MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfurospirillum barnesii SES-3 chromosome

Total Repeats: 939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018002	ATGCCT	2	12	996	1007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390939175
2	NC_018002	AAGCTA	2	12	3707	3718	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939177
3	NC_018002	GATTGA	2	12	6684	6695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939179
4	NC_018002	ATTAGA	2	12	9663	9674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390939182
5	NC_018002	TTCTGG	2	12	10205	10216	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	390939183
6	NC_018002	TTGGAA	2	12	11765	11776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939184
7	NC_018002	CGCATC	2	12	15271	15282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390939186
8	NC_018002	GACTAA	2	12	20067	20078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939193
9	NC_018002	GCGATG	2	12	20269	20280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390939193
10	NC_018002	ATTAAT	2	12	25472	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	390939198
11	NC_018002	AAAATA	2	12	25674	25685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939198
12	NC_018002	TTTTCA	2	12	30851	30862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390939203
13	NC_018002	GGTATA	2	12	31660	31671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390939204
14	NC_018002	AACCAT	2	12	31896	31907	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390939204
15	NC_018002	ATTGTG	2	12	34893	34904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939206
16	NC_018002	GCAGTG	2	12	38120	38131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390939210
17	NC_018002	GCGCAT	2	12	43244	43255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390939216
18	NC_018002	ACACGC	2	12	45564	45575	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	390939219
19	NC_018002	TAACGG	2	12	52083	52094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390939225
20	NC_018002	GCTGAG	2	12	54830	54841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390939228
21	NC_018002	CGTCAC	2	12	57816	57827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390939230
22	NC_018002	TGGCAA	2	12	60466	60477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390939233
23	NC_018002	ATTTTG	2	12	62529	62540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939235
24	NC_018002	AATTTT	2	12	67092	67103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390939239
25	NC_018002	GCCCAT	2	12	72069	72080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390939244
26	NC_018002	CTTTTG	2	12	72629	72640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390939245
27	NC_018002	ATAATC	2	12	73129	73140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390939245
28	NC_018002	AAAAAT	2	12	75191	75202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939248
29	NC_018002	GTTATT	2	12	78151	78162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939250
30	NC_018002	AAAAAC	2	12	79773	79784	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390939251
31	NC_018002	TTGCAT	2	12	86003	86014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390939259
32	NC_018002	CAAAAG	2	12	99488	99499	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390939272
33	NC_018002	GGAAGT	2	12	102414	102425	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390939276
34	NC_018002	AGAATT	2	12	103878	103889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390939277
35	NC_018002	ACCAAC	2	12	104501	104512	50 %	0 %	0 %	50 %	390939278
36	NC_018002	CAAAAA	2	12	104800	104811	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390939279
37	NC_018002	TTTAAG	2	12	107772	107783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390939285
38	NC_018002	TTACTT	2	12	107849	107860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390939285
39	NC_018002	AAATGA	2	12	112298	112309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390939291
40	NC_018002	TCAAAA	2	12	112539	112550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939291
41	NC_018002	TTTGGT	2	12	113754	113765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939292
42	NC_018002	ATCTCC	2	12	115137	115148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390939293
43	NC_018002	ATAACA	2	12	115825	115836	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939293
44	NC_018002	ATTTAA	2	12	127383	127394	50 %	50 %	0 %	0 %	390939305
45	NC_018002	TGGGAT	2	12	128225	128236	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390939306
46	NC_018002	TCCACT	2	12	132012	132023	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390939310
47	NC_018002	CTTGTT	2	12	140700	140711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390939320
48	NC_018002	CGTGTG	2	12	143547	143558	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390939323
49	NC_018002	AAGAGA	2	12	143572	143583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390939323
50	NC_018002	ATTTTT	2	12	149657	149668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390939328
51	NC_018002	AGTGTC	2	12	153238	153249	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939333
52	NC_018002	TTTATG	2	12	155013	155024	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939334
53	NC_018002	CAATGC	2	12	157278	157289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390939335
54	NC_018002	TTTCAA	2	12	158925	158936	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390939336
55	NC_018002	TTTTAT	2	12	159677	159688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390939337
56	NC_018002	TTAAAA	2	12	170436	170447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939350
57	NC_018002	TGAAAA	2	12	171692	171703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390939351
58	NC_018002	TAAAAA	2	12	172033	172044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939352
59	NC_018002	TAAAAC	2	12	176606	176617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939357
60	NC_018002	GCTTTT	2	12	180418	180429	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	390939362
61	NC_018002	TCCAAA	2	12	183052	183063	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	390939364
62	NC_018002	AGTGAA	2	12	184285	184296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390939364
63	NC_018002	AGATTA	2	12	184436	184447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390939365
