MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017718	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730550
2	NC_017718	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730551
3	NC_017718	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730551
4	NC_017718	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730551
5	NC_017718	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
6	NC_017718	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
7	NC_017718	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730551
8	NC_017718	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
9	NC_017718	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730551
10	NC_017718	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730551
11	NC_017718	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730552
12	NC_017718	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730552
13	NC_017718	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730552
14	NC_017718	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730554
15	NC_017718	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730554
16	NC_017718	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
17	NC_017718	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730554
18	NC_017718	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730554
19	NC_017718	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
20	NC_017718	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730554
21	NC_017718	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730554
22	NC_017718	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730554
23	NC_017718	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
24	NC_017718	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730554
25	NC_017718	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
26	NC_017718	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730554
27	NC_017718	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
28	NC_017718	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730554
29	NC_017718	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730554
30	NC_017718	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730555
31	NC_017718	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730555
32	NC_017718	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730555
33	NC_017718	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730555
34	NC_017718	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730555
35	NC_017718	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
36	NC_017718	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
37	NC_017718	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730556
38	NC_017718	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730556
39	NC_017718	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730556
40	NC_017718	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730557
41	NC_017718	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730557
42	NC_017718	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730557
43	NC_017718	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730558
44	NC_017718	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730558
45	NC_017718	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730558
46	NC_017718	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730558
47	NC_017718	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730558
48	NC_017718	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730558
49	NC_017718	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730558
50	NC_017718	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730559
51	NC_017718	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730559
52	NC_017718	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730559
53	NC_017718	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730559
54	NC_017718	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730559
55	NC_017718	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730559
56	NC_017718	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730559
57	NC_017718	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730559
58	NC_017718	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730559
59	NC_017718	AGA	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730560
60	NC_017718	ATG	2	6	6829	6834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730560
61	NC_017718	TGC	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730560
62	NC_017718	ACC	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730560
63	NC_017718	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730560
64	NC_017718	CTC	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730560
65	NC_017718	GCA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
66	NC_017718	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730560
67	NC_017718	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
68	NC_017718	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
69	NC_017718	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
70	NC_017718	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730560
71	NC_017718	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730560
72	NC_017718	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
73	NC_017718	GCA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
74	NC_017718	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
75	NC_017718	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
76	NC_017718	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730561
77	NC_017718	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
78	NC_017718	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730561
79	NC_017718	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730561
80	NC_017718	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730561
81	NC_017718	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730561
82	NC_017718	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730561
83	NC_017718	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730561
84	NC_017718	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
85	NC_017718	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
86	NC_017718	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
87	NC_017718	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730561
88	NC_017718	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730561
89	NC_017718	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
90	NC_017718	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730561
91	NC_017718	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730561
92	NC_017718	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730561
93	NC_017718	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730561
94	NC_017718	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730562
95	NC_017718	AAG	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730562
96	NC_017718	TTA	2	6	10350	10355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730562
97	NC_017718	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730562
98	NC_017718	AAT	2	6	10480	10485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730562
99	NC_017718	GCT	2	6	12549	12554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730563
100	NC_017718	TCA	3	9	12608	12616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730563
101	NC_017718	TGT	2	6	12750	12755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730563
102	NC_017718	GCA	2	6	12856	12861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730564
103	NC_017718	CCA	2	6	12877	12882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730564
104	NC_017718	TGC	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730564
105	NC_017718	ATG	2	6	12960	12965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730564
106	NC_017718	CTG	2	6	12980	12985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730564
107	NC_017718	TGC	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730564
108	NC_017718	AGC	2	6	13152	13157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730564
109	NC_017718	GCC	2	6	13169	13174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730564
110	NC_017718	GAA	2	6	13185	13190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730564
111	NC_017718	CAG	2	6	13202	13207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730564
112	NC_017718	TGG	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730564
113	NC_017718	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730564
114	NC_017718	GCC	2	6	13382	13387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730564
115	NC_017718	AAC	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730564
116	NC_017718	TAA	2	6	13888	13893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730565
117	NC_017718	AGC	2	6	13911	13916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730565
118	NC_017718	GGT	2	6	14256	14261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730566
119	NC_017718	AAG	2	6	14605	14610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730566
120	NC_017718	TGA	2	6	14810	14815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730566
121	NC_017718	CGA	2	6	14920	14925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730567
122	NC_017718	ACA	2	6	14989	14994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730567
123	NC_017718	CGC	2	6	15059	15064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730567
124	NC_017718	TGG	2	6	15174	15179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730567
125	NC_017718	GAT	2	6	15483	15488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730568
126	NC_017718	GCA	2	6	15589	15594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730568
127	NC_017718	CAC	2	6	15714	15719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730568
128	NC_017718	GGT	2	6	15987	15992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730568
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