MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018000	CG	3	6	159268	159273	0 %	0 %	50 %	50 %	398350041
3502	NC_018000	TCGAC	2	10	159277	159286	20 %	20 %	20 %	40 %	398350041
3503	NC_018000	CCG	2	6	159288	159293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350041
3504	NC_018000	GTC	2	6	159305	159310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350041
3505	NC_018000	GGC	2	6	159329	159334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350041
3506	NC_018000	GGC	2	6	159419	159424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350041
3507	NC_018000	TCG	2	6	159483	159488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350041
3508	NC_018000	GGC	2	6	159539	159544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350041
3509	NC_018000	CTT	2	6	159581	159586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350041
3510	NC_018000	CG	3	6	159595	159600	0 %	0 %	50 %	50 %	398350041
3511	NC_018000	TC	3	6	159637	159642	0 %	50 %	0 %	50 %	398350041
3512	NC_018000	GCG	2	6	159759	159764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3513	NC_018000	GAA	2	6	159842	159847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350042
3514	NC_018000	GGT	2	6	159854	159859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350042
3515	NC_018000	TTC	2	6	159867	159872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350042
3516	NC_018000	CGT	2	6	159887	159892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3517	NC_018000	CGG	2	6	159898	159903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3518	NC_018000	ACG	2	6	159954	159959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3519	NC_018000	GTCG	2	8	159980	159987	0 %	25 %	50 %	25 %	398350042
3520	NC_018000	CGC	2	6	160043	160048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3521	NC_018000	CTT	2	6	160067	160072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350042
3522	NC_018000	GA	3	6	160092	160097	50 %	0 %	50 %	0 %	398350042
3523	NC_018000	TCG	2	6	160101	160106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3524	NC_018000	GCC	2	6	160163	160168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3525	NC_018000	CGA	2	6	160189	160194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3526	NC_018000	ATC	2	6	160230	160235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3527	NC_018000	CCG	2	6	160293	160298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3528	NC_018000	CTG	2	6	160304	160309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3529	NC_018000	TCA	2	6	160366	160371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3530	NC_018000	GTC	2	6	160382	160387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3531	NC_018000	CCGCT	2	10	160397	160406	0 %	20 %	20 %	60 %	398350042
3532	NC_018000	CGGC	2	8	160464	160471	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3533	NC_018000	TCA	2	6	160492	160497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3534	NC_018000	GCG	2	6	160502	160507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3535	NC_018000	GAT	2	6	160523	160528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350042
3536	NC_018000	AGCG	2	8	160566	160573	25 %	0 %	50 %	25 %	398350042
3537	NC_018000	CG	3	6	160588	160593	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3538	NC_018000	TCA	3	9	160669	160677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3539	NC_018000	CGC	2	6	160789	160794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3540	NC_018000	GC	3	6	160810	160815	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3541	NC_018000	GGCC	2	8	160818	160825	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3542	NC_018000	GTC	2	6	160826	160831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3543	NC_018000	GC	3	6	160885	160890	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3544	NC_018000	GAT	2	6	160916	160921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350042
3545	NC_018000	CGG	2	6	160945	160950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3546	NC_018000	TCT	2	6	160960	160965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350042
3547	NC_018000	ATC	2	6	161082	161087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3548	NC_018000	GC	3	6	161100	161105	0 %	0 %	50 %	50 %	398350042
3549	NC_018000	CTC	2	6	161111	161116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350042
3550	NC_018000	GGC	2	6	161135	161140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3551	NC_018000	CAT	2	6	161168	161173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350042
3552	NC_018000	CGG	2	6	161188	161193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3553	NC_018000	CGG	2	6	161209	161214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350042
3554	NC_018000	C	6	6	161240	161245	0 %	0 %	0 %	100 %	398350042
3555	NC_018000	CTC	2	6	161249	161254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350042
3556	NC_018000	CGGCG	2	10	161255	161264	0 %	0 %	60 %	40 %	398350042
3557	NC_018000	CAGC	2	8	161270	161277	25 %	0 %	25 %	50 %	398350042
3558	NC_018000	CGT	2	6	161335	161340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3559	NC_018000	GCC	2	6	161409	161414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3560	NC_018000	GCC	2	6	161427	161432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350042
3561	NC_018000	CGT	2	6	161494	161499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3562	NC_018000	GTC	2	6	161516	161521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350042
