MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ST556 chromosome

Total Repeats: 762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017769	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387787131
2	NC_017769	ATCTTC	2	12	6703	6714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387787140
3	NC_017769	ATCGTT	2	12	7006	7017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387787140
4	NC_017769	ATCAAA	2	12	7639	7650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387787140
5	NC_017769	ATAAAA	2	12	19111	19122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387787160
6	NC_017769	CAAAGC	2	12	20608	20619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387787162
7	NC_017769	ATTGGA	2	12	23347	23358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787164
8	NC_017769	TTGCAA	2	12	23636	23647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387787165
9	NC_017769	TGCTTA	2	12	26283	26294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387787165
10	NC_017769	GCTAAC	2	12	26524	26535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387787165
11	NC_017769	TTGATT	2	12	27458	27469	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387787167
12	NC_017769	AGTTGA	2	12	39900	39911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787175
13	NC_017769	TCTATA	2	12	44818	44829	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387787181
14	NC_017769	GAAATT	2	12	48278	48289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387787188
15	NC_017769	AAAAGC	2	12	49799	49810	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387787190
16	NC_017769	GTTACA	2	12	52982	52993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387787196
17	NC_017769	AGAAAC	2	12	56811	56822	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387787204
18	NC_017769	TTTTAC	2	12	58423	58434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387787206
19	NC_017769	TTGATG	2	12	62847	62858	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387787209
20	NC_017769	CTGCAA	2	12	66079	66090	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387787216
21	NC_017769	ATCCAT	2	12	80320	80331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387787226
22	NC_017769	AGGTTG	2	12	82191	82202	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387787229
23	NC_017769	TTGTTT	2	12	84420	84431	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387787231
24	NC_017769	CGATTG	2	12	88442	88453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787236
25	NC_017769	TTCCTT	2	12	91587	91598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387787238
26	NC_017769	AGGATA	2	12	97128	97139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387787246
27	NC_017769	TCAATC	2	12	98457	98468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387787246
28	NC_017769	TTACTG	2	12	108840	108851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387787254
29	NC_017769	GTTTCT	2	12	119140	119151	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387787262
30	NC_017769	TTCCTT	2	12	120220	120231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387787263
31	NC_017769	TTGCAG	2	12	124374	124385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787267
32	NC_017769	TCTTGC	2	12	125948	125959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387787269
33	NC_017769	GACTTG	2	12	126352	126363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787269
34	NC_017769	ACATCA	2	12	136010	136021	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387787283
35	NC_017769	GCTTGC	2	12	137202	137213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387787283
36	NC_017769	TACAGG	2	12	139427	139438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387787286
37	NC_017769	AAAAAC	2	12	139528	139539	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	387787286
38	NC_017769	TGGTTG	2	12	143274	143285	0 %	50 %	50 %	0 %	387787290
39	NC_017769	TAAAAA	2	12	143600	143611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387787291
40	NC_017769	TTTTGA	2	12	146966	146977	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387787293
41	NC_017769	AAGCAG	2	12	147494	147505	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387787293
42	NC_017769	AAGGAA	2	12	156414	156425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387787303
43	NC_017769	TTATCT	2	12	175754	175765	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387787321
44	NC_017769	TTTTAT	2	12	177023	177034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387787324
45	NC_017769	TAACAA	2	12	177518	177529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387787324
46	NC_017769	TTGAAA	2	12	181339	181350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387787328
47	NC_017769	CCAGCT	2	12	182130	182141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387787328
48	NC_017769	CCAGCT	2	12	182157	182168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387787328
49	NC_017769	CCAGCT	2	12	182184	182195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387787328
50	NC_017769	TTTGCT	2	12	189533	189544	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387787336
51	NC_017769	TCAGGG	2	12	191492	191503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387787340
52	NC_017769	GAAGCA	2	12	201176	201187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387787350
53	NC_017769	TCAGGT	2	12	214309	214320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787367
54	NC_017769	ATTGAG	2	12	222647	222658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787376
55	NC_017769	TTCGGA	2	12	222777	222788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787376
56	NC_017769	AACAAG	2	12	226400	226411	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387787378
57	NC_017769	GGATTG	2	12	228129	228140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387787380
58	NC_017769	TGCACT	2	12	231894	231905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387787385
59	NC_017769	CAATAT	2	12	233374	233385	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387787386
60	NC_017769	ATCTAT	2	12	234030	234041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387787387
61	NC_017769	ATTATC	2	12	235456	235467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387787388
62	NC_017769	TTGGAA	2	12	245689	245700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787400
63	NC_017769	TGTTCG	2	12	247049	247060	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387787401
64	NC_017769	TTCCAT	2	12	247587	247598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387787401
