MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 85956

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017623	TGGC	2	8	282487	282494	0 %	25 %	50 %	25 %	386589494
5002	NC_017623	CTG	2	6	282511	282516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589494
5003	NC_017623	GCC	2	6	282610	282615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589494
5004	NC_017623	TGC	2	6	282665	282670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589494
5005	NC_017623	GC	3	6	282746	282751	0 %	0 %	50 %	50 %	386589494
5006	NC_017623	CGG	2	6	282758	282763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589494
5007	NC_017623	GTT	2	6	282770	282775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589494
5008	NC_017623	A	6	6	282794	282799	100 %	0 %	0 %	0 %	386589494
5009	NC_017623	GAC	2	6	282819	282824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589494
5010	NC_017623	TTG	2	6	283261	283266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589495
5011	NC_017623	TAA	2	6	283316	283321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589495
5012	NC_017623	TAT	2	6	283338	283343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589495
5013	NC_017623	CAG	2	6	283348	283353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589495
5014	NC_017623	TTCC	2	8	283389	283396	0 %	50 %	0 %	50 %	386589495
5015	NC_017623	CGG	2	6	283434	283439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589495
5016	NC_017623	ATC	2	6	283468	283473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589495
5017	NC_017623	TTCA	2	8	283483	283490	25 %	50 %	0 %	25 %	386589495
5018	NC_017623	GTA	2	6	283534	283539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589495
5019	NC_017623	CCAG	2	8	283566	283573	25 %	0 %	25 %	50 %	386589495
5020	NC_017623	TTG	2	6	283586	283591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589495
5021	NC_017623	GCT	2	6	283661	283666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589495
5022	NC_017623	GGC	2	6	283823	283828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589496
5023	NC_017623	GC	3	6	283850	283855	0 %	0 %	50 %	50 %	386589496
5024	NC_017623	CTGG	2	8	283889	283896	0 %	25 %	50 %	25 %	386589496
5025	NC_017623	TAC	2	6	284094	284099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589496
5026	NC_017623	TCG	2	6	284122	284127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589496
5027	NC_017623	CCG	2	6	284132	284137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589496
5028	NC_017623	TCC	2	6	284149	284154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589496
5029	NC_017623	TTG	2	6	284206	284211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589496
5030	NC_017623	CG	3	6	284240	284245	0 %	0 %	50 %	50 %	386589496
5031	NC_017623	GGA	2	6	284255	284260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589496
5032	NC_017623	TGA	2	6	284326	284331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589496
5033	NC_017623	GCG	2	6	284356	284361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589496
5034	NC_017623	CTA	2	6	284424	284429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589496
5035	NC_017623	CG	3	6	284447	284452	0 %	0 %	50 %	50 %	386589496
5036	NC_017623	GAT	2	6	284613	284618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589497
5037	NC_017623	GGCG	2	8	284667	284674	0 %	0 %	75 %	25 %	386589497
5038	NC_017623	GCG	2	6	284752	284757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589497
5039	NC_017623	GGA	2	6	284892	284897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589497
5040	NC_017623	TGA	2	6	284912	284917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589497
5041	NC_017623	CCG	2	6	284934	284939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589497
5042	NC_017623	TGG	2	6	285005	285010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589497
5043	NC_017623	GGC	2	6	285013	285018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589497
5044	NC_017623	GAT	2	6	285048	285053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589497
5045	NC_017623	CTG	3	9	285079	285087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589497
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5047	NC_017623	TGA	2	6	285152	285157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589497
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5051	NC_017623	CTG	2	6	285241	285246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589497
5052	NC_017623	ACG	2	6	285254	285259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589497
5053	NC_017623	CGC	2	6	285262	285267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589497
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5055	NC_017623	GC	3	6	285373	285378	0 %	0 %	50 %	50 %	386589497
5056	NC_017623	GCC	2	6	285438	285443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589497
5057	NC_017623	CATC	2	8	285525	285532	25 %	25 %	0 %	50 %	386589497
5058	NC_017623	GCC	2	6	285540	285545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589497
5059	NC_017623	CGG	2	6	285708	285713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589498
5060	NC_017623	GCG	2	6	285754	285759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589498
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5063	NC_017623	GCT	2	6	285870	285875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589498
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5068	NC_017623	GC	3	6	286114	286119	0 %	0 %	50 %	50 %	386589498
5069	NC_017623	GC	3	6	286166	286171	0 %	0 %	50 %	50 %	386589498
5070	NC_017623	CAT	2	6	286325	286330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589498
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5072	NC_017623	GATCT	2	10	286485	286494	20 %	40 %	20 %	20 %	386589499
5073	NC_017623	CGA	2	6	286574	286579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589499
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5079	NC_017623	GCT	2	6	287193	287198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589500
