MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017950	ATT	2	6	58895	58900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855763
1003	NC_017950	GTA	2	6	58916	58921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1004	NC_017950	CAA	2	6	58939	58944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855763
1005	NC_017950	TTG	2	6	58960	58965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855763
1006	NC_017950	GTT	2	6	59038	59043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855763
1007	NC_017950	TCA	2	6	59051	59056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855763
1008	NC_017950	ATT	2	6	59059	59064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855763
1009	NC_017950	TGA	2	6	59078	59083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1010	NC_017950	ATTT	2	8	59107	59114	25 %	75 %	0 %	0 %	389855763
1011	NC_017950	TCT	2	6	59153	59158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855763
1012	NC_017950	GTT	2	6	59166	59171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855763
1013	NC_017950	TAC	2	6	59212	59217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855763
1014	NC_017950	TAG	2	6	59250	59255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1015	NC_017950	TGA	2	6	59285	59290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1016	NC_017950	GA	3	6	59321	59326	50 %	0 %	50 %	0 %	389855763
1017	NC_017950	TAG	2	6	59403	59408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1018	NC_017950	GAT	2	6	59469	59474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1019	NC_017950	ATG	2	6	59509	59514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1020	NC_017950	TGAT	2	8	59519	59526	25 %	50 %	25 %	0 %	389855763
1021	NC_017950	TGC	2	6	59541	59546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855763
1022	NC_017950	GTTG	2	8	59637	59644	0 %	50 %	50 %	0 %	389855763
1023	NC_017950	TGC	2	6	59646	59651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855763
1024	NC_017950	CAGA	2	8	59686	59693	50 %	0 %	25 %	25 %	389855763
1025	NC_017950	TTG	2	6	59747	59752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855763
1026	NC_017950	TGA	2	6	59792	59797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1027	NC_017950	GA	3	6	59819	59824	50 %	0 %	50 %	0 %	389855763
1028	NC_017950	CAA	2	6	59836	59841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855763
1029	NC_017950	CAA	2	6	59858	59863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855763
1030	NC_017950	CT	3	6	59906	59911	0 %	50 %	0 %	50 %	389855763
1031	NC_017950	GAA	2	6	59965	59970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855763
1032	NC_017950	TAG	2	6	60011	60016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855763
1033	NC_017950	AAC	2	6	60083	60088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855763
1034	NC_017950	ATTT	2	8	60127	60134	25 %	75 %	0 %	0 %	389855763
1035	NC_017950	TCA	2	6	60309	60314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855763
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1037	NC_017950	GA	3	6	60328	60333	50 %	0 %	50 %	0 %	389855763
1038	NC_017950	ATC	2	6	60335	60340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855763
1039	NC_017950	GAGAA	2	10	60474	60483	60 %	0 %	40 %	0 %	389855764
1040	NC_017950	GGA	2	6	60513	60518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855764
1041	NC_017950	GAA	2	6	60552	60557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855764
1042	NC_017950	AT	3	6	60569	60574	50 %	50 %	0 %	0 %	389855764
1043	NC_017950	GAG	2	6	60648	60653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855764
1044	NC_017950	GAG	2	6	60990	60995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855765
1045	NC_017950	TGA	2	6	61097	61102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855765
1046	NC_017950	ACC	2	6	61149	61154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855765
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1048	NC_017950	GAG	2	6	61311	61316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855765
1049	NC_017950	CAT	2	6	61352	61357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855765
1050	NC_017950	TAC	2	6	61491	61496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855765
1051	NC_017950	GCT	2	6	61566	61571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855765
1052	NC_017950	TCG	2	6	61583	61588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855765
1053	NC_017950	TGAT	2	8	61666	61673	25 %	50 %	25 %	0 %	389855765
1054	NC_017950	AGA	2	6	61741	61746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855765
1055	NC_017950	CAG	2	6	61863	61868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855765
1056	NC_017950	GCGGAC	2	12	61880	61891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389855765
1057	NC_017950	GGTCG	2	10	61893	61902	0 %	20 %	60 %	20 %	389855765
1058	NC_017950	ATTT	2	8	62031	62038	25 %	75 %	0 %	0 %	389855766
1059	NC_017950	TGGA	2	8	62045	62052	25 %	25 %	50 %	0 %	389855766
1060	NC_017950	CTTT	2	8	62116	62123	0 %	75 %	0 %	25 %	389855766
1061	NC_017950	GAA	2	6	62131	62136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855766
1062	NC_017950	TTC	2	6	62150	62155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855766
1063	NC_017950	TGA	2	6	62211	62216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855766
1064	NC_017950	GTGC	2	8	62227	62234	0 %	25 %	50 %	25 %	389855766
1065	NC_017950	CTGGA	2	10	62293	62302	20 %	20 %	40 %	20 %	389855766
1066	NC_017950	CAG	2	6	62303	62308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855766
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1072	NC_017950	CT	3	6	62992	62997	0 %	50 %	0 %	50 %	389855767
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1075	NC_017950	ATG	2	6	63230	63235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855767
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1092	NC_017950	GAT	2	6	64431	64436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855768
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1105	NC_017950	CAA	2	6	65618	65623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855770
1106	NC_017950	GTT	2	6	65637	65642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855770
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1108	NC_017950	GAT	2	6	66055	66060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855771
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1110	NC_017950	AGCG	2	8	66234	66241	25 %	0 %	50 %	25 %	389855771
1111	NC_017950	TTCC	2	8	66258	66265	0 %	50 %	0 %	50 %	389855771
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1118	NC_017950	CGAATA	2	12	66659	66670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389855771
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