MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018000	CGT	2	6	258125	258130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350121
5502	NC_018000	CGG	2	6	258188	258193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350121
5503	NC_018000	CGG	2	6	258211	258216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350121
5504	NC_018000	GGATC	2	10	258245	258254	20 %	20 %	40 %	20 %	398350121
5505	NC_018000	TGAG	2	8	258274	258281	25 %	25 %	50 %	0 %	398350121
5506	NC_018000	TTC	2	6	258354	258359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350121
5507	NC_018000	TGGA	2	8	258376	258383	25 %	25 %	50 %	0 %	398350121
5508	NC_018000	GC	3	6	258401	258406	0 %	0 %	50 %	50 %	398350121
5509	NC_018000	TCA	2	6	258451	258456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350121
5510	NC_018000	ACG	2	6	258459	258464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350121
5511	NC_018000	CGC	2	6	258496	258501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350121
5512	NC_018000	GC	3	6	258550	258555	0 %	0 %	50 %	50 %	398350121
5513	NC_018000	AAG	2	6	258558	258563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350121
5514	NC_018000	GATCG	2	10	258662	258671	20 %	20 %	40 %	20 %	398350122
5515	NC_018000	TGC	2	6	258690	258695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350122
5516	NC_018000	GGT	2	6	258733	258738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350122
5517	NC_018000	GAA	2	6	258772	258777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350122
5518	NC_018000	ACC	2	6	258876	258881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350122
5519	NC_018000	CGC	2	6	258907	258912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350122
5520	NC_018000	GATC	2	8	258922	258929	25 %	25 %	25 %	25 %	398350122
5521	NC_018000	CGG	2	6	258955	258960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350122
5522	NC_018000	ACC	2	6	258986	258991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350122
5523	NC_018000	TCG	2	6	259065	259070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350122
5524	NC_018000	TCC	2	6	259210	259215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350123
5525	NC_018000	GGC	2	6	259250	259255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
5526	NC_018000	ACG	2	6	259279	259284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5527	NC_018000	CGG	3	9	259295	259303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
5528	NC_018000	GCC	2	6	259320	259325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350123
5529	NC_018000	GTC	2	6	259353	259358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5530	NC_018000	AAC	2	6	259416	259421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350123
5531	NC_018000	GGC	2	6	259442	259447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
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5534	NC_018000	TCGA	2	8	259503	259510	25 %	25 %	25 %	25 %	398350123
5535	NC_018000	GAG	2	6	259533	259538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350123
5536	NC_018000	CCG	2	6	259556	259561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350123
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5538	NC_018000	A	6	6	259721	259726	100 %	0 %	0 %	0 %	398350123
5539	NC_018000	GAT	2	6	259733	259738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350123
5540	NC_018000	CGT	2	6	259754	259759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5541	NC_018000	CGA	2	6	259792	259797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5542	NC_018000	GCAG	2	8	259805	259812	25 %	0 %	50 %	25 %	398350123
5543	NC_018000	CAG	2	6	259827	259832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5544	NC_018000	GCC	2	6	259840	259845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350123
5545	NC_018000	CCG	3	9	259934	259942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350123
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5547	NC_018000	CGA	2	6	260005	260010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5548	NC_018000	CGTCA	2	10	260030	260039	20 %	20 %	20 %	40 %	398350123
5549	NC_018000	CGG	2	6	260090	260095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
5550	NC_018000	CGG	2	6	260144	260149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
5551	NC_018000	TTG	2	6	260210	260215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350123
5552	NC_018000	TCG	2	6	260224	260229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350123
5553	NC_018000	CG	3	6	260251	260256	0 %	0 %	50 %	50 %	398350123
5554	NC_018000	ATC	2	6	260334	260339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350123
5555	NC_018000	CGG	2	6	260395	260400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350123
5556	NC_018000	GGTA	2	8	260473	260480	25 %	25 %	50 %	0 %	398350123
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5558	NC_018000	CGG	2	6	260979	260984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350124
5559	NC_018000	GAC	2	6	260995	261000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350124
5560	NC_018000	TCGA	2	8	261023	261030	25 %	25 %	25 %	25 %	398350124
5561	NC_018000	CGA	2	6	261036	261041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350124
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5564	NC_018000	CGT	2	6	261175	261180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350124
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5585	NC_018000	GATC	2	8	262236	262243	25 %	25 %	25 %	25 %	398350125
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5607	NC_018000	CGA	2	6	263159	263164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350126
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5620	NC_018000	TCG	2	6	264085	264090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350127
5621	NC_018000	GCTG	2	8	264118	264125	0 %	25 %	50 %	25 %	398350127
5622	NC_018000	GGT	2	6	264186	264191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350127
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5624	NC_018000	GGT	2	6	264339	264344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350127
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5651	NC_018000	AAGC	2	8	265317	265324	50 %	0 %	25 %	25 %	398350128
5652	NC_018000	TCG	2	6	265327	265332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350128
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5662	NC_018000	GCGCTC	2	12	266201	266212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	398350129
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5741	NC_018000	GGCGG	2	10	270347	270356	0 %	0 %	80 %	20 %	398350132
5742	NC_018000	GCT	2	6	270362	270367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350132
5743	NC_018000	TGT	2	6	270388	270393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350132
5744	NC_018000	TCG	2	6	270412	270417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350132
5745	NC_018000	GGC	2	6	270438	270443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350132
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5853	NC_018000	CGTCAC	2	12	276836	276847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	398350137
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5855	NC_018000	GGCC	2	8	277261	277268	0 %	0 %	50 %	50 %	398350138
5856	NC_018000	CCA	2	6	277270	277275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350138
5857	NC_018000	CA	3	6	277274	277279	50 %	0 %	0 %	50 %	398350138
5858	NC_018000	ATCCCG	2	12	277296	277307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	398350138
5859	NC_018000	AGC	2	6	277320	277325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350138
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5982	NC_018000	TGT	2	6	286204	286209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350147
5983	NC_018000	TCT	2	6	286254	286259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350147
5984	NC_018000	GC	3	6	286267	286272	0 %	0 %	50 %	50 %	398350147
5985	NC_018000	AAG	2	6	286316	286321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350147
5986	NC_018000	GCGG	2	8	286339	286346	0 %	0 %	75 %	25 %	398350147
5987	NC_018000	GGCC	2	8	286364	286371	0 %	0 %	50 %	50 %	398350147
5988	NC_018000	CGGA	2	8	286479	286486	25 %	0 %	50 %	25 %	398350147
5989	NC_018000	GA	3	6	286485	286490	50 %	0 %	50 %	0 %	398350147
5990	NC_018000	AGA	2	6	286494	286499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350147
5991	NC_018000	CGG	2	6	286703	286708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350147
5992	NC_018000	GGC	2	6	286715	286720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350147
5993	NC_018000	CGA	2	6	286822	286827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350147
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5995	NC_018000	TCG	2	6	287083	287088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350148
5996	NC_018000	TG	3	6	287127	287132	0 %	50 %	50 %	0 %	398350148
5997	NC_018000	GCC	2	6	287152	287157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350148
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