MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 3415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017766	GCC	2	6	49139	49144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1002	NC_017766	CAG	2	6	49156	49161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835896
1003	NC_017766	GAA	2	6	49258	49263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835896
1004	NC_017766	GCG	2	6	49286	49291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835896
1005	NC_017766	CGC	2	6	49300	49305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1006	NC_017766	TCCCC	2	10	49326	49335	0 %	20 %	0 %	80 %	386835896
1007	NC_017766	CATC	2	8	49368	49375	25 %	25 %	0 %	50 %	386835896
1008	NC_017766	CGC	2	6	49381	49386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1009	NC_017766	CCG	2	6	49392	49397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1010	NC_017766	CCT	2	6	49398	49403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835896
1011	NC_017766	GGC	2	6	49427	49432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835896
1012	NC_017766	AAC	2	6	49451	49456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386835896
1013	NC_017766	CCG	2	6	49467	49472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1014	NC_017766	AAG	2	6	49491	49496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835896
1015	NC_017766	CGA	2	6	49605	49610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835896
1016	NC_017766	ACA	3	9	49623	49631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386835896
1017	NC_017766	CGC	2	6	49728	49733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1018	NC_017766	GCA	2	6	49764	49769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835896
1019	NC_017766	GAT	2	6	49770	49775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835896
1020	NC_017766	GTC	2	6	49780	49785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835896
1021	NC_017766	CTGG	2	8	49798	49805	0 %	25 %	50 %	25 %	386835896
1022	NC_017766	CGG	2	6	49810	49815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835896
1023	NC_017766	GTG	2	6	49822	49827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835896
1024	NC_017766	CGC	2	6	49877	49882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835896
1025	NC_017766	TCC	2	6	49883	49888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835896
1026	NC_017766	CAG	3	9	49900	49908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835896
1027	NC_017766	GCG	2	6	49926	49931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835896
1028	NC_017766	GCCA	2	8	50060	50067	25 %	0 %	25 %	50 %	386835896
1029	NC_017766	CCA	2	6	50070	50075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835896
1030	NC_017766	TCC	2	6	50087	50092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835896
1031	NC_017766	CAC	2	6	50094	50099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835896
1032	NC_017766	CTC	2	6	50132	50137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835896
1033	NC_017766	TCC	2	6	50180	50185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835896
1034	NC_017766	ACC	2	6	50205	50210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835896
1035	NC_017766	CGACA	2	10	50264	50273	40 %	0 %	20 %	40 %	386835896
1036	NC_017766	CA	3	6	50296	50301	50 %	0 %	0 %	50 %	386835896
1037	NC_017766	ACCTTG	2	12	51546	51557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386835897
1038	NC_017766	CCG	2	6	51585	51590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835897
1039	NC_017766	CCGC	2	8	51636	51643	0 %	0 %	25 %	75 %	386835897
1040	NC_017766	GAA	2	6	53302	53307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835898
1041	NC_017766	CGC	2	6	53323	53328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835898
1042	NC_017766	GCCG	2	8	53416	53423	0 %	0 %	50 %	50 %	386835898
1043	NC_017766	GTC	2	6	53429	53434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1044	NC_017766	GTC	2	6	53456	53461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1045	NC_017766	CAGA	2	8	53522	53529	50 %	0 %	25 %	25 %	386835898
1046	NC_017766	AC	4	8	53542	53549	50 %	0 %	0 %	50 %	386835898
1047	NC_017766	CGG	2	6	53656	53661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835898
1048	NC_017766	CGAG	2	8	53674	53681	25 %	0 %	50 %	25 %	386835898
1049	NC_017766	ACC	2	6	53703	53708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835898
1050	NC_017766	TCG	2	6	53715	53720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1051	NC_017766	CT	3	6	53726	53731	0 %	50 %	0 %	50 %	386835898
1052	NC_017766	CGAA	2	8	53741	53748	50 %	0 %	25 %	25 %	386835898
1053	NC_017766	AAG	2	6	53754	53759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835898
1054	NC_017766	C	6	6	53835	53840	0 %	0 %	0 %	100 %	386835898
1055	NC_017766	GGC	2	6	53866	53871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835898
1056	NC_017766	ACG	2	6	53905	53910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1057	NC_017766	CAG	2	6	53919	53924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1058	NC_017766	GAA	2	6	54019	54024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835898
1059	NC_017766	CG	3	6	54175	54180	0 %	0 %	50 %	50 %	386835898
1060	NC_017766	ACG	2	6	54261	54266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1061	NC_017766	CGA	2	6	54335	54340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1062	NC_017766	AAGC	2	8	54365	54372	50 %	0 %	25 %	25 %	386835898
1063	NC_017766	TGA	2	6	54486	54491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835898
1064	NC_017766	CCCG	2	8	54520	54527	0 %	0 %	25 %	75 %	386835898
