MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pCol1B9_SL1344

Total Repeats: 1427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017718	GCC	2	6	33300	33305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730590
502	NC_017718	TTG	2	6	33405	33410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730591
503	NC_017718	CCTG	2	8	33431	33438	0 %	25 %	25 %	50 %	386730591
504	NC_017718	GAA	2	6	33468	33473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730591
505	NC_017718	CGG	2	6	33474	33479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730591
506	NC_017718	T	6	6	33485	33490	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
507	NC_017718	AAT	2	6	33506	33511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730591
508	NC_017718	TC	3	6	33526	33531	0 %	50 %	0 %	50 %	386730591
509	NC_017718	AAT	2	6	33605	33610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730591
510	NC_017718	TCA	2	6	33612	33617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730591
511	NC_017718	AGC	2	6	33683	33688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730591
512	NC_017718	ATC	3	9	33704	33712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730591
513	NC_017718	T	6	6	33722	33727	0 %	100 %	0 %	0 %	386730591
514	NC_017718	GTGA	2	8	33969	33976	25 %	25 %	50 %	0 %	386730592
515	NC_017718	AAG	2	6	33986	33991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730592
516	NC_017718	GGATGA	2	12	34043	34054	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386730592
517	NC_017718	GCA	2	6	34113	34118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730592
518	NC_017718	GAT	2	6	34146	34151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730592
519	NC_017718	TGTT	2	8	34198	34205	0 %	75 %	25 %	0 %	386730592
520	NC_017718	TTG	2	6	34246	34251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730592
521	NC_017718	TTCG	2	8	34353	34360	0 %	50 %	25 %	25 %	386730593
522	NC_017718	ATGAC	2	10	34391	34400	40 %	20 %	20 %	20 %	386730593
523	NC_017718	TCT	3	9	34420	34428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730593
524	NC_017718	AAC	2	6	34439	34444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730593
525	NC_017718	TTG	2	6	34469	34474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730593
526	NC_017718	GGCA	2	8	34625	34632	25 %	0 %	50 %	25 %	386730593
527	NC_017718	TGCC	2	8	34887	34894	0 %	25 %	25 %	50 %	386730593
528	NC_017718	ATCGT	2	10	34958	34967	20 %	40 %	20 %	20 %	386730593
529	NC_017718	A	7	7	35016	35022	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
530	NC_017718	TCG	2	6	35103	35108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
531	NC_017718	GATG	2	8	35160	35167	25 %	25 %	50 %	0 %	386730593
532	NC_017718	CCT	2	6	35213	35218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730593
533	NC_017718	A	7	7	35239	35245	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
534	NC_017718	A	6	6	35342	35347	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
535	NC_017718	GCA	2	6	35367	35372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730593
536	NC_017718	GTC	2	6	35381	35386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
537	NC_017718	CTG	2	6	35563	35568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
538	NC_017718	TGG	2	6	35595	35600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730593
539	NC_017718	GTC	2	6	35660	35665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
540	NC_017718	AAAG	2	8	35761	35768	75 %	0 %	25 %	0 %	386730593
541	NC_017718	GAA	2	6	35809	35814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730593
542	NC_017718	CA	3	6	35820	35825	50 %	0 %	0 %	50 %	386730593
543	NC_017718	GTT	2	6	35856	35861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730593
544	NC_017718	ACA	2	6	35889	35894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730593
545	NC_017718	TTG	2	6	35903	35908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730593
546	NC_017718	CAG	2	6	35949	35954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730593
547	NC_017718	CAG	2	6	36017	36022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730593
548	NC_017718	TTTG	2	8	36024	36031	0 %	75 %	25 %	0 %	386730593
549	NC_017718	GCTG	2	8	36066	36073	0 %	25 %	50 %	25 %	386730593
550	NC_017718	CAG	2	6	36093	36098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730593
551	NC_017718	TGC	2	6	36113	36118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
552	NC_017718	TCA	2	6	36237	36242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730593
553	NC_017718	CA	3	6	36263	36268	50 %	0 %	0 %	50 %	386730593
554	NC_017718	GAT	2	6	36283	36288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730593
555	NC_017718	AGA	2	6	36357	36362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730593
556	NC_017718	GCT	2	6	36442	36447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
557	NC_017718	GCT	2	6	36460	36465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730593
558	NC_017718	ACG	2	6	36523	36528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730593
559	NC_017718	AGA	2	6	36608	36613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730593
560	NC_017718	GTT	2	6	36679	36684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730593
561	NC_017718	TAT	2	6	36743	36748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730593
562	NC_017718	ACAA	2	8	36791	36798	75 %	0 %	0 %	25 %	386730593
563	NC_017718	ATC	2	6	36890	36895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730593
564	NC_017718	GAAG	2	8	36901	36908	50 %	0 %	50 %	0 %	386730593
565	NC_017718	CTA	2	6	36915	36920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730593
566	NC_017718	CCG	2	6	36967	36972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730593
567	NC_017718	A	8	8	37010	37017	100 %	0 %	0 %	0 %	386730593
568	NC_017718	GGTT	2	8	37074	37081	0 %	50 %	50 %	0 %	386730594
