356047
19	NC_018184	AAAC	2	8	8894	8901	75 %	0 %	0 %	25 %	398356047
20	NC_018184	GCAG	2	8	9494	9501	25 %	0 %	50 %	25 %	398356047
21	NC_018184	CATT	2	8	9563	9570	25 %	50 %	0 %	25 %	398356047
22	NC_018184	CGCA	2	8	9772	9779	25 %	0 %	25 %	50 %	398356047

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.