1065	NC_017766	TGC	2	6	54583	54588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1066	NC_017766	GAA	2	6	54593	54598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835898
1067	NC_017766	GCG	2	6	54599	54604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835898
1068	NC_017766	CTG	2	6	54635	54640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835898
1069	NC_017766	GAG	2	6	54650	54655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835898
1070	NC_017766	CTC	2	6	54977	54982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835899
1071	NC_017766	CCA	2	6	55014	55019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835899
1072	NC_017766	CGC	2	6	55068	55073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835899
1073	NC_017766	CGC	2	6	55841	55846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835900
1074	NC_017766	CGC	2	6	56918	56923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835901
1075	NC_017766	TCG	3	9	57212	57220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835902
1076	NC_017766	CCCGCG	2	12	57237	57248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1077	NC_017766	C	6	6	57257	57262	0 %	0 %	0 %	100 %	386835902
1078	NC_017766	G	6	6	57288	57293	0 %	0 %	100 %	0 %	386835902
1079	NC_017766	CCCGCG	2	12	57299	57310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1080	NC_017766	CCCGCG	2	12	57360	57371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1081	NC_017766	ATC	2	6	57405	57410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386835902
1082	NC_017766	CCCGCG	2	12	57421	57432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1083	NC_017766	CGG	2	6	57504	57509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835902
1084	NC_017766	CCA	2	6	57527	57532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835902
1085	NC_017766	CCCGCG	2	12	57543	57554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1086	NC_017766	CTC	2	6	57601	57606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835902
1087	NC_017766	CCA	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835902
1088	NC_017766	CGC	2	6	57753	57758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
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1090	NC_017766	GCC	3	9	58043	58051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1091	NC_017766	CG	3	6	58056	58061	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
1092	NC_017766	ACCG	2	8	58233	58240	25 %	0 %	25 %	50 %	386835902
1093	NC_017766	GCC	2	6	58286	58291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1094	NC_017766	CGA	2	6	58403	58408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835902
1095	NC_017766	GGGT	2	8	58462	58469	0 %	25 %	75 %	0 %	386835902
1096	NC_017766	CGC	2	6	58470	58475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1097	NC_017766	CCG	2	6	58487	58492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835902
1098	NC_017766	TGG	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835902
1099	NC_017766	CTC	2	6	58556	58561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835902
1100	NC_017766	GCCG	2	8	58600	58607	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
1101	NC_017766	CCTGC	2	10	58640	58649	0 %	20 %	20 %	60 %	386835902
1102	NC_017766	ACC	3	9	58650	58658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835902
1103	NC_017766	TCG	2	6	58662	58667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835902
1104	NC_017766	CGG	2	6	58670	58675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835902
1105	NC_017766	CG	3	6	58683	58688	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
1106	NC_017766	CG	3	6	58744	58749	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
1107	NC_017766	TGG	2	6	58758	58763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835902
1108	NC_017766	GCG	2	6	58778	58783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835902
1109	NC_017766	GTC	2	6	58789	58794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835902
1110	NC_017766	CGG	2	6	58818	58823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835902
1111	NC_017766	GC	3	6	58837	58842	0 %	0 %	50 %	50 %	386835902
1112	NC_017766	TCA	3	9	58847	58855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386835902
1113	NC_017766	GCGG	3	12	59057	59068	0 %	0 %	75 %	25 %	386835903
1114	NC_017766	GTCC	2	8	59085	59092	0 %	25 %	25 %	50 %	386835903
1115	NC_017766	GCC	2	6	59107	59112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835903
1116	NC_017766	GCC	2	6	59125	59130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835903
1117	NC_017766	CAG	2	6	59160	59165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835903
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1120	NC_017766	GCG	2	6	59253	59258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835903
1121	NC_017766	CGCC	2	8	59277	59284	0 %	0 %	25 %	75 %	386835903
1122	NC_017766	GTCC	2	8	59308	59315	0 %	25 %	25 %	50 %	386835903
1123	NC_017766	GCT	2	6	59331	59336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835903
1124	NC_017766	CGC	2	6	59394	59399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835903
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1126	NC_017766	GCG	2	6	59497	59502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835903
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1247	NC_017766	CAG	2	6	64221	64226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835907
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1372	NC_017766	GCC	2	6	70242	70247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835918
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1374	NC_017766	AAG	2	6	70281	70286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835918
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