MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 3415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017766	CTG	2	6	24586	24591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835869
502	NC_017766	CGG	2	6	24594	24599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835869
503	NC_017766	AGG	2	6	24602	24607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835869
504	NC_017766	TCG	2	6	24608	24613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835869
505	NC_017766	CGC	2	6	24628	24633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835869
506	NC_017766	ACG	2	6	24656	24661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835869
507	NC_017766	GGC	2	6	24705	24710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835869
508	NC_017766	GTCG	2	8	24804	24811	0 %	25 %	50 %	25 %	386835869
509	NC_017766	GCCGC	2	10	24828	24837	0 %	0 %	40 %	60 %	386835869
510	NC_017766	CGG	2	6	24864	24869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835869
511	NC_017766	CCGG	2	8	24878	24885	0 %	0 %	50 %	50 %	386835869
512	NC_017766	GCA	2	6	24969	24974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835869
513	NC_017766	GCG	2	6	25001	25006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835869
514	NC_017766	GAC	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835870
515	NC_017766	GCG	2	6	25254	25259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835870
516	NC_017766	GTC	2	6	25276	25281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835870
517	NC_017766	GCT	2	6	25301	25306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835870
518	NC_017766	ACG	2	6	25331	25336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835870
519	NC_017766	CGC	2	6	25353	25358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835870
520	NC_017766	CGT	2	6	25395	25400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835870
521	NC_017766	GGA	2	6	25446	25451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835870
522	NC_017766	GGCCG	2	10	25456	25465	0 %	0 %	60 %	40 %	386835870
523	NC_017766	GGC	2	6	25469	25474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835870
524	NC_017766	CCT	2	6	25484	25489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835870
525	NC_017766	TGCC	2	8	25503	25510	0 %	25 %	25 %	50 %	386835870
526	NC_017766	AGC	2	6	25523	25528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835870
527	NC_017766	GGC	2	6	25548	25553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835870
528	NC_017766	ACC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835870
529	NC_017766	GAA	2	6	25655	25660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835871
530	NC_017766	GTC	2	6	25724	25729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835871
531	NC_017766	CGAC	2	8	25809	25816	25 %	0 %	25 %	50 %	386835871
532	NC_017766	CGGG	2	8	25841	25848	0 %	0 %	75 %	25 %	386835871
533	NC_017766	GCA	2	6	25924	25929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835871
534	NC_017766	GCG	2	6	25947	25952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835871
535	NC_017766	TCC	2	6	25977	25982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835871
536	NC_017766	CGC	2	6	25991	25996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835871
537	NC_017766	AGA	2	6	26148	26153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386835871
538	NC_017766	GGC	3	9	26170	26178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835871
539	NC_017766	CAC	2	6	26260	26265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835871
540	NC_017766	GCA	2	6	26362	26367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835871
541	NC_017766	CTC	2	6	26655	26660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835872
542	NC_017766	GCA	2	6	26670	26675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835872
543	NC_017766	AGC	2	6	26702	26707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835872
544	NC_017766	TGC	2	6	26737	26742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835872
545	NC_017766	GCC	2	6	26747	26752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835872
546	NC_017766	CGC	2	6	26826	26831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835872
547	NC_017766	CG	3	6	26851	26856	0 %	0 %	50 %	50 %	386835872
548	NC_017766	AGC	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835872
549	NC_017766	GC	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	386835872
550	NC_017766	GCC	2	6	26896	26901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835872
551	NC_017766	GAC	2	6	26914	26919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835872
552	NC_017766	GGT	2	6	27013	27018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835872
553	NC_017766	CTGC	2	8	27156	27163	0 %	25 %	25 %	50 %	386835872
554	NC_017766	CAA	2	6	27363	27368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386835873
555	NC_017766	GCC	2	6	27379	27384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835873
556	NC_017766	GAC	2	6	27394	27399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835873
557	NC_017766	GAG	2	6	27439	27444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835873
558	NC_017766	GCA	2	6	27469	27474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835873
559	NC_017766	CGTC	2	8	27498	27505	0 %	25 %	25 %	50 %	386835873
560	NC_017766	GCT	2	6	27537	27542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835873
561	NC_017766	GAC	2	6	27553	27558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835873
562	NC_017766	GAG	2	6	27601	27606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835873
