MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018000	GCC	2	6	111907	111912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350000
2502	NC_018000	GAA	2	6	111990	111995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350000
2503	NC_018000	GCC	2	6	112003	112008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350000
2504	NC_018000	C	6	6	112034	112039	0 %	0 %	0 %	100 %	398350000
2505	NC_018000	CGAC	2	8	112073	112080	25 %	0 %	25 %	50 %	398350000
2506	NC_018000	GGC	2	6	112113	112118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350000
2507	NC_018000	TGC	2	6	112196	112201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350000
2508	NC_018000	CGA	2	6	112260	112265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350000
2509	NC_018000	TCG	2	6	112280	112285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350000
2510	NC_018000	TGACG	2	10	112290	112299	20 %	20 %	40 %	20 %	398350000
2511	NC_018000	GGC	2	6	112315	112320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350000
2512	NC_018000	GTCG	2	8	112452	112459	0 %	25 %	50 %	25 %	398350000
2513	NC_018000	GGT	2	6	112462	112467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350000
2514	NC_018000	GCA	2	6	112515	112520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350000
2515	NC_018000	TGA	2	6	112529	112534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350000
2516	NC_018000	GAAGCC	2	12	112584	112595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350000
2517	NC_018000	CTT	2	6	112611	112616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350000
2518	NC_018000	GCCG	2	8	112647	112654	0 %	0 %	50 %	50 %	398350000
2519	NC_018000	ATCG	2	8	112665	112672	25 %	25 %	25 %	25 %	398350000
2520	NC_018000	CGC	2	6	113107	113112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2521	NC_018000	AGA	2	6	113116	113121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350001
2522	NC_018000	CGG	2	6	113146	113151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2523	NC_018000	TCG	2	6	113161	113166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2524	NC_018000	CGG	2	6	113204	113209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2525	NC_018000	TTC	2	6	113214	113219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350001
2526	NC_018000	ACGCTG	2	12	113229	113240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2527	NC_018000	GCA	2	6	113246	113251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2528	NC_018000	GTC	2	6	113259	113264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2529	NC_018000	CGGCG	2	10	113273	113282	0 %	0 %	60 %	40 %	398350001
2530	NC_018000	CGGC	2	8	113302	113309	0 %	0 %	50 %	50 %	398350001
2531	NC_018000	TC	3	6	113315	113320	0 %	50 %	0 %	50 %	398350001
2532	NC_018000	TCA	2	6	113329	113334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350001
2533	NC_018000	CGT	2	6	113348	113353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2534	NC_018000	GGC	2	6	113402	113407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2535	NC_018000	GGC	2	6	113421	113426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2536	NC_018000	GCC	2	6	113471	113476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2537	NC_018000	CGA	2	6	113515	113520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2538	NC_018000	CGA	2	6	113542	113547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2539	NC_018000	CGG	2	6	113617	113622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2540	NC_018000	GTC	2	6	113637	113642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2541	NC_018000	GTC	2	6	113649	113654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2542	NC_018000	CGA	2	6	113720	113725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2543	NC_018000	GCC	2	6	113733	113738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2544	NC_018000	TGC	2	6	113767	113772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2545	NC_018000	CGC	2	6	113801	113806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2546	NC_018000	GCC	2	6	113811	113816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2547	NC_018000	CGG	2	6	113890	113895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2548	NC_018000	CGG	2	6	113903	113908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2549	NC_018000	CGG	2	6	113921	113926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350001
2550	NC_018000	GAT	2	6	113960	113965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350001
2551	NC_018000	TCA	2	6	114040	114045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350001
2552	NC_018000	CCG	2	6	114049	114054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350001
2553	NC_018000	AGC	2	6	114083	114088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350001
2554	NC_018000	CCGC	2	8	114114	114121	0 %	0 %	25 %	75 %	398350002
2555	NC_018000	GAT	2	6	114232	114237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350002
2556	NC_018000	GC	4	8	114323	114330	0 %	0 %	50 %	50 %	398350002
2557	NC_018000	GGC	2	6	114551	114556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350002
2558	NC_018000	CGC	3	9	114583	114591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350002
2559	NC_018000	GTC	2	6	114605	114610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350002
2560	NC_018000	GCC	2	6	114629	114634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350002
2561	NC_018000	CGTC	2	8	114679	114686	0 %	25 %	25 %	50 %	398350002
2562	NC_018000	ATCCAT	2	12	114752	114763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350002
2563	NC_018000	TCA	2	6	114786	114791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350002
2564	NC_018000	GCC	2	6	114847	114852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350002
2565	NC_018000	CGC	2	6	114865	114870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350002
2566	NC_018000	GGC	2	6	114909	114914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350003
2567	NC_018000	GCCG	2	8	114919	114926	0 %	0 %	50 %	50 %	398350003
2568	NC_018000	TCG	3	9	114929	114937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350003
2569	NC_018000	GATG	2	8	115032	115039	25 %	25 %	50 %	0 %	398350003
2570	NC_018000	CTG	2	6	115078	115083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350003
2571	NC_018000	CCTT	2	8	115121	115128	0 %	50 %	0 %	50 %	398350003
2572	NC_018000	CGC	2	6	115137	115142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350003
2573	NC_018000	CGC	2	6	115226	115231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350003
2574	NC_018000	CTG	2	6	115264	115269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350003
2575	NC_018000	CGA	2	6	115272	115277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350003
2576	NC_018000	GCG	2	6	115350	115355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350003
2577	NC_018000	CTG	2	6	115357	115362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350003
2578	NC_018000	ATG	2	6	115385	115390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350003
2579	NC_018000	A	6	6	115405	115410	100 %	0 %	0 %	0 %	398350003
2580	NC_018000	GTC	2	6	115444	115449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350003
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2582	NC_018000	GAC	2	6	115704	115709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350004
