MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 14542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018000	GGTC	2	8	151	158	0 %	25 %	50 %	25 %	398349898
2	NC_018000	CGTT	2	8	967	974	0 %	50 %	25 %	25 %	398349898
3	NC_018000	CAGC	2	8	1128	1135	25 %	0 %	25 %	50 %	398349898
4	NC_018000	TCGA	2	8	1199	1206	25 %	25 %	25 %	25 %	398349898
5	NC_018000	ATGG	2	8	1959	1966	25 %	25 %	50 %	0 %	398349900
6	NC_018000	CCTT	2	8	2568	2575	0 %	50 %	0 %	50 %	398349901
7	NC_018000	TGCA	2	8	3033	3040	25 %	25 %	25 %	25 %	398349901
8	NC_018000	GACG	2	8	3756	3763	25 %	0 %	50 %	25 %	398349902
9	NC_018000	CGCC	2	8	3858	3865	0 %	0 %	25 %	75 %	398349902
10	NC_018000	CCAT	2	8	5200	5207	25 %	25 %	0 %	50 %	398349904
11	NC_018000	ACCG	2	8	5500	5507	25 %	0 %	25 %	50 %	398349904
12	NC_018000	AGCG	2	8	5800	5807	25 %	0 %	50 %	25 %	398349905
13	NC_018000	CCGT	2	8	5970	5977	0 %	25 %	25 %	50 %	398349905
14	NC_018000	TGCC	2	8	6169	6176	0 %	25 %	25 %	50 %	398349905
15	NC_018000	CTTC	2	8	6256	6263	0 %	50 %	0 %	50 %	398349905
16	NC_018000	GCCG	2	8	6385	6392	0 %	0 %	50 %	50 %	398349905
17	NC_018000	GCCG	2	8	6449	6456	0 %	0 %	50 %	50 %	398349905
18	NC_018000	GTCC	2	8	7064	7071	0 %	25 %	25 %	50 %	398349906
19	NC_018000	CCGG	2	8	7564	7571	0 %	0 %	50 %	50 %	398349907
20	NC_018000	TCCA	2	8	8272	8279	25 %	25 %	0 %	50 %	398349908
21	NC_018000	TCGA	2	8	8362	8369	25 %	25 %	25 %	25 %	398349908
22	NC_018000	TGCG	2	8	8443	8450	0 %	25 %	50 %	25 %	398349908
23	NC_018000	TCGA	2	8	9172	9179	25 %	25 %	25 %	25 %	398349909
24	NC_018000	GGAA	2	8	9645	9652	50 %	0 %	50 %	0 %	398349909
25	NC_018000	CGCC	2	8	10711	10718	0 %	0 %	25 %	75 %	398349910
26	NC_018000	CATC	2	8	11445	11452	25 %	25 %	0 %	50 %	398349911
27	NC_018000	GACG	2	8	11518	11525	25 %	0 %	50 %	25 %	398349911
28	NC_018000	CGTG	2	8	11847	11854	0 %	25 %	50 %	25 %	398349911
29	NC_018000	GTTG	2	8	11943	11950	0 %	50 %	50 %	0 %	398349911
30	NC_018000	GACG	2	8	12162	12169	25 %	0 %	50 %	25 %	398349911
31	NC_018000	GTGC	2	8	12266	12273	0 %	25 %	50 %	25 %	398349912
32	NC_018000	GCCC	2	8	12832	12839	0 %	0 %	25 %	75 %	398349912
33	NC_018000	GAAG	2	8	13425	13432	50 %	0 %	50 %	0 %	398349913
34	NC_018000	CGTC	2	8	14010	14017	0 %	25 %	25 %	50 %	398349914
35	NC_018000	GCGA	2	8	14421	14428	25 %	0 %	50 %	25 %	398349914
36	NC_018000	GCTT	2	8	14781	14788	0 %	50 %	25 %	25 %	398349915
37	NC_018000	TGAT	2	8	14838	14845	25 %	50 %	25 %	0 %	398349915
38	NC_018000	CGGA	2	8	14865	14872	25 %	0 %	50 %	25 %	398349915
39	NC_018000	TCGC	2	8	15093	15100	0 %	25 %	25 %	50 %	398349915
40	NC_018000	TGCA	2	8	15159	15166	25 %	25 %	25 %	25 %	398349915
41	NC_018000	CCAG	2	8	15277	15284	25 %	0 %	25 %	50 %	398349915
42	NC_018000	CCGG	2	8	15767	15774	0 %	0 %	50 %	50 %	398349915
43	NC_018000	CGCT	2	8	15933	15940	0 %	25 %	25 %	50 %	398349915
44	NC_018000	GCCT	2	8	16019	16026	0 %	25 %	25 %	50 %	398349915
45	NC_018000	CGAT	2	8	16478	16485	25 %	25 %	25 %	25 %	398349916
46	NC_018000	TCGA	2	8	16910	16917	25 %	25 %	25 %	25 %	398349916
47	NC_018000	ACCG	2	8	16993	17000	25 %	0 %	25 %	50 %	398349916
48	NC_018000	GATC	2	8	17876	17883	25 %	25 %	25 %	25 %	398349918
