MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 1317

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017621	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386585203
2	NC_017621	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386585203
3	NC_017621	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386585205
4	NC_017621	AAACA	2	10	5753	5762	80 %	0 %	0 %	20 %	386585209
5	NC_017621	TGTCT	2	10	6144	6153	0 %	60 %	20 %	20 %	386585209
6	NC_017621	GAGAT	2	10	6862	6871	40 %	20 %	40 %	0 %	386585210
7	NC_017621	TGAAA	2	10	9999	10008	60 %	20 %	20 %	0 %	386585211
8	NC_017621	CTATT	2	10	11236	11245	20 %	60 %	0 %	20 %	386585214
9	NC_017621	CTTTG	2	10	13465	13474	0 %	60 %	20 %	20 %	386585216
10	NC_017621	AAGTT	2	10	16214	16223	40 %	40 %	20 %	0 %	386585217
11	NC_017621	TTTAT	2	10	24393	24402	20 %	80 %	0 %	0 %	386585219
12	NC_017621	AATGC	2	10	25359	25368	40 %	20 %	20 %	20 %	386585220
13	NC_017621	CTACG	2	10	30713	30722	20 %	20 %	20 %	40 %	386585226
14	NC_017621	AAATG	2	10	36078	36087	60 %	20 %	20 %	0 %	386585227
15	NC_017621	AGCAG	2	10	39391	39400	40 %	0 %	40 %	20 %	386585230
16	NC_017621	CTATT	2	10	39616	39625	20 %	60 %	0 %	20 %	386585230
17	NC_017621	TAGAA	2	10	40830	40839	60 %	20 %	20 %	0 %	386585231
18	NC_017621	TAATG	2	10	41211	41220	40 %	40 %	20 %	0 %	386585231
19	NC_017621	TTACT	2	10	41785	41794	20 %	60 %	0 %	20 %	386585232
20	NC_017621	AAGCA	2	10	46861	46870	60 %	0 %	20 %	20 %	386585237
21	NC_017621	TAAAA	2	10	46944	46953	80 %	20 %	0 %	0 %	386585237
22	NC_017621	AGCGG	2	10	49422	49431	20 %	0 %	60 %	20 %	386585239
23	NC_017621	TTAGT	2	10	50889	50898	20 %	60 %	20 %	0 %	386585241
24	NC_017621	GTTTT	2	10	51558	51567	0 %	80 %	20 %	0 %	386585242
25	NC_017621	TTATC	2	10	51667	51676	20 %	60 %	0 %	20 %	386585242
26	NC_017621	TAATC	2	10	51775	51784	40 %	40 %	0 %	20 %	386585242
27	NC_017621	TTTAT	2	10	51936	51945	20 %	80 %	0 %	0 %	386585243
28	NC_017621	TCAAT	2	10	52034	52043	40 %	40 %	0 %	20 %	386585243
29	NC_017621	TCTTT	2	10	53571	53580	0 %	80 %	0 %	20 %	386585245
30	NC_017621	GAGAA	2	10	55789	55798	60 %	0 %	40 %	0 %	386585247
31	NC_017621	CTGGA	2	10	58237	58246	20 %	20 %	40 %	20 %	386585249
32	NC_017621	TTGAT	2	10	60248	60257	20 %	60 %	20 %	0 %	386585251
33	NC_017621	AGCAG	2	10	61947	61956	40 %	0 %	40 %	20 %	386585252
34	NC_017621	TTGCT	2	10	67388	67397	0 %	60 %	20 %	20 %	386585257
35	NC_017621	GTGTG	2	10	71415	71424	0 %	40 %	60 %	0 %	386585261
36	NC_017621	GTATC	2	10	72191	72200	20 %	40 %	20 %	20 %	386585262
37	NC_017621	TGGCG	2	10	75905	75914	0 %	20 %	60 %	20 %	386585269
38	NC_017621	AAAAC	2	10	76465	76474	80 %	0 %	0 %	20 %	386585270
39	NC_017621	TACAC	2	10	76879	76888	40 %	20 %	0 %	40 %	386585271
40	NC_017621	GTCTT	2	10	77897	77906	0 %	60 %	20 %	20 %	386585273
41	NC_017621	TTTGG	2	10	78028	78037	0 %	60 %	40 %	0 %	386585273
42	NC_017621	TAAGA	2	10	81405	81414	60 %	20 %	20 %	0 %	386585281
43	NC_017621	AGAAT	2	10	86079	86088	60 %	20 %	20 %	0 %	386585288
44	NC_017621	GAAAA	2	10	88405	88414	80 %	0 %	20 %	0 %	386585293
45	NC_017621	CTGAC	2	10	88799	88808	20 %	20 %	20 %	40 %	386585293
