MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 chromosome

Total Repeats: 959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017927	AAAGG	2	10	2050	2059	60 %	0 %	40 %	0 %	387908810
2	NC_017927	CAAAT	2	10	2387	2396	60 %	20 %	0 %	20 %	387908810
3	NC_017927	TGATT	2	10	2673	2682	20 %	60 %	20 %	0 %	387908810
4	NC_017927	GAGAT	2	10	5641	5650	40 %	20 %	40 %	0 %	387908814
5	NC_017927	TTATG	2	10	7448	7457	20 %	60 %	20 %	0 %	387908814
6	NC_017927	TCAGA	2	10	9231	9240	40 %	20 %	20 %	20 %	387908816
7	NC_017927	CAGTA	2	10	12769	12778	40 %	20 %	20 %	20 %	387908821
8	NC_017927	GGTAA	2	10	12849	12858	40 %	20 %	40 %	0 %	387908821
9	NC_017927	ACCGA	2	10	15573	15582	40 %	0 %	20 %	40 %	387908823
10	NC_017927	CTAGT	2	10	25531	25540	20 %	40 %	20 %	20 %	387908830
11	NC_017927	CAATC	2	10	25867	25876	40 %	20 %	0 %	40 %	387908831
12	NC_017927	ATTCA	2	10	27013	27022	40 %	40 %	0 %	20 %	387908831
13	NC_017927	TGATT	2	10	28232	28241	20 %	60 %	20 %	0 %	387908832
14	NC_017927	TTTTG	2	10	29860	29869	0 %	80 %	20 %	0 %	387908834
15	NC_017927	ATGAA	2	10	31213	31222	60 %	20 %	20 %	0 %	387908835
16	NC_017927	GTAGA	2	10	32577	32586	40 %	20 %	40 %	0 %	387908837
17	NC_017927	AAATG	2	10	38689	38698	60 %	20 %	20 %	0 %	387908840
18	NC_017927	AAAAT	2	10	40864	40873	80 %	20 %	0 %	0 %	387908843
19	NC_017927	GTGAA	2	10	41803	41812	40 %	20 %	40 %	0 %	387908843
20	NC_017927	AGTGG	2	10	41955	41964	20 %	20 %	60 %	0 %	387908843
21	NC_017927	TCAAA	2	10	42118	42127	60 %	20 %	0 %	20 %	387908843
22	NC_017927	TTGAT	2	10	45090	45099	20 %	60 %	20 %	0 %	387908848
23	NC_017927	GAAGC	2	10	48048	48057	40 %	0 %	40 %	20 %	387908850
24	NC_017927	ATTTT	2	10	48358	48367	20 %	80 %	0 %	0 %	387908851
25	NC_017927	GCTTG	2	10	49666	49675	0 %	40 %	40 %	20 %	387908853
26	NC_017927	TAGCT	2	10	62888	62897	20 %	40 %	20 %	20 %	387908865
27	NC_017927	TTGAT	2	10	64976	64985	20 %	60 %	20 %	0 %	387908867
28	NC_017927	CAAAT	2	10	73989	73998	60 %	20 %	0 %	20 %	387908868
29	NC_017927	GAATC	2	10	76328	76337	40 %	20 %	20 %	20 %	387908869
30	NC_017927	AGAAA	2	10	76382	76391	80 %	0 %	20 %	0 %	387908869
31	NC_017927	TCAAA	2	10	77262	77271	60 %	20 %	0 %	20 %	387908869
32	NC_017927	AATTT	2	10	77824	77833	40 %	60 %	0 %	0 %	387908871
33	NC_017927	AAGAT	2	10	78565	78574	60 %	20 %	20 %	0 %	387908872
34	NC_017927	TCAGC	2	10	84713	84722	20 %	20 %	20 %	40 %	387908879
35	NC_017927	GCTTC	2	10	95284	95293	0 %	40 %	20 %	40 %	387908885
36	NC_017927	AAGCC	2	10	95413	95422	40 %	0 %	20 %	40 %	387908885
37	NC_017927	CTGTT	2	10	95493	95502	0 %	60 %	20 %	20 %	387908885
38	NC_017927	AAATA	2	10	98466	98475	80 %	20 %	0 %	0 %	387908891
39	NC_017927	AAATG	2	10	99699	99708	60 %	20 %	20 %	0 %	387908893
40	NC_017927	AACAA	2	10	101462	101471	80 %	0 %	0 %	20 %	387908895
41	NC_017927	CACAC	2	10	101596	101605	40 %	0 %	0 %	60 %	387908895
42	NC_017927	TTTAT	2	10	107757	107766	20 %	80 %	0 %	0 %	387908899
43	NC_017927	TATTT	2	10	109261	109270	20 %	80 %	0 %	0 %	387908901
44	NC_017927	GACGA	2	10	109688	109697	40 %	0 %	40 %	20 %	387908901
