MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018000	CG	3	6	44965	44970	0 %	0 %	50 %	50 %	398349939
1003	NC_018000	TCG	2	6	44986	44991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349939
1004	NC_018000	GT	3	6	45022	45027	0 %	50 %	50 %	0 %	398349939
1005	NC_018000	TGG	2	6	45070	45075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349939
1006	NC_018000	ATG	2	6	45161	45166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349940
1007	NC_018000	GGA	2	6	45211	45216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349940
1008	NC_018000	CGC	2	6	45268	45273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349940
1009	NC_018000	AGC	2	6	45282	45287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1010	NC_018000	GCC	2	6	45301	45306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349940
1011	NC_018000	CGA	2	6	45328	45333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1012	NC_018000	CAT	2	6	45451	45456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349940
1013	NC_018000	GAG	2	6	45509	45514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349940
1014	NC_018000	TCT	2	6	45526	45531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349940
1015	NC_018000	TCC	2	6	45543	45548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349940
1016	NC_018000	GAC	2	6	45575	45580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349940
1017	NC_018000	GAG	2	6	45719	45724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349941
1018	NC_018000	AGT	3	9	45755	45763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349941
1019	NC_018000	ACC	2	6	45764	45769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349941
1020	NC_018000	CAA	2	6	45784	45789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349941
1021	NC_018000	GGTGCG	2	12	45833	45844	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	398349941
1022	NC_018000	TGA	2	6	45876	45881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349941
1023	NC_018000	GAG	2	6	45914	45919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349941
1024	NC_018000	CAA	2	6	45931	45936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349941
1025	NC_018000	TCC	2	6	45939	45944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349941
1026	NC_018000	GAA	2	6	46043	46048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349941
1027	NC_018000	GAC	2	6	46088	46093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1028	NC_018000	CG	3	6	46095	46100	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
1029	NC_018000	CCG	3	9	46153	46161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1030	NC_018000	GCC	2	6	46184	46189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1031	NC_018000	CGC	2	6	46203	46208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1032	NC_018000	TC	3	6	46231	46236	0 %	50 %	0 %	50 %	398349941
1033	NC_018000	CAT	2	6	46273	46278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349941
1034	NC_018000	GCC	2	6	46340	46345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1035	NC_018000	CGA	2	6	46369	46374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1036	NC_018000	CGG	2	6	46378	46383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349941
1037	NC_018000	CTCGT	2	10	46394	46403	0 %	40 %	20 %	40 %	398349941
1038	NC_018000	TCG	2	6	46413	46418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1039	NC_018000	TGG	2	6	46422	46427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349941
1040	NC_018000	GAC	3	9	46451	46459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1041	NC_018000	TCG	2	6	46478	46483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349941
1042	NC_018000	CG	4	8	46504	46511	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
1043	NC_018000	GAG	2	6	46520	46525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349941
1044	NC_018000	CGTG	2	8	46555	46562	0 %	25 %	50 %	25 %	398349941
1045	NC_018000	AGC	2	6	46563	46568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349941
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1047	NC_018000	CGCGT	2	10	46686	46695	0 %	20 %	40 %	40 %	398349941
1048	NC_018000	CAT	2	6	46708	46713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349941
1049	NC_018000	GCC	2	6	46723	46728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1050	NC_018000	GC	3	6	46730	46735	0 %	0 %	50 %	50 %	398349941
1051	NC_018000	CGG	2	6	46736	46741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349941
1052	NC_018000	TGG	2	6	46783	46788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349941
1053	NC_018000	CGC	2	6	46806	46811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349941
1054	NC_018000	CGG	2	6	46818	46823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349941
1055	NC_018000	AGT	2	6	46964	46969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349942
1056	NC_018000	GCG	2	6	46977	46982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349942
1057	NC_018000	TCG	2	6	46987	46992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349942
1058	NC_018000	ATC	2	6	46996	47001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349942
1059	NC_018000	GGC	2	6	47002	47007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349942
1060	NC_018000	ACG	2	6	47026	47031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349942
1061	NC_018000	GTG	2	6	47071	47076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349942
1062	NC_018000	CGA	2	6	47111	47116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349942
1063	NC_018000	GCT	2	6	47123	47128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349942
