MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus parasanguinis FW213 chromosome

Total Repeats: 753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017905	ATTGGA	2	12	5371	5382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878544
2	NC_017905	TCAGAT	2	12	7153	7164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878545
3	NC_017905	TGCTTA	2	12	8308	8319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878545
4	NC_017905	AAAAGA	2	12	15791	15802	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878553
5	NC_017905	ATCGTT	2	12	16255	16266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878554
6	NC_017905	ATGTAG	2	12	16402	16413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878554
7	NC_017905	CTATAT	2	12	16436	16447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387878554
8	NC_017905	AGCTCG	2	12	28630	28641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387878560
9	NC_017905	GTTACT	2	12	30332	30343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878562
10	NC_017905	TTTGCT	2	12	36001	36012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387878569
11	NC_017905	ACTGAG	2	12	36323	36334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387878569
12	NC_017905	CTTGCA	2	12	38300	38311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387878569
13	NC_017905	TTTCAG	2	12	43185	43196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878573
14	NC_017905	TGATGC	2	12	43921	43932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387878573
15	NC_017905	GCTTTG	2	12	45120	45131	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387878574
16	NC_017905	GACATG	2	12	45493	45504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387878574
17	NC_017905	AAAGCC	2	12	48686	48697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387878577
18	NC_017905	TGGATT	2	12	49646	49657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387878578
19	NC_017905	TATATT	2	12	51690	51701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387878580
20	NC_017905	ACTTTG	2	12	54591	54602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878582
21	NC_017905	GAAAAA	2	12	63795	63806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878591
22	NC_017905	CCTTTA	2	12	65127	65138	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387878594
23	NC_017905	CTCTTT	2	12	65393	65404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387878594
24	NC_017905	CCAGAT	2	12	68673	68684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387878595
25	NC_017905	ATGAAA	2	12	74186	74197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387878602
26	NC_017905	CTCTTT	2	12	78339	78350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387878606
27	NC_017905	ATCTTG	2	12	81395	81406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878609
28	NC_017905	ATACCT	2	12	88754	88765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387878617
29	NC_017905	TTTGTA	2	12	95586	95597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387878623
30	NC_017905	CTATTG	2	12	96735	96746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387878625
31	NC_017905	AAAAGA	2	12	111588	111599	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878636
32	NC_017905	AAAAGG	2	12	117851	117862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387878642
33	NC_017905	TCCAGG	2	12	118952	118963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387878643
34	NC_017905	GCAACA	2	12	122043	122054	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387878647
35	NC_017905	CAAGAC	2	12	124858	124869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387878649
36	NC_017905	TAAAGG	2	12	132145	132156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387878655
37	NC_017905	ACATCA	2	12	135273	135284	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387878661
38	NC_017905	ATCGTA	2	12	137808	137819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878668
39	NC_017905	TAAAGG	2	12	139363	139374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387878671
40	NC_017905	ATAAAA	2	12	139529	139540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387878672
41	NC_017905	AAATTA	2	12	140403	140414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387878674
42	NC_017905	ACTTGG	2	12	140470	140481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387878674
43	NC_017905	TGGTAA	2	12	140799	140810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878675
44	NC_017905	GCGGTG	2	12	140849	140860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387878675
45	NC_017905	TTCGTG	2	12	143861	143872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387878679
46	NC_017905	GTAAAG	2	12	144059	144070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387878679
47	NC_017905	GAAAAA	2	12	147302	147313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878683
48	NC_017905	GAATTG	2	12	156654	156665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878687
49	NC_017905	AATTGG	2	12	170268	170279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878703
50	NC_017905	AGCTAG	2	12	173071	173082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387878706
51	NC_017905	TCTAGA	2	12	173732	173743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878706
52	NC_017905	AAGGAA	2	12	176007	176018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387878708
53	NC_017905	AGGAAG	2	12	179537	179548	50 %	0 %	50 %	0 %	387878714
54	NC_017905	GGCCAA	2	12	181326	181337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387878716
55	NC_017905	ATGAAA	2	12	182813	182824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387878718
56	NC_017905	AAGAAA	2	12	183753	183764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878719
57	NC_017905	TGGAAG	2	12	183787	183798	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387878719
58	NC_017905	TTGAAA	2	12	190211	190222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387878724
59	NC_017905	GAATAT	2	12	193218	193229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387878727
60	NC_017905	AGATCT	2	12	193265	193276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878727
61	NC_017905	ACGGTT	2	12	194109	194120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387878727
62	NC_017905	AAAGAA	2	12	196218	196229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878727
63	NC_017905	TGCCTT	2	12	201430	201441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387878731
64	NC_017905	GGAGAA	2	12	212940	212951	50 %	0 %	50 %	0 %	387878742
65	NC_017905	GTACCA	2	12	217736	217747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387878747
66	NC_017905	CTCCAG	2	12	223601	223612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387878752
67	NC_017905	AAAGAA	2	12	227596	227607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878756
68	NC_017905	GGAAAT	2	12	230865	230876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387878758
69	NC_017905	GAAAAA	2	12	231601	231612	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878759
70	NC_017905	TCCAAC	2	12	236149	236160	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387878762
71	NC_017905	GCAAGA	2	12	241793	241804	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387878768
72	NC_017905	CATATT	2	12	243427	243438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387878769
73	NC_017905	TTCATT	2	12	253168	253179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387878773
