MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018000	GC	3	6	179069	179074	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4002	NC_018000	CTG	2	6	179147	179152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4003	NC_018000	CGA	2	6	179170	179175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4004	NC_018000	CGAGA	2	10	179210	179219	40 %	0 %	40 %	20 %	398350058
4005	NC_018000	CAC	2	6	179258	179263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350058
4006	NC_018000	GAC	2	6	179279	179284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4007	NC_018000	CGAG	2	8	179440	179447	25 %	0 %	50 %	25 %	398350058
4008	NC_018000	TTG	2	6	179472	179477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350058
4009	NC_018000	CGA	2	6	179497	179502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4010	NC_018000	GCCGC	2	10	179518	179527	0 %	0 %	40 %	60 %	398350058
4011	NC_018000	GAA	2	6	179564	179569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350058
4012	NC_018000	CGG	3	9	179596	179604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4013	NC_018000	CG	3	6	179605	179610	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4014	NC_018000	CG	3	6	179632	179637	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4015	NC_018000	CTCG	2	8	179642	179649	0 %	25 %	25 %	50 %	398350058
4016	NC_018000	TTCG	2	8	179678	179685	0 %	50 %	25 %	25 %	398350058
4017	NC_018000	CGG	2	6	179704	179709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4018	NC_018000	CG	3	6	179713	179718	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4019	NC_018000	GGT	2	6	179735	179740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350058
4020	NC_018000	GAT	2	6	179780	179785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4021	NC_018000	CAG	2	6	179807	179812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4022	NC_018000	CGC	2	6	179875	179880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4023	NC_018000	GC	3	6	179882	179887	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4024	NC_018000	CCA	2	6	179896	179901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350058
4025	NC_018000	GGCC	2	8	179926	179933	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4026	NC_018000	GAT	2	6	179975	179980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4027	NC_018000	GCA	2	6	180040	180045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4028	NC_018000	CTCG	2	8	180068	180075	0 %	25 %	25 %	50 %	398350058
4029	NC_018000	AGC	2	6	180084	180089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4030	NC_018000	CGA	2	6	180101	180106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4031	NC_018000	GTC	2	6	180110	180115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4032	NC_018000	GCA	2	6	180124	180129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4033	NC_018000	GAG	2	6	180156	180161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4034	NC_018000	CTG	2	6	180245	180250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4035	NC_018000	CGGT	2	8	180357	180364	0 %	25 %	50 %	25 %	398350058
4036	NC_018000	GCG	2	6	180371	180376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4037	NC_018000	CGAGC	2	10	180431	180440	20 %	0 %	40 %	40 %	398350058
4038	NC_018000	AGG	2	6	180531	180536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
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4040	NC_018000	GCC	2	6	180661	180666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4041	NC_018000	CCG	2	6	180675	180680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4042	NC_018000	AGC	2	6	180681	180686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4043	NC_018000	CGA	2	6	180709	180714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4044	NC_018000	AGC	2	6	180720	180725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4045	NC_018000	CGAG	2	8	180727	180734	25 %	0 %	50 %	25 %	398350058
4046	NC_018000	TAG	2	6	180765	180770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
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4049	NC_018000	GCG	2	6	180806	180811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4050	NC_018000	AGC	2	6	180819	180824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4051	NC_018000	CG	3	6	180853	180858	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4052	NC_018000	CGA	2	6	180931	180936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4053	NC_018000	GGC	2	6	180950	180955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
4054	NC_018000	GCC	2	6	180962	180967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4055	NC_018000	GAG	2	6	180977	180982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350058
4056	NC_018000	TGA	2	6	180985	180990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4057	NC_018000	GCCGGA	2	12	181040	181051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	398350058
4058	NC_018000	GGCGAT	2	12	181067	181078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	398350058
4059	NC_018000	GTTC	2	8	181141	181148	0 %	50 %	25 %	25 %	398350058
4060	NC_018000	CGA	2	6	181162	181167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4061	NC_018000	ATG	2	6	181194	181199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350058
4062	NC_018000	CAG	2	6	181223	181228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4063	NC_018000	GC	3	6	181235	181240	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4064	NC_018000	CCG	2	6	181345	181350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
4065	NC_018000	CGA	2	6	181360	181365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
4066	NC_018000	ACC	2	6	181371	181376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350058
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4068	NC_018000	ATC	2	6	181536	181541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350058
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4070	NC_018000	CGA	2	6	181615	181620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
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4073	NC_018000	GC	3	6	181649	181654	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4074	NC_018000	CGG	2	6	181786	181791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
