MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018179	CG	3	6	250	255	0 %	0 %	50 %	50 %	400752654
2	NC_018179	GC	3	6	1383	1388	0 %	0 %	50 %	50 %	400752655
3	NC_018179	GC	3	6	1579	1584	0 %	0 %	50 %	50 %	400752655
4	NC_018179	GC	3	6	1981	1986	0 %	0 %	50 %	50 %	400752656
5	NC_018179	CG	3	6	3443	3448	0 %	0 %	50 %	50 %	400752658
6	NC_018179	CG	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	400752660
7	NC_018179	GC	3	6	6336	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	400752661
8	NC_018179	CG	3	6	7673	7678	0 %	0 %	50 %	50 %	400752664
9	NC_018179	AC	3	6	8063	8068	50 %	0 %	0 %	50 %	400752665
10	NC_018179	CA	3	6	8509	8514	50 %	0 %	0 %	50 %	400752665
11	NC_018179	TC	4	8	9375	9382	0 %	50 %	0 %	50 %	400752667
12	NC_018179	CG	3	6	9852	9857	0 %	0 %	50 %	50 %	400752669
13	NC_018179	TC	3	6	9873	9878	0 %	50 %	0 %	50 %	400752669
14	NC_018179	CG	3	6	10465	10470	0 %	0 %	50 %	50 %	400752671
15	NC_018179	GC	5	10	11975	11984	0 %	0 %	50 %	50 %	400752672
16	NC_018179	CG	3	6	12101	12106	0 %	0 %	50 %	50 %	400752672
17	NC_018179	GC	3	6	12109	12114	0 %	0 %	50 %	50 %	400752672
18	NC_018179	TG	3	6	12609	12614	0 %	50 %	50 %	0 %	400752673
19	NC_018179	GT	3	6	13051	13056	0 %	50 %	50 %	0 %	400752673
20	NC_018179	CG	3	6	14528	14533	0 %	0 %	50 %	50 %	400752674
21	NC_018179	CG	3	6	14614	14619	0 %	0 %	50 %	50 %	400752674
22	NC_018179	CA	3	6	14948	14953	50 %	0 %	0 %	50 %	400752675
23	NC_018179	CT	3	6	15834	15839	0 %	50 %	0 %	50 %	400752675
24	NC_018179	GC	3	6	17124	17129	0 %	0 %	50 %	50 %	400752676
25	NC_018179	CG	3	6	18365	18370	0 %	0 %	50 %	50 %	400752677
26	NC_018179	GC	3	6	20941	20946	0 %	0 %	50 %	50 %	400752681
27	NC_018179	GC	3	6	22939	22944	0 %	0 %	50 %	50 %	400752684
28	NC_018179	GC	3	6	23022	23027	0 %	0 %	50 %	50 %	400752684
29	NC_018179	GC	3	6	23545	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	400752685
30	NC_018179	CG	3	6	23821	23826	0 %	0 %	50 %	50 %	400752685
31	NC_018179	CG	3	6	23973	23978	0 %	0 %	50 %	50 %	400752685
32	NC_018179	AG	3	6	25933	25938	50 %	0 %	50 %	0 %	400752687
33	NC_018179	TC	3	6	26121	26126	0 %	50 %	0 %	50 %	400752687
34	NC_018179	CG	3	6	29167	29172	0 %	0 %	50 %	50 %	400752691
35	NC_018179	GC	3	6	29180	29185	0 %	0 %	50 %	50 %	400752691
36	NC_018179	CG	3	6	29617	29622	0 %	0 %	50 %	50 %	400752691
37	NC_018179	CG	3	6	31738	31743	0 %	0 %	50 %	50 %	400752693
38	NC_018179	CG	3	6	33016	33021	0 %	0 %	50 %	50 %	400752694
39	NC_018179	GC	3	6	34018	34023	0 %	0 %	50 %	50 %	400752695
40	NC_018179	GC	3	6	34921	34926	0 %	0 %	50 %	50 %	400752696
41	NC_018179	GC	3	6	35157	35162	0 %	0 %	50 %	50 %	400752696
42	NC_018179	GC	3	6	35484	35489	0 %	0 %	50 %	50 %	400752696
43	NC_018179	CG	3	6	37253	37258	0 %	0 %	50 %	50 %	400752697
44	NC_018179	CG	4	8	37364	37371	0 %	0 %	50 %	50 %	400752697
45	NC_018179	GC	3	6	37457	37462	0 %	0 %	50 %	50 %	400752697
46	NC_018179	GC	3	6	37590	37595	0 %	0 %	50 %	50 %	400752697
47	NC_018179	GA	3	6	37671	37676	50 %	0 %	50 %	0 %	400752697
48	NC_018179	CG	3	6	39027	39032	0 %	0 %	50 %	50 %	400752698
49	NC_018179	GC	3	6	39726	39731	0 %	0 %	50 %	50 %	400752699
