MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 chromosome

Total Repeats: 130637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018000	TGA	2	6	202307	202312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350078
4502	NC_018000	TGT	2	6	202334	202339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	398350078
4503	NC_018000	GCC	2	6	202372	202377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4504	NC_018000	GCGTG	2	10	202381	202390	0 %	20 %	60 %	20 %	398350078
4505	NC_018000	CCT	2	6	202418	202423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350078
4506	NC_018000	CCG	2	6	202532	202537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4507	NC_018000	GCTT	2	8	202550	202557	0 %	50 %	25 %	25 %	398350078
4508	NC_018000	GTC	2	6	202558	202563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4509	NC_018000	CAGC	2	8	202576	202583	25 %	0 %	25 %	50 %	398350078
4510	NC_018000	AGG	2	6	202666	202671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350078
4511	NC_018000	AAGG	2	8	202689	202696	50 %	0 %	50 %	0 %	398350078
4512	NC_018000	GCC	4	12	202706	202717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4513	NC_018000	TCCGGC	2	12	202720	202731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	398350078
4514	NC_018000	CGC	3	9	202737	202745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4515	NC_018000	CTG	2	6	202755	202760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4516	NC_018000	GAC	2	6	202786	202791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4517	NC_018000	GCC	2	6	202794	202799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350078
4518	NC_018000	CGA	3	9	202841	202849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4519	NC_018000	GC	3	6	202869	202874	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
4520	NC_018000	TGG	2	6	202891	202896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078
4521	NC_018000	GAG	2	6	202914	202919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350078
4522	NC_018000	GGC	2	6	202940	202945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350078
4523	NC_018000	CGA	2	6	202958	202963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4524	NC_018000	GC	3	6	203000	203005	0 %	0 %	50 %	50 %	398350078
4525	NC_018000	AGA	2	6	203018	203023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350078
4526	NC_018000	GCAG	2	8	203051	203058	25 %	0 %	50 %	25 %	398350078
4527	NC_018000	CGA	2	6	203106	203111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4528	NC_018000	CAGGAA	2	12	203121	203132	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	398350078
4529	NC_018000	CGT	2	6	203137	203142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4530	NC_018000	GCT	2	6	203147	203152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350078
4531	NC_018000	GTG	2	6	203158	203163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350078
4532	NC_018000	GCT	2	6	203197	203202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4533	NC_018000	AGC	2	6	203238	203243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4534	NC_018000	AGG	2	6	203250	203255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350079
4535	NC_018000	CGGG	2	8	203300	203307	0 %	0 %	75 %	25 %	398350079
4536	NC_018000	TAA	2	6	203328	203333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398350079
4537	NC_018000	AGG	2	6	203373	203378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398350079
4538	NC_018000	AGA	2	6	203395	203400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
4539	NC_018000	CTT	2	6	203444	203449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350079
4540	NC_018000	CGA	2	6	203554	203559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4541	NC_018000	AGA	2	6	203560	203565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
4542	NC_018000	TCG	3	9	203574	203582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4543	NC_018000	TCC	2	6	203598	203603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350079
4544	NC_018000	GAA	2	6	203726	203731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350079
4545	NC_018000	ATGA	2	8	203747	203754	50 %	25 %	25 %	0 %	398350079
4546	NC_018000	TGCG	2	8	203757	203764	0 %	25 %	50 %	25 %	398350079
4547	NC_018000	CGGCAT	2	12	203797	203808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4548	NC_018000	GCG	2	6	203814	203819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
4549	NC_018000	GCC	2	6	203903	203908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
4550	NC_018000	GAC	2	6	204029	204034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4551	NC_018000	GCG	2	6	204040	204045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
4552	NC_018000	CCT	2	6	204046	204051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350079
4553	NC_018000	GATCA	2	10	204059	204068	40 %	20 %	20 %	20 %	398350079
4554	NC_018000	GC	3	6	204078	204083	0 %	0 %	50 %	50 %	398350079
4555	NC_018000	CGA	2	6	204103	204108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4556	NC_018000	TCT	2	6	204109	204114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350079
4557	NC_018000	CCAG	2	8	204127	204134	25 %	0 %	25 %	50 %	398350079
4558	NC_018000	ACC	2	6	204150	204155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350079
4559	NC_018000	CTT	2	6	204200	204205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350079
4560	NC_018000	CCA	2	6	204208	204213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350079
4561	NC_018000	GCC	2	6	204228	204233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
4562	NC_018000	CGG	2	6	204277	204282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350079
4563	NC_018000	CGATCA	2	12	204283	204294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	398350079
4564	NC_018000	CGA	2	6	204388	204393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
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4567	NC_018000	CGA	2	6	204454	204459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
4568	NC_018000	GAT	2	6	204527	204532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350079
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4570	NC_018000	GCC	2	6	204568	204573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350079