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4080	NC_018000	GCC	2	6	182292	182297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350059
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4088	NC_018000	CGC	4	12	182584	182595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350059
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4090	NC_018000	CGGC	2	8	182657	182664	0 %	0 %	50 %	50 %	398350060
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4094	NC_018000	TCG	2	6	182819	182824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350061
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4102	NC_018000	TCGCC	2	10	183092	183101	0 %	20 %	20 %	60 %	398350061
4103	NC_018000	CGA	2	6	183105	183110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350061
4104	NC_018000	GCC	2	6	183148	183153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350061
4105	NC_018000	TGCCG	2	10	183180	183189	0 %	20 %	40 %	40 %	398350061
4106	NC_018000	CTCGAT	2	12	183217	183228	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398350061
4107	NC_018000	GGC	2	6	183237	183242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350061
4108	NC_018000	TCA	2	6	183269	183274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350061
4109	NC_018000	GC	3	6	183340	183345	0 %	0 %	50 %	50 %	398350061
4110	NC_018000	ATC	2	6	183361	183366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350061
4111	NC_018000	CGA	2	6	183369	183374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350061
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4118	NC_018000	TCG	2	6	183626	183631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350061
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4120	NC_018000	GCG	2	6	183772	183777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350061
4121	NC_018000	TCG	2	6	183785	183790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350061
4122	NC_018000	CGT	3	9	184186	184194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350062
4123	NC_018000	GTC	2	6	184316	184321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350062
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4126	NC_018000	CGA	2	6	184416	184421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350062
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4152	NC_018000	CGA	2	6	185925	185930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350065
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4233	NC_018000	CGA	2	6	189561	189566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350067
4234	NC_018000	CAGG	2	8	189570	189577	25 %	0 %	50 %	25 %	398350067
4235	NC_018000	CAC	2	6	189613	189618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350068
4236	NC_018000	AT	4	8	189678	189685	50 %	50 %	0 %	0 %	398350068
4237	NC_018000	CAG	4	12	189692	189703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350068
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4240	NC_018000	GCA	2	6	189802	189807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350068
4241	NC_018000	GC	3	6	189846	189851	0 %	0 %	50 %	50 %	398350068
4242	NC_018000	GGC	2	6	189965	189970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350068
4243	NC_018000	GCC	2	6	189987	189992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350068
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4245	NC_018000	CGAGC	2	10	190067	190076	20 %	0 %	40 %	40 %	398350068
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4253	NC_018000	GTGC	2	8	190408	190415	0 %	25 %	50 %	25 %	398350068
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4346	NC_018000	TCG	2	6	194978	194983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350073
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4350	NC_018000	CCGGG	2	10	195170	195179	0 %	0 %	60 %	40 %	398350073
4351	NC_018000	CCG	2	6	195255	195260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350073
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4355	NC_018000	GTC	2	6	195376	195381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350073
4356	NC_018000	TGC	2	6	195398	195403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350073
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4358	NC_018000	CCGA	2	8	195439	195446	25 %	0 %	25 %	50 %	398350073
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4360	NC_018000	CCCG	2	8	195497	195504	0 %	0 %	25 %	75 %	398350073
4361	NC_018000	GCG	2	6	195532	195537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350073
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4481	NC_018000	CAGC	2	8	201690	201697	25 %	0 %	25 %	50 %	398350077
4482	NC_018000	CAT	2	6	201718	201723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350077
4483	NC_018000	GGT	2	6	201729	201734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350077
4484	NC_018000	GCAG	2	8	201735	201742	25 %	0 %	50 %	25 %	398350077
4485	NC_018000	GCC	2	6	201757	201762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350077
4486	NC_018000	CGA	2	6	201807	201812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350077
4487	NC_018000	GC	3	6	201855	201860	0 %	0 %	50 %	50 %	398350077
4488	NC_018000	GCC	2	6	201883	201888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4489	NC_018000	GCG	2	6	201911	201916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
4490	NC_018000	GCC	2	6	202033	202038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4491	NC_018000	ATCCGG	2	12	202065	202076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4492	NC_018000	GCG	2	6	202082	202087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
4493	NC_018000	GCT	2	6	202109	202114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4494	NC_018000	GGTC	2	8	202115	202122	0 %	25 %	50 %	25 %	398350078
4495	NC_018000	CGG	2	6	202193	202198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
4496	NC_018000	TCT	2	6	202226	202231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350078
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4498	NC_018000	GAC	2	6	202266	202271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4499	NC_018000	GC	4	8	202272	202279	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
4500	NC_018000	TGG	2	6	202300	202305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078

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