MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 1575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017720	GTA	2	6	24861	24866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730679
502	NC_017720	GCTG	2	8	24953	24960	0 %	25 %	50 %	25 %	386730679
503	NC_017720	AC	3	6	24973	24978	50 %	0 %	0 %	50 %	386730679
504	NC_017720	CG	3	6	24989	24994	0 %	0 %	50 %	50 %	386730679
505	NC_017720	GCA	2	6	25007	25012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730679
506	NC_017720	TCAT	2	8	25090	25097	25 %	50 %	0 %	25 %	386730679
507	NC_017720	GCA	2	6	25133	25138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730679
508	NC_017720	CAG	2	6	25218	25223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730679
509	NC_017720	GCC	2	6	25231	25236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730679
510	NC_017720	TTC	2	6	25258	25263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730679
511	NC_017720	CCG	2	6	25677	25682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730680
512	NC_017720	CTC	2	6	25727	25732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730680
513	NC_017720	CCA	2	6	25751	25756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730680
514	NC_017720	GTC	2	6	25769	25774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730680
515	NC_017720	CAG	2	6	25805	25810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730680
516	NC_017720	GCG	2	6	25811	25816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730680
517	NC_017720	AGC	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730680
518	NC_017720	CAG	2	6	25868	25873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730680
519	NC_017720	GAC	2	6	25879	25884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730680
520	NC_017720	AGA	2	6	25909	25914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730680
521	NC_017720	AC	3	6	25953	25958	50 %	0 %	0 %	50 %	386730680
522	NC_017720	CGG	2	6	26014	26019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730680
523	NC_017720	ATT	2	6	26022	26027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730680
524	NC_017720	GTC	2	6	26062	26067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730680
525	NC_017720	AAT	2	6	26090	26095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730680
526	NC_017720	T	6	6	26104	26109	0 %	100 %	0 %	0 %	386730680
527	NC_017720	TGCC	2	8	26131	26138	0 %	25 %	25 %	50 %	386730681
528	NC_017720	AC	3	6	26167	26172	50 %	0 %	0 %	50 %	386730681
529	NC_017720	CGC	2	6	26197	26202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730681
530	NC_017720	GTT	2	6	26300	26305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730681
531	NC_017720	TTAA	2	8	26477	26484	50 %	50 %	0 %	0 %	386730682
532	NC_017720	ACGG	2	8	26502	26509	25 %	0 %	50 %	25 %	386730682
533	NC_017720	A	6	6	26519	26524	100 %	0 %	0 %	0 %	386730682
534	NC_017720	CGC	2	6	26582	26587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730682
535	NC_017720	CAC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730682
536	NC_017720	GA	3	6	26629	26634	50 %	0 %	50 %	0 %	386730682
537	NC_017720	GCC	2	6	26646	26651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730682
538	NC_017720	GTG	2	6	26689	26694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730682
539	NC_017720	CGG	2	6	26696	26701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730682
540	NC_017720	GGC	2	6	26720	26725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730682
541	NC_017720	CGT	2	6	26774	26779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730682
542	NC_017720	GTG	2	6	26898	26903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730682
543	NC_017720	GTTC	2	8	26924	26931	0 %	50 %	25 %	25 %	386730682
544	NC_017720	CAG	2	6	26945	26950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730682
545	NC_017720	GC	3	6	26953	26958	0 %	0 %	50 %	50 %	386730682
546	NC_017720	GCA	2	6	27018	27023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730683
547	NC_017720	CAGA	2	8	27039	27046	50 %	0 %	25 %	25 %	386730683
548	NC_017720	TAT	2	6	27133	27138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730683
549	NC_017720	ATC	2	6	27175	27180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730683
550	NC_017720	TCA	2	6	27191	27196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730683
551	NC_017720	T	6	6	27239	27244	0 %	100 %	0 %	0 %	386730684
552	NC_017720	TTA	2	6	27252	27257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730684
553	NC_017720	GTT	2	6	27332	27337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730684
554	NC_017720	ACA	2	6	27415	27420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730684
555	NC_017720	TTC	2	6	27485	27490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730684
556	NC_017720	GAC	2	6	27543	27548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730684
557	NC_017720	CCGGA	2	10	27575	27584	20 %	0 %	40 %	40 %	386730684
558	NC_017720	TGT	2	6	27636	27641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730684
559	NC_017720	ACA	2	6	27678	27683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730684
560	NC_017720	TGT	2	6	27689	27694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730684
561	NC_017720	CAGC	2	8	27734	27741	25 %	0 %	25 %	50 %	386730684
562	NC_017720	AGA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730684
563	NC_017720	GTT	2	6	27785	27790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730684