46	NC_017621	ATCGT	2	10	96606	96615	20 %	40 %	20 %	20 %	386585295
47	NC_017621	CATAT	2	10	99039	99048	40 %	40 %	0 %	20 %	386585297
48	NC_017621	TTTGG	2	10	100627	100636	0 %	60 %	40 %	0 %	386585300
49	NC_017621	ATTGC	2	10	101092	101101	20 %	40 %	20 %	20 %	386585300
50	NC_017621	GCTTT	2	10	101323	101332	0 %	60 %	20 %	20 %	386585301
51	NC_017621	AGAAA	2	10	101781	101790	80 %	0 %	20 %	0 %	386585301
52	NC_017621	GACTT	2	10	103360	103369	20 %	40 %	20 %	20 %	386585302
53	NC_017621	CATTT	2	10	104915	104924	20 %	60 %	0 %	20 %	386585304
54	NC_017621	AATGT	2	10	106311	106320	40 %	40 %	20 %	0 %	386585307
55	NC_017621	TTTGG	2	10	106431	106440	0 %	60 %	40 %	0 %	386585307
56	NC_017621	AAGTC	2	10	108086	108095	40 %	20 %	20 %	20 %	386585309
57	NC_017621	CTGGG	2	10	114370	114379	0 %	20 %	60 %	20 %	386585311
58	NC_017621	GTCTG	2	10	124486	124495	0 %	40 %	40 %	20 %	386585315
59	NC_017621	GGCCT	2	10	124561	124570	0 %	20 %	40 %	40 %	386585315
60	NC_017621	AATCA	2	10	124843	124852	60 %	20 %	0 %	20 %	386585315
61	NC_017621	CGGAG	2	10	124966	124975	20 %	0 %	60 %	20 %	386585315
62	NC_017621	TGGTT	2	10	126637	126646	0 %	60 %	40 %	0 %	386585317
63	NC_017621	GGTCA	2	10	126936	126945	20 %	20 %	40 %	20 %	386585317
64	NC_017621	GGCAA	2	10	128584	128593	40 %	0 %	40 %	20 %	386585322
65	NC_017621	GAAAA	2	10	131380	131389	80 %	0 %	20 %	0 %	386585325
66	NC_017621	CCTTG	2	10	131433	131442	0 %	40 %	20 %	40 %	386585325
67	NC_017621	CTGGA	2	10	132321	132330	20 %	20 %	40 %	20 %	386585326
68	NC_017621	AGCAG	2	10	132677	132686	40 %	0 %	40 %	20 %	386585326
69	NC_017621	GGCCG	2	10	132858	132867	0 %	0 %	60 %	40 %	386585326
70	NC_017621	ACTTT	2	10	137673	137682	20 %	60 %	0 %	20 %	386585332
71	NC_017621	ATCGT	2	10	139502	139511	20 %	40 %	20 %	20 %	386585335
72	NC_017621	AAATT	2	10	139785	139794	60 %	40 %	0 %	0 %	386585336
73	NC_017621	TAGCG	2	10	141040	141049	20 %	20 %	40 %	20 %	386585336
74	NC_017621	ATCAA	2	10	142201	142210	60 %	20 %	0 %	20 %	386585338
75	NC_017621	CGTAT	2	10	143358	143367	20 %	40 %	20 %	20 %	386585339
76	NC_017621	CCAAT	2	10	143451	143460	40 %	20 %	0 %	40 %	386585339
77	NC_017621	CAAGA	2	10	144225	144234	60 %	0 %	20 %	20 %	386585339
78	NC_017621	AAGCT	2	10	144655	144664	40 %	20 %	20 %	20 %	386585339
79	NC_017621	ACTAA	2	10	145632	145641	60 %	20 %	0 %	20 %	386585340
80	NC_017621	TTCCG	2	10	149127	149136	0 %	40 %	20 %	40 %	386585342
81	NC_017621	TTGAA	2	10	150440	150449	40 %	40 %	20 %	0 %	386585342
82	NC_017621	AACCA	2	10	151804	151813	60 %	0 %	0 %	40 %	386585342
83	NC_017621	CAAAA	2	10	152644	152653	80 %	0 %	0 %	20 %	386585342
84	NC_017621	AACCA	2	10	153049	153058	60 %	0 %	0 %	40 %	386585342
85	NC_017621	CAAAT	2	10	153776	153785	60 %	20 %	0 %	20 %	386585342
86	NC_017621	TGAAG	2	10	155097	155106	40 %	20 %	40 %	0 %	386585342
87	NC_017621	GAATG	2	10	155646	155655	40 %	20 %	40 %	0 %	386585342
88	NC_017621	GTTTA	2	10	159976	159985	20 %	60 %	20 %	0 %	386585346
89	NC_017621	AAAAT	2	10	161911	161920	80 %	20 %	0 %	0 %	386585348
90	NC_017621	GCTAG	2	10	162860	162869	20 %	20 %	40 %	20 %	386585349
