MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 23117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017950	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855710
2	NC_017950	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855710
3	NC_017950	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
4	NC_017950	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855710
5	NC_017950	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855710
6	NC_017950	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855710
7	NC_017950	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855710
8	NC_017950	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855710
9	NC_017950	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855710
10	NC_017950	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855710
11	NC_017950	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855710
12	NC_017950	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
13	NC_017950	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855710
14	NC_017950	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855710
15	NC_017950	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855710
16	NC_017950	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855710
17	NC_017950	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
18	NC_017950	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855711
19	NC_017950	AAG	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855711
20	NC_017950	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855711
21	NC_017950	TGA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855711
22	NC_017950	TGT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855711
23	NC_017950	GAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855711
24	NC_017950	TCT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
25	NC_017950	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
26	NC_017950	TTA	2	6	2258	2263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855711
27	NC_017950	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855711
28	NC_017950	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
29	NC_017950	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
30	NC_017950	TGT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855711
31	NC_017950	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855711
32	NC_017950	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855711
33	NC_017950	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855712
34	NC_017950	AGT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
35	NC_017950	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
36	NC_017950	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
37	NC_017950	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
38	NC_017950	AGT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855712
39	NC_017950	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855712
40	NC_017950	TTA	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
41	NC_017950	TCT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855712
42	NC_017950	ATT	3	9	3557	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855712
43	NC_017950	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855712
44	NC_017950	TCA	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855713
45	NC_017950	AAG	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855713
46	NC_017950	TGT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855713
47	NC_017950	ATG	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855713
48	NC_017950	TTG	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855715
49	NC_017950	AAC	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855715
50	NC_017950	GAA	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855715
51	NC_017950	TGT	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855715
52	NC_017950	ATT	2	6	4248	4253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855715
53	NC_017950	ATT	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855715
54	NC_017950	CAG	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
55	NC_017950	TCG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855716
56	NC_017950	TGG	2	6	4484	4489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855716
57	NC_017950	TCA	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
58	NC_017950	GTG	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855716
59	NC_017950	TGA	3	9	4677	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
60	NC_017950	TTG	2	6	4721	4726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855716
61	NC_017950	CAA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855716
62	NC_017950	GAA	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
63	NC_017950	GAC	2	6	4962	4967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
64	NC_017950	GCA	2	6	5037	5042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
65	NC_017950	AGT	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
66	NC_017950	AGA	3	9	5100	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
67	NC_017950	CGA	2	6	5121	5126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
68	NC_017950	CAG	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855716
69	NC_017950	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
70	NC_017950	CAT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
71	NC_017950	ATG	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855716
72	NC_017950	GAA	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855716
73	NC_017950	CAT	2	6	5445	5450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855716
74	NC_017950	ATC	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855717
75	NC_017950	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855717
76	NC_017950	TTA	2	6	5866	5871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855717
77	NC_017950	TAG	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855717
78	NC_017950	GAC	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855717
79	NC_017950	TGG	2	6	5959	5964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855717
80	NC_017950	GAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855717
81	NC_017950	GAT	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855717
82	NC_017950	TAT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855718
83	NC_017950	AAT	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855718
84	NC_017950	ATG	2	6	6374	6379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
85	NC_017950	ATT	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855718
86	NC_017950	GAT	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
87	NC_017950	CTA	2	6	6530	6535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855718
88	NC_017950	GTT	2	6	6550	6555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
89	NC_017950	GCT	2	6	6562	6567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855718
90	NC_017950	AAT	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855718
91	NC_017950	TAG	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
92	NC_017950	TTG	2	6	7060	7065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
93	NC_017950	GAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
94	NC_017950	GAT	2	6	7165	7170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
95	NC_017950	AGA	2	6	7175	7180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855718
96	NC_017950	CTT	2	6	7251	7256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855718
97	NC_017950	CCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855718
98	NC_017950	GTT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
99	NC_017950	GCA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855718
100	NC_017950	TAG	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
101	NC_017950	TCA	2	6	7568	7573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855718
102	NC_017950	TGT	2	6	7680	7685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
103	NC_017950	ATT	2	6	7754	7759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855718
104	NC_017950	TCT	2	6	7815	7820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855718
105	NC_017950	TAA	2	6	7860	7865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855718
106	NC_017950	GGA	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855718
107	NC_017950	GAT	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
108	NC_017950	GAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
109	NC_017950	ACT	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855718
110	NC_017950	CGA	2	6	8040	8045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855718
111	NC_017950	TGA	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
112	NC_017950	TAG	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
113	NC_017950	ATG	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
114	NC_017950	TGT	2	6	8385	8390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
115	NC_017950	CTA	2	6	8741	8746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855718
116	NC_017950	CAA	2	6	8837	8842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855718
117	NC_017950	GTG	2	6	9092	9097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855718
118	NC_017950	TGC	2	6	9114	9119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855718
119	NC_017950	GAA	2	6	9352	9357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855718
120	NC_017950	GTA	2	6	9388	9393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855718
121	NC_017950	GAC	2	6	9461	9466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855718
122	NC_017950	TGT	2	6	9591	9596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855718
123	NC_017950	TAA	2	6	9898	9903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855719
124	NC_017950	ACT	2	6	9904	9909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855719
125	NC_017950	GAA	2	6	10004	10009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855719
126	NC_017950	AAT	2	6	10029	10034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855720
127	NC_017950	CAA	2	6	10086	10091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855720
128	NC_017950	TTG	2	6	10159	10164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855720
129	NC_017950	CAG	3	9	10182	10190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855720
130	NC_017950	GAA	2	6	10224	10229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855720
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