MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 chromosome

Total Repeats: 251656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017765	CCT	2	6	30807	30812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836123
502	NC_017765	AGACC	2	10	30838	30847	40 %	0 %	20 %	40 %	386836123
503	NC_017765	GTG	2	6	30857	30862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836123
504	NC_017765	GAC	2	6	30863	30868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836123
505	NC_017765	AGC	2	6	30876	30881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836123
506	NC_017765	AGCA	2	8	30929	30936	50 %	0 %	25 %	25 %	386836123
507	NC_017765	GGCG	2	8	32130	32137	0 %	0 %	75 %	25 %	386836124
508	NC_017765	GGC	3	9	32163	32171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836124
509	NC_017765	GCG	2	6	32225	32230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836124
510	NC_017765	ACG	2	6	32236	32241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836124
511	NC_017765	TCGCAG	2	12	32260	32271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386836124
512	NC_017765	GGT	2	6	32273	32278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836124
513	NC_017765	AAG	2	6	32296	32301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836124
514	NC_017765	CGTG	2	8	32306	32313	0 %	25 %	50 %	25 %	386836124
515	NC_017765	GC	3	6	32320	32325	0 %	0 %	50 %	50 %	386836124
516	NC_017765	GTC	2	6	32352	32357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836124
517	NC_017765	GCG	3	9	32407	32415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836124
518	NC_017765	TGA	2	6	32420	32425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836124
519	NC_017765	CGT	2	6	32474	32479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836124
520	NC_017765	CGA	2	6	32525	32530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836124
521	NC_017765	CGC	2	6	32552	32557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836124
522	NC_017765	CGG	2	6	32576	32581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836124
523	NC_017765	GTG	2	6	32587	32592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836124
524	NC_017765	CGT	2	6	32594	32599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836124
525	NC_017765	GTG	2	6	32629	32634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836124
526	NC_017765	GGT	3	9	32710	32718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836125
527	NC_017765	CG	3	6	32742	32747	0 %	0 %	50 %	50 %	386836125
528	NC_017765	GGT	2	6	32771	32776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836125
529	NC_017765	GCG	2	6	32793	32798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836125
530	NC_017765	CTG	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836125
531	NC_017765	GTC	2	6	32879	32884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836125
532	NC_017765	GTC	2	6	32936	32941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836125
533	NC_017765	GGGCAG	2	12	32942	32953	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836125
534	NC_017765	CGG	3	9	32956	32964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836125
535	NC_017765	GGT	2	6	33011	33016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836125
536	NC_017765	CGCAG	2	10	33019	33028	20 %	0 %	40 %	40 %	386836125
537	NC_017765	GGC	2	6	33055	33060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836125
538	NC_017765	GTC	2	6	33131	33136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836125
539	NC_017765	CGGGT	2	10	33139	33148	0 %	20 %	60 %	20 %	386836125
540	NC_017765	GC	3	6	33153	33158	0 %	0 %	50 %	50 %	386836125
541	NC_017765	GCG	2	6	33231	33236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836125
542	NC_017765	CGA	2	6	33256	33261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836125
543	NC_017765	GCG	2	6	33305	33310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836125
544	NC_017765	ATC	2	6	33321	33326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836125
545	NC_017765	GCGG	2	8	34004	34011	0 %	0 %	75 %	25 %	386836126
546	NC_017765	TGC	2	6	34014	34019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836126
547	NC_017765	CAGGG	2	10	34026	34035	20 %	0 %	60 %	20 %	386836126
548	NC_017765	CCT	2	6	34048	34053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836126
549	NC_017765	ACG	2	6	34062	34067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836126
550	NC_017765	GGT	2	6	34078	34083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836126
551	NC_017765	CGC	2	6	34097	34102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836126
552	NC_017765	CGG	2	6	34129	34134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836126
553	NC_017765	CGG	2	6	34153	34158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836126
554	NC_017765	CG	3	6	34216	34221	0 %	0 %	50 %	50 %	386836126
