MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 85956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017623	GCCA	3	12	222264	222275	25 %	0 %	25 %	50 %	386589451
4002	NC_017623	CCG	2	6	222386	222391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589451
4003	NC_017623	CTC	2	6	222415	222420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589451
4004	NC_017623	TGG	2	6	222470	222475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589451
4005	NC_017623	GCA	2	6	222528	222533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589451
4006	NC_017623	GGA	2	6	222570	222575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589451
4007	NC_017623	TGG	2	6	222587	222592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589451
4008	NC_017623	TGC	2	6	222596	222601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589451
4009	NC_017623	CG	3	6	222747	222752	0 %	0 %	50 %	50 %	386589451
4010	NC_017623	GGCG	2	8	222774	222781	0 %	0 %	75 %	25 %	386589451
4011	NC_017623	TGG	2	6	222782	222787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589451
4012	NC_017623	GCC	2	6	222791	222796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589451
4013	NC_017623	CTG	2	6	222802	222807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589451
4014	NC_017623	CG	3	6	222832	222837	0 %	0 %	50 %	50 %	386589451
4015	NC_017623	TGA	3	9	222849	222857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589451
4016	NC_017623	TGCG	2	8	222896	222903	0 %	25 %	50 %	25 %	386589451
4017	NC_017623	ATG	2	6	222911	222916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589451
4018	NC_017623	GTG	2	6	222922	222927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589451
4019	NC_017623	GCCA	2	8	222976	222983	25 %	0 %	25 %	50 %	386589451
4020	NC_017623	GGCG	2	8	223014	223021	0 %	0 %	75 %	25 %	386589451
4021	NC_017623	A	6	6	223064	223069	100 %	0 %	0 %	0 %	386589451
4022	NC_017623	GCG	2	6	223148	223153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589451
4023	NC_017623	TC	3	6	223161	223166	0 %	50 %	0 %	50 %	386589451
4024	NC_017623	TCT	2	6	223178	223183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589451
4025	NC_017623	TGG	2	6	223241	223246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589451
4026	NC_017623	GCA	2	6	223257	223262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589451
4027	NC_017623	CG	3	6	223283	223288	0 %	0 %	50 %	50 %	386589451
4028	NC_017623	GC	3	6	223333	223338	0 %	0 %	50 %	50 %	386589451
4029	NC_017623	GAA	2	6	223402	223407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589451
4030	NC_017623	TGAA	2	8	223445	223452	50 %	25 %	25 %	0 %	386589451
4031	NC_017623	GC	3	6	223534	223539	0 %	0 %	50 %	50 %	386589451
4032	NC_017623	GGC	2	6	223575	223580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589451
4033	NC_017623	GCT	2	6	223581	223586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589451
4034	NC_017623	CCG	2	6	223676	223681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589451
4035	NC_017623	TAA	2	6	223723	223728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589451
4036	NC_017623	CATC	2	8	223876	223883	25 %	25 %	0 %	50 %	386589452
4037	NC_017623	CATC	2	8	223912	223919	25 %	25 %	0 %	50 %	386589452
4038	NC_017623	AGA	2	6	223938	223943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589452
4039	NC_017623	GTA	2	6	223946	223951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589452
4040	NC_017623	GAT	2	6	224059	224064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589452
4041	NC_017623	AAT	2	6	224072	224077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589452
4042	NC_017623	AAT	2	6	224129	224134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589452
4043	NC_017623	ATA	2	6	224172	224177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589452
4044	NC_017623	AAT	2	6	224186	224191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589452
4045	NC_017623	CTT	2	6	224212	224217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589452
4046	NC_017623	GTG	2	6	224238	224243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589452
4047	NC_017623	CGC	2	6	224390	224395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589452
4048	NC_017623	AAT	2	6	224408	224413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589452
4049	NC_017623	GAG	2	6	224415	224420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589452
4050	NC_017623	GCC	2	6	224521	224526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589452
4051	NC_017623	ATG	2	6	224592	224597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589452
4052	NC_017623	CAA	2	6	224602	224607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589452
4053	NC_017623	CCAT	2	8	224647	224654	25 %	25 %	0 %	50 %	386589452
4054	NC_017623	CAG	2	6	224712	224717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4055	NC_017623	TAA	2	6	224736	224741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589453
4056	NC_017623	CGC	2	6	224767	224772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589453
4057	NC_017623	GCA	2	6	224784	224789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4058	NC_017623	CAG	2	6	224848	224853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4059	NC_017623	TCG	2	6	224864	224869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4060	NC_017623	GAA	2	6	224989	224994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589453
4061	NC_017623	AATA	2	8	224997	225004	75 %	25 %	0 %	0 %	386589453
4062	NC_017623	AAT	2	6	225029	225034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589453
4063	NC_017623	CGA	2	6	225036	225041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4064	NC_017623	TGA	2	6	225073	225078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589453
