MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018000	TGA	2	6	23192	23197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349924
502	NC_018000	TCG	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
503	NC_018000	TGG	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349925
504	NC_018000	AGG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349925
505	NC_018000	GTC	2	6	23323	23328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
506	NC_018000	TCG	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
507	NC_018000	GAT	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349925
508	NC_018000	GC	3	6	23510	23515	0 %	0 %	50 %	50 %	398349925
509	NC_018000	TCG	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
510	NC_018000	GCT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349925
511	NC_018000	CAC	2	6	23574	23579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349925
512	NC_018000	TCA	2	6	23618	23623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349925
513	NC_018000	CGA	2	6	23649	23654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349925
514	NC_018000	GAGC	2	8	23744	23751	25 %	0 %	50 %	25 %	398349926
515	NC_018000	TCA	2	6	23754	23759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349926
516	NC_018000	CGG	2	6	23821	23826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
517	NC_018000	GCG	2	6	23832	23837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
518	NC_018000	GCG	3	9	23910	23918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
519	NC_018000	TCG	2	6	23926	23931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
520	NC_018000	GC	5	10	23935	23944	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
521	NC_018000	CTG	2	6	23955	23960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
522	NC_018000	TGC	2	6	23969	23974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
523	NC_018000	GAT	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349926
524	NC_018000	GCG	2	6	24021	24026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
525	NC_018000	TCCG	2	8	24027	24034	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
526	NC_018000	AGCGG	2	10	24065	24074	20 %	0 %	60 %	20 %	398349926
527	NC_018000	GCT	2	6	24095	24100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
528	NC_018000	CGA	2	6	24103	24108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
529	NC_018000	GCCG	2	8	24290	24297	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
530	NC_018000	GTC	2	6	24324	24329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
531	NC_018000	GC	3	6	24402	24407	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
532	NC_018000	G	6	6	24409	24414	0 %	0 %	100 %	0 %	398349926
533	NC_018000	AGG	2	6	24415	24420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349926
534	NC_018000	GC	3	6	24428	24433	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
535	NC_018000	GCT	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
536	NC_018000	CACG	2	8	24476	24483	25 %	0 %	25 %	50 %	398349926
537	NC_018000	CGC	2	6	24493	24498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
538	NC_018000	AGC	2	6	24553	24558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
539	NC_018000	GCA	2	6	24578	24583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
540	NC_018000	CGGC	2	8	24640	24647	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
541	NC_018000	GTG	2	6	24699	24704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349926
542	NC_018000	CGAT	2	8	24754	24761	25 %	25 %	25 %	25 %	398349926
543	NC_018000	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
544	NC_018000	CGG	2	6	24854	24859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
545	NC_018000	GGC	2	6	24929	24934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
546	NC_018000	CGA	2	6	24935	24940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
547	NC_018000	GC	3	6	24945	24950	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
548	NC_018000	GAG	2	6	24957	24962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349926
549	NC_018000	GAC	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
550	NC_018000	CGG	2	6	25046	25051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
551	NC_018000	CCG	2	6	25139	25144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
552	NC_018000	GCTC	2	8	25175	25182	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
553	NC_018000	CGG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
554	NC_018000	TGC	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
555	NC_018000	CGG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
556	NC_018000	CG	3	6	25245	25250	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
557	NC_018000	GGC	3	9	25259	25267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
558	NC_018000	GC	3	6	25266	25271	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
559	NC_018000	CGT	2	6	25274	25279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
560	NC_018000	ATC	2	6	25317	25322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349926
561	NC_018000	CCTG	2	8	25402	25409	0 %	25 %	25 %	50 %	398349926
562	NC_018000	TGG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349926
563	NC_018000	TGC	2	6	25507	25512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
564	NC_018000	CGGC	2	8	25514	25521	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
565	NC_018000	ACA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398349926
