MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017950	TGA	2	6	30736	30741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855733
502	NC_017950	GAT	2	6	30851	30856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855733
503	NC_017950	TCT	2	6	30860	30865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855733
504	NC_017950	TGGG	2	8	30935	30942	0 %	25 %	75 %	0 %	389855734
505	NC_017950	AGT	2	6	30960	30965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
506	NC_017950	TCAA	2	8	30974	30981	50 %	25 %	0 %	25 %	389855734
507	NC_017950	TGA	2	6	31023	31028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
508	NC_017950	TGACAG	2	12	31049	31060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	389855734
509	NC_017950	ACG	2	6	31081	31086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855734
510	NC_017950	GAT	2	6	31102	31107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
511	NC_017950	TCG	2	6	31125	31130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855734
512	NC_017950	AAGA	2	8	31132	31139	75 %	0 %	25 %	0 %	389855734
513	NC_017950	GAT	2	6	31146	31151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
514	NC_017950	GGC	2	6	31224	31229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389855734
515	NC_017950	GTC	2	6	31240	31245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855734
516	NC_017950	CTA	2	6	31292	31297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855734
517	NC_017950	ATG	2	6	31318	31323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
518	NC_017950	TCA	2	6	31353	31358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855734
519	NC_017950	CGTG	2	8	31401	31408	0 %	25 %	50 %	25 %	389855734
520	NC_017950	AAC	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855734
521	NC_017950	AAC	2	6	31438	31443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855734
522	NC_017950	AAG	2	6	31478	31483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855734
523	NC_017950	TCAA	2	8	31654	31661	50 %	25 %	0 %	25 %	389855734
524	NC_017950	AACC	2	8	31703	31710	50 %	0 %	0 %	50 %	389855734
525	NC_017950	GGT	2	6	31750	31755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855734
526	NC_017950	CTTG	2	8	31761	31768	0 %	50 %	25 %	25 %	389855734
527	NC_017950	TCA	2	6	31784	31789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855734
528	NC_017950	AGT	2	6	31893	31898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855734
529	NC_017950	GGA	2	6	31899	31904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855734
530	NC_017950	AG	3	6	31916	31921	50 %	0 %	50 %	0 %	389855734
531	NC_017950	GTT	2	6	31937	31942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855735
532	NC_017950	AATT	2	8	31944	31951	50 %	50 %	0 %	0 %	389855735
533	NC_017950	ATA	2	6	32004	32009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855735
534	NC_017950	GCA	2	6	32012	32017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855735
535	NC_017950	GGA	2	6	32053	32058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855735
536	NC_017950	TGC	2	6	32083	32088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855735
537	NC_017950	TTG	2	6	32118	32123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855735
538	NC_017950	GAA	2	6	32135	32140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855735
539	NC_017950	A	7	7	32143	32149	100 %	0 %	0 %	0 %	389855735
540	NC_017950	ATC	2	6	32412	32417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855736
541	NC_017950	AGT	2	6	32433	32438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855736
542	NC_017950	TCC	2	6	32534	32539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855736
543	NC_017950	ATG	2	6	32592	32597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855736
544	NC_017950	AT	3	6	32702	32707	50 %	50 %	0 %	0 %	389855736
545	NC_017950	AGT	2	6	32788	32793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855736
546	NC_017950	CTACG	2	10	33072	33081	20 %	20 %	20 %	40 %	389855737
547	NC_017950	GTT	2	6	33097	33102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389855737
548	NC_017950	TGG	2	6	33135	33140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855737
549	NC_017950	AAGA	2	8	33142	33149	75 %	0 %	25 %	0 %	389855737
550	NC_017950	AAT	2	6	33175	33180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389855737
551	NC_017950	TGAA	2	8	33209	33216	50 %	25 %	25 %	0 %	389855737
552	NC_017950	AAG	2	6	33271	33276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855737
553	NC_017950	ATT	2	6	33283	33288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855737
554	NC_017950	GGT	2	6	33297	33302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855737
555	NC_017950	GGA	2	6	33348	33353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855737
556	NC_017950	A	6	6	33394	33399	100 %	0 %	0 %	0 %	389855737
557	NC_017950	GAA	2	6	33484	33489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855737
558	NC_017950	TGG	2	6	33545	33550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855737
559	NC_017950	TCG	2	6	33669	33674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855737
560	NC_017950	GAA	2	6	33774	33779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855738
561	NC_017950	GCA	2	6	33781	33786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855738
562	NC_017950	GAG	2	6	33892	33897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855738
563	NC_017950	GAA	2	6	33964	33969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855738
564	NC_017950	CAG	2	6	34038	34043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855738
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567	NC_017950	AGG	2	6	34076	34081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855738
568	NC_017950	GAA	3	9	34129	34137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855738
569	NC_017950	ATT	2	6	34154	34159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855738
570	NC_017950	TGG	2	6	34205	34210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855738
571	NC_017950	T	6	6	34255	34260	0 %	100 %	0 %	0 %	389855738
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574	NC_017950	TACT	2	8	34401	34408	25 %	50 %	0 %	25 %	389855738
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577	NC_017950	CGA	2	6	34571	34576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389855738
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597	NC_017950	AGG	2	6	35651	35656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855738
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609	NC_017950	TACC	2	8	36214	36221	25 %	25 %	0 %	50 %	389855738
610	NC_017950	AGA	2	6	36237	36242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855738
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615	NC_017950	ACC	2	6	36490	36495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855738
616	NC_017950	AGA	2	6	36570	36575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855738
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622	NC_017950	GAG	2	6	37036	37041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855738
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624	NC_017950	TGG	2	6	37100	37105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855738
625	NC_017950	GGAA	2	8	37188	37195	50 %	0 %	50 %	0 %	389855738
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