MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 1575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017720	GCA	2	6	55963	55968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730717
1002	NC_017720	AGT	2	6	56000	56005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730717
1003	NC_017720	AC	3	6	56018	56023	50 %	0 %	0 %	50 %	386730717
1004	NC_017720	GCT	2	6	56081	56086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730717
1005	NC_017720	A	6	6	56174	56179	100 %	0 %	0 %	0 %	386730717
1006	NC_017720	AAC	2	6	56227	56232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730717
1007	NC_017720	GAA	2	6	56243	56248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730717
1008	NC_017720	GTAT	2	8	56266	56273	25 %	50 %	25 %	0 %	386730717
1009	NC_017720	GTT	2	6	56451	56456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730718
1010	NC_017720	TCA	2	6	56482	56487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730718
1011	NC_017720	GCT	2	6	56591	56596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730718
1012	NC_017720	ATT	2	6	56606	56611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730718
1013	NC_017720	CCGGA	2	10	56638	56647	20 %	0 %	40 %	40 %	386730718
1014	NC_017720	GCT	3	9	56662	56670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730718
1015	NC_017720	GCA	2	6	56727	56732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730718
1016	NC_017720	AACAG	2	10	56791	56800	60 %	0 %	20 %	20 %	386730718
1017	NC_017720	GGAA	2	8	56936	56943	50 %	0 %	50 %	0 %	386730718
1018	NC_017720	CTG	2	6	56958	56963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730718
1019	NC_017720	CGCC	2	8	57010	57017	0 %	0 %	25 %	75 %	386730718
1020	NC_017720	AGC	2	6	57066	57071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730718
1021	NC_017720	GCC	2	6	57131	57136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730719
1022	NC_017720	ACG	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1023	NC_017720	TGC	2	6	57314	57319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1024	NC_017720	AAAT	2	8	57338	57345	75 %	25 %	0 %	0 %	386730719
1025	NC_017720	GCC	2	6	57349	57354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730719
1026	NC_017720	GCT	2	6	57380	57385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1027	NC_017720	GATT	2	8	57415	57422	25 %	50 %	25 %	0 %	386730719
1028	NC_017720	CGG	2	6	57514	57519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730719
1029	NC_017720	GT	4	8	57689	57696	0 %	50 %	50 %	0 %	386730719
1030	NC_017720	CTGCG	2	10	57715	57724	0 %	20 %	40 %	40 %	386730719
1031	NC_017720	GCC	2	6	57778	57783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730719
1032	NC_017720	GGCA	2	8	57881	57888	25 %	0 %	50 %	25 %	386730719
1033	NC_017720	GAC	2	6	57902	57907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1034	NC_017720	AGG	2	6	57952	57957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730719
1035	NC_017720	GGA	2	6	58079	58084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730719
1036	NC_017720	CTGG	2	8	58085	58092	0 %	25 %	50 %	25 %	386730719
1037	NC_017720	GGTG	2	8	58175	58182	0 %	25 %	75 %	0 %	386730719
1038	NC_017720	CTG	2	6	58254	58259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1039	NC_017720	ATGT	2	8	58281	58288	25 %	50 %	25 %	0 %	386730719
1040	NC_017720	TTA	2	6	58316	58321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730719
1041	NC_017720	TGA	2	6	58469	58474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730719
1042	NC_017720	CAG	2	6	58479	58484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1043	NC_017720	CGA	2	6	58574	58579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730719
1044	NC_017720	CTGA	2	8	58638	58645	25 %	25 %	25 %	25 %	386730719
1045	NC_017720	TAT	2	6	58774	58779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730720
1046	NC_017720	AGC	2	6	58796	58801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1047	NC_017720	TGA	2	6	58802	58807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730720
1048	NC_017720	GAC	2	6	58835	58840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1049	NC_017720	GTG	2	6	58858	58863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730720
1050	NC_017720	GCA	3	9	58896	58904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1051	NC_017720	CTG	2	6	58906	58911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1052	NC_017720	AAAAT	2	10	58916	58925	80 %	20 %	0 %	0 %	386730720
1053	NC_017720	CGC	2	6	59044	59049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730720
1054	NC_017720	A	6	6	59074	59079	100 %	0 %	0 %	0 %	386730720
1055	NC_017720	TGTT	2	8	59099	59106	0 %	75 %	25 %	0 %	386730720
1056	NC_017720	CGG	2	6	59175	59180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730720
1057	NC_017720	CGT	2	6	59193	59198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1058	NC_017720	CGT	2	6	59233	59238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1059	NC_017720	CGA	2	6	59240	59245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1060	NC_017720	GGA	2	6	59247	59252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730720
1061	NC_017720	AT	3	6	59310	59315	50 %	50 %	0 %	0 %	386730720
1062	NC_017720	GCT	2	6	59322	59327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1063	NC_017720	GGTAAG	2	12	59341	59352	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386730720
1064	NC_017720	CTG	2	6	59386	59391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730720
1065	NC_017720	TGG	2	6	59567	59572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730720
1066	NC_017720	ATT	2	6	59607	59612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730720
1067	NC_017720	TAA	2	6	59613	59618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730720
1068	NC_017720	CGGT	2	8	59666	59673	0 %	25 %	50 %	25 %	386730720
