MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018000	CGA	2	6	227631	227636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5002	NC_018000	CG	3	6	227657	227662	0 %	0 %	50 %	50 %	398350096
5003	NC_018000	GTT	2	6	227725	227730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350096
5004	NC_018000	GAG	2	6	227848	227853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350096
5005	NC_018000	GGC	2	6	227932	227937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5006	NC_018000	TGG	2	6	228003	228008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350096
5007	NC_018000	CGA	2	6	228279	228284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5008	NC_018000	TTC	2	6	228350	228355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350096
5009	NC_018000	CTT	2	6	228451	228456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350096
5010	NC_018000	ATC	2	6	228482	228487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350096
5011	NC_018000	CCT	2	6	228490	228495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350096
5012	NC_018000	ACG	2	6	228560	228565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5013	NC_018000	CGA	2	6	228591	228596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5014	NC_018000	TCG	2	6	228617	228622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5015	NC_018000	GAG	2	6	228623	228628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350096
5016	NC_018000	CGAC	2	8	228752	228759	25 %	0 %	25 %	50 %	398350096
5017	NC_018000	GGT	2	6	228816	228821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350096
5018	NC_018000	GCTCCT	2	12	228852	228863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	398350096
5019	NC_018000	TCC	2	6	228899	228904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350096
5020	NC_018000	GTA	2	6	228949	228954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350096
5021	NC_018000	CTG	2	6	228985	228990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5022	NC_018000	GTAGGT	2	12	228991	229002	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	398350096
5023	NC_018000	TCT	2	6	229032	229037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350096
5024	NC_018000	GGC	2	6	229078	229083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5025	NC_018000	GCG	2	6	229096	229101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5026	NC_018000	GGC	2	6	229108	229113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5027	NC_018000	GCGA	2	8	229128	229135	25 %	0 %	50 %	25 %	398350096
5028	NC_018000	TCG	2	6	229142	229147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5029	NC_018000	CGATGA	2	12	229149	229160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	398350096
5030	NC_018000	CCGA	2	8	229164	229171	25 %	0 %	25 %	50 %	398350096
5031	NC_018000	CGGT	2	8	229361	229368	0 %	25 %	50 %	25 %	398350096
5032	NC_018000	AGA	2	6	229464	229469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350096
5033	NC_018000	GAC	2	6	229501	229506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5034	NC_018000	TCT	2	6	229554	229559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350096
5035	NC_018000	GGC	3	9	229630	229638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5036	NC_018000	TCG	3	9	229679	229687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5037	NC_018000	CCG	2	6	229846	229851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350096
5038	NC_018000	AGC	2	6	229877	229882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5039	NC_018000	GCG	3	9	229915	229923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5040	NC_018000	GCC	2	6	230020	230025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350096
5041	NC_018000	TCG	2	6	230030	230035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
5042	NC_018000	GCG	2	6	230495	230500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350097
5043	NC_018000	CAT	2	6	230542	230547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350097
5044	NC_018000	GCTA	2	8	230650	230657	25 %	25 %	25 %	25 %	398350097
5045	NC_018000	GGAA	2	8	230726	230733	50 %	0 %	50 %	0 %	398350097
5046	NC_018000	TGA	2	6	230736	230741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350097
5047	NC_018000	TCG	3	9	230751	230759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350097
5048	NC_018000	TCA	2	6	230805	230810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350097
5049	NC_018000	CG	3	6	230834	230839	0 %	0 %	50 %	50 %	398350097
5050	NC_018000	GAC	2	6	230876	230881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350097
5051	NC_018000	GCC	2	6	230980	230985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350097
5052	NC_018000	CGAA	2	8	231095	231102	50 %	0 %	25 %	25 %	398350097
5053	NC_018000	GCC	2	6	231117	231122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350097
5054	NC_018000	GTC	2	6	231172	231177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350097
5055	NC_018000	CT	3	6	231203	231208	0 %	50 %	0 %	50 %	398350097
5056	NC_018000	GTTG	2	8	231255	231262	0 %	50 %	50 %	0 %	398350097
5057	NC_018000	GTTC	2	8	231274	231281	0 %	50 %	25 %	25 %	398350097
5058	NC_018000	CAC	2	6	231282	231287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350097
5059	NC_018000	GGA	2	6	231292	231297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350097