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4572	NC_018000	CGA	2	6	204634	204639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350079
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4580	NC_018000	ACC	2	6	204932	204937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350080
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4587	NC_018000	CG	3	6	205097	205102	0 %	0 %	50 %	50 %	398350080
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4593	NC_018000	GGC	2	6	205386	205391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350080
4594	NC_018000	GCCGA	2	10	205486	205495	20 %	0 %	40 %	40 %	398350080
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4600	NC_018000	GC	3	6	205602	205607	0 %	0 %	50 %	50 %	398350080
4601	NC_018000	CG	3	6	205621	205626	0 %	0 %	50 %	50 %	398350080
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4603	NC_018000	GC	3	6	205811	205816	0 %	0 %	50 %	50 %	398350081
4604	NC_018000	CGC	2	6	205849	205854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350081
4605	NC_018000	CGG	2	6	205894	205899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350081
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4621	NC_018000	ATG	2	6	206532	206537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350081
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4743	NC_018000	CCA	2	6	211446	211451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350082
4744	NC_018000	GTC	2	6	211741	211746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350082
4745	NC_018000	TCG	2	6	211877	211882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350082
4746	NC_018000	ATA	2	6	211888	211893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398350082
4747	NC_018000	CGA	2	6	211956	211961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350082
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4749	NC_018000	GCCA	2	8	212034	212041	25 %	0 %	25 %	50 %	398350082
4750	NC_018000	GGTC	2	8	212076	212083	0 %	25 %	50 %	25 %	398350082
4751	NC_018000	GGT	3	9	212089	212097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350082
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4753	NC_018000	CAC	2	6	212269	212274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	398350082
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4763	NC_018000	GCCGG	2	10	212645	212654	0 %	0 %	60 %	40 %	398350082
4764	NC_018000	TCG	2	6	212699	212704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350082
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4772	NC_018000	GCC	2	6	212933	212938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398350082
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4832	NC_018000	CGCGC	2	10	216376	216385	0 %	0 %	40 %	60 %	398350084
4833	NC_018000	ATCG	2	8	216400	216407	25 %	25 %	25 %	25 %	398350084
4834	NC_018000	CAT	2	6	216423	216428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350084
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4842	NC_018000	GGCG	2	8	217126	217133	0 %	0 %	75 %	25 %	398350085
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4844	NC_018000	CGATC	2	10	217259	217268	20 %	20 %	20 %	40 %	398350086
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4849	NC_018000	CGA	2	6	217400	217405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350086
4850	NC_018000	AAG	2	6	217455	217460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398350086
4851	NC_018000	GAT	2	6	217463	217468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350086
4852	NC_018000	TCT	2	6	217507	217512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350086
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4854	NC_018000	GAC	2	6	217616	217621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350086
4855	NC_018000	ATC	2	6	217647	217652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350086
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4857	NC_018000	GC	4	8	217716	217723	0 %	0 %	50 %	50 %	398350086
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4861	NC_018000	CCT	2	6	217861	217866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350086
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4863	NC_018000	TGG	2	6	217945	217950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398350086
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4894	NC_018000	GCCGG	2	10	219827	219836	0 %	0 %	60 %	40 %	398350089
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4983	NC_018000	CATC	2	8	225720	225727	25 %	25 %	0 %	50 %	398350094
4984	NC_018000	GAT	2	6	225874	225879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398350094
4985	NC_018000	CTG	2	6	225997	226002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350094
4986	NC_018000	CTC	2	6	226013	226018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350094
4987	NC_018000	ACA	2	6	226027	226032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350094
4988	NC_018000	AACG	2	8	226055	226062	50 %	0 %	25 %	25 %	398350094
4989	NC_018000	TC	3	6	226625	226630	0 %	50 %	0 %	50 %	398350095
4990	NC_018000	TCA	2	6	226644	226649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398350095
4991	NC_018000	CGA	2	6	226695	226700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350095
4992	NC_018000	CTG	2	6	226730	226735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350095
4993	NC_018000	TCG	2	6	227267	227272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
4994	NC_018000	CGT	3	9	227304	227312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398350096
4995	NC_018000	CAG	2	6	227401	227406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398350096
4996	NC_018000	TCC	2	6	227438	227443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398350096
4997	NC_018000	TTC	2	6	227491	227496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398350096
4998	NC_018000	CAA	2	6	227547	227552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	398350096
4999	NC_018000	CGG	3	9	227577	227585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096
5000	NC_018000	GCG	2	6	227606	227611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398350096

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