MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	CTATTC	2	12	1787	1798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648810
2	NC_018089	ATCAAA	2	12	3225	3236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397648811
3	NC_018089	CTTGAC	2	12	7530	7541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397648814
4	NC_018089	TGCTTA	2	12	8004	8015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648814
5	NC_018089	AAATTG	2	12	8627	8638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397648814
6	NC_018089	GATTTT	2	12	9232	9243	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648816
7	NC_018089	TAATGT	2	12	9647	9658	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648818
8	NC_018089	ATAGCT	2	12	11007	11018	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648819
9	NC_018089	CAGGAA	2	12	13381	13392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397648821
10	NC_018089	TTTTGG	2	12	15785	15796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648822
11	NC_018089	GCACAA	2	12	25246	25257	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648825
12	NC_018089	CAAGCA	2	12	25858	25869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648825
13	NC_018089	AGCTGT	2	12	26223	26234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648825
14	NC_018089	TTCAAG	2	12	26294	26305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648825
15	NC_018089	AACAGA	2	12	33227	33238	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397648833
16	NC_018089	GTAGAT	2	12	33516	33527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648833
17	NC_018089	CAGGTG	2	12	33682	33693	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648833
18	NC_018089	GCAATG	2	12	34078	34089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648833
19	NC_018089	GTTTTG	2	12	38663	38674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648835
20	NC_018089	GCTGGT	2	12	39367	39378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648836
21	NC_018089	ATGCGG	2	12	41752	41763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648839
22	NC_018089	AATAAA	2	12	45886	45897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397648844
23	NC_018089	TCCTTA	2	12	50341	50352	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648847
24	NC_018089	ACAGTG	2	12	50928	50939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648847
25	NC_018089	TGCAGG	2	12	51605	51616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648848
26	NC_018089	CAAGCC	2	12	52834	52845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397648849
27	NC_018089	GTAATG	2	12	61562	61573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648858
28	NC_018089	TTATGC	2	12	67602	67613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648864
29	NC_018089	AGTCTG	2	12	69068	69079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648865
30	NC_018089	AATGGA	2	12	76448	76459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397648871
31	NC_018089	CAAAAA	2	12	78192	78203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397648871
32	NC_018089	AAGCTC	2	12	84581	84592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397648875
33	NC_018089	TGATTC	2	12	84666	84677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648875
34	NC_018089	GCTGAA	2	12	87842	87853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648878
35	NC_018089	AAAAGC	2	12	91100	91111	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	397648882
36	NC_018089	TGAACG	2	12	91979	91990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648883
37	NC_018089	AAATAA	2	12	92829	92840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397648883
38	NC_018089	TGACCT	2	12	95255	95266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397648886
39	NC_018089	CCGTCA	2	12	96425	96436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397648886
40	NC_018089	TTTTCC	2	12	119094	119105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648907
41	NC_018089	GTTTGG	2	12	120696	120707	0 %	50 %	50 %	0 %	397648908
42	NC_018089	TGCGTG	2	12	121139	121150	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648908
43	NC_018089	CTCAGG	2	12	127814	127825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397648912
44	NC_018089	TGACAT	2	12	129308	129319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648913
45	NC_018089	AATTGG	2	12	132541	132552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648915
46	NC_018089	GGCCTA	2	12	132822	132833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397648915
47	NC_018089	CTTGGG	2	12	139741	139752	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648921
48	NC_018089	GGTGAT	2	12	141006	141017	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397648922
49	NC_018089	GATAAG	2	12	142374	142385	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397648923
50	NC_018089	TATGAT	2	12	142448	142459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648924
51	NC_018089	GAAGCA	2	12	143117	143128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	397648924
52	NC_018089	CTAATT	2	12	145490	145501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397648927
53	NC_018089	CTTATC	2	12	146122	146133	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648928
54	NC_018089	TTTGGG	2	12	146941	146952	0 %	50 %	50 %	0 %	397648928
55	NC_018089	TTGATT	2	12	147101	147112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648928
56	NC_018089	AAGATA	2	12	147697	147708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	397648929
57	NC_018089	TGAAAC	2	12	148925	148936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397648929
58	NC_018089	TCATAT	2	12	150502	150513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397648930
59	NC_018089	AGAAAA	2	12	152857	152868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397648934
60	NC_018089	GTTGAT	2	12	156398	156409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397648937
61	NC_018089	ATTGAT	2	12	156479	156490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648937
62	NC_018089	TTTTCT	2	12	163113	163124	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397648945
63	NC_018089	TCTTGT	2	12	165904	165915	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397648948
64	NC_018089	TGTTAT	2	12	167446	167457	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397648951
65	NC_018089	GCACAA	2	12	167756	167767	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397648952
