MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018180	CAT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752837
2	NC_018180	CCG	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752837
3	NC_018180	CGT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752837
4	NC_018180	GGA	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752837
5	NC_018180	GCT	3	9	1749	1757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752838
6	NC_018180	TTG	2	6	1771	1776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752838
7	NC_018180	TGG	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752838
8	NC_018180	ACG	3	9	1787	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752838
9	NC_018180	ACG	2	6	1841	1846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752838
10	NC_018180	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752838
11	NC_018180	TCA	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752838
12	NC_018180	ATC	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752838
13	NC_018180	GCA	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752840
14	NC_018180	CCA	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752841
15	NC_018180	AGA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
16	NC_018180	CCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752841
17	NC_018180	GAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
18	NC_018180	CGG	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752841
19	NC_018180	AAG	2	6	3049	3054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752841
20	NC_018180	GAC	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752842
21	NC_018180	GAA	2	6	3443	3448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752842
22	NC_018180	CGC	2	6	3485	3490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752842
23	NC_018180	GGC	3	9	3529	3537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752842
24	NC_018180	AGG	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752842
25	NC_018180	CGC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752842
26	NC_018180	CGC	2	6	3689	3694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752843
27	NC_018180	GCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752843
28	NC_018180	CGC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752843
29	NC_018180	TCG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752843
30	NC_018180	GTT	2	6	4076	4081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752844
31	NC_018180	CGA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752845
32	NC_018180	CGT	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752845
33	NC_018180	GCG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752845
34	NC_018180	ATG	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752845
35	NC_018180	TCG	2	6	4559	4564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752845
36	NC_018180	GCG	2	6	4582	4587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752845
37	NC_018180	CGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752845
38	NC_018180	GGA	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752845
39	NC_018180	TCA	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752846
40	NC_018180	CCG	2	6	4813	4818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
41	NC_018180	GAT	3	9	4864	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752846
42	NC_018180	TTC	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400752846
43	NC_018180	CGC	2	6	5022	5027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
44	NC_018180	AGG	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752846
45	NC_018180	ACG	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
46	NC_018180	CAT	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752846
47	NC_018180	CCT	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752846
48	NC_018180	GAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752846
49	NC_018180	GCC	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
50	NC_018180	GAT	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752846
51	NC_018180	TTG	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752846
52	NC_018180	GCG	2	6	5429	5434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752846
53	NC_018180	GCA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
54	NC_018180	CGA	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
55	NC_018180	TCG	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752846
56	NC_018180	ACC	2	6	5891	5896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752846
57	NC_018180	CAC	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752846
58	NC_018180	TCG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752846
59	NC_018180	AGA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752846
60	NC_018180	GCC	2	6	6058	6063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
61	NC_018180	CGG	2	6	6160	6165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752846
62	NC_018180	CGC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752846
63	NC_018180	ACG	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
64	NC_018180	CGA	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
65	NC_018180	CGA	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752846
66	NC_018180	GAT	2	6	6700	6705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752847
67	NC_018180	GCC	2	6	6755	6760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
68	NC_018180	GCC	2	6	6804	6809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
69	NC_018180	GAC	2	6	6849	6854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752847
70	NC_018180	GCC	2	6	6858	6863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752847
71	NC_018180	CCT	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752847
72	NC_018180	GAT	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
73	NC_018180	ATC	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752848
74	NC_018180	CAG	2	6	7442	7447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
75	NC_018180	GCC	3	9	7473	7481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752848
76	NC_018180	GAT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
77	NC_018180	GGC	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
78	NC_018180	ATC	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752848
79	NC_018180	GAA	2	6	7722	7727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752848
80	NC_018180	TGA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752848
81	NC_018180	GGA	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752848
82	NC_018180	GAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752848
83	NC_018180	GTC	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
84	NC_018180	GGC	2	6	8138	8143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
85	NC_018180	CTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
86	NC_018180	AGC	2	6	8245	8250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
87	NC_018180	CGA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752848
88	NC_018180	TGC	2	6	8371	8376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752848
89	NC_018180	AGG	2	6	8386	8391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752848
90	NC_018180	CGG	2	6	8422	8427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752848
91	NC_018180	CAC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752848
92	NC_018180	CGA	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
93	NC_018180	TCC	2	6	8876	8881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752849
94	NC_018180	CAG	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
95	NC_018180	GTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752849
96	NC_018180	GCC	2	6	9033	9038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
97	NC_018180	GCA	2	6	9115	9120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
98	NC_018180	TCG	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752849
99	NC_018180	CCG	2	6	9190	9195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
100	NC_018180	CCG	2	6	9213	9218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