49	NC_018000	GCCG	2	8	18308	18315	0 %	0 %	50 %	50 %	398349918
50	NC_018000	AAGG	2	8	19657	19664	50 %	0 %	50 %	0 %	398349919
51	NC_018000	GAGC	2	8	20668	20675	25 %	0 %	50 %	25 %	398349922
52	NC_018000	GCTT	2	8	20723	20730	0 %	50 %	25 %	25 %	398349922
53	NC_018000	CGGG	2	8	20809	20816	0 %	0 %	75 %	25 %	398349922
54	NC_018000	GCCG	2	8	21431	21438	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
55	NC_018000	CGGC	3	12	21796	21807	0 %	0 %	50 %	50 %	398349923
56	NC_018000	GGCG	2	8	21866	21873	0 %	0 %	75 %	25 %	398349923
57	NC_018000	GACC	2	8	22037	22044	25 %	0 %	25 %	50 %	398349923
58	NC_018000	GGGC	2	8	22293	22300	0 %	0 %	75 %	25 %	398349923
59	NC_018000	GGGC	2	8	22600	22607	0 %	0 %	75 %	25 %	398349924
60	NC_018000	GGCC	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	398349924
61	NC_018000	GAGC	2	8	23744	23751	25 %	0 %	50 %	25 %	398349926
62	NC_018000	TCCG	2	8	24027	24034	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
63	NC_018000	GCCG	2	8	24290	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
64	NC_018000	CACG	2	8	24476	24483	25 %	0 %	25 %	50 %	398349926
65	NC_018000	CGGC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
66	NC_018000	CGAT	2	8	24754	24761	25 %	25 %	25 %	25 %	398349926
67	NC_018000	GCTC	2	8	25175	25182	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
68	NC_018000	CCTG	2	8	25402	25409	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
69	NC_018000	CGGC	2	8	25514	25521	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
70	NC_018000	GGGA	2	8	25818	25825	25 %	0 %	75 %	0 %	398349926
71	NC_018000	GCCG	2	8	25934	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
72	NC_018000	CGCC	2	8	26512	26519	0 %	0 %	25 %	75 %	398349927
73	NC_018000	TCCT	2	8	26702	26709	0 %	50 %	0 %	50 %	398349927
74	NC_018000	CCGG	2	8	26752	26759	0 %	0 %	50 %	50 %	398349927
75	NC_018000	AGGC	2	8	27673	27680	25 %	0 %	50 %	25 %	398349928
76	NC_018000	AAGC	2	8	27868	27875	50 %	0 %	25 %	25 %	398349928
77	NC_018000	TCGA	2	8	29436	29443	25 %	25 %	25 %	25 %	398349928
78	NC_018000	GCGA	2	8	29646	29653	25 %	0 %	50 %	25 %	398349928
79	NC_018000	CGAG	2	8	29952	29959	25 %	0 %	50 %	25 %	398349929
80	NC_018000	GACC	2	8	30928	30935	25 %	0 %	25 %	50 %	398349929
81	NC_018000	CTTC	2	8	31267	31274	0 %	50 %	0 %	50 %	398349929
82	NC_018000	CATC	2	8	31483	31490	25 %	25 %	0 %	50 %	398349929
83	NC_018000	ACGG	2	8	31844	31851	25 %	0 %	50 %	25 %	398349929
84	NC_018000	GTCG	2	8	32392	32399	0 %	25 %	50 %	25 %	398349929
85	NC_018000	GCCG	2	8	32627	32634	0 %	0 %	50 %	50 %	398349929
86	NC_018000	CTTG	2	8	33075	33082	0 %	50 %	25 %	25 %	398349930
87	NC_018000	GGCG	2	8	33630	33637	0 %	0 %	75 %	25 %	398349930
88	NC_018000	AAGG	2	8	33667	33674	50 %	0 %	50 %	0 %	398349930
89	NC_018000	CGCT	2	8	34243	34250	0 %	25 %	25 %	50 %	398349930
90	NC_018000	GATC	2	8	34482	34489	25 %	25 %	25 %	25 %	398349930
91	NC_018000	TGGT	2	8	34690	34697	0 %	50 %	50 %	0 %	398349930
92	NC_018000	CGGG	2	8	35271	35278	0 %	0 %	75 %	25 %	398349930
93	NC_018000	GCTT	2	8	35525	35532	0 %	50 %	25 %	25 %	398349930