4065	NC_017623	T	6	6	225112	225117	0 %	100 %	0 %	0 %	386589453
4066	NC_017623	TAG	2	6	225127	225132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589453
4067	NC_017623	ATT	2	6	225164	225169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589453
4068	NC_017623	TA	3	6	225172	225177	50 %	50 %	0 %	0 %	386589453
4069	NC_017623	TA	3	6	225188	225193	50 %	50 %	0 %	0 %	386589453
4070	NC_017623	GAT	2	6	225214	225219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589453
4071	NC_017623	TAAA	2	8	225243	225250	75 %	25 %	0 %	0 %	386589453
4072	NC_017623	AGC	2	6	225287	225292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4073	NC_017623	ATTA	2	8	225328	225335	50 %	50 %	0 %	0 %	386589453
4074	NC_017623	CAA	2	6	225420	225425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589453
4075	NC_017623	T	6	6	225443	225448	0 %	100 %	0 %	0 %	386589453
4076	NC_017623	AGG	2	6	225482	225487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589453
4077	NC_017623	ACG	2	6	225570	225575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589453
4078	NC_017623	AG	3	6	225595	225600	50 %	0 %	50 %	0 %	386589453
4079	NC_017623	A	6	6	225611	225616	100 %	0 %	0 %	0 %	386589453
4080	NC_017623	T	6	6	225664	225669	0 %	100 %	0 %	0 %	386589453
4081	NC_017623	GTT	2	6	226032	226037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589454
4082	NC_017623	GCG	2	6	226057	226062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589454
4083	NC_017623	GCC	2	6	226067	226072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589454
4084	NC_017623	CCA	2	6	226168	226173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589454
4085	NC_017623	GAG	2	6	226253	226258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589454
4086	NC_017623	CCGCG	2	10	226296	226305	0 %	0 %	40 %	60 %	386589454
4087	NC_017623	A	6	6	226307	226312	100 %	0 %	0 %	0 %	386589454
4088	NC_017623	ATG	2	6	226325	226330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589454
4089	NC_017623	TG	3	6	226329	226334	0 %	50 %	50 %	0 %	386589454
4090	NC_017623	GCC	2	6	226430	226435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589454
4091	NC_017623	ACTG	2	8	226458	226465	25 %	25 %	25 %	25 %	386589454
4092	NC_017623	AAT	2	6	226504	226509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589454
4093	NC_017623	GCG	2	6	226530	226535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589454
4094	NC_017623	GAA	2	6	226602	226607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589454
4095	NC_017623	AGC	2	6	226682	226687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589454
4096	NC_017623	CCG	2	6	226787	226792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589454
4097	NC_017623	T	6	6	226818	226823	0 %	100 %	0 %	0 %	386589454
4098	NC_017623	GCG	2	6	226888	226893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589454
4099	NC_017623	GCG	2	6	226914	226919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589454
4100	NC_017623	CAATG	2	10	226940	226949	40 %	20 %	20 %	20 %	386589454
4101	NC_017623	CA	3	6	226976	226981	50 %	0 %	0 %	50 %	386589454
4102	NC_017623	GGC	2	6	227051	227056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589454
4103	NC_017623	TGCT	2	8	227207	227214	0 %	50 %	25 %	25 %	386589455
4104	NC_017623	ATT	2	6	227266	227271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589455
4105	NC_017623	T	6	6	227407	227412	0 %	100 %	0 %	0 %	386589455
4106	NC_017623	CAG	2	6	227445	227450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589455
4107	NC_017623	TTG	2	6	227551	227556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589455
4108	NC_017623	T	6	6	227597	227602	0 %	100 %	0 %	0 %	386589455
4109	NC_017623	CAG	2	6	227610	227615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589455
4110	NC_017623	TTG	2	6	227645	227650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589455
4111	NC_017623	CG	3	6	227726	227731	0 %	0 %	50 %	50 %	386589455
4112	NC_017623	TGA	2	6	227778	227783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589455
4113	NC_017623	CG	3	6	227872	227877	0 %	0 %	50 %	50 %	386589455
4114	NC_017623	GCG	2	6	228002	228007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589455
4115	NC_017623	ACCAC	2	10	228048	228057	40 %	0 %	0 %	60 %	386589455
4116	NC_017623	GAA	2	6	228066	228071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589455
4117	NC_017623	TGA	2	6	228096	228101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589455
4118	NC_017623	GCA	2	6	228168	228173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589455
4119	NC_017623	CG	3	6	228205	228210	0 %	0 %	50 %	50 %	386589455
4120	NC_017623	TCG	3	9	228220	228228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589455
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4123	NC_017623	CGG	2	6	228263	228268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589455
4124	NC_017623	CAG	2	6	228489	228494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589455
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4366	NC_017623	GC	3	6	241730	241735	0 %	0 %	50 %	50 %	386589463
4367	NC_017623	ACG	2	6	241748	241753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589463
4368	NC_017623	CGG	2	6	241838	241843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589463
4369	NC_017623	ACGTCA	2	12	241879	241890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386589463
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4480	NC_017623	AGA	2	6	247974	247979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589468
4481	NC_017623	AAT	2	6	248028	248033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589468
4482	NC_017623	GGATG	2	10	248061	248070	20 %	20 %	60 %	0 %	386589468
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