MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017950	ATGA	2	8	239596	239603	50 %	25 %	25 %	0 %	389855941
4002	NC_017950	TTA	2	6	239606	239611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855941
4003	NC_017950	CAG	2	6	239651	239656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855941
4004	NC_017950	TTG	2	6	239690	239695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855941
4005	NC_017950	AAG	2	6	239710	239715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855941
4006	NC_017950	CT	3	6	239751	239756	0 %	50 %	0 %	50 %	389855941
4007	NC_017950	GTC	2	6	239780	239785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855941
4008	NC_017950	AGA	2	6	239786	239791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855941
4009	NC_017950	GTC	2	6	239798	239803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855941
4010	NC_017950	TGG	2	6	239804	239809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855941
4011	NC_017950	CTACT	2	10	239827	239836	20 %	40 %	0 %	40 %	389855941
4012	NC_017950	TCT	2	6	239886	239891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855941
4013	NC_017950	TGGGC	2	10	239922	239931	0 %	20 %	60 %	20 %	389855941
4014	NC_017950	TC	3	6	239943	239948	0 %	50 %	0 %	50 %	389855941
4015	NC_017950	GTTAA	2	10	240007	240016	40 %	40 %	20 %	0 %	389855941
4016	NC_017950	AAC	2	6	240066	240071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855941
4017	NC_017950	GTG	2	6	240127	240132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855941
4018	NC_017950	AGA	2	6	240219	240224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855941
4019	NC_017950	GA	3	6	240234	240239	50 %	0 %	50 %	0 %	389855941
4020	NC_017950	ATC	2	6	240359	240364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855941
4021	NC_017950	TAT	2	6	240451	240456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855942
4022	NC_017950	CAAA	2	8	240458	240465	75 %	0 %	0 %	25 %	389855942
4023	NC_017950	TAT	2	6	240494	240499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855942
4024	NC_017950	AAG	2	6	240500	240505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855942
4025	NC_017950	CT	3	6	240525	240530	0 %	50 %	0 %	50 %	389855942
4026	NC_017950	GAC	2	6	240535	240540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855942
4027	NC_017950	GTC	2	6	240551	240556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855942
4028	NC_017950	TTTTAT	2	12	240583	240594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	389855942
4029	NC_017950	GCA	2	6	240608	240613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855942
4030	NC_017950	TGA	2	6	240652	240657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855942
4031	NC_017950	GAT	2	6	240743	240748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855942
4032	NC_017950	TAG	2	6	240759	240764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855942
4033	NC_017950	CTA	2	6	240769	240774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855942
4034	NC_017950	TGT	2	6	240787	240792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855942
4035	NC_017950	AGA	2	6	240820	240825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855942
4036	NC_017950	TGA	2	6	240835	240840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855942
4037	NC_017950	ATG	2	6	240903	240908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855942
4038	NC_017950	GA	3	6	240936	240941	50 %	0 %	50 %	0 %	389855942
4039	NC_017950	AAAC	2	8	240978	240985	75 %	0 %	0 %	25 %	389855942
4040	NC_017950	ATC	2	6	241474	241479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855943
4041	NC_017950	AGT	2	6	241495	241500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855943
4042	NC_017950	TCC	2	6	241596	241601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855943
4043	NC_017950	ATG	2	6	241654	241659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855943
4044	NC_017950	AT	3	6	241764	241769	50 %	50 %	0 %	0 %	389855943
4045	NC_017950	CAG	2	6	242168	242173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4046	NC_017950	ATG	2	6	242203	242208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855944
4047	NC_017950	CTT	2	6	242228	242233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855944
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4049	NC_017950	GCT	2	6	242305	242310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4050	NC_017950	CA	3	6	242391	242396	50 %	0 %	0 %	50 %	389855944
4051	NC_017950	GCA	2	6	242419	242424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4052	NC_017950	CGT	2	6	242483	242488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4053	NC_017950	GCG	2	6	242556	242561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389855944
4054	NC_017950	CCA	2	6	242576	242581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855944
4055	NC_017950	ATG	2	6	242611	242616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855944
4056	NC_017950	ACCAGA	2	12	242694	242705	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	389855944
4057	NC_017950	TGC	2	6	242742	242747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4058	NC_017950	AAACC	2	10	242768	242777	60 %	0 %	0 %	40 %	389855944
4059	NC_017950	ACC	2	6	242808	242813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855944
4060	NC_017950	ACC	2	6	242898	242903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855944
4061	NC_017950	CAG	2	6	242918	242923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855944
4062	NC_017950	ACC	2	6	243027	243032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855944
4063	NC_017950	ACC	2	6	243036	243041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855944
4064	NC_017950	TGAAC	2	10	243164	243173	40 %	20 %	20 %	20 %	389855944
4065	NC_017950	TGA	2	6	243233	243238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855944
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4069	NC_017950	GGA	2	6	243341	243346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855944
4070	NC_017950	AAG	2	6	243386	243391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855944
4071	NC_017950	TGA	2	6	243691	243696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855945
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4074	NC_017950	GGCTT	2	10	243870	243879	0 %	40 %	40 %	20 %	389855945
4075	NC_017950	CTA	2	6	243894	243899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855945
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4079	NC_017950	ACTT	2	8	244107	244114	25 %	50 %	0 %	25 %	389855945
4080	NC_017950	ACC	2	6	244139	244144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855945
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4087	NC_017950	AAGG	2	8	244464	244471	50 %	0 %	50 %	0 %	389855945
4088	NC_017950	CAT	2	6	244511	244516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855945
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4091	NC_017950	CCAAG	2	10	244868	244877	40 %	0 %	20 %	40 %	389855946
4092	NC_017950	A	8	8	245010	245017	100 %	0 %	0 %	0 %	389855946
4093	NC_017950	CTA	2	6	245027	245032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855946
4094	NC_017950	AAGGT	2	10	245176	245185	40 %	20 %	40 %	0 %	389855947
4095	NC_017950	GAA	2	6	245191	245196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855947
4096	NC_017950	TAG	2	6	245215	245220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855947
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4100	NC_017950	A	6	6	245475	245480	100 %	0 %	0 %	0 %	389855947
4101	NC_017950	AGA	2	6	245487	245492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855947
4102	NC_017950	T	6	6	245796	245801	0 %	100 %	0 %	0 %	389855948
4103	NC_017950	TAT	2	6	245819	245824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855948
4104	NC_017950	ATT	3	9	245832	245840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855948
4105	NC_017950	TTC	2	6	245947	245952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855948
4106	NC_017950	GAG	2	6	245953	245958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855948
4107	NC_017950	CAA	2	6	246119	246124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855948
4108	NC_017950	ATG	2	6	246130	246135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855948
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4110	NC_017950	GT	3	6	246229	246234	0 %	50 %	50 %	0 %	389855948
4111	NC_017950	CAC	2	6	246274	246279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855948
4112	NC_017950	AGG	2	6	246364	246369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855948
4113	NC_017950	ATG	2	6	246373	246378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855948
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4115	NC_017950	GAGC	2	8	246423	246430	25 %	0 %	50 %	25 %	389855948
4116	NC_017950	GGA	2	6	246497	246502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855948
4117	NC_017950	TGAT	2	8	246526	246533	25 %	50 %	25 %	0 %	389855948
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