101	NC_018180	GCT	2	6	9253	9258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752849
102	NC_018180	CGA	2	6	9322	9327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
103	NC_018180	CGC	2	6	9382	9387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
104	NC_018180	ATC	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752849
105	NC_018180	CGG	2	6	9440	9445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752849
106	NC_018180	GCT	2	6	9517	9522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752849
107	NC_018180	TGT	2	6	9550	9555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752849
108	NC_018180	TGC	2	6	9595	9600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752849
109	NC_018180	ATG	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752849
110	NC_018180	GGA	2	6	9759	9764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752849
111	NC_018180	GCC	2	6	9782	9787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
112	NC_018180	CGA	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
113	NC_018180	GAG	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752849
114	NC_018180	CGA	2	6	10015	10020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
115	NC_018180	CCG	2	6	10092	10097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
116	NC_018180	AGC	2	6	10149	10154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
117	NC_018180	GAC	3	9	10186	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
118	NC_018180	GCG	3	9	10246	10254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752849
119	NC_018180	GGA	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752849
120	NC_018180	CGG	2	6	10307	10312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752849
121	NC_018180	CGG	2	6	10440	10445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752849
122	NC_018180	GCC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752849
123	NC_018180	CAC	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752849
124	NC_018180	GAG	2	6	10505	10510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752849
125	NC_018180	CTC	2	6	10531	10536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752849
126	NC_018180	GAC	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
127	NC_018180	AGC	3	9	10848	10856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752849
128	NC_018180	CGG	2	6	10942	10947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752849
129	NC_018180	AGG	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752849
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253	NC_018180	CCA	2	6	20783	20788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752858
254	NC_018180	GCG	2	6	20821	20826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752859
255	NC_018180	AAG	2	6	20840	20845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752859
256	NC_018180	GTG	2	6	20885	20890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752859
257	NC_018180	AGC	2	6	21139	21144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752859
258	NC_018180	ACG	2	6	21185	21190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752859
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261	NC_018180	CGG	2	6	21477	21482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752859
262	NC_018180	AGA	2	6	21771	21776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752860
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376	NC_018180	ATC	2	6	31538	31543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752873
377	NC_018180	GCC	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752873
378	NC_018180	ACG	2	6	31705	31710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752873
379	NC_018180	ACA	2	6	31736	31741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400752873
380	NC_018180	GTC	2	6	31817	31822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752873
381	NC_018180	ATC	2	6	31999	32004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752873
382	NC_018180	TAC	2	6	32192	32197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752874
383	NC_018180	GCC	2	6	32339	32344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752874
384	NC_018180	GCT	2	6	32532	32537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752874
385	NC_018180	GCG	2	6	32577	32582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752874
386	NC_018180	CGA	2	6	32686	32691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752874
387	NC_018180	AGC	2	6	32729	32734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752874
388	NC_018180	TGG	2	6	32741	32746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752874
389	NC_018180	GCC	2	6	32783	32788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752874
390	NC_018180	CCT	2	6	33027	33032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752875
391	NC_018180	ATC	2	6	33038	33043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752875
392	NC_018180	CTC	2	6	33238	33243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752875
393	NC_018180	CAC	2	6	33248	33253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	400752875
394	NC_018180	CAT	2	6	33300	33305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752875
395	NC_018180	CGA	2	6	33336	33341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752875
396	NC_018180	TGG	2	6	33468	33473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	400752875
397	NC_018180	GCG	2	6	33612	33617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752875
398	NC_018180	AGC	2	6	33756	33761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752875
399	NC_018180	CTG	2	6	33978	33983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752876
400	NC_018180	GTC	2	6	34027	34032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752876
401	NC_018180	GCG	2	6	34033	34038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752876
402	NC_018180	CCT	2	6	34300	34305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	400752877
403	NC_018180	TTA	2	6	34339	34344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400752877
404	NC_018180	TGC	2	6	34521	34526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752877
405	NC_018180	ATG	2	6	34535	34540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400752877
406	NC_018180	AAG	2	6	34676	34681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400752878
407	NC_018180	AGG	2	6	34760	34765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752878
408	NC_018180	GCC	2	6	34776	34781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752878
409	NC_018180	ATC	2	6	34987	34992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752878
410	NC_018180	TCG	3	9	35081	35089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752878
411	NC_018180	GTT	2	6	35100	35105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400752878
412	NC_018180	GAG	2	6	35106	35111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752878
413	NC_018180	ATC	2	6	35140	35145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752878
414	NC_018180	CAG	2	6	35203	35208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752879
415	NC_018180	CGT	2	6	35263	35268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752879
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417	NC_018180	GAG	2	6	35450	35455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400752879
418	NC_018180	TCG	2	6	35676	35681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752880
419	NC_018180	CAT	2	6	35781	35786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400752880
420	NC_018180	CGA	2	6	35892	35897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400752880
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422	NC_018180	GCC	2	6	35984	35989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	400752880
423	NC_018180	GGC	2	6	36000	36005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	400752880
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443	NC_018180	CGT	2	6	37561	37566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	400752882
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