MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 3415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017766	GAC	2	6	145207	145212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835997
3002	NC_017766	CCT	2	6	145227	145232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835997
3003	NC_017766	CGC	2	6	145253	145258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835997
3004	NC_017766	CGC	2	6	145268	145273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835997
3005	NC_017766	GGT	2	6	145814	145819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835999
3006	NC_017766	AGG	2	6	145869	145874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835999
3007	NC_017766	TCT	2	6	145875	145880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835999
3008	NC_017766	GTC	2	6	145973	145978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835999
3009	NC_017766	GTG	2	6	146027	146032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835999
3010	NC_017766	TCC	3	9	146049	146057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835999
3011	NC_017766	CTGT	2	8	146106	146113	0 %	50 %	25 %	25 %	386835999
3012	NC_017766	CAG	2	6	146120	146125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835999
3013	NC_017766	TCC	2	6	146133	146138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835999
3014	NC_017766	GCGG	2	8	146169	146176	0 %	0 %	75 %	25 %	386835999
3015	NC_017766	GAA	2	6	146474	146479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836000
3016	NC_017766	GGCGC	2	10	146504	146513	0 %	0 %	60 %	40 %	386836000
3017	NC_017766	GGT	2	6	146516	146521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836000
3018	NC_017766	TGA	2	6	146566	146571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836000
3019	NC_017766	GCT	2	6	146575	146580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836000
3020	NC_017766	GCC	2	6	146597	146602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836000
3021	NC_017766	TCG	2	6	146628	146633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836000
3022	NC_017766	AGG	2	6	146635	146640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836000
3023	NC_017766	CG	3	6	146648	146653	0 %	0 %	50 %	50 %	386836000
3024	NC_017766	CGGC	2	8	146662	146669	0 %	0 %	50 %	50 %	386836000
3025	NC_017766	TTC	2	6	146673	146678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836000
3026	NC_017766	CGG	2	6	146686	146691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836000
3027	NC_017766	GTTCTT	2	12	146696	146707	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386836000
3028	NC_017766	ATC	2	6	146721	146726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836000
3029	NC_017766	GCC	2	6	146741	146746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836000
3030	NC_017766	GCC	2	6	146765	146770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836000
3031	NC_017766	GAT	2	6	146801	146806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836000
3032	NC_017766	GTA	2	6	146867	146872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836000
3033	NC_017766	CGG	2	6	146890	146895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836000
3034	NC_017766	GGTGAA	2	12	146933	146944	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386836000
3035	NC_017766	GGT	2	6	146951	146956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836000
3036	NC_017766	TCT	3	9	146974	146982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836000
3037	NC_017766	GGC	2	6	147086	147091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836000
3038	NC_017766	GCCC	2	8	147113	147120	0 %	0 %	25 %	75 %	386836000
3039	NC_017766	GAC	2	6	147239	147244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836000
3040	NC_017766	GAC	2	6	147248	147253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836000
3041	NC_017766	CACTCG	2	12	147273	147284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386836000
3042	NC_017766	GCC	2	6	147417	147422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836000
3043	NC_017766	GTG	2	6	147883	147888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836001
3044	NC_017766	CCA	2	6	147895	147900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836001
3045	NC_017766	GCC	2	6	147919	147924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836001
3046	NC_017766	CGG	4	12	147974	147985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836001
3047	NC_017766	GTGCG	2	10	148158	148167	0 %	20 %	60 %	20 %	386836002
3048	NC_017766	TCG	2	6	148225	148230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836002
3049	NC_017766	GGC	2	6	148311	148316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3050	NC_017766	CTG	2	6	148377	148382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836002
3051	NC_017766	GCAG	2	8	148466	148473	25 %	0 %	50 %	25 %	386836002
3052	NC_017766	GGC	2	6	148476	148481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3053	NC_017766	CGG	2	6	148499	148504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3054	NC_017766	CCA	2	6	148512	148517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836002
3055	NC_017766	GCG	2	6	148651	148656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3056	NC_017766	TTC	2	6	148659	148664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836002
3057	NC_017766	TGGC	2	8	148669	148676	0 %	25 %	50 %	25 %	386836002
3058	NC_017766	CCA	2	6	148698	148703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836002
3059	NC_017766	GGC	2	6	148721	148726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3060	NC_017766	GGGCGC	2	12	148727	148738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836002
3061	NC_017766	GGA	3	9	148740	148748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836002
3062	NC_017766	CCG	2	6	148758	148763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836002
3063	NC_017766	GTC	2	6	148870	148875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836002
3064	NC_017766	CTC	2	6	148919	148924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836003
3065	NC_017766	CGG	2	6	148950	148955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836003
3066	NC_017766	GCT	2	6	149048	149053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3067	NC_017766	GAT	2	6	149075	149080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836003
3068	NC_017766	CAG	2	6	149108	149113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3069	NC_017766	CG	3	6	149158	149163	0 %	0 %	50 %	50 %	386836003