555	NC_017765	CGC	3	9	34249	34257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836126
556	NC_017765	TGCC	2	8	34388	34395	0 %	25 %	25 %	50 %	386836127
557	NC_017765	GCG	2	6	34417	34422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836127
558	NC_017765	CGG	2	6	34428	34433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836127
559	NC_017765	AGC	2	6	34463	34468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836127
560	NC_017765	GAC	2	6	34491	34496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836127
561	NC_017765	GCG	2	6	34544	34549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836127
562	NC_017765	CGG	3	9	34590	34598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836127
563	NC_017765	GCAGGT	2	12	34629	34640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836127
564	NC_017765	CGGAT	2	10	34658	34667	20 %	20 %	40 %	20 %	386836127
565	NC_017765	AGG	2	6	34671	34676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836127
566	NC_017765	GTG	3	9	34774	34782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836128
567	NC_017765	GGC	2	6	34860	34865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836128
568	NC_017765	CGGC	2	8	34874	34881	0 %	0 %	50 %	50 %	386836128
569	NC_017765	TGGG	2	8	34936	34943	0 %	25 %	75 %	0 %	386836128
570	NC_017765	GTC	2	6	35021	35026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836129
571	NC_017765	TG	3	6	35034	35039	0 %	50 %	50 %	0 %	386836129
572	NC_017765	CGG	2	6	35041	35046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836129
573	NC_017765	CCGAG	2	10	35263	35272	20 %	0 %	40 %	40 %	386836129
574	NC_017765	GGATGC	2	12	35293	35304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836129
575	NC_017765	CCGGGG	2	12	35310	35321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836129
576	NC_017765	CTGTGT	3	18	35398	35415	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386836129
577	NC_017765	GCGTCC	2	12	35421	35432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836129
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580	NC_017765	GCA	2	6	35527	35532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836129
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582	NC_017765	GGTGCT	2	12	38988	38999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386836130
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584	NC_017765	GTG	2	6	39097	39102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836130
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590	NC_017765	GAA	2	6	39237	39242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836130
591	NC_017765	GCT	2	6	39255	39260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
592	NC_017765	GCT	2	6	39264	39269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
593	NC_017765	CCGG	2	8	39319	39326	0 %	0 %	50 %	50 %	386836130
594	NC_017765	CCGG	2	8	39344	39351	0 %	0 %	50 %	50 %	386836130
595	NC_017765	GCG	2	6	39355	39360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
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598	NC_017765	CGGG	2	8	39408	39415	0 %	0 %	75 %	25 %	386836130
599	NC_017765	GCG	2	6	39425	39430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
600	NC_017765	GCG	3	9	39457	39465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836130
601	NC_017765	GCT	2	6	39477	39482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836130
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605	NC_017765	GGA	2	6	39648	39653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836130
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608	NC_017765	GGGT	2	8	40819	40826	0 %	25 %	75 %	0 %	386836131
609	NC_017765	AGC	2	6	40893	40898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836131
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611	NC_017765	CCCA	2	8	40976	40983	25 %	0 %	0 %	75 %	386836131
612	NC_017765	CCT	2	6	41014	41019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836131
613	NC_017765	CCGC	2	8	41145	41152	0 %	0 %	25 %	75 %	386836131
614	NC_017765	GAGAC	2	10	41181	41190	40 %	0 %	40 %	20 %	386836131
615	NC_017765	GTC	2	6	41231	41236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836131
616	NC_017765	CCG	2	6	41268	41273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836131
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620	NC_017765	GGC	2	6	41476	41481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836132
621	NC_017765	CCAG	2	8	41490	41497	25 %	0 %	25 %	50 %	386836132
622	NC_017765	GCA	2	6	41526	41531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836132
623	NC_017765	ACC	2	6	41546	41551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836132
624	NC_017765	ACG	2	6	41555	41560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836132
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