1069	NC_017720	TGA	2	6	59977	59982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730721
1070	NC_017720	CCAG	2	8	60086	60093	25 %	0 %	25 %	50 %	386730721
1071	NC_017720	GAT	2	6	60117	60122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730721
1072	NC_017720	CCA	2	6	60134	60139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730721
1073	NC_017720	CGCC	2	8	60153	60160	0 %	0 %	25 %	75 %	386730721
1074	NC_017720	TGTA	2	8	60161	60168	25 %	50 %	25 %	0 %	386730721
1075	NC_017720	ATAA	2	8	60193	60200	75 %	25 %	0 %	0 %	386730721
1076	NC_017720	TGC	3	9	60212	60220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730721
1077	NC_017720	CCCGT	2	10	60236	60245	0 %	20 %	20 %	60 %	386730721
1078	NC_017720	TTC	2	6	60435	60440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730721
1079	NC_017720	CTGC	2	8	60494	60501	0 %	25 %	25 %	50 %	386730721
1080	NC_017720	TGA	2	6	60554	60559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730721
1081	NC_017720	CAGC	2	8	60594	60601	25 %	0 %	25 %	50 %	386730721
1082	NC_017720	GTAAA	2	10	60713	60722	60 %	20 %	20 %	0 %	386730721
1083	NC_017720	GGC	2	6	60753	60758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730721
1084	NC_017720	GCA	2	6	60800	60805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730721
1085	NC_017720	TTG	2	6	60849	60854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730721
1086	NC_017720	TAT	2	6	61516	61521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730722
1087	NC_017720	TAA	2	6	61534	61539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730722
1088	NC_017720	A	6	6	61538	61543	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
1089	NC_017720	AG	3	6	61649	61654	50 %	0 %	50 %	0 %	386730722
1090	NC_017720	GAA	2	6	61678	61683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730722
1091	NC_017720	AAC	2	6	61794	61799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730722
1092	NC_017720	ATA	2	6	61805	61810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730722
1093	NC_017720	A	6	6	61837	61842	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
1094	NC_017720	A	6	6	61875	61880	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
1095	NC_017720	ATA	2	6	61913	61918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730722
1096	NC_017720	GAA	2	6	61919	61924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730722
1097	NC_017720	ACAA	2	8	61934	61941	75 %	0 %	0 %	25 %	386730722
1098	NC_017720	ATT	2	6	61965	61970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730722
1099	NC_017720	TTAT	2	8	62021	62028	25 %	75 %	0 %	0 %	386730722
1100	NC_017720	A	6	6	62033	62038	100 %	0 %	0 %	0 %	386730722
1101	NC_017720	TTCT	2	8	62039	62046	0 %	75 %	0 %	25 %	386730722
1102	NC_017720	T	7	7	62137	62143	0 %	100 %	0 %	0 %	386730722
1103	NC_017720	GTTCA	2	10	62197	62206	20 %	40 %	20 %	20 %	386730722
1104	NC_017720	ACA	2	6	62218	62223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730722
1105	NC_017720	CCT	2	6	62319	62324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730722
1106	NC_017720	CAG	2	6	62384	62389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730722
1107	NC_017720	TTAT	2	8	62919	62926	25 %	75 %	0 %	0 %	386730723
1108	NC_017720	ACC	2	6	62940	62945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730723
1109	NC_017720	ATT	3	9	63010	63018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730723
1110	NC_017720	TTA	2	6	63055	63060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730723
1111	NC_017720	GCA	2	6	63185	63190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730723
1112	NC_017720	CGG	2	6	63230	63235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730723
1113	NC_017720	TGG	2	6	63280	63285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730723
1114	NC_017720	ATG	2	6	63289	63294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730723
1115	NC_017720	CTG	2	6	63318	63323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730723
1116	NC_017720	CTG	2	6	63360	63365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730723
1117	NC_017720	AGC	2	6	63402	63407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730723
1118	NC_017720	AGC	2	6	63493	63498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730723
1119	NC_017720	CCGA	2	8	63507	63514	25 %	0 %	25 %	50 %	386730723
1120	NC_017720	ACA	2	6	63520	63525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730723
1121	NC_017720	CTGAC	2	10	63535	63544	20 %	20 %	20 %	40 %	386730723
1122	NC_017720	CCG	2	6	63577	63582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730723
1123	NC_017720	AGTC	2	8	63955	63962	25 %	25 %	25 %	25 %	386730724
1124	NC_017720	GCGCTG	2	12	64030	64041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386730724
1125	NC_017720	CAG	2	6	64047	64052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730724
1126	NC_017720	GGC	2	6	64057	64062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730724
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1243	NC_017720	CAGGCT	2	12	71286	71297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730732
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1249	NC_017720	CAG	2	6	71439	71444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730732
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1251	NC_017720	CAC	2	6	71487	71492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730732
1252	NC_017720	CCT	2	6	71497	71502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730732
1253	NC_017720	CCT	2	6	71601	71606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730733
1254	NC_017720	GCA	2	6	71734	71739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
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1256	NC_017720	CGGT	2	8	71877	71884	0 %	25 %	50 %	25 %	386730733
1257	NC_017720	GC	3	6	71897	71902	0 %	0 %	50 %	50 %	386730733
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