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5085	NC_017623	TAAG	2	8	287372	287379	50 %	25 %	25 %	0 %	386589500
5086	NC_017623	CG	3	6	287441	287446	0 %	0 %	50 %	50 %	386589501
5087	NC_017623	GC	3	6	287460	287465	0 %	0 %	50 %	50 %	386589501
5088	NC_017623	CTGC	2	8	287475	287482	0 %	25 %	25 %	50 %	386589501
5089	NC_017623	ACGA	2	8	287564	287571	50 %	0 %	25 %	25 %	386589501
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5092	NC_017623	G	6	6	287753	287758	0 %	0 %	100 %	0 %	386589501
5093	NC_017623	AGC	3	9	287763	287771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589501
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5101	NC_017623	GCC	2	6	288178	288183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589502
5102	NC_017623	GC	3	6	288384	288389	0 %	0 %	50 %	50 %	386589502
5103	NC_017623	ATC	2	6	288406	288411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589502
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5105	NC_017623	CTG	2	6	288433	288438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589502
5106	NC_017623	TTG	2	6	288482	288487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589502
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5108	NC_017623	AG	4	8	288533	288540	50 %	0 %	50 %	0 %	386589502
5109	NC_017623	CT	4	8	288608	288615	0 %	50 %	0 %	50 %	386589502
5110	NC_017623	TGG	2	6	288909	288914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589503
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5112	NC_017623	GCT	2	6	288976	288981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589503
5113	NC_017623	GCA	3	9	289057	289065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589503
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5120	NC_017623	GCG	2	6	289463	289468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589503
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5122	NC_017623	CA	3	6	289521	289526	50 %	0 %	0 %	50 %	386589503
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5234	NC_017623	C	6	6	294337	294342	0 %	0 %	0 %	100 %	386589506
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5240	NC_017623	AG	3	6	294480	294485	50 %	0 %	50 %	0 %	386589506
5241	NC_017623	CACG	2	8	300768	300775	25 %	0 %	25 %	50 %	386589507
5242	NC_017623	AGC	2	6	300815	300820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589507
5243	NC_017623	CGTG	2	8	300933	300940	0 %	25 %	50 %	25 %	386589507
5244	NC_017623	ACG	2	6	300997	301002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589507
5245	NC_017623	ATC	3	9	301010	301018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589507
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5247	NC_017623	TTCTA	2	10	301039	301048	20 %	60 %	0 %	20 %	386589507
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5273	NC_017623	TTGA	2	8	303113	303120	25 %	50 %	25 %	0 %	386589509
5274	NC_017623	CTG	2	6	303129	303134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589509
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5334	NC_017623	GCGCT	2	10	305323	305332	0 %	20 %	40 %	40 %	386589510
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5351	NC_017623	CTGC	2	8	306197	306204	0 %	25 %	25 %	50 %	386589511
5352	NC_017623	CTGA	2	8	306323	306330	25 %	25 %	25 %	25 %	386589511
5353	NC_017623	GCC	2	6	306458	306463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589511
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5355	NC_017623	AAG	2	6	306594	306599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589511
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5357	NC_017623	CAG	2	6	306704	306709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589511
5358	NC_017623	GCGAT	2	10	306714	306723	20 %	20 %	40 %	20 %	386589511
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5360	NC_017623	GCC	2	6	306755	306760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589511
5361	NC_017623	TGT	2	6	306783	306788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589511
5362	NC_017623	GTG	2	6	306821	306826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589511
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5364	NC_017623	GGA	2	6	306955	306960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589511
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5483	NC_017623	TAT	2	6	313227	313232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589515
5484	NC_017623	GCT	2	6	313284	313289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589515
5485	NC_017623	GCC	2	6	313309	313314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589515
5486	NC_017623	TGC	2	6	313317	313322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589515
5487	NC_017623	CG	3	6	313323	313328	0 %	0 %	50 %	50 %	386589515
5488	NC_017623	GATG	2	8	313410	313417	25 %	25 %	50 %	0 %	386589515
5489	NC_017623	ATT	2	6	313531	313536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589515
5490	NC_017623	TGA	2	6	313539	313544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589515
5491	NC_017623	GC	3	6	313589	313594	0 %	0 %	50 %	50 %	386589515
5492	NC_017623	CGCTGG	2	12	313607	313618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386589515
5493	NC_017623	TGC	2	6	313623	313628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589515
5494	NC_017623	TGC	2	6	313637	313642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589515
5495	NC_017623	GCGAT	2	10	313649	313658	20 %	20 %	40 %	20 %	386589515
5496	NC_017623	GAT	2	6	313665	313670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589515
5497	NC_017623	A	6	6	313680	313685	100 %	0 %	0 %	0 %	386589515
5498	NC_017623	GGC	2	6	313800	313805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589515
5499	NC_017623	GGA	2	6	313806	313811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589515
5500	NC_017623	CCG	2	6	313815	313820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589515

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