74	NC_017905	TTTTAC	2	12	253536	253547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387878773
75	NC_017905	AATTTT	2	12	255798	255809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387878777
76	NC_017905	GTAGAG	2	12	255862	255873	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387878777
77	NC_017905	ATGAAT	2	12	260073	260084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387878783
78	NC_017905	ATGAAA	2	12	260133	260144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387878783
79	NC_017905	CGGTTC	2	12	269003	269014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387878788
80	NC_017905	TCTATC	2	12	271255	271266	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387878790
81	NC_017905	GGATTG	2	12	279593	279604	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387878796
82	NC_017905	GGATTT	2	12	284967	284978	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387878802
83	NC_017905	TATCGC	2	12	286035	286046	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387878805
84	NC_017905	GCATCC	2	12	286442	286453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387878805
85	NC_017905	GGGATG	2	12	289171	289182	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387878806
86	NC_017905	GCAACG	2	12	289227	289238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387878806
87	NC_017905	TCAATG	2	12	289615	289626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878806
88	NC_017905	TGGAAT	2	12	290401	290412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387878807
89	NC_017905	GAAGGC	2	12	295476	295487	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387878808
90	NC_017905	GGTATT	2	12	298819	298830	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387878809
91	NC_017905	TTCAAT	2	12	299746	299757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387878810
92	NC_017905	ATGAAA	2	12	301329	301340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387878812
93	NC_017905	CAAGCT	2	12	301788	301799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387878812
94	NC_017905	TCTTAT	2	12	302115	302126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387878812
95	NC_017905	GAAAAA	2	12	302970	302981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878813
96	NC_017905	TTTTCT	2	12	309439	309450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387878823
97	NC_017905	GTTTTG	2	12	310526	310537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387878824
98	NC_017905	AGAAGC	2	12	311622	311633	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387878825
99	NC_017905	GCTTGC	2	12	315851	315862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387878829
100	NC_017905	GTCTTT	2	12	317341	317352	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387878831
101	NC_017905	TGTGAT	2	12	319222	319233	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387878834
102	NC_017905	GTCGAT	2	12	320920	320931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387878835
103	NC_017905	AACCTT	2	12	321087	321098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387878835
104	NC_017905	GCTGCA	2	12	324659	324670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387878840
105	NC_017905	AACAGA	2	12	328000	328011	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387878844
106	NC_017905	TTATCC	2	12	342809	342820	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387878858
107	NC_017905	GTGAGG	2	12	344773	344784	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	387878861
108	NC_017905	AAGCTG	2	12	350355	350366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387878869
109	NC_017905	GCAGAA	2	12	351861	351872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387878869
110	NC_017905	GCTTTG	2	12	359411	359422	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387878877
111	NC_017905	AAAGAT	2	12	363377	363388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387878881
112	NC_017905	ACAATT	2	12	366534	366545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387878884
113	NC_017905	AATGCC	2	12	373053	373064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387878888
114	NC_017905	AGAAAA	2	12	373403	373414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387878888
115	NC_017905	CCAATC	2	12	375017	375028	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387878889
116	NC_017905	GCCTGA	2	12	380202	380213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387878895
117	NC_017905	GATATC	2	12	380326	380337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878895
118	NC_017905	TGCTTT	2	12	384976	384987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387878899
119	NC_017905	CATTGA	2	12	391216	391227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387878904
120	NC_017905	TTTGTC	2	12	391241	391252	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387878904
121	NC_017905	CTGAAA	2	12	395285	395296	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387878910
122	NC_017905	GCCTTG	2	12	400178	400189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387878914
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129	NC_017905	GACTCT	2	12	418658	418669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387878929
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133	NC_017905	TGCCAT	2	12	433119	433130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387878941
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140	NC_017905	GCTGAA	2	12	445972	445983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387878951
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219	NC_017905	ATCACC	2	12	714342	714353	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387879216
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221	NC_017905	AGAAAA	2	12	720453	720464	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387879222
222	NC_017905	TTTCAG	2	12	720947	720958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387879222
223	NC_017905	ACAGGG	2	12	725059	725070	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387879226
224	NC_017905	ACTCGT	2	12	730174	730185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387879230
225	NC_017905	GCTCAA	2	12	731162	731173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387879231
226	NC_017905	GTAGCA	2	12	733251	733262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387879232
227	NC_017905	GCTCTT	2	12	733557	733568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387879232
228	NC_017905	TCAAAG	2	12	736549	736560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387879235
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453	NC_017905	CAAGAT	2	12	1395742	1395753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387879873
454	NC_017905	CGTTGG	2	12	1395791	1395802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387879873
455	NC_017905	AATCAT	2	12	1400013	1400024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387879875
456	NC_017905	GCTCCA	2	12	1400434	1400445	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387879875
457	NC_017905	CAACTG	2	12	1402597	1402608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387879878
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459	NC_017905	TTCCTC	2	12	1408752	1408763	0 %	50 %	0 %	50 %	387879886
460	NC_017905	AAAAAT	2	12	1409354	1409365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387879889
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