MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 1575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017720	CTG	3	9	88317	88325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730752
1502	NC_017720	GCTG	2	8	88337	88344	0 %	25 %	50 %	25 %	386730752
1503	NC_017720	CGC	2	6	88462	88467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730752
1504	NC_017720	CGT	2	6	88480	88485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730752
1505	NC_017720	TGA	2	6	88547	88552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730752
1506	NC_017720	GCCGGT	2	12	88629	88640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386730752
1507	NC_017720	TAA	2	6	89112	89117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730753
1508	NC_017720	TCT	2	6	89134	89139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730753
1509	NC_017720	T	7	7	89139	89145	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
1510	NC_017720	AGG	2	6	89152	89157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730753
1511	NC_017720	CAGA	2	8	89231	89238	50 %	0 %	25 %	25 %	386730753
1512	NC_017720	GGT	2	6	89253	89258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730753
1513	NC_017720	CAT	2	6	89261	89266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730753
1514	NC_017720	GTG	2	6	89267	89272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730753
1515	NC_017720	TGGATG	2	12	89310	89321	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386730753
1516	NC_017720	TCCG	2	8	89391	89398	0 %	25 %	25 %	50 %	386730753
1517	NC_017720	GA	3	6	89439	89444	50 %	0 %	50 %	0 %	386730753
1518	NC_017720	T	7	7	89505	89511	0 %	100 %	0 %	0 %	386730753
1519	NC_017720	TGTCAG	2	12	89623	89634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730753
1520	NC_017720	A	6	6	89645	89650	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
1521	NC_017720	AC	3	6	89673	89678	50 %	0 %	0 %	50 %	386730753
1522	NC_017720	CTG	2	6	89684	89689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730753
1523	NC_017720	A	6	6	89702	89707	100 %	0 %	0 %	0 %	386730753
1524	NC_017720	AGG	2	6	89730	89735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730753
1525	NC_017720	AGT	2	6	89771	89776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730753
1526	NC_017720	ATTT	2	8	89847	89854	25 %	75 %	0 %	0 %	386730753
1527	NC_017720	CAT	3	9	91104	91112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730755
1528	NC_017720	CGC	2	6	91126	91131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730755
1529	NC_017720	CCG	2	6	91159	91164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730755
1530	NC_017720	GCT	2	6	91196	91201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730755
1531	NC_017720	CGC	2	6	91246	91251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730755
1532	NC_017720	CATC	2	8	91343	91350	25 %	25 %	0 %	50 %	386730755
1533	NC_017720	GCT	2	6	91379	91384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730755
1534	NC_017720	GCG	2	6	91407	91412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730755
1535	NC_017720	GGC	2	6	91413	91418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730755
1536	NC_017720	TCGG	2	8	91477	91484	0 %	25 %	50 %	25 %	386730755
1537	NC_017720	GGTA	2	8	91520	91527	25 %	25 %	50 %	0 %	386730755
1538	NC_017720	AGC	2	6	91690	91695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730755
1539	NC_017720	ACG	2	6	91707	91712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730755
1540	NC_017720	GCA	2	6	91715	91720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730755
1541	NC_017720	GGC	2	6	91723	91728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730755
1542	NC_017720	CGAA	3	12	91749	91760	50 %	0 %	25 %	25 %	386730755
1543	NC_017720	TC	3	6	91849	91854	0 %	50 %	0 %	50 %	386730755
1544	NC_017720	CGGATT	2	12	91866	91877	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386730755
1545	NC_017720	GTCA	2	8	91914	91921	25 %	25 %	25 %	25 %	386730755
1546	NC_017720	CTGC	2	8	91925	91932	0 %	25 %	25 %	50 %	386730755
1547	NC_017720	TGG	2	6	92020	92025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730757
1548	NC_017720	TAG	2	6	92272	92277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730758
1549	NC_017720	AGT	2	6	92296	92301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730758
1550	NC_017720	GCT	2	6	92319	92324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730758
1551	NC_017720	CTTT	2	8	92330	92337	0 %	75 %	0 %	25 %	386730758
1552	NC_017720	ATGT	2	8	92338	92345	25 %	50 %	25 %	0 %	386730758
1553	NC_017720	CGT	2	6	92374	92379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730758
1554	NC_017720	T	6	6	92381	92386	0 %	100 %	0 %	0 %	386730758
1555	NC_017720	TCT	3	9	92403	92411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730758
1556	NC_017720	GAC	2	6	92706	92711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1557	NC_017720	CTG	2	6	92737	92742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1558	NC_017720	AAT	2	6	92749	92754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730759
1559	NC_017720	GAA	2	6	92806	92811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730759
1560	NC_017720	AC	3	6	92818	92823	50 %	0 %	0 %	50 %	386730759
1561	NC_017720	CAG	2	6	92855	92860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1562	NC_017720	CTG	2	6	92874	92879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1563	NC_017720	TCCAG	2	10	92908	92917	20 %	20 %	20 %	40 %	386730759
1564	NC_017720	C	10	10	92919	92928	0 %	0 %	0 %	100 %	386730759
1565	NC_017720	TAA	2	6	92956	92961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730759
1566	NC_017720	GCCA	2	8	92966	92973	25 %	0 %	25 %	50 %	386730759
1567	NC_017720	GCT	2	6	93046	93051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1568	NC_017720	ACGG	2	8	93083	93090	25 %	0 %	50 %	25 %	386730759
1569	NC_017720	CAG	2	6	93115	93120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730759
1570	NC_017720	GCG	2	6	93561	93566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730760
1571	NC_017720	GCC	2	6	93567	93572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730760
1572	NC_017720	ACT	2	6	93575	93580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730760
1573	NC_017720	GC	3	6	93598	93603	0 %	0 %	50 %	50 %	386730760
1574	NC_017720	TGG	2	6	93616	93621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730760
1575	NC_017720	CTG	2	6	93716	93721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730760

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