66	NC_018089	AATTAC	2	12	168534	168545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397648953
67	NC_018089	TGCTTT	2	12	171503	171514	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	397648958
68	NC_018089	ATTGAT	2	12	174176	174187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397648961
69	NC_018089	AGGTGG	2	12	174436	174447	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	397648961
70	NC_018089	TATCCA	2	12	182728	182739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648967
71	NC_018089	TTCGGG	2	12	189044	189055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397648969
72	NC_018089	GTTCAT	2	12	194912	194923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397648976
73	NC_018089	GTTAAA	2	12	194975	194986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397648976
74	NC_018089	ACGATG	2	12	199120	199131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397648979
75	NC_018089	TAAAAT	2	12	201280	201291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648981
76	NC_018089	GCTGAG	2	12	201308	201319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397648981
77	NC_018089	GTTCAA	2	12	202453	202464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648983
78	NC_018089	AACAAT	2	12	202598	202609	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397648983
79	NC_018089	GTCTAA	2	12	202733	202744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397648983
80	NC_018089	CTTGAG	2	12	203110	203121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397648983
81	NC_018089	TTGATG	2	12	206348	206359	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397648986
82	NC_018089	ATCCTT	2	12	208625	208636	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648987
83	NC_018089	CGGAGG	2	12	209707	209718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	397648987
84	NC_018089	CAATGC	2	12	209920	209931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397648988
85	NC_018089	TTTATA	2	12	215917	215928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648993
86	NC_018089	GGATTG	2	12	225962	225973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397649002
87	NC_018089	TATAGA	2	12	228810	228821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397649005
88	NC_018089	AACACG	2	12	229237	229248	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	397649006
89	NC_018089	AAAAAC	2	12	231625	231636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	397649008
90	NC_018089	CAATTT	2	12	236002	236013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	397649010
91	NC_018089	CTTTCT	2	12	236265	236276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397649010
92	NC_018089	AAGTTC	2	12	240320	240331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397649013
93	NC_018089	GAAGGA	2	12	243262	243273	50 %	0 %	50 %	0 %	397649017
94	NC_018089	GATCCT	2	12	247865	247876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397649025
95	NC_018089	AAGAAA	2	12	250107	250118	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	397649026
96	NC_018089	TAAACA	2	12	251972	251983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397649027
97	NC_018089	GGTGAT	2	12	255139	255150	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	397649029
98	NC_018089	GCTTCC	2	12	257590	257601	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397649030
99	NC_018089	ATATTG	2	12	263961	263972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	397649036
100	NC_018089	CAGATG	2	12	264030	264041	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397649036
101	NC_018089	TAAGCG	2	12	264354	264365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397649037
102	NC_018089	TGATTG	2	12	265900	265911	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397649038
103	NC_018089	TTTGAT	2	12	269864	269875	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397649043
104	NC_018089	GGCACC	2	12	276403	276414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397649049
105	NC_018089	GGTGCA	2	12	278456	278467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397649053
106	NC_018089	CTCCTT	2	12	282529	282540	0 %	50 %	0 %	50 %	397649057
107	NC_018089	TTGGCC	2	12	287738	287749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397649063
108	NC_018089	GAACGT	2	12	288819	288830	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	397649064
109	NC_018089	AATCCG	2	12	291881	291892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397649067
110	NC_018089	TTTAAA	2	12	292004	292015	50 %	50 %	0 %	0 %	397649067
111	NC_018089	CGTATG	2	12	296417	296428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397649071
112	NC_018089	TTCTTT	2	12	298231	298242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	397649073
113	NC_018089	GTTGTG	2	12	302570	302581	0 %	50 %	50 %	0 %	397649080
114	NC_018089	GATACA	2	12	307180	307191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	397649086
115	NC_018089	TGTTGA	2	12	309178	309189	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397649088
116	NC_018089	GTTCCA	2	12	315135	315146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397649093
117	NC_018089	TTGATG	2	12	315328	315339	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	397649093
118	NC_018089	AGCACC	2	12	319539	319550	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	397649097
119	NC_018089	ATTGCT	2	12	323176	323187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397649098
120	NC_018089	TTCAGG	2	12	329361	329372	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397649103
121	NC_018089	TAGTGA	2	12	329997	330008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397649103
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123	NC_018089	AGGATA	2	12	333208	333219	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	397649107
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222	NC_018089	AGCAGG	2	12	586747	586758	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	397649350
223	NC_018089	TAAAAA	2	12	592298	592309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	397649357
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225	NC_018089	CATGGC	2	12	602322	602333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397649364
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228	NC_018089	CAAGTT	2	12	616020	616031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397649379
229	NC_018089	TCCTTA	2	12	620738	620749	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397649381
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