5060	NC_018000	GTA	2	6	231337	231342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350097
5061	NC_018000	ATGA	2	8	231490	231497	50 %	25 %	25 %	0 %	398350097
5062	NC_018000	AGCTG	2	10	231525	231534	20 %	20 %	40 %	20 %	398350097
5063	NC_018000	GAA	2	6	231677	231682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350098
5064	NC_018000	GCC	2	6	231721	231726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350098
5065	NC_018000	CTC	2	6	231759	231764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350098
5066	NC_018000	CGG	2	6	231800	231805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350098
5067	NC_018000	CTC	2	6	231918	231923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350098
5068	NC_018000	GAA	2	6	231945	231950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350098
5069	NC_018000	CTC	2	6	231957	231962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350098
5070	NC_018000	TCG	2	6	232075	232080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350098
5071	NC_018000	GAA	2	6	232146	232151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350098
5072	NC_018000	GACC	2	8	232157	232164	25 %	0 %	25 %	50 %	398350098
5073	NC_018000	CTTC	2	8	232200	232207	0 %	50 %	0 %	50 %	398350098
5074	NC_018000	GCC	2	6	232237	232242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350098
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5077	NC_018000	GCC	2	6	232428	232433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350098
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5080	NC_018000	GCC	2	6	232659	232664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350098
5081	NC_018000	GAT	2	6	232707	232712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350098
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5084	NC_018000	CGC	2	6	232754	232759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350098
5085	NC_018000	CGT	2	6	232950	232955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350098
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5087	NC_018000	CG	3	6	233069	233074	0 %	0 %	50 %	50 %	398350098
5088	NC_018000	CAG	2	6	233139	233144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350098
5089	NC_018000	GTC	2	6	233241	233246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350098
5090	NC_018000	TTC	2	6	233370	233375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350099
5091	NC_018000	TTC	2	6	233423	233428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350099
5092	NC_018000	CAG	2	6	233606	233611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350099
5093	NC_018000	GAA	2	6	233719	233724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350099
5094	NC_018000	GCG	2	6	233759	233764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350099
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5096	NC_018000	CGA	2	6	233899	233904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350099
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5101	NC_018000	TTG	2	6	234150	234155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350099
5102	NC_018000	TCAGC	2	10	234184	234193	20 %	20 %	20 %	40 %	398350099
5103	NC_018000	GCC	2	6	234204	234209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350099
5104	NC_018000	CG	3	6	234288	234293	0 %	0 %	50 %	50 %	398350099
5105	NC_018000	CGC	2	6	234365	234370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350099
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5107	NC_018000	CCAC	2	8	234415	234422	25 %	0 %	0 %	75 %	398350099
5108	NC_018000	TGTC	2	8	234447	234454	0 %	50 %	25 %	25 %	398350099
5109	NC_018000	TTG	2	6	234462	234467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350099
5110	NC_018000	CGCTG	2	10	234505	234514	0 %	20 %	40 %	40 %	398350099
5111	NC_018000	CTTG	2	8	234519	234526	0 %	50 %	25 %	25 %	398350099
5112	NC_018000	CAG	2	6	234628	234633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350099
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5117	NC_018000	TCATCC	2	12	234765	234776	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	398350099
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5119	NC_018000	CGAG	2	8	234855	234862	25 %	0 %	50 %	25 %	398350099
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5121	NC_018000	TCG	2	6	234876	234881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350099
5122	NC_018000	CCT	2	6	234928	234933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350099
5123	NC_018000	TTC	2	6	234962	234967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350099
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5140	NC_018000	CGG	2	6	236360	236365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350100
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5148	NC_018000	CGG	2	6	236639	236644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350100
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5150	NC_018000	CG	3	6	236706	236711	0 %	0 %	50 %	50 %	398350100
5151	NC_018000	CCGG	2	8	236771	236778	0 %	0 %	50 %	50 %	398350100
5152	NC_018000	CGAC	2	8	236812	236819	25 %	0 %	25 %	50 %	398350100
5153	NC_018000	TGA	2	6	236842	236847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350100