566	NC_018000	CGG	2	6	25594	25599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349926
567	NC_018000	GCC	2	6	25612	25617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
568	NC_018000	TGC	2	6	25621	25626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
569	NC_018000	GAC	2	6	25635	25640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349926
570	NC_018000	GA	3	6	25674	25679	50 %	0 %	50 %	0 %	398349926
571	NC_018000	CGC	2	6	25712	25717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349926
572	NC_018000	GCAAG	2	10	25733	25742	40 %	0 %	40 %	20 %	398349926
573	NC_018000	GGGA	2	8	25818	25825	25 %	0 %	75 %	0 %	398349926
574	NC_018000	GGT	2	6	25853	25858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398349926
575	NC_018000	TCA	2	6	25889	25894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349926
576	NC_018000	CTG	2	6	25896	25901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
577	NC_018000	AC	3	6	25925	25930	50 %	0 %	0 %	50 %	398349926
578	NC_018000	GCCG	2	8	25934	25941	0 %	0 %	50 %	50 %	398349926
579	NC_018000	GCT	2	6	25973	25978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349926
580	NC_018000	CGA	2	6	26136	26141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349927
581	NC_018000	TCG	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349927
582	NC_018000	CTG	2	6	26375	26380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349927
583	NC_018000	GGA	2	6	26410	26415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349927
584	NC_018000	TCG	2	6	26421	26426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349927
585	NC_018000	CTG	2	6	26438	26443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349927
586	NC_018000	AGG	2	6	26448	26453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349927
587	NC_018000	CG	3	6	26458	26463	0 %	0 %	50 %	50 %	398349927
588	NC_018000	TCT	2	6	26506	26511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349927
589	NC_018000	CGCC	2	8	26512	26519	0 %	0 %	25 %	75 %	398349927
590	NC_018000	TGC	2	6	26559	26564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349927
591	NC_018000	GAG	2	6	26681	26686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398349927
592	NC_018000	TCCT	2	8	26702	26709	0 %	50 %	0 %	50 %	398349927
593	NC_018000	CAC	2	6	26711	26716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398349927
594	NC_018000	CGC	2	6	26746	26751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349927
595	NC_018000	CCGG	2	8	26752	26759	0 %	0 %	50 %	50 %	398349927
596	NC_018000	GAA	2	6	26806	26811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398349927
597	NC_018000	GCC	2	6	26827	26832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349927
598	NC_018000	TCA	2	6	26835	26840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349927
599	NC_018000	ACG	2	6	26903	26908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349927
600	NC_018000	AT	3	6	26937	26942	50 %	50 %	0 %	0 %	398349927
601	NC_018000	ACT	2	6	26958	26963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349927
602	NC_018000	TTC	2	6	26986	26991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398349927
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604	NC_018000	CGA	2	6	27598	27603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349928
605	NC_018000	GCC	2	6	27626	27631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349928
606	NC_018000	AGGC	2	8	27673	27680	25 %	0 %	50 %	25 %	398349928
607	NC_018000	CGG	2	6	27757	27762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349928
608	NC_018000	AAGC	2	8	27868	27875	50 %	0 %	25 %	25 %	398349928
609	NC_018000	CG	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
610	NC_018000	AGCCG	2	10	27895	27904	20 %	0 %	40 %	40 %	398349928
611	NC_018000	CCT	2	6	27922	27927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398349928
612	NC_018000	CGA	2	6	27982	27987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398349928
613	NC_018000	GCG	2	6	28058	28063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349928
614	NC_018000	GGC	2	6	28142	28147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349928
615	NC_018000	GTT	2	6	28163	28168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398349928
616	NC_018000	GC	3	6	28259	28264	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
617	NC_018000	CGG	2	6	28312	28317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349928
618	NC_018000	GCT	2	6	28363	28368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349928
619	NC_018000	CAT	2	6	28394	28399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398349928
620	NC_018000	GGC	2	6	28441	28446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398349928
621	NC_018000	GATCG	2	10	28481	28490	20 %	20 %	40 %	20 %	398349928
622	NC_018000	GCT	2	6	28504	28509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349928
623	NC_018000	GC	3	6	28541	28546	0 %	0 %	50 %	50 %	398349928
624	NC_018000	GCC	2	6	28563	28568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349928
625	NC_018000	ATG	2	6	28623	28628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398349928
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627	NC_018000	CGT	2	6	28675	28680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398349928
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754	NC_018000	CGC	2	6	33591	33596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398349930
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