65	NC_017769	ACTTGG	2	12	247846	247857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787401
66	NC_017769	ACCACG	2	12	252383	252394	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387787407
67	NC_017769	GCAGAC	2	12	253244	253255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387787408
68	NC_017769	ACAAGA	2	12	261047	261058	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387787415
69	NC_017769	CAGGAA	2	12	261251	261262	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387787416
70	NC_017769	TAAAGG	2	12	263939	263950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387787420
71	NC_017769	GCAATC	2	12	266527	266538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387787425
72	NC_017769	ACATCA	2	12	267074	267085	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387787426
73	NC_017769	TAAAGG	2	12	271325	271336	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387787435
74	NC_017769	AAATTA	2	12	272364	272375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387787438
75	NC_017769	ACTTGG	2	12	272431	272442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787438
76	NC_017769	TTGAAG	2	12	275372	275383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787442
77	NC_017769	GTAAAG	2	12	276055	276066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387787443
78	NC_017769	AAACTC	2	12	277430	277441	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	387787445
79	NC_017769	AGATAA	2	12	281532	281543	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387787450
80	NC_017769	CATAAT	2	12	283599	283610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387787453
81	NC_017769	TATCTG	2	12	288977	288988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387787461
82	NC_017769	ACAATT	2	12	291097	291108	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387787462
83	NC_017769	CCAATT	2	12	296077	296088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387787465
84	NC_017769	TGAAAT	2	12	297108	297119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387787465
85	NC_017769	TGTCAA	2	12	306724	306735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387787474
86	NC_017769	GATGGT	2	12	307485	307496	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387787475
87	NC_017769	TGCCTT	2	12	309136	309147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387787476
88	NC_017769	GTTGCT	2	12	313602	313613	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387787478
89	NC_017769	GCAAGA	2	12	317448	317459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387787481
90	NC_017769	ATTCGA	2	12	318846	318857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387787481
91	NC_017769	GTCAGT	2	12	322251	322262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787482
92	NC_017769	CGATAC	2	12	332542	332553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387787493
93	NC_017769	GTAAGG	2	12	343782	343793	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387787506
94	NC_017769	TAAACA	2	12	347541	347552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387787509
95	NC_017769	TCCCAT	2	12	348864	348875	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387787511
96	NC_017769	TCTTGT	2	12	351240	351251	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387787514
97	NC_017769	GAATTA	2	12	351748	351759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387787515
98	NC_017769	AAAAGG	2	12	353876	353887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387787518
99	NC_017769	TAGATA	2	12	358888	358899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387787523
100	NC_017769	GATAAA	2	12	364237	364248	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387787526
101	NC_017769	AAAATG	2	12	368139	368150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387787529
102	NC_017769	AGAGGA	2	12	370713	370724	50 %	0 %	50 %	0 %	387787532
103	NC_017769	ATGGAG	2	12	371146	371157	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387787533
104	NC_017769	CCATAG	2	12	375476	375487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387787538
105	NC_017769	TTGATT	2	12	375919	375930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387787538
106	NC_017769	GATCAG	2	12	379622	379633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387787546
107	NC_017769	AGCGTG	2	12	379803	379814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387787546
108	NC_017769	ACACAA	2	12	382111	382122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387787548
109	NC_017769	AGGTTC	2	12	382905	382916	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387787548
110	NC_017769	GACCGT	2	12	393292	393303	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387787555
111	NC_017769	TGGAAT	2	12	401672	401683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387787564
112	NC_017769	GCCAAA	2	12	406920	406931	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387787569
113	NC_017769	GCTAAA	2	12	409726	409737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387787573
114	NC_017769	GAAAAA	2	12	411038	411049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387787574
115	NC_017769	AGCTAT	2	12	412907	412918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387787574
116	NC_017769	AGACAA	2	12	415702	415713	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387787574
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452	NC_017769	ATTGAC	2	12	1261545	1261556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387788415
453	NC_017769	TTTTAG	2	12	1264314	1264325	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387788418
454	NC_017769	AACGAT	2	12	1271210	1271221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387788424
455	NC_017769	TGAATC	2	12	1271522	1271533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387788424
456	NC_017769	TCAACT	2	12	1272129	1272140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387788424
457	NC_017769	ATATCA	3	18	1275869	1275886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387788426
458	NC_017769	TTCCCA	2	12	1276002	1276013	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387788426
459	NC_017769	CATGAT	2	12	1282027	1282038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387788430
460	NC_017769	CATATG	2	12	1282330	1282341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387788430
461	NC_017769	TATCTA	2	12	1284687	1284698	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387788431
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481	NC_017769	GACCAC	2	12	1335216	1335227	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387788480
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