1064	NC_018000	ATCG	2	8	47136	47143	25 %	25 %	25 %	25 %	398349942
1065	NC_018000	TGC	2	6	47159	47164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349942
1066	NC_018000	CCAG	2	8	47240	47247	25 %	0 %	25 %	50 %	398349942
1067	NC_018000	GTA	3	9	47298	47306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349942
1068	NC_018000	GC	3	6	47308	47313	0 %	0 %	50 %	50 %	398349942
1069	NC_018000	TCT	2	6	47423	47428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349942
1070	NC_018000	GCCC	2	8	47793	47800	0 %	0 %	25 %	75 %	398349944
1071	NC_018000	CG	3	6	47805	47810	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
1072	NC_018000	GGCA	2	8	47835	47842	25 %	0 %	50 %	25 %	398349944
1073	NC_018000	TCG	2	6	47876	47881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349944
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1075	NC_018000	TTCC	2	8	47949	47956	0 %	50 %	0 %	50 %	398349944
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1078	NC_018000	GCCG	2	8	48024	48031	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
1079	NC_018000	TCGGCT	2	12	48050	48061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349944
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1083	NC_018000	CCG	2	6	48155	48160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349944
1084	NC_018000	GTCG	2	8	48220	48227	0 %	25 %	50 %	25 %	398349944
1085	NC_018000	TGC	2	6	48231	48236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349944
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1088	NC_018000	CGA	2	6	48368	48373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1089	NC_018000	GCC	2	6	48400	48405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349944
1090	NC_018000	TCG	2	6	48413	48418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1091	NC_018000	CGC	2	6	48468	48473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349944
1092	NC_018000	CGGCTA	2	12	48480	48491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1093	NC_018000	GAA	2	6	48573	48578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349944
1094	NC_018000	GATG	2	8	48579	48586	25 %	25 %	50 %	0 %	398349944
1095	NC_018000	GC	3	6	48594	48599	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
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1099	NC_018000	GGGC	2	8	48797	48804	0 %	0 %	75 %	25 %	398349944
1100	NC_018000	CTA	2	6	48816	48821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349944
1101	NC_018000	CGA	2	6	48840	48845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1102	NC_018000	TCG	2	6	48857	48862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1103	NC_018000	TCGC	2	8	48943	48950	0 %	25 %	25 %	50 %	398349944
1104	NC_018000	CGG	2	6	48963	48968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349944
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1107	NC_018000	CGA	2	6	49056	49061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349944
1108	NC_018000	TCA	2	6	49152	49157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349944
1109	NC_018000	GC	3	6	49167	49172	0 %	0 %	50 %	50 %	398349944
1110	NC_018000	GAT	2	6	49191	49196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349944
1111	NC_018000	CGC	2	6	49200	49205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349944
1112	NC_018000	TTG	2	6	49226	49231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349944
1113	NC_018000	GTG	2	6	49238	49243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349944
1114	NC_018000	GACG	2	8	49281	49288	25 %	0 %	50 %	25 %	398349944
1115	NC_018000	CGAC	2	8	49316	49323	25 %	0 %	25 %	50 %	398349944
1116	NC_018000	TCT	2	6	49343	49348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349944
1117	NC_018000	TTG	2	6	49369	49374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349944
1118	NC_018000	GCG	2	6	49378	49383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349944
1119	NC_018000	AAG	3	9	49577	49585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349945
1120	NC_018000	TTCGCC	2	12	49620	49631	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	398349945
1121	NC_018000	CAG	2	6	49688	49693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349945
1122	NC_018000	TCC	2	6	49751	49756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349945
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1124	NC_018000	TGG	2	6	49851	49856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349945
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1245	NC_018000	GCG	3	9	55451	55459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349951
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1359	NC_018000	GCGG	3	12	61160	61171	0 %	0 %	75 %	25 %	398349955
1360	NC_018000	GTCCT	2	10	61340	61349	0 %	40 %	20 %	40 %	398349956
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1371	NC_018000	GGCGC	2	10	61618	61627	0 %	0 %	60 %	40 %	398349956
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1495	NC_018000	TCGA	2	8	66102	66109	25 %	25 %	25 %	25 %	398349959
1496	NC_018000	CGT	2	6	66125	66130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349959
1497	NC_018000	TTG	2	6	66264	66269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349959
1498	NC_018000	CCG	2	6	66295	66300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349959
1499	NC_018000	CG	3	6	66315	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	398349959
1500	NC_018000	GAC	2	6	66362	66367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349959

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