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5201	NC_018000	GC	3	6	238867	238872	0 %	0 %	50 %	50 %	398350102
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5241	NC_018000	ACG	2	6	241025	241030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350106
5242	NC_018000	GCTG	2	8	241040	241047	0 %	25 %	50 %	25 %	398350106
5243	NC_018000	GAGT	2	8	241061	241068	25 %	25 %	50 %	0 %	398350107
5244	NC_018000	AAC	2	6	241081	241086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350107
5245	NC_018000	GCC	2	6	241136	241141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350107
5246	NC_018000	CGA	3	9	241236	241244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350107
5247	NC_018000	CGA	4	12	241254	241265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350107
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5251	NC_018000	GC	3	6	243696	243701	0 %	0 %	50 %	50 %	398350108
5252	NC_018000	GAT	2	6	243710	243715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350108
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5254	NC_018000	TTC	2	6	243816	243821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350108
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5256	NC_018000	GTTTC	2	10	243910	243919	0 %	60 %	20 %	20 %	398350108
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5266	NC_018000	CAGC	2	8	244386	244393	25 %	0 %	25 %	50 %	398350108
5267	NC_018000	CGCA	2	8	244412	244419	25 %	0 %	25 %	50 %	398350108
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5274	NC_018000	CAA	2	6	244651	244656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350109
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5283	NC_018000	TCCA	2	8	245176	245183	25 %	25 %	0 %	50 %	398350109
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5347	NC_018000	CACGT	2	10	249016	249025	20 %	20 %	20 %	40 %	398350114
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5353	NC_018000	ATAG	2	8	249447	249454	50 %	25 %	25 %	0 %	398350114
5354	NC_018000	GCT	2	6	249470	249475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350114
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5358	NC_018000	GGC	2	6	249971	249976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350115
5359	NC_018000	TGA	2	6	249989	249994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350115
5360	NC_018000	TTC	2	6	250005	250010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350115
5361	NC_018000	TTC	2	6	250017	250022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350115
5362	NC_018000	GAG	2	6	250053	250058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350115
5363	NC_018000	CG	3	6	250128	250133	0 %	0 %	50 %	50 %	398350115
5364	NC_018000	GCA	2	6	250150	250155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350115
5365	NC_018000	AGG	2	6	250159	250164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350115
5366	NC_018000	GGA	2	6	250173	250178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350115
5367	NC_018000	CGA	2	6	250295	250300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350115
5368	NC_018000	TCG	2	6	250303	250308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350115
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5370	NC_018000	GCA	2	6	250352	250357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350115
5371	NC_018000	GCT	2	6	250381	250386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350115
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5380	NC_018000	TCG	2	6	250710	250715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350116
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5383	NC_018000	CGA	2	6	250930	250935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350116
5384	NC_018000	TCT	2	6	250945	250950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350116
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5483	NC_018000	GCA	2	6	257051	257056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350120
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5486	NC_018000	CG	3	6	257144	257149	0 %	0 %	50 %	50 %	398350120
5487	NC_018000	C	7	7	257298	257304	0 %	0 %	0 %	100 %	398350121
5488	NC_018000	CCT	2	6	257347	257352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350121
5489	NC_018000	CCG	2	6	257366	257371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350121
5490	NC_018000	TTCG	2	8	257382	257389	0 %	50 %	25 %	25 %	398350121
5491	NC_018000	AAT	2	6	257445	257450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398350121
5492	NC_018000	CT	3	6	257456	257461	0 %	50 %	0 %	50 %	398350121
5493	NC_018000	AGCC	2	8	257504	257511	25 %	0 %	25 %	50 %	398350121
5494	NC_018000	GAG	2	6	257586	257591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350121
5495	NC_018000	GAA	2	6	257835	257840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350121
5496	NC_018000	TGGCAT	2	12	257876	257887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	398350121
5497	NC_018000	CGG	2	6	257957	257962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350121
5498	NC_018000	GGCG	2	8	257981	257988	0 %	0 %	75 %	25 %	398350121
5499	NC_018000	CA	3	6	258035	258040	50 %	0 %	0 %	50 %	398350121
5500	NC_018000	GTT	2	6	258066	258071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350121

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