45	NC_017927	ATTAT	2	10	110084	110093	40 %	60 %	0 %	0 %	387908901
46	NC_017927	ATGGC	2	10	111048	111057	20 %	20 %	40 %	20 %	387908903
47	NC_017927	TTTGT	2	10	113395	113404	0 %	80 %	20 %	0 %	387908906
48	NC_017927	TCTGT	2	10	118929	118938	0 %	60 %	20 %	20 %	387908912
49	NC_017927	CGGTT	2	10	119580	119589	0 %	40 %	40 %	20 %	387908913
50	NC_017927	CAGTT	2	10	121724	121733	20 %	40 %	20 %	20 %	387908916
51	NC_017927	AAGGT	2	10	121946	121955	40 %	20 %	40 %	0 %	387908916
52	NC_017927	TTAGT	2	10	122195	122204	20 %	60 %	20 %	0 %	387908916
53	NC_017927	GTATC	2	10	124424	124433	20 %	40 %	20 %	20 %	387908918
54	NC_017927	AAAGG	2	10	126254	126263	60 %	0 %	40 %	0 %	387908919
55	NC_017927	TCCTT	2	10	135301	135310	0 %	60 %	0 %	40 %	387908923
56	NC_017927	GGATC	2	10	135416	135425	20 %	20 %	40 %	20 %	387908923
57	NC_017927	GGATG	2	10	138567	138576	20 %	20 %	60 %	0 %	387908926
58	NC_017927	GGTTT	2	10	146739	146748	0 %	60 %	40 %	0 %	387908933
59	NC_017927	TTTGG	2	10	150022	150031	0 %	60 %	40 %	0 %	387908939
60	NC_017927	AAGGT	2	10	150048	150057	40 %	20 %	40 %	0 %	387908939
61	NC_017927	CTGGT	2	10	151632	151641	0 %	40 %	40 %	20 %	387908941
62	NC_017927	TGATT	2	10	153149	153158	20 %	60 %	20 %	0 %	387908943
63	NC_017927	GAGAT	2	10	154201	154210	40 %	20 %	40 %	0 %	387908943
64	NC_017927	ATTGA	2	10	154506	154515	40 %	40 %	20 %	0 %	387908943
65	NC_017927	AATGA	2	10	157575	157584	60 %	20 %	20 %	0 %	387908948
66	NC_017927	GGTTG	2	10	159262	159271	0 %	40 %	60 %	0 %	387908949
67	NC_017927	AAGTA	2	10	162345	162354	60 %	20 %	20 %	0 %	387908954
68	NC_017927	CGTAG	2	10	166660	166669	20 %	20 %	40 %	20 %	387908958
69	NC_017927	GTCTT	2	10	170751	170760	0 %	60 %	20 %	20 %	387908962
70	NC_017927	AAGTT	2	10	171102	171111	40 %	40 %	20 %	0 %	387908962
71	NC_017927	CTCAG	2	10	173897	173906	20 %	20 %	20 %	40 %	387908965
72	NC_017927	TTGAT	2	10	176918	176927	20 %	60 %	20 %	0 %	387908972
73	NC_017927	TCATC	2	10	177005	177014	20 %	40 %	0 %	40 %	387908972
74	NC_017927	AGCTT	2	10	180740	180749	20 %	40 %	20 %	20 %	387908979
75	NC_017927	TCCAA	2	10	183149	183158	40 %	20 %	0 %	40 %	387908981
76	NC_017927	TTGGT	2	10	185312	185321	0 %	60 %	40 %	0 %	387908984
77	NC_017927	TTGCC	2	10	185743	185752	0 %	40 %	20 %	40 %	387908985
78	NC_017927	GAAAT	2	10	186691	186700	60 %	20 %	20 %	0 %	387908986
79	NC_017927	CAAGT	2	10	188383	188392	40 %	20 %	20 %	20 %	387908989
80	NC_017927	TTGGT	2	10	188608	188617	0 %	60 %	40 %	0 %	387908989
81	NC_017927	ATCGT	2	10	192464	192473	20 %	40 %	20 %	20 %	387908993
82	NC_017927	TGGCT	2	10	199826	199835	0 %	40 %	40 %	20 %	387908998
83	NC_017927	GAAGC	2	10	204547	204556	40 %	0 %	40 %	20 %	387909006
84	NC_017927	CAATG	2	10	205233	205242	40 %	20 %	20 %	20 %	387909007
85	NC_017927	TACAA	2	10	205348	205357	60 %	20 %	0 %	20 %	387909007
86	NC_017927	TTTCT	2	10	205717	205726	0 %	80 %	0 %	20 %	387909008
87	NC_017927	TGGTA	2	10	205870	205879	20 %	40 %	40 %	0 %	387909008
88	NC_017927	TTTCT	2	10	205912	205921	0 %	80 %	0 %	20 %	387909008
89	NC_017927	CAATC	2	10	206368	206377	40 %	20 %	0 %	40 %	387909010
