MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017720	ACCAGC	2	12	892	903	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386730661
2	NC_017720	CCACAT	2	12	3894	3905	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386730662
3	NC_017720	ACCGTC	2	12	4415	4426	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386730662
4	NC_017720	CCCGCT	2	12	5316	5327	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386730662
5	NC_017720	GGCTGT	2	12	7656	7667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386730664
6	NC_017720	ACGGTT	2	12	8282	8293	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730664
7	NC_017720	TAACTG	2	12	13233	13244	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730667
8	NC_017720	CGGCAC	2	12	28653	28664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386730685
9	NC_017720	GGCAGC	2	12	29142	29153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386730685
10	NC_017720	ATAAAA	2	12	30454	30465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386730687
11	NC_017720	AGCGCC	2	12	37960	37971	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386730696
12	NC_017720	ACTGGC	2	12	38499	38510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730696
13	NC_017720	CCAGCG	2	12	53726	53737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386730715
14	NC_017720	GGTAAG	2	12	59341	59352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386730720
15	NC_017720	GCGCTG	2	12	64030	64041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386730724
16	NC_017720	CCACCG	2	12	64972	64983	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386730724
17	NC_017720	CAAAAT	2	12	65018	65029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386730724
18	NC_017720	TGCGCC	2	12	69446	69457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386730730
19	NC_017720	CAGGCT	2	12	71286	71297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730732
20	NC_017720	GCTGTC	2	12	73708	73719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730737
21	NC_017720	CACTGT	2	12	73720	73731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730737
22	NC_017720	AACAGA	2	12	75465	75476	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386730739
23	NC_017720	TGGATA	2	12	76452	76463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730740
24	NC_017720	TACCAA	2	12	84524	84535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386730747
25	NC_017720	CGGGAG	2	12	87691	87702	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386730751
26	NC_017720	CGGGGA	2	12	87820	87831	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386730751
27	NC_017720	CGTGGT	2	12	88023	88034	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386730751
28	NC_017720	GCCGGT	2	12	88629	88640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386730752
29	NC_017720	TGGATG	2	12	89310	89321	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386730753
30	NC_017720	TGTCAG	2	12	89623	89634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730753
31	NC_017720	CGGATT	2	12	91866	91877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730755

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.