MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 34189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017950	GAT	2	6	300428	300433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855994
5003	NC_017950	CAGG	2	8	300480	300487	25 %	0 %	50 %	25 %	389855994
5004	NC_017950	TAT	2	6	300497	300502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855994
5005	NC_017950	TGG	2	6	300616	300621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855994
5006	NC_017950	GGT	2	6	300659	300664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855994
5007	NC_017950	GTG	2	6	300667	300672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855994
5008	NC_017950	GTG	2	6	300819	300824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855994
5009	NC_017950	GGA	2	6	300938	300943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855994
5010	NC_017950	TTGA	2	8	300969	300976	25 %	50 %	25 %	0 %	389855994
5011	NC_017950	ACC	2	6	300993	300998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389855994
5012	NC_017950	TCG	2	6	301008	301013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855994
5013	NC_017950	ACA	2	6	301015	301020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389855994
5014	NC_017950	AGG	2	6	301081	301086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855994
5015	NC_017950	ATT	2	6	301108	301113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389855995
5016	NC_017950	GTC	2	6	301162	301167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855995
5017	NC_017950	TCC	2	6	301181	301186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389855995
5018	NC_017950	GCG	2	6	301231	301236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389855995
5019	NC_017950	AGGATG	2	12	301323	301334	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	389855995
5020	NC_017950	GTCCCA	2	12	301455	301466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	389855995
5021	NC_017950	TCT	2	6	301595	301600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855995
5022	NC_017950	CTT	2	6	301624	301629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389855995
5023	NC_017950	GAA	2	6	301781	301786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389855995
5024	NC_017950	ATG	2	6	301893	301898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855995
5025	NC_017950	GAG	2	6	301917	301922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855995
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5028	NC_017950	TGG	2	6	301983	301988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389855995
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5031	NC_017950	CGGC	2	8	302106	302113	0 %	0 %	50 %	50 %	389855995
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5041	NC_017950	CAT	2	6	302612	302617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389855996
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5043	NC_017950	TGGG	2	8	302872	302879	0 %	25 %	75 %	0 %	389855996
5044	NC_017950	AGG	2	6	302902	302907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389855996
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5053	NC_017950	GAT	2	6	303458	303463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855997
5054	NC_017950	T	6	6	303486	303491	0 %	100 %	0 %	0 %	389855997
5055	NC_017950	ATG	2	6	303516	303521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389855997
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5057	NC_017950	GCT	2	6	303602	303607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389855997
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5061	NC_017950	TCAA	2	8	303838	303845	50 %	25 %	0 %	25 %	389855998
5062	NC_017950	CGG	2	6	303850	303855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389855998
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5122	NC_017950	TTG	2	6	306920	306925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389856001
5123	NC_017950	TGG	3	9	306936	306944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856001
5124	NC_017950	CCT	2	6	306962	306967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389856001
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5131	NC_017950	TGA	2	6	307334	307339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856001
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5153	NC_017950	TGG	3	9	308478	308486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856002
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5233	NC_017950	CTTTT	2	10	313484	313493	0 %	80 %	0 %	20 %	389856007
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5238	NC_017950	GCCA	2	8	313846	313853	25 %	0 %	25 %	50 %	389856008
5239	NC_017950	TGGC	2	8	313924	313931	0 %	25 %	50 %	25 %	389856008
5240	NC_017950	GAT	2	6	314016	314021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856008
5241	NC_017950	TGG	2	6	314065	314070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856008
5242	NC_017950	GGC	2	6	314077	314082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389856008
5243	NC_017950	ATG	2	6	314094	314099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856008
5244	NC_017950	GATTTG	2	12	314127	314138	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	389856008
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5251	NC_017950	GCG	2	6	314427	314432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389856008
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5275	NC_017950	TTGGT	2	10	315621	315630	0 %	60 %	40 %	0 %	389856010
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5351	NC_017950	CATG	2	8	320221	320228	25 %	25 %	25 %	25 %	389856016
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5355	NC_017950	CTAG	2	8	320403	320410	25 %	25 %	25 %	25 %	389856017
5356	NC_017950	CTGT	2	8	320667	320674	0 %	50 %	25 %	25 %	389856017
5357	NC_017950	GAC	2	6	320693	320698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389856017
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5361	NC_017950	AGAGC	2	10	320798	320807	40 %	0 %	40 %	20 %	389856017
5362	NC_017950	AAT	2	6	320829	320834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389856017
5363	NC_017950	TTGG	2	8	320852	320859	0 %	50 %	50 %	0 %	389856017
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5488	NC_017950	AGT	2	6	329306	329311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856026
5489	NC_017950	TCC	2	6	329407	329412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389856026
5490	NC_017950	ATG	2	6	329465	329470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856026
5491	NC_017950	AT	3	6	329575	329580	50 %	50 %	0 %	0 %	389856026
5492	NC_017950	AGT	2	6	329661	329666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856026
5493	NC_017950	CT	3	6	329836	329841	0 %	50 %	0 %	50 %	389856027
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5495	NC_017950	TGG	2	6	329890	329895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856027
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5498	NC_017950	CAATC	2	10	330038	330047	40 %	20 %	0 %	40 %	389856027
5499	NC_017950	TCA	2	6	330048	330053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856027
5500	NC_017950	ATT	2	6	330156	330161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856027

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