569	NC_017718	T	7	7	37080	37086	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
570	NC_017718	ATG	2	6	37087	37092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730594
571	NC_017718	GGT	2	6	37119	37124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730594
572	NC_017718	TCG	2	6	37240	37245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730594
573	NC_017718	GCC	2	6	37346	37351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730594
574	NC_017718	ATG	2	6	37451	37456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730594
575	NC_017718	AGT	2	6	37492	37497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730594
576	NC_017718	CGG	2	6	37511	37516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730594
577	NC_017718	AAC	2	6	37561	37566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730594
578	NC_017718	GCT	2	6	37573	37578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730594
579	NC_017718	GAA	2	6	37603	37608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730594
580	NC_017718	TCAA	2	8	37667	37674	50 %	25 %	0 %	25 %	386730594
581	NC_017718	GTT	2	6	37765	37770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730594
582	NC_017718	CTT	2	6	37785	37790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730594
583	NC_017718	CGG	2	6	37794	37799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730594
584	NC_017718	TAC	2	6	37821	37826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730594
585	NC_017718	TGT	2	6	37894	37899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730594
586	NC_017718	TCA	2	6	38009	38014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730594
587	NC_017718	T	6	6	38047	38052	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
588	NC_017718	GATATC	2	12	38224	38235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386730594
589	NC_017718	GA	3	6	38306	38311	50 %	0 %	50 %	0 %	386730594
590	NC_017718	TGT	2	6	38318	38323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730594
591	NC_017718	TTC	2	6	38332	38337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730594
592	NC_017718	CTT	2	6	38418	38423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730594
593	NC_017718	ATC	2	6	38434	38439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730594
594	NC_017718	CA	3	6	38524	38529	50 %	0 %	0 %	50 %	386730594
595	NC_017718	C	6	6	38591	38596	0 %	0 %	0 %	100 %	386730594
596	NC_017718	GCA	2	6	38610	38615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730594
597	NC_017718	T	6	6	38691	38696	0 %	100 %	0 %	0 %	386730594
598	NC_017718	CAC	2	6	38697	38702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730594
599	NC_017718	TCC	2	6	38728	38733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730594
600	NC_017718	GGT	2	6	38905	38910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730594
601	NC_017718	CTT	2	6	39068	39073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730594
602	NC_017718	AAC	2	6	39179	39184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730594
603	NC_017718	CCA	2	6	39234	39239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730594
604	NC_017718	GGT	2	6	39356	39361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730595
605	NC_017718	GCT	2	6	39501	39506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730595
606	NC_017718	GTT	2	6	39531	39536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730595
607	NC_017718	TCT	2	6	39537	39542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730595
608	NC_017718	TCA	2	6	39550	39555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730595
609	NC_017718	GCA	2	6	39591	39596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730595
610	NC_017718	CA	3	6	39616	39621	50 %	0 %	0 %	50 %	386730595
611	NC_017718	GTG	2	6	39625	39630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730595
612	NC_017718	CGGT	2	8	39636	39643	0 %	25 %	50 %	25 %	386730595
613	NC_017718	CCA	2	6	39654	39659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730595
614	NC_017718	CAGG	2	8	39741	39748	25 %	0 %	50 %	25 %	386730595
615	NC_017718	GTTC	2	8	39768	39775	0 %	50 %	25 %	25 %	386730595
616	NC_017718	T	6	6	39908	39913	0 %	100 %	0 %	0 %	386730595
617	NC_017718	CTG	2	6	39991	39996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730595
618	NC_017718	ATC	2	6	40019	40024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730595
619	NC_017718	AG	3	6	40053	40058	50 %	0 %	50 %	0 %	386730595
620	NC_017718	CTG	2	6	40122	40127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730595
621	NC_017718	GCG	2	6	40130	40135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730595
622	NC_017718	GCAG	2	8	40156	40163	25 %	0 %	50 %	25 %	386730595
623	NC_017718	ATCA	2	8	40208	40215	50 %	25 %	0 %	25 %	386730595
624	NC_017718	ATT	2	6	40271	40276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730595
625	NC_017718	AAT	2	6	40319	40324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730595
626	NC_017718	GTC	2	6	40460	40465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730596
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628	NC_017718	CCG	2	6	40553	40558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730596
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757	NC_017718	ATC	2	6	48451	48456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730603
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761	NC_017718	CGA	2	6	48620	48625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730603
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791	NC_017718	GGA	2	6	50678	50683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730605
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870	NC_017718	TGA	2	6	54905	54910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730610
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