50	NC_018179	GC	3	6	39741	39746	0 %	0 %	50 %	50 %	400752699
51	NC_018179	GC	3	6	40304	40309	0 %	0 %	50 %	50 %	400752700
52	NC_018179	GC	3	6	41639	41644	0 %	0 %	50 %	50 %	400752702
53	NC_018179	CT	3	6	41691	41696	0 %	50 %	0 %	50 %	400752702
54	NC_018179	GA	3	6	41910	41915	50 %	0 %	50 %	0 %	400752702
55	NC_018179	TG	3	6	42949	42954	0 %	50 %	50 %	0 %	400752704
56	NC_018179	CG	3	6	44629	44634	0 %	0 %	50 %	50 %	400752705
57	NC_018179	AG	3	6	44732	44737	50 %	0 %	50 %	0 %	400752705
58	NC_018179	TG	3	6	44801	44806	0 %	50 %	50 %	0 %	400752705
59	NC_018179	CG	3	6	45220	45225	0 %	0 %	50 %	50 %	400752706
60	NC_018179	AC	3	6	46019	46024	50 %	0 %	0 %	50 %	400752707
61	NC_018179	TG	4	8	47466	47473	0 %	50 %	50 %	0 %	400752709
62	NC_018179	CG	4	8	47493	47500	0 %	0 %	50 %	50 %	400752709
63	NC_018179	GT	3	6	47577	47582	0 %	50 %	50 %	0 %	400752709
64	NC_018179	GC	4	8	47631	47638	0 %	0 %	50 %	50 %	400752709
65	NC_018179	CG	3	6	47773	47778	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
66	NC_018179	CG	3	6	47967	47972	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
67	NC_018179	GC	4	8	48164	48171	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
68	NC_018179	GC	3	6	48605	48610	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
69	NC_018179	CG	3	6	48697	48702	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
70	NC_018179	CG	3	6	48854	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	400752710
71	NC_018179	GC	3	6	49321	49326	0 %	0 %	50 %	50 %	400752711
72	NC_018179	GC	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	400752711
73	NC_018179	CT	3	6	49820	49825	0 %	50 %	0 %	50 %	400752712
74	NC_018179	CG	3	6	50096	50101	0 %	0 %	50 %	50 %	400752712
75	NC_018179	CG	3	6	50136	50141	0 %	0 %	50 %	50 %	400752712
76	NC_018179	GC	3	6	51032	51037	0 %	0 %	50 %	50 %	400752713
77	NC_018179	GC	3	6	51098	51103	0 %	0 %	50 %	50 %	400752713
78	NC_018179	CG	3	6	51673	51678	0 %	0 %	50 %	50 %	400752715
79	NC_018179	AT	3	6	52223	52228	50 %	50 %	0 %	0 %	400752715
80	NC_018179	CG	3	6	52463	52468	0 %	0 %	50 %	50 %	400752716
81	NC_018179	CG	3	6	52506	52511	0 %	0 %	50 %	50 %	400752716
82	NC_018179	TC	4	8	52747	52754	0 %	50 %	0 %	50 %	400752716
83	NC_018179	GT	3	6	54611	54616	0 %	50 %	50 %	0 %	400752718
84	NC_018179	GA	3	6	54677	54682	50 %	0 %	50 %	0 %	400752718
85	NC_018179	GC	3	6	54815	54820	0 %	0 %	50 %	50 %	400752718
86	NC_018179	GA	3	6	55434	55439	50 %	0 %	50 %	0 %	400752719
87	NC_018179	TC	3	6	56820	56825	0 %	50 %	0 %	50 %	400752722
88	NC_018179	GA	3	6	57220	57225	50 %	0 %	50 %	0 %	400752722
89	NC_018179	GC	3	6	57950	57955	0 %	0 %	50 %	50 %	400752723
90	NC_018179	GC	3	6	58045	58050	0 %	0 %	50 %	50 %	400752723
91	NC_018179	GC	3	6	59828	59833	0 %	0 %	50 %	50 %	400752724
92	NC_018179	CG	3	6	60772	60777	0 %	0 %	50 %	50 %	400752725
93	NC_018179	GA	3	6	61098	61103	50 %	0 %	50 %	0 %	400752725
94	NC_018179	CG	3	6	61159	61164	0 %	0 %	50 %	50 %	400752725
95	NC_018179	GA	3	6	61383	61388	50 %	0 %	50 %	0 %	400752726
96	NC_018179	GC	4	8	61648	61655	0 %	0 %	50 %	50 %	400752726
97	NC_018179	CT	3	6	61792	61797	0 %	50 %	0 %	50 %	400752726