94	NC_018000	GACC	2	8	35628	35635	25 %	0 %	25 %	50 %	398349930
95	NC_018000	CTCG	2	8	36605	36612	0 %	25 %	25 %	50 %	398349931
96	NC_018000	GCCG	2	8	36773	36780	0 %	0 %	50 %	50 %	398349931
97	NC_018000	TGGC	2	8	37209	37216	0 %	25 %	50 %	25 %	398349931
98	NC_018000	ACCG	2	8	37931	37938	25 %	0 %	25 %	50 %	398349932
99	NC_018000	CCTC	2	8	38260	38267	0 %	25 %	0 %	75 %	398349932
100	NC_018000	TCCG	2	8	38558	38565	0 %	25 %	25 %	50 %	398349932
101	NC_018000	GCGG	2	8	39204	39211	0 %	0 %	75 %	25 %	398349933
102	NC_018000	GAAG	2	8	39384	39391	50 %	0 %	50 %	0 %	398349933
103	NC_018000	GACG	2	8	39471	39478	25 %	0 %	50 %	25 %	398349933
104	NC_018000	AAGG	2	8	39804	39811	50 %	0 %	50 %	0 %	398349934
105	NC_018000	GACC	2	8	39911	39918	25 %	0 %	25 %	50 %	398349934
106	NC_018000	CGGC	2	8	39993	40000	0 %	0 %	50 %	50 %	398349934
107	NC_018000	GTCG	2	8	40157	40164	0 %	25 %	50 %	25 %	398349934
108	NC_018000	GCCG	2	8	40659	40666	0 %	0 %	50 %	50 %	398349935
109	NC_018000	GCCT	2	8	41753	41760	0 %	25 %	25 %	50 %	398349937
110	NC_018000	TTGG	2	8	41761	41768	0 %	50 %	50 %	0 %	398349937
111	NC_018000	CGGC	2	8	42061	42068	0 %	0 %	50 %	50 %	398349937
112	NC_018000	AGTC	2	8	42400	42407	25 %	25 %	25 %	25 %	398349937
113	NC_018000	GCGG	2	8	42453	42460	0 %	0 %	75 %	25 %	398349937
114	NC_018000	GACG	2	8	42728	42735	25 %	0 %	50 %	25 %	398349938
115	NC_018000	GCGA	2	8	42846	42853	25 %	0 %	50 %	25 %	398349938
116	NC_018000	CGAT	2	8	43407	43414	25 %	25 %	25 %	25 %	398349938
117	NC_018000	GGGA	2	8	43794	43801	25 %	0 %	75 %	0 %	398349938
118	NC_018000	GGCC	2	8	43934	43941	0 %	0 %	50 %	50 %	398349938
119	NC_018000	ACCA	2	8	44301	44308	50 %	0 %	0 %	50 %	398349939
120	NC_018000	TCGA	2	8	44358	44365	25 %	25 %	25 %	25 %	398349939
121	NC_018000	CGGC	2	8	44649	44656	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
122	NC_018000	GGCG	2	8	44663	44670	0 %	0 %	75 %	25 %	398349939
123	NC_018000	CGTG	2	8	46555	46562	0 %	25 %	50 %	25 %	398349941
124	NC_018000	ATCG	2	8	47136	47143	25 %	25 %	25 %	25 %	398349942
125	NC_018000	CCAG	2	8	47240	47247	25 %	0 %	25 %	50 %	398349942
126	NC_018000	GCCC	2	8	47793	47800	0 %	0 %	25 %	75 %	398349944
127	NC_018000	GGCA	2	8	47835	47842	25 %	0 %	50 %	25 %	398349944
128	NC_018000	TTCC	2	8	47949	47956	0 %	50 %	0 %	50 %	398349944
129	NC_018000	GCCG	2	8	48024	48031	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
130	NC_018000	GTCG	2	8	48220	48227	0 %	25 %	50 %	25 %	398349944
131	NC_018000	GATG	2	8	48579	48586	25 %	25 %	50 %	0 %	398349944
132	NC_018000	GGGC	2	8	48797	48804	0 %	0 %	75 %	25 %	398349944
133	NC_018000	TCGC	2	8	48943	48950	0 %	25 %	25 %	50 %	398349944
134	NC_018000	GACG	2	8	49281	49288	25 %	0 %	50 %	25 %	398349944
135	NC_018000	CGAC	2	8	49316	49323	25 %	0 %	25 %	50 %	398349944
136	NC_018000	TCTT	2	8	49775	49782	0 %	75 %	0 %	25 %	398349945
137	NC_018000	TGCC	2	8	50650	50657	0 %	25 %	25 %	50 %	398349946
138	NC_018000	CGAG	2	8	50811	50818	25 %	0 %	50 %	25 %	398349946
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140	NC_018000	TCAT	2	8	51920	51927	25 %	50 %	0 %	25 %	398349947
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