64	NC_018002	ATCAAA	2	12	187119	187130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939368
65	NC_018002	CGTAAA	2	12	188030	188041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939368
66	NC_018002	GCCGCA	2	12	193058	193069	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390939371
67	NC_018002	TGGCTA	2	12	196107	196118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939376
68	NC_018002	ATAAAA	2	12	198857	198868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939380
69	NC_018002	AAAATA	2	12	199358	199369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939380
70	NC_018002	TGAATT	2	12	199659	199670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390939380
71	NC_018002	GGGTGA	2	12	201308	201319	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	390939382
72	NC_018002	TGGTAT	2	12	208596	208607	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939389
73	NC_018002	CACTTG	2	12	209286	209297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390939390
74	NC_018002	TTTGAT	2	12	209762	209773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939391
75	NC_018002	GTATTG	2	12	213575	213586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939395
76	NC_018002	TTGATT	2	12	219879	219890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939401
77	NC_018002	TTCAAA	2	12	222075	222086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	390939403
78	NC_018002	TGAGTG	2	12	222297	222308	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390939403
79	NC_018002	TAAAGG	2	12	223432	223443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390939404
80	NC_018002	TAATCC	2	12	230200	230211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390939413
81	NC_018002	TATTGA	2	12	231710	231721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390939414
82	NC_018002	ATCAAA	2	12	236089	236100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939418
83	NC_018002	AAAATA	2	12	244764	244775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	390939429
84	NC_018002	CTTTAT	2	12	246253	246264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390939431
85	NC_018002	AAAAAG	2	12	246678	246689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390939431
86	NC_018002	TTGTGG	2	12	247297	247308	0 %	50 %	50 %	0 %	390939431
87	NC_018002	TGCTAG	2	12	248105	248116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939431
88	NC_018002	GGCAAG	2	12	251252	251263	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390939436
89	NC_018002	GGTTTT	2	12	251677	251688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939437
90	NC_018002	TGCAAA	2	12	252984	252995	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939438
91	NC_018002	TGAAAG	2	12	255615	255626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390939440
92	NC_018002	GAATAC	2	12	256885	256896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939442
93	NC_018002	GCAAAA	2	12	259302	259313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390939445
94	NC_018002	TGTGGA	2	12	261275	261286	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390939446
95	NC_018002	GAAGAG	2	12	271224	271235	50 %	0 %	50 %	0 %	390939454
96	NC_018002	TTACGC	2	12	272148	272159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390939455
97	NC_018002	CTCATC	2	12	272914	272925	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390939455
98	NC_018002	ATGGAC	2	12	275629	275640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390939458
99	NC_018002	CAGATT	2	12	280087	280098	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390939463
100	NC_018002	GCCAAT	2	12	280134	280145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390939463
101	NC_018002	CAATGC	2	12	287714	287725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390939471
102	NC_018002	TGAGCT	2	12	290856	290867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939475
103	NC_018002	TTTGAT	2	12	294315	294326	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390939479
104	NC_018002	ATTTTT	2	12	299458	299469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390939484
105	NC_018002	TGGTAT	2	12	305190	305201	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939492
106	NC_018002	GGTTTT	2	12	305701	305712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390939492
107	NC_018002	TATAGC	2	12	306625	306636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390939493
108	NC_018002	AGTTTA	2	12	309859	309870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390939497
109	NC_018002	ACTTTT	2	12	311149	311160	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390939498
110	NC_018002	GCCAAA	2	12	311681	311692	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390939498
111	NC_018002	AAAAAC	2	12	312135	312146	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	390939498
112	NC_018002	TTGAAA	2	12	314272	314283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390939501
113	NC_018002	AAGAAA	2	12	324518	324529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390939509
114	NC_018002	AAATAC	2	12	324852	324863	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939509
115	NC_018002	GTCAAT	2	12	325323	325334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390939509
116	NC_018002	GATTTG	2	12	328610	328621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939513
117	NC_018002	ACGTGT	2	12	330550	330561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939514
118	NC_018002	TCTTTC	2	12	333317	333328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939518
119	NC_018002	GTTTGA	2	12	335915	335926	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939522
120	NC_018002	ATTGAC	2	12	337652	337663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390939526
121	NC_018002	TGAGAA	2	12	339555	339566	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390939529
122	NC_018002	ATGGAA	2	12	345055	345066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390939534
123	NC_018002	TGCACG	2	12	345813	345824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390939534
124	NC_018002	TTTAAG	2	12	348112	348123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390939536
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126	NC_018002	CAGGTA	2	12	352469	352480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390939542
127	NC_018002	TTAAAG	2	12	353220	353231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	390939543
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129	NC_018002	TGGTCT	2	12	353921	353932	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	390939544