98	NC_018179	GC	3	6	61952	61957	0 %	0 %	50 %	50 %	400752727
99	NC_018179	AG	3	6	61994	61999	50 %	0 %	50 %	0 %	400752727
100	NC_018179	GC	3	6	62606	62611	0 %	0 %	50 %	50 %	400752729
101	NC_018179	GC	3	6	63317	63322	0 %	0 %	50 %	50 %	400752729
102	NC_018179	CA	3	6	65404	65409	50 %	0 %	0 %	50 %	400752732
103	NC_018179	AT	3	6	66118	66123	50 %	50 %	0 %	0 %	400752733
104	NC_018179	GC	3	6	66235	66240	0 %	0 %	50 %	50 %	400752733
105	NC_018179	CG	3	6	69757	69762	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
106	NC_018179	GC	3	6	70060	70065	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
107	NC_018179	CG	3	6	70221	70226	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
108	NC_018179	GC	3	6	70255	70260	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
109	NC_018179	GC	3	6	70411	70416	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
110	NC_018179	CG	4	8	70724	70731	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
111	NC_018179	CG	3	6	70859	70864	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
112	NC_018179	CG	3	6	71162	71167	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
113	NC_018179	GC	4	8	71234	71241	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
114	NC_018179	CG	3	6	71251	71256	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
115	NC_018179	GC	3	6	71371	71376	0 %	0 %	50 %	50 %	400752739
116	NC_018179	CA	3	6	71843	71848	50 %	0 %	0 %	50 %	400752740
117	NC_018179	CG	4	8	72317	72324	0 %	0 %	50 %	50 %	400752740
118	NC_018179	CG	3	6	73016	73021	0 %	0 %	50 %	50 %	400752741
119	NC_018179	CG	3	6	73109	73114	0 %	0 %	50 %	50 %	400752741
120	NC_018179	TA	3	6	73214	73219	50 %	50 %	0 %	0 %	400752741
121	NC_018179	AC	3	6	73330	73335	50 %	0 %	0 %	50 %	400752741
122	NC_018179	GC	3	6	73402	73407	0 %	0 %	50 %	50 %	400752741
123	NC_018179	CG	3	6	73582	73587	0 %	0 %	50 %	50 %	400752741
124	NC_018179	GC	3	6	73792	73797	0 %	0 %	50 %	50 %	400752742
125	NC_018179	GA	3	6	74008	74013	50 %	0 %	50 %	0 %	400752742
126	NC_018179	CG	3	6	74094	74099	0 %	0 %	50 %	50 %	400752742
127	NC_018179	GC	4	8	75132	75139	0 %	0 %	50 %	50 %	400752743
128	NC_018179	CG	3	6	75849	75854	0 %	0 %	50 %	50 %	400752744
129	NC_018179	AT	3	6	76927	76932	50 %	50 %	0 %	0 %	400752745
130	NC_018179	AG	3	6	77304	77309	50 %	0 %	50 %	0 %	400752746
131	NC_018179	TC	3	6	77338	77343	0 %	50 %	0 %	50 %	400752746
132	NC_018179	CT	3	6	77811	77816	0 %	50 %	0 %	50 %	400752746
133	NC_018179	CG	3	6	78872	78877	0 %	0 %	50 %	50 %	400752747
134	NC_018179	CA	3	6	79167	79172	50 %	0 %	0 %	50 %	400752747
135	NC_018179	GA	3	6	79524	79529	50 %	0 %	50 %	0 %	400752747
136	NC_018179	GC	3	6	81638	81643	0 %	0 %	50 %	50 %	400752750
137	NC_018179	TG	3	6	82266	82271	0 %	50 %	50 %	0 %	400752750
138	NC_018179	TC	3	6	82612	82617	0 %	50 %	0 %	50 %	400752751
139	NC_018179	GA	3	6	82935	82940	50 %	0 %	50 %	0 %	400752752
140	NC_018179	CG	4	8	83128	83135	0 %	0 %	50 %	50 %	400752752
141	NC_018179	TC	3	6	83853	83858	0 %	50 %	0 %	50 %	400752754
142	NC_018179	GA	3	6	84112	84117	50 %	0 %	50 %	0 %	400752754
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.