91	NC_017621	TTTCA	2	10	167372	167381	20 %	60 %	0 %	20 %	386585354
92	NC_017621	GTCTT	2	10	171512	171521	0 %	60 %	20 %	20 %	386585358
93	NC_017621	TTGGA	2	10	173937	173946	20 %	40 %	40 %	0 %	386585359
94	NC_017621	TCATC	2	10	174810	174819	20 %	40 %	0 %	40 %	386585361
95	NC_017621	CTTGG	2	10	174979	174988	0 %	40 %	40 %	20 %	386585361
96	NC_017621	GAGCA	2	10	175910	175919	40 %	0 %	40 %	20 %	386585362
97	NC_017621	TCCTT	2	10	176352	176361	0 %	60 %	0 %	40 %	386585362
98	NC_017621	CCAAA	2	10	176517	176526	60 %	0 %	0 %	40 %	386585362
99	NC_017621	TCTGG	2	10	183522	183531	0 %	40 %	40 %	20 %	386585368
100	NC_017621	CTCAA	2	10	183658	183667	40 %	20 %	0 %	40 %	386585368
101	NC_017621	TGATT	2	10	191181	191190	20 %	60 %	20 %	0 %	386585373
102	NC_017621	AGGAT	2	10	191224	191233	40 %	20 %	40 %	0 %	386585373
103	NC_017621	GCGTG	2	10	194442	194451	0 %	20 %	60 %	20 %	386585375
104	NC_017621	GTTGG	2	10	196815	196824	0 %	40 %	60 %	0 %	386585379
105	NC_017621	GGAAA	2	10	199859	199868	60 %	0 %	40 %	0 %	386585380
106	NC_017621	CTGGT	2	10	200356	200365	0 %	40 %	40 %	20 %	386585381
107	NC_017621	CCAGA	2	10	200409	200418	40 %	0 %	20 %	40 %	386585381
108	NC_017621	AGCAG	2	10	202460	202469	40 %	0 %	40 %	20 %	386585383
109	NC_017621	ACCAG	2	10	205624	205633	40 %	0 %	20 %	40 %	386585385
110	NC_017621	GTTTT	2	10	206862	206871	0 %	80 %	20 %	0 %	386585386
111	NC_017621	CCATA	2	10	206964	206973	40 %	20 %	0 %	40 %	386585387
112	NC_017621	ATGAC	2	10	208352	208361	40 %	20 %	20 %	20 %	386585388
113	NC_017621	AGCTC	2	10	210346	210355	20 %	20 %	20 %	40 %	386585389
114	NC_017621	AAAGA	2	10	217334	217343	80 %	0 %	20 %	0 %	386585392
115	NC_017621	GTCTG	2	10	219663	219672	0 %	40 %	40 %	20 %	386585395
116	NC_017621	GTTAT	2	10	222186	222195	20 %	60 %	20 %	0 %	386585398
117	NC_017621	TGAAA	2	10	223100	223109	60 %	20 %	20 %	0 %	386585400
118	NC_017621	GAGAC	2	10	224902	224911	40 %	0 %	40 %	20 %	386585402
119	NC_017621	ATCAA	2	10	225948	225957	60 %	20 %	0 %	20 %	386585404
120	NC_017621	CCTTG	2	10	227515	227524	0 %	40 %	20 %	40 %	386585405
121	NC_017621	ACCAA	2	10	228524	228533	60 %	0 %	0 %	40 %	386585406
122	NC_017621	TAATG	2	10	231524	231533	40 %	40 %	20 %	0 %	386585409
123	NC_017621	ATTTT	2	10	232787	232796	20 %	80 %	0 %	0 %	386585410
124	NC_017621	TTGGT	2	10	236208	236217	0 %	60 %	40 %	0 %	386585413
125	NC_017621	CTACT	2	10	237132	237141	20 %	40 %	0 %	40 %	386585414
126	NC_017621	TGGGC	2	10	237227	237236	0 %	20 %	60 %	20 %	386585414
127	NC_017621	GTTAA	2	10	237312	237321	40 %	40 %	20 %	0 %	386585414
128	NC_017621	AAACC	2	10	239266	239275	60 %	0 %	0 %	40 %	386585416
129	NC_017621	TGAAC	2	10	239662	239671	40 %	20 %	20 %	20 %	386585416
130	NC_017621	GGCTT	2	10	243214	243223	0 %	40 %	40 %	20 %	386585418
131	NC_017621	AAAGA	2	10	244926	244935	80 %	0 %	20 %	0 %	386585419
132	NC_017621	TCCAT	2	10	246736	246745	20 %	40 %	0 %	40 %	386585421
133	NC_017621	CTTGG	2	10	247188	247197	0 %	40 %	40 %	20 %	386585422
134	NC_017621	GAGAA	2	10	248153	248162	60 %	0 %	40 %	0 %	386585423
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