3563	NC_018000	TGA	2	6	162076	162081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350043
3564	NC_018000	AGC	2	6	162097	162102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
3565	NC_018000	CGAC	2	8	162114	162121	25 %	0 %	25 %	50 %	398350043
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3570	NC_018000	GGC	2	6	162278	162283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350043
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3572	NC_018000	CGC	2	6	162305	162310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350043
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3574	NC_018000	ATGC	2	8	162390	162397	25 %	25 %	25 %	25 %	398350043
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3581	NC_018000	CGA	3	9	162665	162673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
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3588	NC_018000	CG	3	6	162876	162881	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3589	NC_018000	TCG	2	6	162883	162888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350043
3590	NC_018000	CGT	2	6	162920	162925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350043
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3592	NC_018000	GCCC	2	8	162978	162985	0 %	0 %	25 %	75 %	398350043
3593	NC_018000	GC	3	6	163026	163031	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3594	NC_018000	CGGCT	2	10	163060	163069	0 %	20 %	40 %	40 %	398350043
3595	NC_018000	CAGC	2	8	163109	163116	25 %	0 %	25 %	50 %	398350043
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3599	NC_018000	CGCCGG	2	12	163264	163275	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3600	NC_018000	GAG	2	6	163329	163334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350043
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3602	NC_018000	TC	3	6	163397	163402	0 %	50 %	0 %	50 %	398350043
3603	NC_018000	GCCG	2	8	163430	163437	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3604	NC_018000	CGA	2	6	163492	163497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
3605	NC_018000	CGA	2	6	163499	163504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
3606	NC_018000	AT	3	6	163505	163510	50 %	50 %	0 %	0 %	398350043
3607	NC_018000	GCC	2	6	163518	163523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350043
3608	NC_018000	GCC	2	6	163530	163535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350043
3609	NC_018000	CGA	2	6	163619	163624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
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3611	NC_018000	GAA	2	6	163734	163739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350043
3612	NC_018000	CG	3	6	163771	163776	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3613	NC_018000	GAT	2	6	163784	163789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350043
3614	NC_018000	GTG	2	6	163797	163802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350043
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3617	NC_018000	CAG	2	6	163857	163862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350043
3618	NC_018000	TCC	2	6	163923	163928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350043
3619	NC_018000	GC	3	6	164052	164057	0 %	0 %	50 %	50 %	398350043
3620	NC_018000	GCCC	2	8	164069	164076	0 %	0 %	25 %	75 %	398350043
3621	NC_018000	TCGA	2	8	164079	164086	25 %	25 %	25 %	25 %	398350043
3622	NC_018000	GGA	2	6	164108	164113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350043
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3865	NC_018000	GCAAGG	2	12	173877	173888	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398350052
3866	NC_018000	CG	3	6	173902	173907	0 %	0 %	50 %	50 %	398350052
3867	NC_018000	CGC	2	6	173914	173919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350052
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3869	NC_018000	GC	3	6	173945	173950	0 %	0 %	50 %	50 %	398350052
3870	NC_018000	CGA	2	6	173992	173997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350052
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3982	NC_018000	GGC	2	6	178526	178531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
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3985	NC_018000	CGC	2	6	178579	178584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350058
3986	NC_018000	CGG	2	6	178603	178608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
3987	NC_018000	GC	3	6	178642	178647	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
3988	NC_018000	CGT	2	6	178678	178683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
3989	NC_018000	GGT	2	6	178687	178692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350058
3990	NC_018000	CGA	2	6	178699	178704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
3991	NC_018000	GGC	2	6	178751	178756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350058
3992	NC_018000	CGT	2	6	178769	178774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058
3993	NC_018000	CAG	3	9	178796	178804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
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3997	NC_018000	CG	3	6	178999	179004	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
3998	NC_018000	CGA	2	6	179014	179019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350058
3999	NC_018000	GC	3	6	179051	179056	0 %	0 %	50 %	50 %	398350058
4000	NC_018000	TCG	2	6	179061	179066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350058

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