MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018000	ATG	2	6	287299	287304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350148
6002	NC_018000	TGT	2	6	287338	287343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350148
6003	NC_018000	GCG	2	6	287504	287509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350148
6004	NC_018000	GCC	2	6	287591	287596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
6005	NC_018000	T	7	7	287639	287645	0 %	100 %	0 %	0 %	398350148
6006	NC_018000	CTC	2	6	287655	287660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350148
6007	NC_018000	GCG	2	6	287661	287666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350148
6008	NC_018000	CGC	2	6	287709	287714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
6009	NC_018000	CTTC	2	8	287720	287727	0 %	50 %	0 %	50 %	398350148
6010	NC_018000	GCG	2	6	287747	287752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350148
6011	NC_018000	TCCGC	2	10	287762	287771	0 %	20 %	20 %	60 %	398350148
6012	NC_018000	GCC	2	6	287811	287816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
6013	NC_018000	CCG	2	6	287870	287875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
6014	NC_018000	GCC	2	6	287899	287904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
6015	NC_018000	CGCC	2	8	287921	287928	0 %	0 %	25 %	75 %	398350148
6016	NC_018000	CAA	2	6	287939	287944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350148
6017	NC_018000	TCA	2	6	287978	287983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350148
6018	NC_018000	AGT	2	6	288094	288099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350149
6019	NC_018000	GACG	2	8	288152	288159	25 %	0 %	50 %	25 %	398350149
6020	NC_018000	CCA	2	6	288178	288183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350149
6021	NC_018000	CGC	2	6	288197	288202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6022	NC_018000	GCC	2	6	288232	288237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6023	NC_018000	GGT	2	6	288275	288280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350149
6024	NC_018000	CGC	2	6	288326	288331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6025	NC_018000	GCC	2	6	288369	288374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6026	NC_018000	GACG	2	8	288380	288387	25 %	0 %	50 %	25 %	398350149
6027	NC_018000	CTC	3	9	288411	288419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350149
6028	NC_018000	GGC	2	6	288462	288467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6029	NC_018000	CGG	2	6	288492	288497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6030	NC_018000	CGG	2	6	288542	288547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6031	NC_018000	CGA	2	6	288595	288600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350149
6032	NC_018000	CATGTG	2	12	288620	288631	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	398350149
6033	NC_018000	CAC	2	6	288638	288643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350149
6034	NC_018000	CGG	2	6	288670	288675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6035	NC_018000	CTGCC	2	10	288695	288704	0 %	20 %	20 %	60 %	398350149
6036	NC_018000	CAAGTC	2	12	288710	288721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	398350149
6037	NC_018000	GCC	2	6	288761	288766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6038	NC_018000	CAC	2	6	288773	288778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350149
6039	NC_018000	GTC	2	6	288824	288829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350149
6040	NC_018000	GCC	2	6	288837	288842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350149
6041	NC_018000	ACC	2	6	288906	288911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350149
6042	NC_018000	AG	3	6	288918	288923	50 %	0 %	50 %	0 %	398350149
6043	NC_018000	GGC	2	6	289012	289017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6044	NC_018000	CGG	2	6	289036	289041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350149
6045	NC_018000	CTC	2	6	289050	289055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350149
6046	NC_018000	ACA	2	6	289418	289423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350150
6047	NC_018000	CAG	2	6	289432	289437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350150
6048	NC_018000	GTCG	2	8	289479	289486	0 %	25 %	50 %	25 %	398350150
6049	NC_018000	CAT	2	6	289536	289541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350150
6050	NC_018000	GGTG	2	8	289595	289602	0 %	25 %	75 %	0 %	398350150
6051	NC_018000	GT	3	6	289604	289609	0 %	50 %	50 %	0 %	398350150
6052	NC_018000	GCA	2	6	289749	289754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350150
6053	NC_018000	CGC	2	6	289809	289814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350151
6054	NC_018000	T	7	7	289823	289829	0 %	100 %	0 %	0 %	398350151
6055	NC_018000	CTG	2	6	289833	289838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350151
6056	NC_018000	TGC	2	6	289871	289876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350151
6057	NC_018000	GC	3	6	289935	289940	0 %	0 %	50 %	50 %	398350151
6058	NC_018000	TCT	2	6	289976	289981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350151
6059	NC_018000	CGA	2	6	290036	290041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350151
6060	NC_018000	GTCA	2	8	290070	290077	25 %	25 %	25 %	25 %	398350151
6061	NC_018000	CGT	2	6	290090	290095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350151
6062	NC_018000	TG	3	6	290188	290193	0 %	50 %	50 %	0 %	398350151
6063	NC_018000	GC	3	6	290254	290259	0 %	0 %	50 %	50 %	398350151
6064	NC_018000	GAA	2	6	290367	290372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350151
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6070	NC_018000	CGTC	2	8	292354	292361	0 %	25 %	25 %	50 %	398350153
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6103	NC_018000	GTCG	2	8	294986	294993	0 %	25 %	50 %	25 %	398350154
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6117	NC_018000	GA	3	6	295617	295622	50 %	0 %	50 %	0 %	398350154
6118	NC_018000	CGA	2	6	295658	295663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350154
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6120	NC_018000	GGC	2	6	295694	295699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350154
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6122	NC_018000	GGT	2	6	295754	295759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350154
6123	NC_018000	CAGTG	2	10	295820	295829	20 %	20 %	40 %	20 %	398350154
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6243	NC_018000	CTGG	2	8	301749	301756	0 %	25 %	50 %	25 %	398350157
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6364	NC_018000	GCG	2	6	307603	307608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350159
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6480	NC_018000	AATG	2	8	313126	313133	50 %	25 %	25 %	0 %	398350165
6481	NC_018000	GGC	2	6	313136	313141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350165
6482	NC_018000	GAT	2	6	313205	313210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350165
6483	NC_018000	CGA	3	9	313213	313221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350165
6484	NC_018000	GCCGAA	2	12	313235	313246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350165
6485	NC_018000	AGCC	2	8	313269	313276	25 %	0 %	25 %	50 %	398350165
6486	NC_018000	CGA	2	6	313288	313293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350165
6487	NC_018000	GCC	2	6	313608	313613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350166
6488	NC_018000	ACC	3	9	313614	313622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350166
6489	NC_018000	GCC	2	6	313642	313647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350166
6490	NC_018000	CCG	2	6	313699	313704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350166
6491	NC_018000	CTG	2	6	313794	313799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350166
6492	NC_018000	CGA	2	6	313823	313828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350166
6493	NC_018000	TCA	2	6	313871	313876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350166
6494	NC_018000	CGGCG	2	10	313938	313947	0 %	0 %	60 %	40 %	398350166
6495	NC_018000	GATC	3	12	313997	314008	25 %	25 %	25 %	25 %	398350166
6496	NC_018000	GTC	3	9	314019	314027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350166
6497	NC_018000	GCC	2	6	314055	314060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350166
6498	NC_018000	CTT	2	6	314064	314069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350166
6499	NC_018000	CGA	2	6	314087	314092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350166
6500	NC_018000	GTG	2	6	314118	314123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350166

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