MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730447
2	NC_017675	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730448
3	NC_017675	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730448
4	NC_017675	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730448
5	NC_017675	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
6	NC_017675	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
7	NC_017675	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
8	NC_017675	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730450
9	NC_017675	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
10	NC_017675	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
11	NC_017675	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730450
12	NC_017675	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730450
13	NC_017675	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
14	NC_017675	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
15	NC_017675	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
16	NC_017675	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
17	NC_017675	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
18	NC_017675	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
19	NC_017675	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
20	NC_017675	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
21	NC_017675	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730451
22	NC_017675	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730451
23	NC_017675	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730451
24	NC_017675	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730451
25	NC_017675	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730451
26	NC_017675	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
27	NC_017675	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
28	NC_017675	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
29	NC_017675	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730452
30	NC_017675	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730452
31	NC_017675	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730453
32	NC_017675	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
33	NC_017675	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
34	NC_017675	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
35	NC_017675	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730454
36	NC_017675	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
37	NC_017675	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
38	NC_017675	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730454
39	NC_017675	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730454
40	NC_017675	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
41	NC_017675	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730455
42	NC_017675	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
43	NC_017675	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
44	NC_017675	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
45	NC_017675	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
46	NC_017675	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730455
47	NC_017675	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730455
48	NC_017675	CAC	2	6	6271	6276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
49	NC_017675	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
50	NC_017675	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730456
51	NC_017675	GCA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
52	NC_017675	TCA	2	6	7480	7485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
53	NC_017675	ATC	2	6	7584	7589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
54	NC_017675	GCA	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730456
55	NC_017675	ATC	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730456
56	NC_017675	GAT	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
57	NC_017675	GCA	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
58	NC_017675	TGC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
59	NC_017675	ATG	2	6	8751	8756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
60	NC_017675	AAG	2	6	8885	8890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730457
61	NC_017675	GCA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
62	NC_017675	AAC	2	6	9117	9122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730457
63	NC_017675	TCA	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730457
64	NC_017675	TTG	2	6	9210	9215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730457
65	NC_017675	GTG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
66	NC_017675	TCT	2	6	9295	9300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730457
67	NC_017675	GGT	2	6	9352	9357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730457
68	NC_017675	CTG	2	6	9459	9464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
69	NC_017675	ATG	2	6	9528	9533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
70	NC_017675	GAT	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
71	NC_017675	TAA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730457
72	NC_017675	ATG	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730457
73	NC_017675	GCA	2	6	10016	10021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
74	NC_017675	GCT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730457
75	NC_017675	CAG	2	6	10035	10040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730457
76	NC_017675	ATT	2	6	10100	10105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730457
77	NC_017675	GGC	2	6	10108	10113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730457
78	NC_017675	AAT	2	6	10268	10273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730458
79	NC_017675	AAG	2	6	10313	10318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730458
80	NC_017675	TTA	2	6	10350	10355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730458
81	NC_017675	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730458
82	NC_017675	AAT	2	6	10480	10485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730458
83	NC_017675	TCC	2	6	11623	11628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730459
84	NC_017675	AGA	2	6	11729	11734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730459
85	NC_017675	CGT	2	6	11809	11814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730459
86	NC_017675	GTT	2	6	11831	11836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730459
87	NC_017675	GCT	2	6	12549	12554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730460
88	NC_017675	TCA	3	9	12608	12616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730460
89	NC_017675	TGT	2	6	12750	12755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730460
90	NC_017675	GCA	2	6	12856	12861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730461
91	NC_017675	CCA	2	6	12877	12882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730461
92	NC_017675	TGC	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730461
93	NC_017675	ATG	2	6	12960	12965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730461
94	NC_017675	CTG	2	6	12980	12985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730461
95	NC_017675	TGC	2	6	13038	13043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730461
96	NC_017675	AGC	2	6	13152	13157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730461
97	NC_017675	GCC	2	6	13169	13174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730461
98	NC_017675	GAA	2	6	13185	13190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730461
99	NC_017675	CAG	2	6	13202	13207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730461
100	NC_017675	TGG	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730461
101	NC_017675	TAA	2	6	13297	13302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730461
102	NC_017675	GCC	2	6	13382	13387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730461
103	NC_017675	AAC	2	6	13620	13625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730461
104	NC_017675	GGT	2	6	14256	14261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730462
105	NC_017675	AAG	2	6	14605	14610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730462
106	NC_017675	TGA	2	6	14810	14815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730462
107	NC_017675	CGA	2	6	14920	14925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730463
108	NC_017675	ACA	2	6	14989	14994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730463
109	NC_017675	CGC	2	6	15059	15064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730463
110	NC_017675	TGG	2	6	15174	15179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730463
111	NC_017675	GAT	2	6	15483	15488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730464
112	NC_017675	GCA	2	6	15589	15594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730464
113	NC_017675	CAC	2	6	15714	15719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730464
114	NC_017675	GGT	2	6	15987	15992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730464
115	NC_017675	TTG	2	6	16015	16020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730464
116	NC_017675	CAG	2	6	16112	16117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730464
117	NC_017675	GTT	2	6	16260	16265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730464
118	NC_017675	GAT	2	6	16266	16271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730464
119	NC_017675	TGC	2	6	16273	16278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730464
120	NC_017675	ACC	2	6	16357	16362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730464
121	NC_017675	GGT	2	6	16373	16378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730464
122	NC_017675	GGA	2	6	16433	16438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730464
123	NC_017675	GAA	2	6	16458	16463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730465
124	NC_017675	GGA	2	6	16493	16498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730465
125	NC_017675	TGA	2	6	16604	16609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730465
126	NC_017675	CCG	2	6	16618	16623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730465
127	NC_017675	CTC	2	6	16703	16708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730465
128	NC_017675	GTG	2	6	17571	17576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730466
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253	NC_017675	TGG	2	6	31038	31043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730483
254	NC_017675	GCA	2	6	31144	31149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730483
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256	NC_017675	GAA	2	6	31342	31347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730483
257	NC_017675	TGA	2	6	31358	31363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730483
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273	NC_017675	ATT	2	6	33271	33276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730485
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499	NC_017675	TGC	2	6	55904	55909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730506
500	NC_017675	TGT	2	6	55924	55929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730506

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