90	NC_017927	AGTTC	2	10	210854	210863	20 %	40 %	20 %	20 %	387909014
91	NC_017927	TTTGG	2	10	211935	211944	0 %	60 %	40 %	0 %	387909016
92	NC_017927	ATGGG	2	10	214401	214410	20 %	20 %	60 %	0 %	387909019
93	NC_017927	CAACA	2	10	214547	214556	60 %	0 %	0 %	40 %	387909019
94	NC_017927	GCAAC	2	10	214829	214838	40 %	0 %	20 %	40 %	387909019
95	NC_017927	TACAT	2	10	218444	218453	40 %	40 %	0 %	20 %	387909022
96	NC_017927	ATCAA	2	10	218945	218954	60 %	20 %	0 %	20 %	387909023
97	NC_017927	TGTCA	3	15	221588	221602	20 %	40 %	20 %	20 %	387909025
98	NC_017927	TGGTT	2	10	222692	222701	0 %	60 %	40 %	0 %	387909026
99	NC_017927	CCATG	2	10	222835	222844	20 %	20 %	20 %	40 %	387909026
100	NC_017927	AAATT	2	10	226947	226956	60 %	40 %	0 %	0 %	387909028
101	NC_017927	TGGAT	2	10	227763	227772	20 %	40 %	40 %	0 %	387909030
102	NC_017927	ATAAA	2	10	230021	230030	80 %	20 %	0 %	0 %	387909032
103	NC_017927	ATTGA	2	10	233084	233093	40 %	40 %	20 %	0 %	387909034
104	NC_017927	TTTGA	2	10	233357	233366	20 %	60 %	20 %	0 %	387909034
105	NC_017927	GAAGA	2	10	235238	235247	60 %	0 %	40 %	0 %	387909034
106	NC_017927	TCTTA	2	10	239139	239148	20 %	60 %	0 %	20 %	387909038
107	NC_017927	GCCAG	2	10	243797	243806	20 %	0 %	40 %	40 %	387909044
108	NC_017927	TTTGG	2	10	246277	246286	0 %	60 %	40 %	0 %	387909048
109	NC_017927	GATTT	2	10	247720	247729	20 %	60 %	20 %	0 %	387909049
110	NC_017927	TGTCC	2	10	249283	249292	0 %	40 %	20 %	40 %	387909052
111	NC_017927	GTGAT	2	10	250840	250849	20 %	40 %	40 %	0 %	387909054
112	NC_017927	TCCTT	2	10	251476	251485	0 %	60 %	0 %	40 %	387909055
113	NC_017927	GATTT	2	10	251896	251905	20 %	60 %	20 %	0 %	387909056
114	NC_017927	ATGAA	2	10	260259	260268	60 %	20 %	20 %	0 %	387909066
115	NC_017927	TTGGT	2	10	261246	261255	0 %	60 %	40 %	0 %	387909067
116	NC_017927	CTTTT	2	10	264165	264174	0 %	80 %	0 %	20 %	387909073
117	NC_017927	AGTAG	2	10	264282	264291	40 %	20 %	40 %	0 %	387909073
118	NC_017927	GTTTA	2	10	265680	265689	20 %	60 %	20 %	0 %	387909074
119	NC_017927	TGGTA	2	10	265756	265765	20 %	40 %	40 %	0 %	387909074
120	NC_017927	AGAAA	2	10	271026	271035	80 %	0 %	20 %	0 %	387909081
121	NC_017927	TTCTT	2	10	273016	273025	0 %	80 %	0 %	20 %	387909084
122	NC_017927	GATGT	2	10	274856	274865	20 %	40 %	40 %	0 %	387909086
123	NC_017927	ATTTA	2	10	275602	275611	40 %	60 %	0 %	0 %	387909086
124	NC_017927	ATTTT	2	10	276832	276841	20 %	80 %	0 %	0 %	387909086
125	NC_017927	ATTCC	2	10	277253	277262	20 %	40 %	0 %	40 %	387909086
126	NC_017927	TTGAT	2	10	278897	278906	20 %	60 %	20 %	0 %	387909087
127	NC_017927	AAACT	2	10	279725	279734	60 %	20 %	0 %	20 %	387909088
128	NC_017927	CTTTT	2	10	280422	280431	0 %	80 %	0 %	20 %	387909088
129	NC_017927	TTGAT	2	10	280932	280941	20 %	60 %	20 %	0 %	387909089
130	NC_017927	TATCG	2	10	285676	285685	20 %	40 %	20 %	20 %	387909096
131	NC_017927	GTCTT	2	10	287032	287041	0 %	60 %	20 %	20 %	387909097
132	NC_017927	TTTGG	2	10	287849	287858	0 %	60 %	40 %	0 %	387909098
133	NC_017927	AATTC	2	10	288683	288692	40 %	40 %	0 %	20 %	387909099
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