3070	NC_017766	CGA	2	6	149185	149190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3071	NC_017766	CGC	2	6	149193	149198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836003
3072	NC_017766	CTG	2	6	149213	149218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3073	NC_017766	AGC	2	6	149238	149243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3074	NC_017766	CCT	2	6	149341	149346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836003
3075	NC_017766	TCA	2	6	149350	149355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836003
3076	NC_017766	GCG	2	6	149389	149394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836003
3077	NC_017766	CGT	2	6	149416	149421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836003
3078	NC_017766	GCTC	2	8	149731	149738	0 %	25 %	25 %	50 %	386836004
3079	NC_017766	CGT	2	6	149834	149839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3080	NC_017766	AGCC	2	8	149874	149881	25 %	0 %	25 %	50 %	386836005
3081	NC_017766	GTC	2	6	149889	149894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3082	NC_017766	GCC	2	6	149907	149912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836005
3083	NC_017766	GAC	2	6	149913	149918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3084	NC_017766	CAG	2	6	149937	149942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3085	NC_017766	CAC	2	6	149981	149986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836005
3086	NC_017766	CGT	2	6	150073	150078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3087	NC_017766	TGG	2	6	150099	150104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836005
3088	NC_017766	CGT	2	6	150113	150118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836005
3089	NC_017766	GGT	2	6	150382	150387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836006
3090	NC_017766	TTGCC	2	10	150432	150441	0 %	40 %	20 %	40 %	386836006
3091	NC_017766	GCC	3	9	150439	150447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836006
3092	NC_017766	GTTC	2	8	150453	150460	0 %	50 %	25 %	25 %	386836006
3093	NC_017766	TGG	2	6	150480	150485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836006
3094	NC_017766	ACG	2	6	150545	150550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836006
3095	NC_017766	GGGGA	2	10	150575	150584	20 %	0 %	80 %	0 %	386836006
3096	NC_017766	CCG	2	6	150624	150629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836006
3097	NC_017766	TGG	2	6	150636	150641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836006
3098	NC_017766	CCGG	2	8	150967	150974	0 %	0 %	50 %	50 %	386836007
3099	NC_017766	ACC	2	6	151011	151016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836007
3100	NC_017766	GCG	2	6	151017	151022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836007
3101	NC_017766	ACA	2	6	151030	151035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386836007
3102	NC_017766	GCCG	2	8	151056	151063	0 %	0 %	50 %	50 %	386836007
3103	NC_017766	CTA	2	6	151094	151099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836007
3104	NC_017766	GTC	3	9	151143	151151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836007
3105	NC_017766	ACC	2	6	151152	151157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836007
3106	NC_017766	AGC	2	6	151162	151167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836007
3107	NC_017766	GCG	2	6	151188	151193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836007
3108	NC_017766	GGC	2	6	151198	151203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836007
3109	NC_017766	CCG	2	6	151271	151276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836007
3110	NC_017766	GGA	2	6	151298	151303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836007
3111	NC_017766	GCG	2	6	151307	151312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836007
3112	NC_017766	CGG	2	6	151336	151341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836008
3113	NC_017766	GGA	2	6	151361	151366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836008
3114	NC_017766	GAG	2	6	151387	151392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836008
3115	NC_017766	ACC	2	6	151393	151398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836008
3116	NC_017766	GCG	2	6	151439	151444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836008
3117	NC_017766	CGA	2	6	151455	151460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836008
3118	NC_017766	AGG	2	6	151472	151477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836008
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3120	NC_017766	GCC	2	6	151489	151494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836008
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3229	NC_017766	CGG	2	6	155731	155736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836015
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3232	NC_017766	CGTCC	2	10	155798	155807	0 %	20 %	20 %	60 %	386836015
3233	NC_017766	CAG	2	6	155828	155833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836015
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3237	NC_017766	CGC	2	6	155941	155946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836015
3238	NC_017766	CGG	2	6	155954	155959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836015
3239	NC_017766	GAC	2	6	156027	156032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836015
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3242	NC_017766	CGT	2	6	156118	156123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836015
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3350	NC_017766	TG	3	6	161219	161224	0 %	50 %	50 %	0 %	386836020
3351	NC_017766	GGC	2	6	161227	161232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836020
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3355	NC_017766	GCC	2	6	161288	161293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836020
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3357	NC_017766	CTC	2	6	161308	161313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836020
3358	NC_017766	CTG	2	6	161347	161352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836020
3359	NC_017766	TGT	2	6	161390	161395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386836020
3360	NC_017766	GTC	2	6	161413	161418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836020
3361	NC_017766	GCT	2	6	161562	161567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836020
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3363	NC_017766	TCCTTG	2	12	161576	161587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386836020
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.