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2584	NC_018000	TGC	2	6	115738	115743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2585	NC_018000	GCG	2	6	115744	115749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350004
2586	NC_018000	GCC	2	6	115765	115770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350004
2587	NC_018000	GCC	2	6	115805	115810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350004
2588	NC_018000	GTG	2	6	115812	115817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350004
2589	NC_018000	CCG	2	6	115822	115827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350004
2590	NC_018000	GCC	2	6	115833	115838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350004
2591	NC_018000	CGC	2	6	115856	115861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350004
2592	NC_018000	CGG	2	6	115867	115872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350004
2593	NC_018000	TGA	2	6	115891	115896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350004
2594	NC_018000	GGCT	2	8	115937	115944	0 %	25 %	50 %	25 %	398350004
2595	NC_018000	CGG	2	6	115981	115986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350004
2596	NC_018000	ACC	2	6	115992	115997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350004
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2598	NC_018000	GAC	2	6	116093	116098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2599	NC_018000	TCG	2	6	116159	116164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2600	NC_018000	GAC	2	6	116201	116206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2601	NC_018000	ACC	2	6	116262	116267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350004
2602	NC_018000	ATC	2	6	116277	116282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350004
2603	NC_018000	TCG	2	6	116299	116304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2604	NC_018000	ATT	2	6	116320	116325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	398350004
2605	NC_018000	CTGC	2	8	116327	116334	0 %	25 %	25 %	50 %	398350004
2606	NC_018000	GCGG	2	8	116369	116376	0 %	0 %	75 %	25 %	398350004
2607	NC_018000	CTT	2	6	116399	116404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350004
2608	NC_018000	GAG	2	6	116514	116519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350004
2609	NC_018000	ACG	2	6	116590	116595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350004
2610	NC_018000	CGATG	2	10	116678	116687	20 %	20 %	40 %	20 %	398350004
2611	NC_018000	CTC	2	6	116846	116851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350005
2612	NC_018000	TCCGC	2	10	116908	116917	0 %	20 %	20 %	60 %	398350005
2613	NC_018000	CGC	3	9	116930	116938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350005
2614	NC_018000	AGGC	2	8	116953	116960	25 %	0 %	50 %	25 %	398350005
2615	NC_018000	GGC	2	6	116985	116990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350005
2616	NC_018000	CGGC	2	8	116995	117002	0 %	0 %	50 %	50 %	398350005
2617	NC_018000	TGC	2	6	117011	117016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350005
2618	NC_018000	GAT	2	6	117044	117049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350005
2619	NC_018000	GAC	2	6	117143	117148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350005
2620	NC_018000	CGG	2	6	117152	117157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350005
2621	NC_018000	CG	3	6	117186	117191	0 %	0 %	50 %	50 %	398350005
2622	NC_018000	CGG	2	6	117194	117199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350005
2623	NC_018000	TCG	2	6	117202	117207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350005
2624	NC_018000	CTA	2	6	117227	117232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350005
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2740	NC_018000	CTGG	2	8	123218	123225	0 %	25 %	50 %	25 %	398350009
2741	NC_018000	CAT	2	6	123254	123259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350009
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2744	NC_018000	GCTC	2	8	123337	123344	0 %	25 %	25 %	50 %	398350009
2745	NC_018000	TCG	2	6	123391	123396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350009
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2752	NC_018000	CTG	2	6	123778	123783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350010
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2861	NC_018000	TGC	3	9	128091	128099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350013
2862	NC_018000	TCC	2	6	128169	128174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350013
2863	NC_018000	TGC	2	6	128175	128180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350013
2864	NC_018000	GCG	2	6	128189	128194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350013
2865	NC_018000	CTG	2	6	128219	128224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350013
2866	NC_018000	GCT	2	6	128287	128292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350013
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2869	NC_018000	CTG	2	6	128330	128335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350013
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2889	NC_018000	CG	4	8	131271	131278	0 %	0 %	50 %	50 %	398350015
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2980	NC_018000	GTC	2	6	135218	135223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350018
2981	NC_018000	CGG	2	6	135229	135234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350018
2982	NC_018000	CCG	2	6	135240	135245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350018
2983	NC_018000	CTC	2	6	135298	135303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350018
2984	NC_018000	GTC	3	9	135467	135475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350018
2985	NC_018000	AAG	2	6	135503	135508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350018
2986	NC_018000	CGCTT	2	10	135523	135532	0 %	40 %	20 %	40 %	398350018
2987	NC_018000	CGC	2	6	135547	135552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350018
2988	NC_018000	GCACG	2	10	135571	135580	20 %	0 %	40 %	40 %	398350018
2989	NC_018000	CG	3	6	135579	135584	0 %	0 %	50 %	50 %	398350018
2990	NC_018000	GAG	2	6	135593	135598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350018
2991	NC_018000	TCA	2	6	135642	135647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350018
2992	NC_018000	CAA	2	6	135763	135768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350018
2993	NC_018000	CGT	2	6	135844	135849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350018
2994	NC_018000	CCCG	2	8	135891	135898	0 %	0 %	25 %	75 %	398350018
2995	NC_018000	TTC	2	6	135902	135907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350018
2996	NC_018000	AAG	2	6	135914	135919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350018
2997	NC_018000	GTT	2	6	135932	135937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350018
2998	NC_018000	TTC	2	6	135962	135967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350018
2999	NC_018000	CGA	2	6	135970	135975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350018
3000	NC_018000	GAT	2	6	135979	135984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350018

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