130	NC_018002	GAAAAA	2	12	356170	356181	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390939545
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135	NC_018002	TACATG	2	12	364134	364145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390939549
136	NC_018002	TGATGT	2	12	370078	370089	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390939553
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139	NC_018002	CATGTT	2	12	374450	374461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390939556
140	NC_018002	CATATT	2	12	375532	375543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	390939558
141	NC_018002	CATCGC	2	12	381719	381730	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390939564
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143	NC_018002	GGGCTT	2	12	382884	382895	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390939565
144	NC_018002	TGACTT	2	12	386880	386891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390939569
145	NC_018002	ATCAAA	2	12	387202	387213	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939569
146	NC_018002	TTTCAT	2	12	388474	388485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390939570
147	NC_018002	TAAATA	2	12	388961	388972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390939571
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151	NC_018002	CCATTA	2	12	401438	401449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390939587
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218	NC_018002	CAGGTT	2	12	567848	567859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390939754
219	NC_018002	TTTGCA	2	12	570184	570195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390939757
220	NC_018002	TGCCAT	2	12	571732	571743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390939758
221	NC_018002	CAATAA	2	12	573207	573218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	390939759
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223	NC_018002	GTGGTT	2	12	577682	577693	0 %	50 %	50 %	0 %	390939764
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229	NC_018002	GGCTGT	2	12	590039	590050	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390939774
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231	NC_018002	CTCTTT	2	12	593829	593840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939777
232	NC_018002	CAAATG	2	12	594385	594396	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390939778
233	NC_018002	CTCTTT	2	12	594870	594881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390939779
234	NC_018002	CTAAGC	2	12	599262	599273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390939783
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341	NC_018002	AAAGAT	2	12	901586	901597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	390940064
342	NC_018002	TTGAAG	2	12	902330	902341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390940065
343	NC_018002	AACACA	2	12	902417	902428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390940066
344	NC_018002	GGGCTT	2	12	907173	907184	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	390940071
345	NC_018002	AATGCC	2	12	908624	908635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390940073
346	NC_018002	AAGCCA	4	24	912920	912943	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	390940079
347	NC_018002	ATTAAA	2	12	912982	912993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390940079
348	NC_018002	GCTTGA	2	12	913068	913079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390940079
349	NC_018002	ATTTTA	2	12	914969	914980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390940080
350	NC_018002	CAATGG	2	12	918511	918522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390940085
351	NC_018002	GGTTTT	2	12	919083	919094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390940085
352	NC_018002	GTATCG	2	12	921025	921036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390940088
353	NC_018002	GTGAAG	2	12	925452	925463	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	390940092
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372	NC_018002	TGGCAT	2	12	979459	979470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390940144
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374	NC_018002	CAATGC	2	12	985923	985934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390940155
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448	NC_018002	AAGTTC	2	12	1150720	1150731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390940317
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452	NC_018002	TCCTGC	2	12	1172587	1172598	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390940338
453	NC_018002	GAAAAC	2	12	1174870	1174881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	390940340
454	NC_018002	TTTAAG	2	12	1175293	1175304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390940341
455	NC_018002	GCAATG	2	12	1175546	1175557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390940341
456	NC_018002	ATAGCA	2	12	1182268	1182279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390940345
457	NC_018002	CATTGG	2	12	1182942	1182953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390940346
458	NC_018002	AAAAGG	2	12	1186675	1186686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390940351
459	NC_018002	GATACG	2	12	1187201	1187212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390940351
460	NC_018002	ACGTAT	2	12	1188477	1188488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390940352
461	NC_018002	ATTTTT	2	12	1192410	1192421	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390940356
462	NC_018002	TGTCAA	2	12	1193224	1193235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390940357
463	NC_018002	GTCAAT	2	12	1194061	1194072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390940357
464	NC_018002	ATTTTG	2	12	1194544	1194555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	390940358
465	NC_018002	ATTTTT	2	12	1194632	1194643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	390940358
466	NC_018002	AGCATT	2	12	1196905	1196916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390940360
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487	NC_018002	TGGCAA	2	12	1245012	1245023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390940410
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