564	NC_017720	TCC	2	6	27816	27821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730685
565	NC_017720	CTG	2	6	27840	27845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
566	NC_017720	GCT	2	6	27863	27868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
567	NC_017720	TCC	2	6	27949	27954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730685
568	NC_017720	TTC	2	6	27984	27989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730685
569	NC_017720	TAA	2	6	28087	28092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730685
570	NC_017720	CAC	3	9	28121	28129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730685
571	NC_017720	CTG	2	6	28191	28196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
572	NC_017720	CAC	2	6	28278	28283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730685
573	NC_017720	GTAC	2	8	28378	28385	25 %	25 %	25 %	25 %	386730685
574	NC_017720	CG	3	6	28389	28394	0 %	0 %	50 %	50 %	386730685
575	NC_017720	C	6	6	28409	28414	0 %	0 %	0 %	100 %	386730685
576	NC_017720	AGGG	2	8	28594	28601	25 %	0 %	75 %	0 %	386730685
577	NC_017720	TTC	2	6	28606	28611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730685
578	NC_017720	CGGCAC	2	12	28653	28664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386730685
579	NC_017720	GGA	2	6	28726	28731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730685
580	NC_017720	GTC	2	6	28834	28839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
581	NC_017720	GCG	2	6	28879	28884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730685
582	NC_017720	ACG	2	6	28908	28913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730685
583	NC_017720	GTC	2	6	28917	28922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
584	NC_017720	GCT	2	6	28928	28933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
585	NC_017720	TCG	2	6	28963	28968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730685
586	NC_017720	GCC	2	6	28987	28992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730685
587	NC_017720	GTG	2	6	29008	29013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730685
588	NC_017720	TCA	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730685
589	NC_017720	CCA	2	6	29048	29053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730685
590	NC_017720	GGCAGC	2	12	29142	29153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386730685
591	NC_017720	CAA	2	6	29162	29167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730685
592	NC_017720	CCAG	2	8	29171	29178	25 %	0 %	25 %	50 %	386730685
593	NC_017720	GCTG	2	8	29287	29294	0 %	25 %	50 %	25 %	386730686
594	NC_017720	ATTTT	2	10	29358	29367	20 %	80 %	0 %	0 %	386730686
595	NC_017720	CA	3	6	29406	29411	50 %	0 %	0 %	50 %	386730686
596	NC_017720	CAGA	2	8	29425	29432	50 %	0 %	25 %	25 %	386730686
597	NC_017720	CCGG	2	8	29433	29440	0 %	0 %	50 %	50 %	386730686
598	NC_017720	CTT	2	6	29452	29457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730686
599	NC_017720	GGCA	2	8	29483	29490	25 %	0 %	50 %	25 %	386730686
600	NC_017720	CAG	2	6	29525	29530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730686
601	NC_017720	CCT	2	6	29566	29571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730686
602	NC_017720	CGGA	2	8	29637	29644	25 %	0 %	50 %	25 %	386730686
603	NC_017720	CCA	3	9	29704	29712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730686
604	NC_017720	CGC	2	6	29713	29718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730686
605	NC_017720	CCG	2	6	29838	29843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730686
606	NC_017720	ACC	3	9	29856	29864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730686
607	NC_017720	GCC	2	6	29919	29924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730686
608	NC_017720	T	6	6	29949	29954	0 %	100 %	0 %	0 %	386730686
609	NC_017720	CCAG	2	8	29981	29988	25 %	0 %	25 %	50 %	386730687
610	NC_017720	AATGT	2	10	30018	30027	40 %	40 %	20 %	0 %	386730687
611	NC_017720	A	6	6	30127	30132	100 %	0 %	0 %	0 %	386730687
612	NC_017720	CTT	2	6	30167	30172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730687
613	NC_017720	AT	3	6	30214	30219	50 %	50 %	0 %	0 %	386730687
614	NC_017720	GAC	2	6	30256	30261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730687
615	NC_017720	CTG	2	6	30297	30302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730687
616	NC_017720	CCG	2	6	30368	30373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730687
617	NC_017720	TTA	2	6	30400	30405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730687
618	NC_017720	CAG	2	6	30444	30449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730687
619	NC_017720	ATAAAA	2	12	30454	30465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386730687
620	NC_017720	T	6	6	30648	30653	0 %	100 %	0 %	0 %	386730688
621	NC_017720	GTT	2	6	30704	30709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730688
622	NC_017720	ACAG	2	8	30735	30742	50 %	0 %	25 %	25 %	386730688
623	NC_017720	CAG	3	9	30740	30748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730688
624	NC_017720	AATT	2	8	30750	30757	50 %	50 %	0 %	0 %	386730688
625	NC_017720	TGGT	2	8	30787	30794	0 %	50 %	50 %	0 %	386730688
626	NC_017720	CGA	2	6	30868	30873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730689
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628	NC_017720	TCA	2	6	30940	30945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730689
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