MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018000	TCC	2	6	669797	669802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350504
14002	NC_018000	GCA	2	6	669812	669817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350504
14003	NC_018000	GCA	2	6	669826	669831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350504
14004	NC_018000	AGTG	2	8	669849	669856	25 %	25 %	50 %	0 %	398350504
14005	NC_018000	AG	3	6	669867	669872	50 %	0 %	50 %	0 %	398350504
14006	NC_018000	GAA	2	6	669893	669898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350504
14007	NC_018000	CAT	2	6	669991	669996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350504
14008	NC_018000	CAC	2	6	670030	670035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350505
14009	NC_018000	GCG	2	6	670055	670060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350505
14010	NC_018000	CGT	2	6	670069	670074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14011	NC_018000	GCCC	2	8	670083	670090	0 %	0 %	25 %	75 %	398350505
14012	NC_018000	CGA	2	6	670213	670218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14013	NC_018000	GAT	2	6	670231	670236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350505
14014	NC_018000	GAT	3	9	670258	670266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350505
14015	NC_018000	CGG	3	9	670375	670383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350505
14016	NC_018000	CG	3	6	670408	670413	0 %	0 %	50 %	50 %	398350505
14017	NC_018000	GCC	2	6	670418	670423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350505
14018	NC_018000	GGC	2	6	670424	670429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350505
14019	NC_018000	TCG	2	6	670455	670460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14020	NC_018000	GATC	2	8	670495	670502	25 %	25 %	25 %	25 %	398350505
14021	NC_018000	CAA	3	9	670528	670536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350505
14022	NC_018000	GAG	2	6	670577	670582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350505
14023	NC_018000	TCG	2	6	670610	670615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14024	NC_018000	GTC	2	6	670625	670630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14025	NC_018000	GCCG	2	8	670651	670658	0 %	0 %	50 %	50 %	398350505
14026	NC_018000	GCC	3	9	670757	670765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350505
14027	NC_018000	CGG	2	6	670843	670848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350505
14028	NC_018000	GGC	2	6	670856	670861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350505
14029	NC_018000	TCG	2	6	670881	670886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350505
14030	NC_018000	CG	3	6	670885	670890	0 %	0 %	50 %	50 %	398350505
14031	NC_018000	CGT	2	6	671133	671138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14032	NC_018000	TCG	3	9	671171	671179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14033	NC_018000	GAT	2	6	671185	671190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350506
14034	NC_018000	GGCG	2	8	671191	671198	0 %	0 %	75 %	25 %	398350506
14035	NC_018000	TCG	2	6	671219	671224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14036	NC_018000	CGG	2	6	671225	671230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350506
14037	NC_018000	CG	3	6	671300	671305	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14038	NC_018000	CAC	2	6	671361	671366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350506
14039	NC_018000	GAC	2	6	671400	671405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14040	NC_018000	CGA	2	6	671421	671426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14041	NC_018000	CGGCC	2	10	671485	671494	0 %	0 %	40 %	60 %	398350506
14042	NC_018000	TGG	2	6	671507	671512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350506
14043	NC_018000	CG	3	6	671513	671518	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14044	NC_018000	GGC	2	6	671521	671526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350506
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14047	NC_018000	GAC	2	6	671620	671625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14048	NC_018000	CG	3	6	671636	671641	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14049	NC_018000	TCGAGA	2	12	671753	671764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	398350506
14050	NC_018000	AAGGCG	2	12	671776	671787	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	398350506
14051	NC_018000	GCA	2	6	671817	671822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350506
14052	NC_018000	GCC	2	6	671827	671832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350506
14053	NC_018000	CGTC	2	8	671868	671875	0 %	25 %	25 %	50 %	398350506
14054	NC_018000	TCGG	2	8	671989	671996	0 %	25 %	50 %	25 %	398350506
14055	NC_018000	CG	3	6	672015	672020	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14056	NC_018000	GC	3	6	672061	672066	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14057	NC_018000	CCT	2	6	672135	672140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350506
14058	NC_018000	GC	3	6	672213	672218	0 %	0 %	50 %	50 %	398350506