563	NC_017766	GGA	2	6	27744	27749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835873
564	NC_017766	CGG	2	6	27869	27874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835873
565	NC_017766	TCG	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835874
566	NC_017766	AGG	2	6	28065	28070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835874
567	NC_017766	GCT	2	6	28106	28111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835874
568	NC_017766	CCG	2	6	28138	28143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835874
569	NC_017766	CGC	2	6	28289	28294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835874
570	NC_017766	ACG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835874
571	NC_017766	CG	3	6	28347	28352	0 %	0 %	50 %	50 %	386835874
572	NC_017766	GAC	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835874
573	NC_017766	CAG	2	6	28378	28383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835874
574	NC_017766	CGG	2	6	28402	28407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835874
575	NC_017766	GCT	2	6	28419	28424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835874
576	NC_017766	TCCG	2	8	28429	28436	0 %	25 %	25 %	50 %	386835874
577	NC_017766	CCA	2	6	28457	28462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835874
578	NC_017766	ACG	2	6	28465	28470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835874
579	NC_017766	TCT	2	6	28496	28501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386835874
580	NC_017766	GCTG	2	8	28548	28555	0 %	25 %	50 %	25 %	386835874
581	NC_017766	AGC	2	6	28561	28566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835874
582	NC_017766	GT	3	6	28634	28639	0 %	50 %	50 %	0 %	386835874
583	NC_017766	GC	3	6	28688	28693	0 %	0 %	50 %	50 %	386835874
584	NC_017766	GC	3	6	29062	29067	0 %	0 %	50 %	50 %	386835875
585	NC_017766	GGT	2	6	29084	29089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835875
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587	NC_017766	AGC	2	6	29157	29162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835875
588	NC_017766	CGG	2	6	29180	29185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835875
589	NC_017766	CGG	2	6	29197	29202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835875
590	NC_017766	GGC	2	6	29213	29218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835875
591	NC_017766	GCG	2	6	29244	29249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835875
592	NC_017766	CGC	2	6	29301	29306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835875
593	NC_017766	TCG	2	6	29313	29318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835875
594	NC_017766	GCCA	2	8	29629	29636	25 %	0 %	25 %	50 %	386835876
595	NC_017766	GGTG	2	8	29647	29654	0 %	25 %	75 %	0 %	386835876
596	NC_017766	CGT	2	6	29713	29718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835876
597	NC_017766	CCA	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835876
598	NC_017766	TGCG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	50 %	25 %	386835876
599	NC_017766	GCC	2	6	29828	29833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
600	NC_017766	CCG	2	6	29910	29915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
601	NC_017766	CCG	2	6	29949	29954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
602	NC_017766	TCG	2	6	29982	29987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835876
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604	NC_017766	GCC	2	6	30032	30037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
605	NC_017766	AGC	2	6	30042	30047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835876
606	NC_017766	GCT	2	6	30067	30072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835876
607	NC_017766	TGA	2	6	30154	30159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835876
608	NC_017766	CAG	2	6	30232	30237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835876
609	NC_017766	CCG	2	6	30238	30243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
610	NC_017766	AGC	2	6	30294	30299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835876
611	NC_017766	GCG	2	6	30306	30311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835876
612	NC_017766	GGT	2	6	30344	30349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835876
613	NC_017766	GCCA	2	8	30374	30381	25 %	0 %	25 %	50 %	386835876
614	NC_017766	GCC	3	9	30426	30434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835876
615	NC_017766	GCG	2	6	30480	30485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835876
616	NC_017766	TGC	2	6	30492	30497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835876
617	NC_017766	GTG	3	9	30564	30572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835876
618	NC_017766	GCGGG	2	10	30573	30582	0 %	0 %	80 %	20 %	386835876
619	NC_017766	GGT	3	9	30584	30592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835876
620	NC_017766	GCT	2	6	30602	30607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835876
621	NC_017766	GGC	3	9	30608	30616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835876
622	NC_017766	GCG	2	6	30633	30638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835876
623	NC_017766	CGC	2	6	30834	30839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835877
624	NC_017766	CG	3	6	30912	30917	0 %	0 %	50 %	50 %	386835877
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626	NC_017766	GCC	2	6	31042	31047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835877
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