MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 35165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017622	ATA	2	6	30758	30763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587305
502	NC_017622	GCA	2	6	30766	30771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587305
503	NC_017622	GGA	2	6	30807	30812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587305
504	NC_017622	TGC	2	6	30837	30842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587305
505	NC_017622	TTG	2	6	30872	30877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587305
506	NC_017622	TTTA	2	8	30880	30887	25 %	75 %	0 %	0 %	386587305
507	NC_017622	A	7	7	30897	30903	100 %	0 %	0 %	0 %	386587305
508	NC_017622	CTACG	2	10	31071	31080	20 %	20 %	20 %	40 %	386587306
509	NC_017622	TTG	2	6	31097	31102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587306
510	NC_017622	TGG	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587306
511	NC_017622	AAGA	2	8	31141	31148	75 %	0 %	25 %	0 %	386587306
512	NC_017622	AAT	2	6	31174	31179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587306
513	NC_017622	TGAA	2	8	31208	31215	50 %	25 %	25 %	0 %	386587306
514	NC_017622	AAG	2	6	31270	31275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587306
515	NC_017622	ATT	2	6	31282	31287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587306
516	NC_017622	GTT	2	6	31297	31302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587306
517	NC_017622	GAA	2	6	31348	31353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587306
518	NC_017622	A	6	6	31393	31398	100 %	0 %	0 %	0 %	386587306
519	NC_017622	GAA	2	6	31483	31488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587306
520	NC_017622	TGG	2	6	31544	31549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587306
521	NC_017622	TCG	2	6	31668	31673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587306
522	NC_017622	GAA	2	6	31773	31778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
523	NC_017622	GCA	2	6	31780	31785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587307
524	NC_017622	GAG	2	6	31891	31896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
525	NC_017622	GAA	2	6	31963	31968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
526	NC_017622	CAG	2	6	32037	32042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587307
527	NC_017622	AGG	2	6	32045	32050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
528	NC_017622	GTC	2	6	32069	32074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587307
529	NC_017622	AGG	2	6	32075	32080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
530	NC_017622	GAA	3	9	32128	32136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
531	NC_017622	ATT	2	6	32153	32158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587307
532	NC_017622	TGG	2	6	32204	32209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
533	NC_017622	T	6	6	32254	32259	0 %	100 %	0 %	0 %	386587307
534	NC_017622	TGGAAG	2	12	32315	32326	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386587307
535	NC_017622	TTCA	2	8	32335	32342	25 %	50 %	0 %	25 %	386587307
536	NC_017622	TACT	2	8	32400	32407	25 %	50 %	0 %	25 %	386587307
537	NC_017622	GCC	2	6	32420	32425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386587307
538	NC_017622	CGA	2	6	32570	32575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587307
539	NC_017622	GTC	2	6	32603	32608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587307
540	NC_017622	GTGGAT	2	12	32662	32673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386587307
541	NC_017622	CTC	2	6	32692	32697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587307
542	NC_017622	GGT	2	6	32767	32772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
543	NC_017622	TTC	2	6	32919	32924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587307
544	NC_017622	GGT	2	6	33085	33090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
545	NC_017622	GAA	2	6	33196	33201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
546	NC_017622	A	6	6	33250	33255	100 %	0 %	0 %	0 %	386587307
547	NC_017622	AGG	2	6	33273	33278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
548	NC_017622	GAACG	2	10	33357	33366	40 %	0 %	40 %	20 %	386587307
549	NC_017622	GTCC	2	8	33409	33416	0 %	25 %	25 %	50 %	386587307
550	NC_017622	GTC	2	6	33446	33451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587307
551	NC_017622	AAACC	2	10	33493	33502	60 %	0 %	0 %	40 %	386587307
552	NC_017622	TTCC	2	8	33546	33553	0 %	50 %	0 %	50 %	386587307
553	NC_017622	GTG	3	9	33574	33582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
554	NC_017622	ACA	2	6	33628	33633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587307
555	NC_017622	ACC	2	6	33746	33751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587307
556	NC_017622	GTC	2	6	33761	33766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587307
557	NC_017622	GAC	2	6	33822	33827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587307
558	NC_017622	TGG	2	6	33926	33931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
559	NC_017622	GCAG	2	8	33996	34003	25 %	0 %	50 %	25 %	386587307
560	NC_017622	ACA	2	6	34150	34155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587307
561	NC_017622	TACC	2	8	34213	34220	25 %	25 %	0 %	50 %	386587307
562	NC_017622	AGA	2	6	34236	34241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
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564	NC_017622	GGA	2	6	34333	34338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
565	NC_017622	TGG	2	6	34431	34436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587307
566	NC_017622	AAG	2	6	34454	34459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
567	NC_017622	AGA	2	6	34569	34574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587307
568	NC_017622	CAG	2	6	34622	34627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587307
569	NC_017622	AG	3	6	34785	34790	50 %	0 %	50 %	0 %	386587307
570	NC_017622	ATTCT	2	10	34840	34849	20 %	60 %	0 %	20 %	386587307
571	NC_017622	A	6	6	34955	34960	100 %	0 %	0 %	0 %	386587307
572	NC_017622	TCA	2	6	34967	34972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587307
573	NC_017622	TTG	2	6	35014	35019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587307
574	NC_017622	GAG	2	6	35035	35040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386587307
575	NC_017622	CCAA	2	8	35078	35085	50 %	0 %	0 %	50 %	386587307
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577	NC_017622	GACG	2	8	35205	35212	25 %	0 %	50 %	25 %	386587307
578	NC_017622	GCCAT	2	10	35315	35324	20 %	20 %	20 %	40 %	386587307
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581	NC_017622	AAAT	2	8	35464	35471	75 %	25 %	0 %	0 %	386587307
582	NC_017622	GAA	2	6	35499	35504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587308
583	NC_017622	GCT	2	6	35538	35543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587308
584	NC_017622	GCA	2	6	35573	35578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587308
585	NC_017622	AAG	2	6	35587	35592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587308
586	NC_017622	ATG	2	6	35611	35616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587308
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591	NC_017622	TCT	4	12	35871	35882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587308
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597	NC_017622	TGA	2	6	36158	36163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587308
598	NC_017622	GTC	2	6	36295	36300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587308
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601	NC_017622	AAATG	2	10	36401	36410	60 %	20 %	20 %	0 %	386587308
602	NC_017622	CAAC	2	8	36450	36457	50 %	0 %	0 %	50 %	386587308
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611	NC_017622	GAA	2	6	36867	36872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587308
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615	NC_017622	ATC	2	6	38292	38297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587309
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