14059	NC_018000	CGT	2	6	672324	672329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350507
14060	NC_018000	TCC	2	6	672374	672379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350507
14061	NC_018000	GC	3	6	672416	672421	0 %	0 %	50 %	50 %	398350507
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14065	NC_018000	CCGG	2	8	672627	672634	0 %	0 %	50 %	50 %	398350507
14066	NC_018000	GC	3	6	672660	672665	0 %	0 %	50 %	50 %	398350507
14067	NC_018000	GGC	2	6	672787	672792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350507
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14069	NC_018000	GCCG	2	8	673327	673334	0 %	0 %	50 %	50 %	398350509
14070	NC_018000	CAT	2	6	673342	673347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350509
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14114	NC_018000	ACG	2	6	674926	674931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350510
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14119	NC_018000	ATCCTG	2	12	675010	675021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	398350510
14120	NC_018000	CAT	2	6	675045	675050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350510
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14122	NC_018000	TG	3	6	675132	675137	0 %	50 %	50 %	0 %	398350510
14123	NC_018000	CAC	2	6	675142	675147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350510
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14223	NC_018000	GGCT	2	8	679007	679014	0 %	25 %	50 %	25 %	398350515
14224	NC_018000	GGAC	2	8	679041	679048	25 %	0 %	50 %	25 %	398350515
14225	NC_018000	CAA	2	6	679102	679107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350515
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14227	NC_018000	ATGA	2	8	679129	679136	50 %	25 %	25 %	0 %	398350515
14228	NC_018000	CCG	2	6	679153	679158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350516
14229	NC_018000	AAGG	2	8	679184	679191	50 %	0 %	50 %	0 %	398350516
14230	NC_018000	CCGG	2	8	679239	679246	0 %	0 %	50 %	50 %	398350516
14231	NC_018000	TCG	2	6	679319	679324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350516
14232	NC_018000	TGGA	2	8	679351	679358	25 %	25 %	50 %	0 %	398350516
14233	NC_018000	GTCAAT	2	12	679360	679371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	398350516
14234	NC_018000	CCA	2	6	679372	679377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350516
14235	NC_018000	GC	3	6	679451	679456	0 %	0 %	50 %	50 %	398350516
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14358	NC_018000	A	7	7	684533	684539	100 %	0 %	0 %	0 %	398350523
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14465	NC_018000	GTC	2	6	690161	690166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350527
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14467	NC_018000	ATCG	2	8	690257	690264	25 %	25 %	25 %	25 %	398350527
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14472	NC_018000	GGCG	2	8	690370	690377	0 %	0 %	75 %	25 %	398350527
14473	NC_018000	ACC	2	6	690516	690521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350527
14474	NC_018000	AG	3	6	690533	690538	50 %	0 %	50 %	0 %	398350527
14475	NC_018000	TCA	2	6	690556	690561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350527
14476	NC_018000	TCAGC	2	10	690624	690633	20 %	20 %	20 %	40 %	398350528
14477	NC_018000	GGC	2	6	690790	690795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350528
14478	NC_018000	CGGC	2	8	690890	690897	0 %	0 %	50 %	50 %	398350528
14479	NC_018000	T	8	8	690915	690922	0 %	100 %	0 %	0 %	398350528
14480	NC_018000	GCG	2	6	690974	690979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350528
14481	NC_018000	CAG	2	6	691015	691020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14482	NC_018000	GTC	2	6	691064	691069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14483	NC_018000	GC	3	6	691111	691116	0 %	0 %	50 %	50 %	398350528
14484	NC_018000	GAT	2	6	691141	691146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350528
14485	NC_018000	TCC	2	6	691233	691238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350528
14486	NC_018000	GCC	2	6	691246	691251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350528
14487	NC_018000	CGT	2	6	691264	691269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14488	NC_018000	ATG	2	6	691292	691297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350528
14489	NC_018000	TCG	2	6	691388	691393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14490	NC_018000	GTC	2	6	691439	691444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14491	NC_018000	CTG	2	6	691453	691458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350528
14492	NC_018000	CTC	2	6	691536	691541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350528
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14497	NC_018000	ATC	2	6	691748	691753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350528
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14499	NC_018000	CTT	2	6	691852	691857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350528
14500	NC_018000	ACC	2	6	691891	691896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350528

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